FuNGI

G2XIZ8

Protein Details

Accession

G2XIZ8

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
36-58	GDPLVARRRPQPKSNAPRPKAAG	Hydrophilic
556-578	SETESTLRKKKLKKNGSSVQVSR	Hydrophilic
678-704	GPLNPGRSSRRCHRRAYRQKNSTDAST	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
26-58	RPAPIKRRAKGDPLVARRRPQPKSNAPRPKAAG
539-546	RKGKSLKR
563-569	RKKKLKK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	vda:VDAG_10130 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSAPPSGLPNGQAQDQKPNPTGQQPRPAPIKRRAKGDPLVARRRPQPKSNAPRPKAAGAASSSRATPPSAALRPEVHTAGLLSRIANNRSKTAANGGWTEPLPPGGREWKIVTTKRALMEGTRHHVMRFSSSRIEKEKLHIDPTDQNDFTRPVTLQRRDPRQPAAGREVKPEEEEPEPEPNPEDEKEAERIAQLKAEKDAWKAMEAAKSAPAIKDPNASTRTKQPKQEDRGVQFHRAPRSEKERKQQSLRYEEALPWHIEDADGKHVWVGSYVAPLSETTVCLVPTTDGKFAMTPLEKWYKFQPKPNFTTMRIEEAEALMKQQSGVSRWHMQAQEKKAGQKDLEDWRRFKNGPSRIKTESSTFRGVSKSEKMDHDEIDFEGDEFQDDDEAPNFEPDNDEDQKESAERIKREQLGANVFGEGDEGKVDQEELETRLLEESRKREGKTINKALVKREKETIYKKDSDDEDGNRYFGPSDEEDSDDESKDGEDEANKKDEDKASSQDPSAQSQDANGAKDKDANSKGTLTPSGKQKEADATRKGKSLKRPGSPNLSESSETESTLRKKKLKKNGSSVQVSRSGTPLPSGHKHKVGMSSMSDGEATGGEMSDGQQRKKKIKLLGTGARGTPTGSRAGSPAPAGAAGSTFRPLEENMDQADKTSQVHPRRARIRVPAHPPDPGPLNPGRSSRRCHRRAYRQKNSTDASTNVLVMDRAKHLKLDGSTS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.43
3	0.48
4	0.45
5	0.47
6	0.46
7	0.5
8	0.58
9	0.56
10	0.62
11	0.59
12	0.64
13	0.69
14	0.74
15	0.73
16	0.73
17	0.76
18	0.71
19	0.75
20	0.74
21	0.72
22	0.71
23	0.73
24	0.73
25	0.72
26	0.77
27	0.75
28	0.75
29	0.75
30	0.78
31	0.75
32	0.73
33	0.73
34	0.74
35	0.79
36	0.84
37	0.86
38	0.8
39	0.82
40	0.78
41	0.71
42	0.64
43	0.55
44	0.48
45	0.41
46	0.43
47	0.37
48	0.33
49	0.3
50	0.27
51	0.27
52	0.24
53	0.21
54	0.2
55	0.25
56	0.28
57	0.29
58	0.31
59	0.33
60	0.34
61	0.37
62	0.34
63	0.26
64	0.22
65	0.21
66	0.19
67	0.18
68	0.16
69	0.13
70	0.17
71	0.22
72	0.26
73	0.32
74	0.33
75	0.33
76	0.35
77	0.36
78	0.32
79	0.35
80	0.33
81	0.3
82	0.31
83	0.29
84	0.3
85	0.29
86	0.28
87	0.21
88	0.22
89	0.2
90	0.17
91	0.2
92	0.24
93	0.25
94	0.27
95	0.3
96	0.34
97	0.41
98	0.45
99	0.46
100	0.44
101	0.47
102	0.46
103	0.45
104	0.38
105	0.33
106	0.36
107	0.38
108	0.38
109	0.38
110	0.37
111	0.34
112	0.37
113	0.35
114	0.36
115	0.33
116	0.31
117	0.35
118	0.38
119	0.44
120	0.46
121	0.48
122	0.42
123	0.44
124	0.48
125	0.43
126	0.44
127	0.39
128	0.38
129	0.41
130	0.44
131	0.46
132	0.38
133	0.36
134	0.34
135	0.35
136	0.32
137	0.28
138	0.23
139	0.23
140	0.32
141	0.37
142	0.43
143	0.5
144	0.59
145	0.63
146	0.67
147	0.65
148	0.64
149	0.64
150	0.6
151	0.61
152	0.59
153	0.54
154	0.55
155	0.53
156	0.46
157	0.44
158	0.39
159	0.33
160	0.27
161	0.28
162	0.24
163	0.27
164	0.27
165	0.24
166	0.25
167	0.23
168	0.24
169	0.23
170	0.23
171	0.18
172	0.2
173	0.23
174	0.21
175	0.2
176	0.18
177	0.2
178	0.17
179	0.2
180	0.18
181	0.17
182	0.19
183	0.23
184	0.24
185	0.23
186	0.27
187	0.24
188	0.23
189	0.23
190	0.23
191	0.22
192	0.21
193	0.2
194	0.18
195	0.19
196	0.18
197	0.17
198	0.17
199	0.16
200	0.16
201	0.21
202	0.2
203	0.26
204	0.29
205	0.31
206	0.31
207	0.39
208	0.48
209	0.48
210	0.55
211	0.57
212	0.63
213	0.68
214	0.76
215	0.74
216	0.69
217	0.73
218	0.68
219	0.64
220	0.59
221	0.56
222	0.53
223	0.48
224	0.46
225	0.43
226	0.5
227	0.55
228	0.57
229	0.62
230	0.66
231	0.7
232	0.74
233	0.74
234	0.71
235	0.69
236	0.64
237	0.57
238	0.48
239	0.42
240	0.38
241	0.35
242	0.27
243	0.19
244	0.17
245	0.14
246	0.13
247	0.12
248	0.11
249	0.13
250	0.13
251	0.12
252	0.12
253	0.12
254	0.12
255	0.12
256	0.11
257	0.06
258	0.08
259	0.08
260	0.07
261	0.08
262	0.08
263	0.09
264	0.09
265	0.08
266	0.08
267	0.09
268	0.09
269	0.08
270	0.09
271	0.07
272	0.1
273	0.12
274	0.12
275	0.11
276	0.12
277	0.12
278	0.12
279	0.16
280	0.14
281	0.12
282	0.16
283	0.24
284	0.24
285	0.25
286	0.33
287	0.39
288	0.42
289	0.5
290	0.55
291	0.54
292	0.59
293	0.66
294	0.62
295	0.54
296	0.59
297	0.51
298	0.46
299	0.39
300	0.35
301	0.27
302	0.23
303	0.22
304	0.14
305	0.13
306	0.08
307	0.07
308	0.07
309	0.08
310	0.08
311	0.09
312	0.11
313	0.15
314	0.19
315	0.19
316	0.24
317	0.25
318	0.29
319	0.34
320	0.36
321	0.4
322	0.37
323	0.4
324	0.38
325	0.38
326	0.33
327	0.28
328	0.29
329	0.31
330	0.39
331	0.39
332	0.39
333	0.4
334	0.44
335	0.43
336	0.42
337	0.41
338	0.41
339	0.46
340	0.49
341	0.51
342	0.5
343	0.52
344	0.49
345	0.45
346	0.42
347	0.37
348	0.35
349	0.3
350	0.28
351	0.27
352	0.26
353	0.25
354	0.23
355	0.22
356	0.22
357	0.23
358	0.26
359	0.26
360	0.26
361	0.23
362	0.2
363	0.17
364	0.15
365	0.14
366	0.09
367	0.08
368	0.07
369	0.06
370	0.05
371	0.05
372	0.04
373	0.04
374	0.05
375	0.05
376	0.06
377	0.06
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.08
382	0.09
383	0.14
384	0.14
385	0.15
386	0.15
387	0.15
388	0.15
389	0.15
390	0.14
391	0.14
392	0.18
393	0.19
394	0.22
395	0.28
396	0.29
397	0.31
398	0.33
399	0.31
400	0.29
401	0.3
402	0.26
403	0.2
404	0.18
405	0.16
406	0.13
407	0.09
408	0.06
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.04
416	0.06
417	0.07
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.09
422	0.1
423	0.11
424	0.14
425	0.16
426	0.24
427	0.28
428	0.29
429	0.33
430	0.4
431	0.47
432	0.53
433	0.58
434	0.57
435	0.58
436	0.59
437	0.62
438	0.63
439	0.58
440	0.5
441	0.47
442	0.44
443	0.46
444	0.52
445	0.51
446	0.49
447	0.5
448	0.48
449	0.48
450	0.45
451	0.43
452	0.4
453	0.36
454	0.35
455	0.31
456	0.31
457	0.26
458	0.24
459	0.19
460	0.15
461	0.16
462	0.11
463	0.14
464	0.14
465	0.16
466	0.16
467	0.19
468	0.2
469	0.16
470	0.15
471	0.12
472	0.11
473	0.1
474	0.09
475	0.07
476	0.09
477	0.12
478	0.15
479	0.19
480	0.19
481	0.19
482	0.23
483	0.25
484	0.26
485	0.26
486	0.27
487	0.27
488	0.29
489	0.28
490	0.3
491	0.28
492	0.28
493	0.27
494	0.24
495	0.2
496	0.19
497	0.25
498	0.21
499	0.21
500	0.21
501	0.2
502	0.2
503	0.24
504	0.25
505	0.27
506	0.28
507	0.29
508	0.28
509	0.29
510	0.3
511	0.29
512	0.33
513	0.27
514	0.29
515	0.35
516	0.37
517	0.36
518	0.35
519	0.34
520	0.38
521	0.43
522	0.46
523	0.45
524	0.47
525	0.47
526	0.52
527	0.55
528	0.51
529	0.53
530	0.57
531	0.58
532	0.6
533	0.66
534	0.67
535	0.72
536	0.69
537	0.62
538	0.55
539	0.49
540	0.43
541	0.36
542	0.37
543	0.27
544	0.25
545	0.24
546	0.26
547	0.28
548	0.36
549	0.42
550	0.42
551	0.51
552	0.6
553	0.7
554	0.75
555	0.78
556	0.8
557	0.82
558	0.83
559	0.82
560	0.75
561	0.69
562	0.65
563	0.57
564	0.47
565	0.41
566	0.33
567	0.25
568	0.26
569	0.24
570	0.23
571	0.29
572	0.36
573	0.39
574	0.42
575	0.44
576	0.44
577	0.48
578	0.45
579	0.41
580	0.36
581	0.35
582	0.3
583	0.29
584	0.25
585	0.19
586	0.16
587	0.12
588	0.1
589	0.06
590	0.06
591	0.05
592	0.05
593	0.07
594	0.14
595	0.18
596	0.21
597	0.26
598	0.32
599	0.39
600	0.46
601	0.52
602	0.53
603	0.58
604	0.63
605	0.67
606	0.7
607	0.69
608	0.66
609	0.6
610	0.52
611	0.44
612	0.36
613	0.29
614	0.22
615	0.21
616	0.18
617	0.17
618	0.18
619	0.19
620	0.2
621	0.18
622	0.17
623	0.13
624	0.13
625	0.12
626	0.11
627	0.1
628	0.09
629	0.09
630	0.11
631	0.1
632	0.1
633	0.12
634	0.12
635	0.18
636	0.19
637	0.21
638	0.21
639	0.25
640	0.24
641	0.24
642	0.25
643	0.2
644	0.2
645	0.23
646	0.29
647	0.33
648	0.44
649	0.49
650	0.57
651	0.65
652	0.69
653	0.7
654	0.72
655	0.73
656	0.73
657	0.76
658	0.76
659	0.7
660	0.68
661	0.62
662	0.57
663	0.53
664	0.45
665	0.41
666	0.36
667	0.39
668	0.38
669	0.45
670	0.49
671	0.49
672	0.56
673	0.61
674	0.67
675	0.68
676	0.75
677	0.78
678	0.81
679	0.86
680	0.9
681	0.9
682	0.89
683	0.88
684	0.86
685	0.8
686	0.75
687	0.69
688	0.6
689	0.53
690	0.46
691	0.4
692	0.32
693	0.27
694	0.22
695	0.18
696	0.2
697	0.21
698	0.24
699	0.24
700	0.25
701	0.26
702	0.31

G2XIZ8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer