Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165TMV8

Protein Details
Accession A0A165TMV8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21ATTARQPKPQRKGGAPEPAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-16QRKGGA
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.833, mito 6.5, cyto_mito 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
Amino Acid Sequences MATTARQPKPQRKGGAPEPAARRAPAWSNPRASPTYSPNTANARLPNGAPAASPGAFPPLSQPNGSGNTPPPRAQPDAPHDRVLSQLSGLIGTTITLTTKTHVRYEGSVASTSGEGDTTGVTLRDVKEISNAGAPLRETLFIASTNIDQWSSGPADAKPPTTNGDSFKTDTDISKTASRRERELQAWQPSDDTTAAPGAGAAGALGPAANGAVRDDVTFGPGASNGGSWNQFEVNERLFGVKANFDEDVYTTKLDRSAPNFKERERWAAGIANEILQSQTGNVHVAEERTTDFVGEGKDEEDKYGAVVRGANAYVPPGARKPGQPGPAPTPGAKQDVPRVAVNAPDGTAVSSDKEKEKAADVAKAGSPAPGTNKPTADAVPAFRDFVSNEKDRLMKKKQALMKNEMERRLAELVKFGQSFKLNKPIPEDLVPILAKDEEKQRQIKEKSTKDAESTQARSISTSATLTVSPSASRALASPNTSANPPSSAKPPAATAKGAAATAKPAASKEAKGRISMVIQAIPPFKGKRAGAAPTPAAAPTGQRPGVASPLSPTAANRLNVNASSFRPTVKSVSPPAGSPNPNGTASSTASPKVKAAEGSASPTQGPPNPFFGTRLLKKGVVVHIKEDFNPFKHHKVIDANLVGPNWPYSGKRYMQMFPPLPQPQQQSPPMAHPPPPSMQPPPSYEPPEDAAAQAAARGYVYAYPPYYPGQYAQPMMPGMPPPPPGAYIPAGPPFMQPMPYAHMPPNAMYPGTPMGQMPPPQAYMQQAPPPGYPVPPNGAGPRPSMPPTPIPSHTHPYYQQSPQLQHAVPYPMMMPPPGPPHAYDPSQAPPMGGVGHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.8
3 0.74
4 0.73
5 0.7
6 0.69
7 0.64
8 0.56
9 0.48
10 0.42
11 0.43
12 0.44
13 0.45
14 0.45
15 0.49
16 0.51
17 0.56
18 0.54
19 0.51
20 0.49
21 0.49
22 0.49
23 0.48
24 0.48
25 0.48
26 0.51
27 0.51
28 0.5
29 0.46
30 0.43
31 0.4
32 0.38
33 0.36
34 0.31
35 0.28
36 0.22
37 0.21
38 0.21
39 0.19
40 0.19
41 0.15
42 0.19
43 0.18
44 0.18
45 0.21
46 0.24
47 0.27
48 0.27
49 0.29
50 0.29
51 0.34
52 0.35
53 0.33
54 0.33
55 0.38
56 0.42
57 0.42
58 0.41
59 0.42
60 0.47
61 0.47
62 0.49
63 0.5
64 0.56
65 0.58
66 0.57
67 0.52
68 0.47
69 0.46
70 0.4
71 0.31
72 0.21
73 0.19
74 0.15
75 0.15
76 0.14
77 0.11
78 0.08
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.08
85 0.1
86 0.16
87 0.18
88 0.21
89 0.24
90 0.27
91 0.28
92 0.33
93 0.36
94 0.33
95 0.31
96 0.27
97 0.25
98 0.22
99 0.2
100 0.15
101 0.1
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.1
110 0.11
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.18
115 0.2
116 0.21
117 0.21
118 0.2
119 0.17
120 0.18
121 0.18
122 0.16
123 0.16
124 0.15
125 0.12
126 0.13
127 0.13
128 0.12
129 0.13
130 0.12
131 0.11
132 0.12
133 0.13
134 0.11
135 0.1
136 0.1
137 0.13
138 0.13
139 0.13
140 0.14
141 0.13
142 0.2
143 0.22
144 0.24
145 0.22
146 0.22
147 0.25
148 0.27
149 0.3
150 0.27
151 0.3
152 0.31
153 0.32
154 0.31
155 0.3
156 0.27
157 0.26
158 0.27
159 0.24
160 0.23
161 0.28
162 0.3
163 0.35
164 0.42
165 0.42
166 0.43
167 0.47
168 0.5
169 0.48
170 0.54
171 0.55
172 0.56
173 0.56
174 0.51
175 0.46
176 0.39
177 0.38
178 0.29
179 0.21
180 0.13
181 0.11
182 0.1
183 0.09
184 0.09
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.02
194 0.02
195 0.02
196 0.03
197 0.03
198 0.04
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.08
214 0.1
215 0.09
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.14
220 0.17
221 0.16
222 0.16
223 0.16
224 0.16
225 0.15
226 0.16
227 0.14
228 0.13
229 0.12
230 0.14
231 0.13
232 0.12
233 0.13
234 0.12
235 0.14
236 0.13
237 0.14
238 0.12
239 0.12
240 0.14
241 0.16
242 0.19
243 0.23
244 0.31
245 0.34
246 0.42
247 0.44
248 0.43
249 0.49
250 0.48
251 0.49
252 0.42
253 0.4
254 0.33
255 0.35
256 0.34
257 0.29
258 0.27
259 0.2
260 0.17
261 0.16
262 0.13
263 0.09
264 0.09
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.06
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.09
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.1
286 0.1
287 0.11
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.12
292 0.11
293 0.09
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.11
298 0.11
299 0.08
300 0.08
301 0.09
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.12
306 0.13
307 0.15
308 0.21
309 0.26
310 0.31
311 0.32
312 0.35
313 0.38
314 0.42
315 0.42
316 0.36
317 0.33
318 0.3
319 0.31
320 0.28
321 0.25
322 0.25
323 0.27
324 0.29
325 0.26
326 0.26
327 0.22
328 0.22
329 0.21
330 0.16
331 0.12
332 0.09
333 0.09
334 0.07
335 0.08
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.09
340 0.1
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.14
345 0.18
346 0.18
347 0.2
348 0.19
349 0.19
350 0.19
351 0.19
352 0.17
353 0.13
354 0.11
355 0.09
356 0.13
357 0.16
358 0.19
359 0.2
360 0.21
361 0.21
362 0.22
363 0.21
364 0.19
365 0.15
366 0.14
367 0.15
368 0.15
369 0.15
370 0.13
371 0.14
372 0.12
373 0.14
374 0.18
375 0.16
376 0.16
377 0.18
378 0.21
379 0.23
380 0.3
381 0.33
382 0.34
383 0.37
384 0.42
385 0.48
386 0.51
387 0.54
388 0.53
389 0.55
390 0.56
391 0.57
392 0.52
393 0.46
394 0.39
395 0.36
396 0.32
397 0.26
398 0.18
399 0.15
400 0.14
401 0.16
402 0.17
403 0.14
404 0.14
405 0.17
406 0.19
407 0.19
408 0.28
409 0.26
410 0.26
411 0.31
412 0.3
413 0.29
414 0.27
415 0.27
416 0.18
417 0.2
418 0.19
419 0.14
420 0.13
421 0.11
422 0.1
423 0.1
424 0.16
425 0.16
426 0.21
427 0.25
428 0.27
429 0.36
430 0.39
431 0.46
432 0.49
433 0.5
434 0.52
435 0.53
436 0.52
437 0.45
438 0.46
439 0.42
440 0.38
441 0.36
442 0.31
443 0.28
444 0.27
445 0.25
446 0.22
447 0.18
448 0.13
449 0.11
450 0.09
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.07
457 0.07
458 0.08
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.09
463 0.11
464 0.13
465 0.13
466 0.14
467 0.15
468 0.15
469 0.15
470 0.13
471 0.14
472 0.14
473 0.15
474 0.17
475 0.18
476 0.18
477 0.18
478 0.2
479 0.21
480 0.22
481 0.2
482 0.17
483 0.17
484 0.17
485 0.16
486 0.14
487 0.1
488 0.09
489 0.09
490 0.09
491 0.08
492 0.07
493 0.11
494 0.13
495 0.15
496 0.19
497 0.27
498 0.27
499 0.27
500 0.28
501 0.26
502 0.25
503 0.26
504 0.21
505 0.15
506 0.14
507 0.16
508 0.16
509 0.15
510 0.17
511 0.15
512 0.15
513 0.19
514 0.19
515 0.21
516 0.24
517 0.27
518 0.27
519 0.3
520 0.29
521 0.24
522 0.24
523 0.19
524 0.16
525 0.12
526 0.11
527 0.1
528 0.15
529 0.15
530 0.14
531 0.15
532 0.16
533 0.19
534 0.18
535 0.16
536 0.12
537 0.14
538 0.15
539 0.14
540 0.13
541 0.14
542 0.19
543 0.19
544 0.18
545 0.18
546 0.19
547 0.19
548 0.21
549 0.19
550 0.15
551 0.2
552 0.19
553 0.19
554 0.19
555 0.2
556 0.22
557 0.22
558 0.26
559 0.24
560 0.29
561 0.29
562 0.27
563 0.31
564 0.34
565 0.33
566 0.3
567 0.31
568 0.29
569 0.29
570 0.29
571 0.24
572 0.21
573 0.21
574 0.21
575 0.18
576 0.18
577 0.19
578 0.19
579 0.19
580 0.18
581 0.17
582 0.16
583 0.16
584 0.18
585 0.17
586 0.22
587 0.22
588 0.2
589 0.19
590 0.19
591 0.2
592 0.2
593 0.22
594 0.19
595 0.23
596 0.25
597 0.25
598 0.26
599 0.29
600 0.33
601 0.33
602 0.36
603 0.34
604 0.32
605 0.33
606 0.36
607 0.38
608 0.38
609 0.36
610 0.34
611 0.37
612 0.37
613 0.37
614 0.39
615 0.35
616 0.29
617 0.36
618 0.36
619 0.35
620 0.39
621 0.38
622 0.37
623 0.39
624 0.4
625 0.4
626 0.38
627 0.35
628 0.32
629 0.31
630 0.27
631 0.21
632 0.19
633 0.12
634 0.12
635 0.12
636 0.14
637 0.21
638 0.23
639 0.28
640 0.31
641 0.33
642 0.38
643 0.46
644 0.44
645 0.4
646 0.47
647 0.46
648 0.44
649 0.46
650 0.46
651 0.42
652 0.46
653 0.48
654 0.43
655 0.4
656 0.45
657 0.47
658 0.44
659 0.44
660 0.4
661 0.4
662 0.39
663 0.42
664 0.4
665 0.38
666 0.4
667 0.39
668 0.42
669 0.44
670 0.47
671 0.48
672 0.45
673 0.42
674 0.4
675 0.38
676 0.32
677 0.26
678 0.21
679 0.16
680 0.15
681 0.13
682 0.1
683 0.07
684 0.07
685 0.06
686 0.06
687 0.08
688 0.1
689 0.12
690 0.13
691 0.14
692 0.16
693 0.18
694 0.19
695 0.18
696 0.18
697 0.21
698 0.24
699 0.25
700 0.23
701 0.24
702 0.23
703 0.22
704 0.22
705 0.18
706 0.16
707 0.18
708 0.2
709 0.19
710 0.2
711 0.21
712 0.2
713 0.23
714 0.23
715 0.21
716 0.23
717 0.25
718 0.26
719 0.24
720 0.23
721 0.24
722 0.23
723 0.23
724 0.2
725 0.18
726 0.23
727 0.26
728 0.28
729 0.26
730 0.29
731 0.29
732 0.29
733 0.31
734 0.26
735 0.24
736 0.21
737 0.21
738 0.2
739 0.2
740 0.19
741 0.15
742 0.17
743 0.22
744 0.25
745 0.24
746 0.24
747 0.25
748 0.26
749 0.27
750 0.28
751 0.28
752 0.31
753 0.34
754 0.35
755 0.35
756 0.35
757 0.37
758 0.34
759 0.32
760 0.29
761 0.28
762 0.29
763 0.29
764 0.32
765 0.33
766 0.37
767 0.36
768 0.37
769 0.36
770 0.35
771 0.36
772 0.37
773 0.36
774 0.37
775 0.41
776 0.44
777 0.46
778 0.48
779 0.51
780 0.56
781 0.55
782 0.54
783 0.53
784 0.54
785 0.56
786 0.55
787 0.56
788 0.55
789 0.56
790 0.54
791 0.57
792 0.5
793 0.45
794 0.44
795 0.42
796 0.35
797 0.32
798 0.27
799 0.23
800 0.23
801 0.22
802 0.18
803 0.17
804 0.24
805 0.26
806 0.26
807 0.26
808 0.31
809 0.37
810 0.39
811 0.36
812 0.34
813 0.37
814 0.4
815 0.37
816 0.31
817 0.25
818 0.23