Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168DDT9

Protein Details
Accession A0A168DDT9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
373-398LGSYGGKPGKRTHKKSKAQTGLEQLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
297-302RKKKRK
379-388KPGKRTHKKS
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPKGKWIDKKNAQHFTLVHRPQNDPLIYDENAPSMVLNPTEGSKNASKGKNLGDLASELGADAEHIRANEGEAANYGVYFDDSEYDYMQHLRDLNTGGGDVVFVEAKATGNTGKGKQKQSLEDALKQMDLEHKAGDVLDPDMLPSRDLSRMSYEQQQDVPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDDAFVDNEDDDIFGQLAKDGYEIDDYEFEENQFNDDDDGWESDDTAKPNKEYKDDQVPQLVAVGEQPEEGPSQDWLEDFKKFKKEQKSGGSPKAAGAPSQSELQSTWTTTTNGGRKKKRKGALTVASGFSMTSSSLVRTEQLSFLDARFDKIEEKYNEEFDDMGSVSAISTASSVTGPVRGDFDSIMDEFLGSYGGKPGKRTHKKSKAQTGLEQLDEIRRELGPARIKGRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.64
3 0.65
4 0.61
5 0.57
6 0.52
7 0.53
8 0.52
9 0.58
10 0.5
11 0.41
12 0.38
13 0.38
14 0.34
15 0.34
16 0.31
17 0.23
18 0.23
19 0.21
20 0.16
21 0.13
22 0.14
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.13
27 0.15
28 0.16
29 0.19
30 0.21
31 0.27
32 0.34
33 0.37
34 0.38
35 0.41
36 0.45
37 0.47
38 0.44
39 0.39
40 0.33
41 0.3
42 0.28
43 0.23
44 0.19
45 0.1
46 0.09
47 0.08
48 0.07
49 0.07
50 0.06
51 0.07
52 0.07
53 0.09
54 0.09
55 0.1
56 0.15
57 0.14
58 0.14
59 0.13
60 0.14
61 0.13
62 0.13
63 0.12
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.09
71 0.1
72 0.1
73 0.11
74 0.12
75 0.12
76 0.13
77 0.14
78 0.14
79 0.15
80 0.17
81 0.16
82 0.15
83 0.15
84 0.13
85 0.11
86 0.09
87 0.07
88 0.06
89 0.05
90 0.04
91 0.05
92 0.05
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.1
98 0.13
99 0.19
100 0.27
101 0.34
102 0.38
103 0.43
104 0.48
105 0.49
106 0.51
107 0.55
108 0.51
109 0.48
110 0.46
111 0.41
112 0.36
113 0.32
114 0.28
115 0.24
116 0.21
117 0.17
118 0.15
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.13
123 0.09
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.07
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.11
133 0.13
134 0.14
135 0.15
136 0.17
137 0.2
138 0.22
139 0.29
140 0.29
141 0.28
142 0.29
143 0.28
144 0.24
145 0.21
146 0.19
147 0.12
148 0.1
149 0.09
150 0.08
151 0.07
152 0.06
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.08
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.1
213 0.11
214 0.13
215 0.14
216 0.15
217 0.2
218 0.22
219 0.24
220 0.26
221 0.29
222 0.37
223 0.38
224 0.38
225 0.36
226 0.35
227 0.3
228 0.29
229 0.24
230 0.13
231 0.11
232 0.1
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.1
245 0.11
246 0.15
247 0.18
248 0.22
249 0.29
250 0.32
251 0.4
252 0.47
253 0.52
254 0.57
255 0.63
256 0.69
257 0.69
258 0.73
259 0.69
260 0.59
261 0.53
262 0.51
263 0.41
264 0.31
265 0.25
266 0.2
267 0.18
268 0.2
269 0.19
270 0.14
271 0.14
272 0.17
273 0.16
274 0.15
275 0.15
276 0.14
277 0.15
278 0.17
279 0.23
280 0.26
281 0.33
282 0.42
283 0.5
284 0.57
285 0.67
286 0.74
287 0.75
288 0.76
289 0.76
290 0.78
291 0.76
292 0.74
293 0.68
294 0.59
295 0.52
296 0.44
297 0.35
298 0.25
299 0.17
300 0.1
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.09
305 0.09
306 0.1
307 0.11
308 0.13
309 0.14
310 0.14
311 0.15
312 0.15
313 0.14
314 0.21
315 0.19
316 0.2
317 0.19
318 0.19
319 0.21
320 0.23
321 0.32
322 0.27
323 0.33
324 0.34
325 0.35
326 0.35
327 0.32
328 0.3
329 0.21
330 0.21
331 0.15
332 0.12
333 0.09
334 0.08
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.07
345 0.1
346 0.11
347 0.11
348 0.14
349 0.14
350 0.15
351 0.14
352 0.14
353 0.14
354 0.14
355 0.14
356 0.11
357 0.11
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.06
362 0.06
363 0.12
364 0.17
365 0.19
366 0.22
367 0.3
368 0.41
369 0.52
370 0.61
371 0.66
372 0.72
373 0.81
374 0.89
375 0.92
376 0.9
377 0.86
378 0.84
379 0.83
380 0.77
381 0.68
382 0.59
383 0.49
384 0.45
385 0.4
386 0.33
387 0.25
388 0.2
389 0.2
390 0.22
391 0.28
392 0.31
393 0.36