FuNGI

A0A167QRG6

Protein Details

Accession

A0A167QRG6

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
14-37	MELKPLGRRQQPVRPPPPRPAPSR	Hydrophilic
97-121	PMDWIRPVKLNRKELKKNYKAVDKI	Hydrophilic
159-189	PKDNGKGKDKDQPKRKFKRTKTRQVFRVSDE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
26-35	VRPPPPRPAP
155-181	GRARPKDNGKGKDKDQPKRKFKRTKTR
348-351	RRRE

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MASRIKAEFKNDPMELKPLGRRQQPVRPPPPRPAPSRPGQSKAFVQPDIKPKVESKPLPEDPPGTYTDFVITSSGISEWRHDMMRFRPTNMNQVVNPMDWIRPVKLNRKELKKNYKAVDKIEPARPLLGLDGKPVVGPDGKIVMVGGPDGLLPNGRARPKDNGKGKDKDQPKRKFKRTKTRQVFRVSDEVRAVRREERHPWVMESADGAHVWEGRLEDRGPQLQVLLFQSQKEGFVAVPLSKWYTFKEPPKHTILTLDQAEQFEKDLAKSSDIQRWMMRKTGGRVSEATQLTLKRESSAEPARPRANADGSIHARSGARMLQVRTGNAADYGDQGDDDEGAEGAGSRRRRERERGGGGDGDYDEFEYEEEFQDDDEGAILPDDEEEDEETKALKEKEARMMRAANAVNDENRMDEDGQEEDEDEDEDELNDAGKAMKKALKLWEKGAYADEDDDDNKNPYLSSEEEEEEEGTESGSSTPLPTGVLPQASTPGKSGTPRPNGSASKPTSRNISRAGSPVGGRSSNGISGASVLAHRATSPPPGTSRLPAVGGVAARALSPLAAEAGGRRASSPPRTAPAASSLKRKAPDDVSSPPGGRGSSPGPTTAASPGSSNTPNKRPRTLPRVAVPASLVFDKAIPPGPIIAFLRMKPRTTGDCVKNFKDWFKEDARNKNVLSFWIKQIAKLDNSSGESVLKLHDDAKLAQMGIEF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.41
3	0.39
4	0.42
5	0.43
6	0.5
7	0.53
8	0.59
9	0.61
10	0.69
11	0.74
12	0.77
13	0.79
14	0.8
15	0.79
16	0.81
17	0.85
18	0.82
19	0.79
20	0.78
21	0.75
22	0.74
23	0.8
24	0.77
25	0.72
26	0.69
27	0.66
28	0.63
29	0.64
30	0.61
31	0.54
32	0.5
33	0.51
34	0.56
35	0.58
36	0.53
37	0.47
38	0.44
39	0.49
40	0.55
41	0.53
42	0.5
43	0.54
44	0.58
45	0.59
46	0.6
47	0.54
48	0.47
49	0.46
50	0.41
51	0.34
52	0.29
53	0.25
54	0.23
55	0.2
56	0.18
57	0.15
58	0.13
59	0.1
60	0.1
61	0.1
62	0.1
63	0.11
64	0.13
65	0.15
66	0.17
67	0.2
68	0.2
69	0.25
70	0.29
71	0.39
72	0.39
73	0.41
74	0.47
75	0.47
76	0.56
77	0.55
78	0.53
79	0.43
80	0.47
81	0.45
82	0.36
83	0.35
84	0.27
85	0.23
86	0.22
87	0.24
88	0.21
89	0.26
90	0.31
91	0.39
92	0.47
93	0.56
94	0.62
95	0.69
96	0.77
97	0.81
98	0.86
99	0.85
100	0.84
101	0.81
102	0.82
103	0.76
104	0.71
105	0.7
106	0.66
107	0.64
108	0.62
109	0.57
110	0.49
111	0.45
112	0.4
113	0.31
114	0.27
115	0.26
116	0.2
117	0.19
118	0.19
119	0.18
120	0.18
121	0.17
122	0.16
123	0.12
124	0.12
125	0.11
126	0.12
127	0.12
128	0.12
129	0.12
130	0.1
131	0.09
132	0.08
133	0.07
134	0.05
135	0.05
136	0.05
137	0.05
138	0.05
139	0.06
140	0.1
141	0.16
142	0.19
143	0.21
144	0.25
145	0.34
146	0.43
147	0.51
148	0.56
149	0.6
150	0.65
151	0.7
152	0.7
153	0.69
154	0.7
155	0.7
156	0.72
157	0.73
158	0.76
159	0.81
160	0.88
161	0.89
162	0.9
163	0.92
164	0.93
165	0.93
166	0.93
167	0.92
168	0.9
169	0.88
170	0.82
171	0.75
172	0.74
173	0.63
174	0.56
175	0.5
176	0.45
177	0.38
178	0.36
179	0.34
180	0.29
181	0.33
182	0.35
183	0.38
184	0.43
185	0.46
186	0.45
187	0.45
188	0.41
189	0.36
190	0.31
191	0.25
192	0.19
193	0.14
194	0.12
195	0.1
196	0.09
197	0.09
198	0.08
199	0.08
200	0.08
201	0.08
202	0.1
203	0.1
204	0.12
205	0.15
206	0.17
207	0.17
208	0.16
209	0.16
210	0.14
211	0.16
212	0.16
213	0.16
214	0.14
215	0.14
216	0.16
217	0.15
218	0.15
219	0.13
220	0.12
221	0.08
222	0.09
223	0.1
224	0.08
225	0.09
226	0.09
227	0.11
228	0.12
229	0.13
230	0.14
231	0.2
232	0.26
233	0.34
234	0.43
235	0.46
236	0.5
237	0.55
238	0.54
239	0.47
240	0.46
241	0.4
242	0.36
243	0.32
244	0.29
245	0.24
246	0.24
247	0.24
248	0.19
249	0.17
250	0.12
251	0.11
252	0.1
253	0.12
254	0.12
255	0.14
256	0.17
257	0.19
258	0.23
259	0.24
260	0.26
261	0.25
262	0.28
263	0.28
264	0.28
265	0.29
266	0.26
267	0.29
268	0.33
269	0.31
270	0.29
271	0.29
272	0.28
273	0.33
274	0.3
275	0.27
276	0.23
277	0.22
278	0.23
279	0.24
280	0.21
281	0.14
282	0.15
283	0.15
284	0.19
285	0.25
286	0.29
287	0.29
288	0.34
289	0.34
290	0.34
291	0.35
292	0.31
293	0.27
294	0.24
295	0.22
296	0.25
297	0.25
298	0.26
299	0.24
300	0.22
301	0.2
302	0.17
303	0.17
304	0.11
305	0.11
306	0.13
307	0.14
308	0.18
309	0.2
310	0.2
311	0.2
312	0.19
313	0.16
314	0.14
315	0.13
316	0.08
317	0.08
318	0.08
319	0.06
320	0.06
321	0.06
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.04
326	0.03
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.04
331	0.08
332	0.09
333	0.11
334	0.16
335	0.21
336	0.26
337	0.34
338	0.41
339	0.48
340	0.53
341	0.54
342	0.51
343	0.48
344	0.43
345	0.36
346	0.28
347	0.18
348	0.11
349	0.08
350	0.06
351	0.05
352	0.05
353	0.04
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.06
360	0.06
361	0.05
362	0.05
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.03
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.03
372	0.04
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.1
379	0.1
380	0.11
381	0.14
382	0.17
383	0.27
384	0.31
385	0.32
386	0.31
387	0.33
388	0.31
389	0.33
390	0.31
391	0.22
392	0.2
393	0.2
394	0.18
395	0.17
396	0.16
397	0.1
398	0.1
399	0.11
400	0.08
401	0.08
402	0.09
403	0.08
404	0.09
405	0.08
406	0.08
407	0.07
408	0.07
409	0.07
410	0.06
411	0.06
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.04
418	0.04
419	0.05
420	0.08
421	0.08
422	0.1
423	0.13
424	0.14
425	0.18
426	0.26
427	0.33
428	0.32
429	0.36
430	0.4
431	0.37
432	0.37
433	0.35
434	0.28
435	0.21
436	0.19
437	0.16
438	0.11
439	0.12
440	0.12
441	0.12
442	0.12
443	0.12
444	0.11
445	0.11
446	0.1
447	0.12
448	0.12
449	0.13
450	0.14
451	0.15
452	0.15
453	0.16
454	0.16
455	0.13
456	0.12
457	0.1
458	0.07
459	0.07
460	0.06
461	0.06
462	0.06
463	0.05
464	0.05
465	0.05
466	0.05
467	0.06
468	0.06
469	0.08
470	0.1
471	0.11
472	0.11
473	0.11
474	0.16
475	0.16
476	0.17
477	0.15
478	0.15
479	0.16
480	0.18
481	0.25
482	0.29
483	0.37
484	0.38
485	0.4
486	0.45
487	0.46
488	0.49
489	0.5
490	0.45
491	0.46
492	0.47
493	0.46
494	0.47
495	0.47
496	0.47
497	0.43
498	0.42
499	0.36
500	0.36
501	0.37
502	0.3
503	0.28
504	0.27
505	0.25
506	0.22
507	0.19
508	0.18
509	0.17
510	0.16
511	0.16
512	0.13
513	0.1
514	0.1
515	0.11
516	0.09
517	0.07
518	0.07
519	0.07
520	0.07
521	0.07
522	0.08
523	0.09
524	0.15
525	0.16
526	0.18
527	0.2
528	0.25
529	0.27
530	0.27
531	0.29
532	0.25
533	0.25
534	0.22
535	0.21
536	0.18
537	0.16
538	0.14
539	0.11
540	0.09
541	0.08
542	0.08
543	0.07
544	0.04
545	0.04
546	0.04
547	0.04
548	0.04
549	0.05
550	0.05
551	0.1
552	0.11
553	0.11
554	0.12
555	0.15
556	0.21
557	0.27
558	0.32
559	0.32
560	0.35
561	0.38
562	0.38
563	0.36
564	0.39
565	0.42
566	0.4
567	0.44
568	0.45
569	0.47
570	0.49
571	0.49
572	0.47
573	0.43
574	0.45
575	0.42
576	0.43
577	0.43
578	0.43
579	0.42
580	0.37
581	0.33
582	0.28
583	0.23
584	0.21
585	0.19
586	0.21
587	0.22
588	0.22
589	0.21
590	0.21
591	0.23
592	0.22
593	0.21
594	0.16
595	0.16
596	0.16
597	0.19
598	0.24
599	0.29
600	0.33
601	0.41
602	0.49
603	0.54
604	0.6
605	0.63
606	0.67
607	0.7
608	0.71
609	0.7
610	0.68
611	0.71
612	0.65
613	0.59
614	0.51
615	0.43
616	0.38
617	0.31
618	0.24
619	0.16
620	0.15
621	0.14
622	0.15
623	0.17
624	0.15
625	0.15
626	0.18
627	0.17
628	0.21
629	0.22
630	0.25
631	0.24
632	0.25
633	0.34
634	0.35
635	0.37
636	0.35
637	0.39
638	0.39
639	0.44
640	0.52
641	0.51
642	0.57
643	0.63
644	0.63
645	0.65
646	0.63
647	0.61
648	0.59
649	0.54
650	0.51
651	0.52
652	0.58
653	0.59
654	0.67
655	0.67
656	0.65
657	0.62
658	0.61
659	0.54
660	0.51
661	0.48
662	0.42
663	0.4
664	0.44
665	0.43
666	0.4
667	0.44
668	0.45
669	0.42
670	0.41
671	0.39
672	0.34
673	0.38
674	0.37
675	0.32
676	0.26
677	0.22
678	0.21
679	0.19
680	0.16
681	0.14
682	0.14
683	0.16
684	0.19
685	0.19
686	0.23
687	0.24
688	0.22

A0A167QRG6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer