Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G2WQN8

Protein Details
Accession G2WQN8    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-50ATGILKNKAPKVKKGKKTKEDDENYVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-41KNKAPKVKKGKKT
Subcellular Location(s) cyto 20, cyto_nucl 13.166, cyto_mito 12.666, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007955  Bystin  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0016973  P:poly(A)+ mRNA export from nucleus  
KEGG vda:VDAG_00680  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05291  Bystin  
Amino Acid Sequences MGKATPSTDRQARRHNPLQDDILATGILKNKAPKVKKGKKTKEDDENYVDNKQSQNILRLGRELAEEDEGPKPVAKPTVDMFGIEARYGIEAPDEDRQYDDDEAWGDEDEVVEEIELDPEDLEMYRKFMPDAGEEPSDMLREAGWDTKGGDDDMGGGGTNLTELILDKIAAHEAAEARREAGLPVDDYELPPKVVEAYTKIGQILSRYKSGALPKPFKILPTLPHWEDIIEVTEPAKWTPNAAYQATRIFTASTPATCQKFMEIVMIDKVREDIYETKKLNVHLFNALKKSLYKPRAFFLGFLFPLLSSNCTLREAHIISAVLARVSVPVLHSAAALKGITEIAAQEASQGTEGGGAANVFIKTLLEKKYALPYQVIDSVVFHFLRFRSVDPASVKEGQAVSGDMVKSLPVIFHQSLLSFAQRYRNDLSEDQREALLDLLLTHGHPAIAPEIRRELIAGRGRGVVAEPEGPAFDGDDTMMDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.77
3 0.75
4 0.72
5 0.7
6 0.62
7 0.56
8 0.46
9 0.38
10 0.3
11 0.23
12 0.2
13 0.21
14 0.19
15 0.19
16 0.24
17 0.3
18 0.39
19 0.44
20 0.52
21 0.58
22 0.67
23 0.74
24 0.81
25 0.85
26 0.86
27 0.9
28 0.9
29 0.89
30 0.86
31 0.84
32 0.79
33 0.75
34 0.68
35 0.61
36 0.53
37 0.45
38 0.39
39 0.34
40 0.33
41 0.29
42 0.32
43 0.34
44 0.37
45 0.35
46 0.36
47 0.35
48 0.29
49 0.27
50 0.23
51 0.2
52 0.18
53 0.17
54 0.18
55 0.19
56 0.18
57 0.18
58 0.18
59 0.17
60 0.17
61 0.22
62 0.2
63 0.21
64 0.22
65 0.27
66 0.26
67 0.25
68 0.24
69 0.22
70 0.23
71 0.19
72 0.17
73 0.11
74 0.12
75 0.12
76 0.1
77 0.07
78 0.07
79 0.1
80 0.16
81 0.17
82 0.16
83 0.17
84 0.18
85 0.2
86 0.21
87 0.18
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.12
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.07
110 0.07
111 0.1
112 0.11
113 0.12
114 0.12
115 0.14
116 0.15
117 0.16
118 0.18
119 0.19
120 0.19
121 0.18
122 0.19
123 0.17
124 0.16
125 0.13
126 0.11
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.12
135 0.13
136 0.12
137 0.1
138 0.07
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.08
161 0.09
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.11
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.09
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.13
176 0.12
177 0.11
178 0.1
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.1
184 0.14
185 0.15
186 0.16
187 0.16
188 0.15
189 0.15
190 0.17
191 0.2
192 0.18
193 0.19
194 0.18
195 0.19
196 0.22
197 0.27
198 0.31
199 0.33
200 0.36
201 0.35
202 0.39
203 0.39
204 0.36
205 0.34
206 0.29
207 0.25
208 0.26
209 0.3
210 0.27
211 0.27
212 0.27
213 0.23
214 0.21
215 0.18
216 0.13
217 0.08
218 0.07
219 0.06
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.07
225 0.08
226 0.1
227 0.14
228 0.16
229 0.17
230 0.18
231 0.17
232 0.2
233 0.19
234 0.18
235 0.14
236 0.11
237 0.1
238 0.12
239 0.11
240 0.09
241 0.11
242 0.15
243 0.16
244 0.16
245 0.16
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.14
250 0.1
251 0.1
252 0.13
253 0.13
254 0.12
255 0.11
256 0.12
257 0.09
258 0.08
259 0.1
260 0.14
261 0.19
262 0.27
263 0.28
264 0.3
265 0.32
266 0.34
267 0.36
268 0.31
269 0.28
270 0.27
271 0.29
272 0.3
273 0.3
274 0.29
275 0.25
276 0.24
277 0.28
278 0.29
279 0.34
280 0.36
281 0.35
282 0.37
283 0.42
284 0.41
285 0.37
286 0.31
287 0.3
288 0.25
289 0.24
290 0.22
291 0.15
292 0.16
293 0.16
294 0.14
295 0.08
296 0.09
297 0.1
298 0.12
299 0.12
300 0.12
301 0.17
302 0.17
303 0.16
304 0.18
305 0.17
306 0.15
307 0.17
308 0.16
309 0.1
310 0.08
311 0.08
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.05
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.08
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.05
331 0.06
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.05
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.12
352 0.15
353 0.16
354 0.17
355 0.19
356 0.28
357 0.3
358 0.31
359 0.28
360 0.26
361 0.27
362 0.29
363 0.28
364 0.19
365 0.18
366 0.18
367 0.2
368 0.19
369 0.15
370 0.15
371 0.14
372 0.18
373 0.19
374 0.18
375 0.21
376 0.22
377 0.28
378 0.27
379 0.31
380 0.32
381 0.34
382 0.32
383 0.3
384 0.29
385 0.24
386 0.22
387 0.19
388 0.15
389 0.15
390 0.15
391 0.12
392 0.12
393 0.11
394 0.1
395 0.1
396 0.09
397 0.07
398 0.14
399 0.14
400 0.16
401 0.17
402 0.16
403 0.18
404 0.2
405 0.21
406 0.16
407 0.18
408 0.25
409 0.26
410 0.31
411 0.33
412 0.34
413 0.37
414 0.4
415 0.45
416 0.44
417 0.46
418 0.43
419 0.39
420 0.35
421 0.31
422 0.26
423 0.2
424 0.11
425 0.08
426 0.08
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.09
434 0.12
435 0.17
436 0.18
437 0.21
438 0.25
439 0.25
440 0.25
441 0.25
442 0.22
443 0.26
444 0.33
445 0.31
446 0.28
447 0.3
448 0.29
449 0.29
450 0.28
451 0.22
452 0.17
453 0.17
454 0.16
455 0.15
456 0.15
457 0.15
458 0.14
459 0.13
460 0.11
461 0.09
462 0.09