Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A167JQM1

Protein Details
Accession A0A167JQM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
421-444AATEEEQPKKKKKKEGPGVAARNMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
428-437PKKKKKKEGP
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 10, cyto_nucl 7.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MSRQQASKRPKLDGGLALPQQSTGWATAALTPGRVYTPGQAANGGLALPAGGTTGYPRQQYPTPQPSQLQSQMDSAIDPSLQGTRCSSVYPPTVANLPPPTQRTASSSSQPSASQQQSQPRLSAQDQAAWDEYVRKYYEYYGVPPPVTTPGGQAAAASAFQQQSTAVAYQAYQQRMASQQSQSSSQSSQPAQQEAQQQTQQPPPYSQYAQQLLQQQQQQQQQAQYALPGSSVVRRGRPAAQKPENKETINDALGSAGVDLRAEEDAIHRTYDAVPGSYPAVLHPRDDRTRKQNFIPPNALMKRVTATASGHSIKTVSPDAASYIALAAQAHISTLLRGALAASKNRQPATNGVTRPPGLYPQPAASTSDPSAPPLPMWSQEITRDIGKQIAAIERVQRDNEIQARLKKREREEATNGNGDAATEEEQPKKKKKKEGPGVAARNMSEDVRKRLSDAVAMRAAGNTISKYSWLQAGAAAAAAPIQPLKKLNKDKPKEVETPAPVPPPTTAAGKKNAASGWGRAFQSLKEESKDNRRKVEVRDVIWAMEGRAGSGVPSGGTKGVGKGGRGGTRWRGWEAWGRIRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.53
3 0.49
4 0.45
5 0.4
6 0.36
7 0.3
8 0.24
9 0.21
10 0.13
11 0.12
12 0.1
13 0.11
14 0.13
15 0.18
16 0.17
17 0.16
18 0.15
19 0.15
20 0.16
21 0.17
22 0.16
23 0.16
24 0.22
25 0.24
26 0.25
27 0.24
28 0.23
29 0.22
30 0.21
31 0.16
32 0.1
33 0.06
34 0.05
35 0.04
36 0.04
37 0.04
38 0.03
39 0.03
40 0.07
41 0.13
42 0.17
43 0.2
44 0.21
45 0.25
46 0.3
47 0.38
48 0.45
49 0.49
50 0.5
51 0.53
52 0.56
53 0.55
54 0.58
55 0.57
56 0.5
57 0.42
58 0.39
59 0.36
60 0.33
61 0.29
62 0.22
63 0.16
64 0.12
65 0.1
66 0.09
67 0.13
68 0.14
69 0.15
70 0.16
71 0.17
72 0.18
73 0.2
74 0.21
75 0.21
76 0.24
77 0.25
78 0.24
79 0.23
80 0.26
81 0.25
82 0.28
83 0.27
84 0.27
85 0.3
86 0.32
87 0.34
88 0.32
89 0.33
90 0.33
91 0.35
92 0.36
93 0.37
94 0.39
95 0.37
96 0.37
97 0.36
98 0.34
99 0.36
100 0.34
101 0.34
102 0.34
103 0.42
104 0.48
105 0.49
106 0.47
107 0.4
108 0.43
109 0.38
110 0.4
111 0.32
112 0.29
113 0.29
114 0.3
115 0.29
116 0.24
117 0.23
118 0.21
119 0.21
120 0.2
121 0.2
122 0.18
123 0.17
124 0.19
125 0.25
126 0.22
127 0.26
128 0.28
129 0.31
130 0.3
131 0.29
132 0.28
133 0.26
134 0.25
135 0.21
136 0.16
137 0.16
138 0.17
139 0.16
140 0.15
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.1
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.1
152 0.1
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.13
157 0.19
158 0.19
159 0.18
160 0.18
161 0.19
162 0.23
163 0.26
164 0.25
165 0.22
166 0.24
167 0.24
168 0.27
169 0.27
170 0.26
171 0.25
172 0.23
173 0.26
174 0.24
175 0.27
176 0.27
177 0.28
178 0.26
179 0.29
180 0.34
181 0.32
182 0.36
183 0.33
184 0.34
185 0.35
186 0.4
187 0.39
188 0.33
189 0.31
190 0.3
191 0.32
192 0.31
193 0.31
194 0.32
195 0.32
196 0.31
197 0.33
198 0.37
199 0.35
200 0.38
201 0.37
202 0.35
203 0.38
204 0.42
205 0.41
206 0.37
207 0.35
208 0.33
209 0.31
210 0.27
211 0.21
212 0.17
213 0.14
214 0.11
215 0.1
216 0.08
217 0.09
218 0.15
219 0.15
220 0.17
221 0.18
222 0.21
223 0.27
224 0.35
225 0.4
226 0.45
227 0.53
228 0.57
229 0.62
230 0.66
231 0.64
232 0.56
233 0.5
234 0.43
235 0.37
236 0.32
237 0.26
238 0.18
239 0.13
240 0.13
241 0.12
242 0.08
243 0.04
244 0.04
245 0.03
246 0.03
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.12
259 0.11
260 0.09
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.08
266 0.06
267 0.11
268 0.11
269 0.12
270 0.14
271 0.19
272 0.25
273 0.3
274 0.34
275 0.39
276 0.45
277 0.47
278 0.48
279 0.48
280 0.47
281 0.49
282 0.48
283 0.4
284 0.42
285 0.4
286 0.38
287 0.33
288 0.28
289 0.23
290 0.2
291 0.19
292 0.12
293 0.12
294 0.11
295 0.15
296 0.15
297 0.14
298 0.13
299 0.13
300 0.12
301 0.13
302 0.13
303 0.09
304 0.08
305 0.08
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.07
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.08
327 0.1
328 0.12
329 0.14
330 0.18
331 0.22
332 0.23
333 0.23
334 0.21
335 0.24
336 0.28
337 0.32
338 0.29
339 0.28
340 0.3
341 0.3
342 0.29
343 0.25
344 0.23
345 0.18
346 0.18
347 0.18
348 0.17
349 0.18
350 0.18
351 0.21
352 0.18
353 0.2
354 0.19
355 0.22
356 0.2
357 0.2
358 0.21
359 0.18
360 0.17
361 0.15
362 0.16
363 0.13
364 0.15
365 0.15
366 0.14
367 0.16
368 0.18
369 0.18
370 0.18
371 0.17
372 0.15
373 0.16
374 0.14
375 0.13
376 0.13
377 0.14
378 0.14
379 0.14
380 0.18
381 0.2
382 0.22
383 0.21
384 0.21
385 0.19
386 0.23
387 0.26
388 0.27
389 0.29
390 0.35
391 0.41
392 0.47
393 0.53
394 0.55
395 0.55
396 0.6
397 0.61
398 0.62
399 0.62
400 0.63
401 0.61
402 0.58
403 0.53
404 0.43
405 0.36
406 0.28
407 0.21
408 0.14
409 0.12
410 0.11
411 0.13
412 0.19
413 0.25
414 0.32
415 0.41
416 0.5
417 0.55
418 0.63
419 0.7
420 0.76
421 0.81
422 0.86
423 0.86
424 0.86
425 0.85
426 0.79
427 0.71
428 0.6
429 0.51
430 0.41
431 0.32
432 0.28
433 0.26
434 0.28
435 0.3
436 0.3
437 0.29
438 0.32
439 0.32
440 0.32
441 0.3
442 0.29
443 0.27
444 0.27
445 0.26
446 0.22
447 0.21
448 0.16
449 0.15
450 0.1
451 0.09
452 0.09
453 0.11
454 0.11
455 0.12
456 0.15
457 0.14
458 0.13
459 0.13
460 0.13
461 0.12
462 0.11
463 0.09
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.05
468 0.06
469 0.06
470 0.08
471 0.14
472 0.2
473 0.29
474 0.4
475 0.49
476 0.59
477 0.66
478 0.73
479 0.77
480 0.78
481 0.75
482 0.7
483 0.7
484 0.64
485 0.61
486 0.56
487 0.52
488 0.44
489 0.39
490 0.34
491 0.28
492 0.25
493 0.27
494 0.28
495 0.29
496 0.35
497 0.38
498 0.38
499 0.39
500 0.37
501 0.35
502 0.33
503 0.32
504 0.31
505 0.33
506 0.33
507 0.31
508 0.31
509 0.28
510 0.32
511 0.34
512 0.32
513 0.29
514 0.34
515 0.38
516 0.48
517 0.57
518 0.57
519 0.58
520 0.63
521 0.65
522 0.68
523 0.73
524 0.69
525 0.62
526 0.64
527 0.57
528 0.5
529 0.46
530 0.4
531 0.29
532 0.24
533 0.21
534 0.14
535 0.13
536 0.12
537 0.1
538 0.1
539 0.1
540 0.07
541 0.08
542 0.09
543 0.09
544 0.11
545 0.12
546 0.12
547 0.19
548 0.21
549 0.21
550 0.26
551 0.31
552 0.35
553 0.37
554 0.42
555 0.43
556 0.47
557 0.51
558 0.49
559 0.44
560 0.43
561 0.5
562 0.52