Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165SGQ0

Protein Details
Accession A0A165SGQ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-36NAKTNISKSKNKRPRTASKASKAHCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-27SKNKRPRT
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037869  Spp1/CFP1  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0048188  C:Set1C/COMPASS complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
Amino Acid Sequences MSKLVDVDNKENAKTNISKSKNKRPRTASKASKAHCLCRKPDDGSPMIRCEECKEWYVYHFRCVNLSARDAEDVQTYVCPSCHERTGLRTISEYLGSMQGDFASVLAYPCTSFTLHVSLPPCALCPHF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.39
3 0.41
4 0.46
5 0.55
6 0.58
7 0.69
8 0.73
9 0.77
10 0.8
11 0.78
12 0.83
13 0.82
14 0.84
15 0.82
16 0.82
17 0.83
18 0.75
19 0.76
20 0.68
21 0.69
22 0.65
23 0.6
24 0.54
25 0.52
26 0.55
27 0.49
28 0.5
29 0.47
30 0.42
31 0.43
32 0.41
33 0.37
34 0.34
35 0.3
36 0.26
37 0.24
38 0.25
39 0.21
40 0.2
41 0.2
42 0.19
43 0.21
44 0.29
45 0.26
46 0.28
47 0.28
48 0.27
49 0.26
50 0.27
51 0.28
52 0.21
53 0.22
54 0.18
55 0.16
56 0.17
57 0.16
58 0.15
59 0.11
60 0.1
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.11
68 0.13
69 0.15
70 0.17
71 0.18
72 0.22
73 0.29
74 0.3
75 0.27
76 0.26
77 0.25
78 0.24
79 0.23
80 0.2
81 0.14
82 0.14
83 0.13
84 0.12
85 0.1
86 0.09
87 0.09
88 0.08
89 0.07
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.07
97 0.08
98 0.09
99 0.09
100 0.11
101 0.16
102 0.16
103 0.21
104 0.22
105 0.22
106 0.23
107 0.22
108 0.22