FuNGI

A0A168BNU6

Protein Details

Accession

A0A168BNU6

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
32-54	ELSAYKKVPSSKKRTDARQGTID	Hydrophilic
127-147	EDESAKKKGREPKTEKPERVE	Basic
471-490	GGPTRRGRRGRGGRGNNGGG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
103-151	KRANRLKDSVSGKKRGEGKGKGSREDESAKKKGREPKTEKPERVEKGSK
457-485	KSKTGEKEKEKGSEGGPTRRGRRGRGGRG

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.166, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MLALSETVRTSTWEDAKNSFTSPALVGPPSLELSAYKKVPSSKKRTDARQGTIDQDPEFMAFLEGLANPVPLRDSADLDDGDDANKGEIKVTTTPLVEYLKEKRANRLKDSVSGKKRGEGKGKGSREDESAKKKGREPKTEKPERVEKGSKTTVKILTKKAATEQAADAAKNVAKAINAAISQDAPKNRRAGIATAARILQRDLGLSPGSAHRKARHDAAKAEAKAKEANQANQAEEVQEASQIAEPATTEEGKGKVNGTTGKPQSGRRGREAKNGAKVTTAPEGQLQSTTINPPVILKKKPEGQANASSSTAGSTTGSTNQQTTALKPATDKNLKPTATNSKAGQSQKKLQSVTAGATRAFVKHAIQSQGVTEVALRQALEPLGTITAIEMDKRKSFAYVDFADHGGLVKAVNASPLAVAQCSVQILERKDKKPTTTSPPTVAGTASVSAEGDKDKSKTGEKEKEKGSEGGPTRRGRRGRGGRGNNGGGASNAQATSASAGQAAPKNAAPVTLG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.38
3	0.41
4	0.41
5	0.39
6	0.34
7	0.27
8	0.23
9	0.21
10	0.21
11	0.2
12	0.19
13	0.17
14	0.17
15	0.18
16	0.17
17	0.16
18	0.13
19	0.12
20	0.16
21	0.23
22	0.24
23	0.23
24	0.25
25	0.34
26	0.43
27	0.52
28	0.57
29	0.61
30	0.69
31	0.77
32	0.82
33	0.85
34	0.84
35	0.81
36	0.79
37	0.72
38	0.67
39	0.63
40	0.57
41	0.46
42	0.38
43	0.31
44	0.23
45	0.2
46	0.16
47	0.11
48	0.08
49	0.08
50	0.08
51	0.08
52	0.08
53	0.08
54	0.08
55	0.08
56	0.08
57	0.09
58	0.08
59	0.12
60	0.13
61	0.15
62	0.17
63	0.2
64	0.2
65	0.2
66	0.21
67	0.17
68	0.16
69	0.14
70	0.12
71	0.09
72	0.11
73	0.11
74	0.1
75	0.11
76	0.14
77	0.16
78	0.19
79	0.21
80	0.19
81	0.19
82	0.21
83	0.22
84	0.2
85	0.22
86	0.25
87	0.31
88	0.38
89	0.39
90	0.46
91	0.53
92	0.59
93	0.61
94	0.63
95	0.57
96	0.58
97	0.65
98	0.65
99	0.63
100	0.64
101	0.59
102	0.56
103	0.61
104	0.6
105	0.61
106	0.58
107	0.59
108	0.61
109	0.65
110	0.64
111	0.59
112	0.54
113	0.49
114	0.49
115	0.47
116	0.45
117	0.49
118	0.51
119	0.52
120	0.57
121	0.62
122	0.65
123	0.69
124	0.7
125	0.72
126	0.76
127	0.83
128	0.81
129	0.78
130	0.77
131	0.7
132	0.7
133	0.66
134	0.58
135	0.55
136	0.6
137	0.57
138	0.5
139	0.52
140	0.5
141	0.51
142	0.54
143	0.51
144	0.49
145	0.47
146	0.46
147	0.43
148	0.43
149	0.36
150	0.33
151	0.29
152	0.27
153	0.27
154	0.26
155	0.22
156	0.18
157	0.17
158	0.15
159	0.14
160	0.09
161	0.08
162	0.09
163	0.09
164	0.1
165	0.09
166	0.09
167	0.09
168	0.09
169	0.11
170	0.14
171	0.18
172	0.18
173	0.21
174	0.23
175	0.23
176	0.25
177	0.26
178	0.24
179	0.26
180	0.29
181	0.27
182	0.26
183	0.27
184	0.24
185	0.23
186	0.21
187	0.16
188	0.1
189	0.1
190	0.09
191	0.09
192	0.09
193	0.09
194	0.09
195	0.13
196	0.17
197	0.18
198	0.21
199	0.24
200	0.29
201	0.31
202	0.37
203	0.39
204	0.39
205	0.38
206	0.42
207	0.44
208	0.41
209	0.43
210	0.36
211	0.31
212	0.29
213	0.28
214	0.29
215	0.24
216	0.25
217	0.27
218	0.27
219	0.26
220	0.25
221	0.25
222	0.18
223	0.15
224	0.13
225	0.08
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.06
232	0.05
233	0.05
234	0.06
235	0.07
236	0.07
237	0.06
238	0.07
239	0.09
240	0.09
241	0.1
242	0.09
243	0.09
244	0.11
245	0.14
246	0.15
247	0.21
248	0.22
249	0.26
250	0.28
251	0.3
252	0.37
253	0.42
254	0.43
255	0.42
256	0.51
257	0.49
258	0.55
259	0.6
260	0.56
261	0.56
262	0.55
263	0.48
264	0.39
265	0.38
266	0.31
267	0.27
268	0.22
269	0.14
270	0.14
271	0.15
272	0.14
273	0.14
274	0.12
275	0.09
276	0.1
277	0.11
278	0.1
279	0.09
280	0.09
281	0.11
282	0.17
283	0.21
284	0.23
285	0.24
286	0.27
287	0.34
288	0.39
289	0.43
290	0.41
291	0.41
292	0.47
293	0.47
294	0.44
295	0.38
296	0.33
297	0.27
298	0.23
299	0.17
300	0.1
301	0.07
302	0.06
303	0.07
304	0.1
305	0.12
306	0.12
307	0.12
308	0.13
309	0.15
310	0.15
311	0.15
312	0.2
313	0.18
314	0.18
315	0.2
316	0.23
317	0.29
318	0.34
319	0.34
320	0.34
321	0.41
322	0.41
323	0.4
324	0.42
325	0.43
326	0.42
327	0.44
328	0.39
329	0.35
330	0.41
331	0.46
332	0.48
333	0.43
334	0.47
335	0.51
336	0.55
337	0.51
338	0.45
339	0.44
340	0.38
341	0.36
342	0.31
343	0.25
344	0.2
345	0.2
346	0.2
347	0.17
348	0.16
349	0.14
350	0.12
351	0.14
352	0.19
353	0.2
354	0.21
355	0.2
356	0.2
357	0.21
358	0.19
359	0.15
360	0.11
361	0.09
362	0.09
363	0.1
364	0.09
365	0.07
366	0.09
367	0.09
368	0.09
369	0.08
370	0.08
371	0.07
372	0.07
373	0.06
374	0.05
375	0.08
376	0.08
377	0.09
378	0.11
379	0.14
380	0.16
381	0.18
382	0.18
383	0.17
384	0.19
385	0.2
386	0.24
387	0.23
388	0.25
389	0.25
390	0.25
391	0.23
392	0.22
393	0.19
394	0.13
395	0.1
396	0.07
397	0.06
398	0.07
399	0.07
400	0.08
401	0.08
402	0.08
403	0.08
404	0.09
405	0.09
406	0.08
407	0.08
408	0.07
409	0.08
410	0.09
411	0.09
412	0.1
413	0.15
414	0.19
415	0.29
416	0.38
417	0.4
418	0.48
419	0.53
420	0.55
421	0.57
422	0.61
423	0.61
424	0.62
425	0.64
426	0.6
427	0.6
428	0.56
429	0.49
430	0.41
431	0.32
432	0.24
433	0.2
434	0.15
435	0.11
436	0.1
437	0.09
438	0.1
439	0.11
440	0.11
441	0.14
442	0.15
443	0.18
444	0.22
445	0.29
446	0.36
447	0.45
448	0.53
449	0.57
450	0.64
451	0.66
452	0.69
453	0.66
454	0.61
455	0.52
456	0.5
457	0.5
458	0.5
459	0.52
460	0.54
461	0.56
462	0.61
463	0.65
464	0.62
465	0.67
466	0.69
467	0.72
468	0.75
469	0.79
470	0.79
471	0.82
472	0.78
473	0.69
474	0.59
475	0.49
476	0.38
477	0.3
478	0.23
479	0.17
480	0.14
481	0.12
482	0.11
483	0.11
484	0.13
485	0.12
486	0.11
487	0.1
488	0.1
489	0.15
490	0.2
491	0.21
492	0.21
493	0.21
494	0.24
495	0.23

A0A168BNU6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer