Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162JHJ6

Protein Details
Accession A0A162JHJ6    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
275-294SDEDEKPKSKPKTKATAKDSHydrophilic
312-336PPLPPAPTDKTKRKHNEPFSRISKDHydrophilic
362-386IITKGKGFTKAKNKMKKGCFRGGMIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 15, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSAPPPWLFSNNNTIAAPPRPTPDRRPPATTQTAMAKQSISAAPAPLMDVVEKFLKDHAFVAAHKAFREQRKAKGLAAKDKDAVTSAPALVDVFEAWQKASTKSDDDEDDDSESSESSDSSDSSDDDDSSSSSDESEAEEAPKKEEPAKSLKRKAPESDSSDSESSDSDSSSDSSDSDSDDEDDKKKPQAKKQKTATAQKHASDDKMDVDSDSDSDSSSGSSGSDSSSDSSSDSDSDSDSDSDSDSDAASEVAKAAAVALPESDSSSDSDSSSSSDEDEKPKSKPKTKATAKDSSDSSVTLDRASPVAAAEPPLPPAPTDKTKRKHNEPFSRISKDIKVDPRFASNEWVPMDYSQRAHEDLIITKGKGFTKAKNKMKKGCFRGGMIDITEKKAVYFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.35
3 0.37
4 0.37
5 0.3
6 0.32
7 0.36
8 0.42
9 0.5
10 0.56
11 0.62
12 0.63
13 0.68
14 0.68
15 0.7
16 0.73
17 0.65
18 0.58
19 0.56
20 0.56
21 0.51
22 0.46
23 0.36
24 0.28
25 0.31
26 0.28
27 0.22
28 0.18
29 0.17
30 0.16
31 0.16
32 0.17
33 0.13
34 0.12
35 0.1
36 0.09
37 0.11
38 0.14
39 0.14
40 0.13
41 0.16
42 0.16
43 0.17
44 0.17
45 0.18
46 0.18
47 0.18
48 0.26
49 0.27
50 0.27
51 0.27
52 0.32
53 0.35
54 0.4
55 0.5
56 0.47
57 0.51
58 0.59
59 0.61
60 0.6
61 0.61
62 0.61
63 0.6
64 0.61
65 0.56
66 0.5
67 0.47
68 0.43
69 0.36
70 0.3
71 0.21
72 0.17
73 0.14
74 0.11
75 0.11
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.07
80 0.06
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.11
85 0.12
86 0.14
87 0.17
88 0.18
89 0.2
90 0.21
91 0.24
92 0.22
93 0.24
94 0.24
95 0.22
96 0.22
97 0.2
98 0.19
99 0.16
100 0.14
101 0.11
102 0.09
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.09
109 0.08
110 0.11
111 0.11
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.08
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.09
124 0.08
125 0.1
126 0.14
127 0.14
128 0.16
129 0.18
130 0.18
131 0.21
132 0.23
133 0.24
134 0.3
135 0.4
136 0.47
137 0.55
138 0.57
139 0.59
140 0.62
141 0.63
142 0.6
143 0.58
144 0.55
145 0.5
146 0.48
147 0.45
148 0.41
149 0.36
150 0.29
151 0.22
152 0.17
153 0.13
154 0.11
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.1
168 0.12
169 0.13
170 0.15
171 0.15
172 0.2
173 0.26
174 0.3
175 0.37
176 0.47
177 0.55
178 0.63
179 0.69
180 0.73
181 0.74
182 0.79
183 0.77
184 0.75
185 0.69
186 0.61
187 0.57
188 0.49
189 0.42
190 0.33
191 0.27
192 0.2
193 0.16
194 0.15
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.08
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.12
263 0.15
264 0.19
265 0.24
266 0.25
267 0.28
268 0.37
269 0.44
270 0.5
271 0.56
272 0.61
273 0.67
274 0.74
275 0.8
276 0.79
277 0.8
278 0.74
279 0.7
280 0.62
281 0.54
282 0.45
283 0.35
284 0.3
285 0.23
286 0.2
287 0.16
288 0.16
289 0.14
290 0.13
291 0.13
292 0.11
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.1
297 0.11
298 0.11
299 0.13
300 0.14
301 0.14
302 0.12
303 0.16
304 0.21
305 0.28
306 0.36
307 0.44
308 0.51
309 0.61
310 0.7
311 0.77
312 0.81
313 0.83
314 0.86
315 0.83
316 0.85
317 0.82
318 0.8
319 0.71
320 0.66
321 0.6
322 0.53
323 0.55
324 0.55
325 0.52
326 0.51
327 0.51
328 0.52
329 0.5
330 0.46
331 0.45
332 0.37
333 0.38
334 0.34
335 0.33
336 0.28
337 0.26
338 0.3
339 0.25
340 0.25
341 0.23
342 0.24
343 0.25
344 0.24
345 0.25
346 0.23
347 0.23
348 0.28
349 0.28
350 0.25
351 0.26
352 0.3
353 0.29
354 0.34
355 0.36
356 0.38
357 0.46
358 0.57
359 0.65
360 0.71
361 0.78
362 0.8
363 0.87
364 0.88
365 0.86
366 0.85
367 0.8
368 0.73
369 0.7
370 0.64
371 0.57
372 0.49
373 0.49
374 0.41
375 0.4
376 0.39
377 0.32
378 0.28