Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168D839

Protein Details
Accession A0A168D839    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-68SEQSPRSPSPPPRKRSPSPTHEYVHydrophilic
298-319GEEKRKRREYRLMRKEQFKRPEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
279-287PKAKKLSNK
292-318IPRFEAGEEKRKRREYRLMRKEQFKRP
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 3.5, cyto_mito 3.5, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MASDNDSSDLSSLSSLSPVPSDDELDAGNGAPKNDGILKFFSKVSEQSPRSPSPPPRKRSPSPTHEYVLADNPDIAFIVMFRSRFIDALPKSLANFGPQELERDVVEPIPGDRAEHFLCALLGLLLNRKQDVKPGHYNRALEDAIASHKGQWPASWEDKSPLTGGGGFNTMNPTQRLTLLRTLILWTMSSSESVKAIINQAYKQNRHEDDLNQPRAVQPWGSDGDKRRYFLVEGQDDTAFRVYRESNPAGTNRTWWSVAGSIEELRALAEKLNTKDGGPKAKKLSNKMIQAIPRFEAGEEKRKRREYRLMRKEQFKRPEPGFSMYEGRTRGKRVKYTYSDDEDMFYSDSTNRRSARNTGANTPAEPPTTASGRTVRVPSRMGAGDDSAAASIQGDYSEADREGSVGVTGRPRRAAATGSANGWGEANGRGHSNRPSLDSDDAASEAEFGDDEEDAEAHVPEESEEEDDEFDEDEAMVDDDIDDSPKSLVVKLAIKTPNLRTALSPIESVPNALPTPNVEDQKPALGETPSKAVVDVIMEDSPAQEAGREEQSALLTETKHEDQSADKPDAQTEQAGPDIVAASSTAVSSAPLAFRGSPEKKHVQPAAVPGIINAPQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.1
4 0.11
5 0.11
6 0.15
7 0.15
8 0.17
9 0.16
10 0.16
11 0.16
12 0.15
13 0.15
14 0.11
15 0.15
16 0.14
17 0.14
18 0.14
19 0.13
20 0.15
21 0.21
22 0.22
23 0.21
24 0.25
25 0.28
26 0.29
27 0.3
28 0.29
29 0.27
30 0.28
31 0.31
32 0.37
33 0.37
34 0.43
35 0.49
36 0.51
37 0.51
38 0.57
39 0.61
40 0.62
41 0.68
42 0.67
43 0.71
44 0.76
45 0.81
46 0.83
47 0.84
48 0.82
49 0.81
50 0.8
51 0.72
52 0.67
53 0.6
54 0.52
55 0.49
56 0.41
57 0.33
58 0.27
59 0.24
60 0.2
61 0.18
62 0.15
63 0.08
64 0.06
65 0.09
66 0.11
67 0.11
68 0.12
69 0.14
70 0.15
71 0.15
72 0.16
73 0.22
74 0.2
75 0.25
76 0.27
77 0.26
78 0.26
79 0.29
80 0.29
81 0.22
82 0.23
83 0.18
84 0.21
85 0.2
86 0.23
87 0.21
88 0.21
89 0.19
90 0.18
91 0.18
92 0.13
93 0.14
94 0.1
95 0.1
96 0.12
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.16
101 0.17
102 0.17
103 0.17
104 0.14
105 0.13
106 0.12
107 0.12
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.11
112 0.14
113 0.15
114 0.16
115 0.19
116 0.19
117 0.25
118 0.31
119 0.34
120 0.41
121 0.48
122 0.56
123 0.58
124 0.58
125 0.53
126 0.52
127 0.45
128 0.34
129 0.27
130 0.2
131 0.18
132 0.19
133 0.18
134 0.14
135 0.18
136 0.2
137 0.2
138 0.19
139 0.21
140 0.26
141 0.32
142 0.31
143 0.28
144 0.29
145 0.3
146 0.3
147 0.26
148 0.2
149 0.15
150 0.16
151 0.15
152 0.13
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.15
157 0.15
158 0.15
159 0.15
160 0.16
161 0.15
162 0.19
163 0.21
164 0.21
165 0.26
166 0.24
167 0.24
168 0.23
169 0.23
170 0.2
171 0.18
172 0.14
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.11
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.1
183 0.12
184 0.15
185 0.16
186 0.18
187 0.25
188 0.31
189 0.33
190 0.36
191 0.41
192 0.39
193 0.4
194 0.42
195 0.37
196 0.41
197 0.48
198 0.49
199 0.41
200 0.39
201 0.36
202 0.35
203 0.33
204 0.23
205 0.13
206 0.13
207 0.16
208 0.18
209 0.21
210 0.24
211 0.32
212 0.35
213 0.35
214 0.32
215 0.3
216 0.3
217 0.31
218 0.34
219 0.28
220 0.26
221 0.27
222 0.27
223 0.25
224 0.24
225 0.22
226 0.14
227 0.11
228 0.12
229 0.12
230 0.14
231 0.21
232 0.21
233 0.22
234 0.24
235 0.25
236 0.27
237 0.26
238 0.25
239 0.21
240 0.22
241 0.2
242 0.17
243 0.17
244 0.15
245 0.15
246 0.13
247 0.12
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.08
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.08
257 0.11
258 0.13
259 0.16
260 0.16
261 0.16
262 0.21
263 0.23
264 0.32
265 0.3
266 0.33
267 0.36
268 0.4
269 0.43
270 0.43
271 0.5
272 0.47
273 0.49
274 0.48
275 0.46
276 0.46
277 0.46
278 0.42
279 0.33
280 0.26
281 0.22
282 0.19
283 0.21
284 0.19
285 0.27
286 0.31
287 0.35
288 0.42
289 0.49
290 0.52
291 0.52
292 0.6
293 0.61
294 0.66
295 0.72
296 0.76
297 0.74
298 0.81
299 0.82
300 0.81
301 0.78
302 0.72
303 0.67
304 0.58
305 0.58
306 0.51
307 0.48
308 0.4
309 0.33
310 0.32
311 0.27
312 0.28
313 0.25
314 0.24
315 0.22
316 0.25
317 0.29
318 0.31
319 0.36
320 0.38
321 0.45
322 0.48
323 0.53
324 0.54
325 0.53
326 0.49
327 0.43
328 0.39
329 0.31
330 0.26
331 0.2
332 0.14
333 0.1
334 0.1
335 0.13
336 0.14
337 0.19
338 0.2
339 0.21
340 0.24
341 0.27
342 0.33
343 0.38
344 0.38
345 0.37
346 0.42
347 0.4
348 0.39
349 0.37
350 0.3
351 0.23
352 0.21
353 0.18
354 0.14
355 0.15
356 0.14
357 0.14
358 0.15
359 0.16
360 0.19
361 0.21
362 0.21
363 0.23
364 0.24
365 0.22
366 0.23
367 0.22
368 0.2
369 0.17
370 0.16
371 0.13
372 0.12
373 0.11
374 0.07
375 0.06
376 0.05
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.03
381 0.04
382 0.04
383 0.05
384 0.07
385 0.06
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.06
392 0.06
393 0.07
394 0.13
395 0.16
396 0.17
397 0.18
398 0.19
399 0.2
400 0.21
401 0.21
402 0.18
403 0.23
404 0.23
405 0.22
406 0.24
407 0.22
408 0.21
409 0.19
410 0.16
411 0.1
412 0.11
413 0.11
414 0.1
415 0.12
416 0.12
417 0.15
418 0.19
419 0.22
420 0.21
421 0.23
422 0.26
423 0.27
424 0.28
425 0.26
426 0.23
427 0.2
428 0.19
429 0.16
430 0.12
431 0.09
432 0.07
433 0.06
434 0.05
435 0.04
436 0.05
437 0.04
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.06
443 0.06
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.06
449 0.07
450 0.07
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.09
456 0.08
457 0.08
458 0.07
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.07
469 0.06
470 0.06
471 0.07
472 0.09
473 0.09
474 0.09
475 0.11
476 0.13
477 0.19
478 0.19
479 0.27
480 0.29
481 0.3
482 0.35
483 0.37
484 0.41
485 0.38
486 0.38
487 0.31
488 0.32
489 0.35
490 0.31
491 0.29
492 0.22
493 0.24
494 0.23
495 0.24
496 0.19
497 0.18
498 0.16
499 0.16
500 0.15
501 0.13
502 0.2
503 0.24
504 0.26
505 0.23
506 0.26
507 0.27
508 0.31
509 0.3
510 0.24
511 0.2
512 0.2
513 0.22
514 0.21
515 0.24
516 0.2
517 0.2
518 0.19
519 0.16
520 0.15
521 0.14
522 0.13
523 0.11
524 0.1
525 0.1
526 0.1
527 0.1
528 0.1
529 0.09
530 0.08
531 0.07
532 0.08
533 0.12
534 0.15
535 0.15
536 0.15
537 0.17
538 0.18
539 0.18
540 0.18
541 0.17
542 0.14
543 0.15
544 0.21
545 0.21
546 0.22
547 0.21
548 0.2
549 0.22
550 0.29
551 0.34
552 0.33
553 0.33
554 0.33
555 0.35
556 0.37
557 0.34
558 0.29
559 0.24
560 0.22
561 0.21
562 0.2
563 0.18
564 0.16
565 0.15
566 0.12
567 0.1
568 0.08
569 0.07
570 0.07
571 0.07
572 0.07
573 0.06
574 0.06
575 0.07
576 0.09
577 0.09
578 0.11
579 0.13
580 0.13
581 0.16
582 0.26
583 0.3
584 0.33
585 0.41
586 0.48
587 0.51
588 0.6
589 0.61
590 0.57
591 0.56
592 0.58
593 0.58
594 0.51
595 0.46
596 0.37