Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G2XDM8

Protein Details
Accession G2XDM8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-109APNDGVPRPRRGQKKKKPALHTPPPRQVEAHydrophilic
488-510ELQGRRDRKTQWRRVQDDLRDNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-98PRPRRGQKKKKPA
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 3, cyto 2.5, plas 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG vda:VDAG_08260  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSLVQLQRLLPLPEDELKQVLDYGATLSKSEAAEHFGNLLGDSPQAIEFISSFNSRRKDTKPAPTPNYTPEASSANNSDAPNDGVPRPRRGQKKKKPALHTPPPRQVEALPTPGLSYSKKSQQEDYIGKRPSPAPATAATSSAFKPPAKAATPAPAPPAQRTAAGYLISEGPQKAKAKSNPVSRSSTPKPGSTTKVSIAGGTPMAGASTALNDLDAAIRTLEMTTNPTLQDNVNARRCNCVGARHGVQAAAPNCLSCGKVICLKEGLGPCTFCGAPLLSSADVQAMVQELKLERGREKMAADREIHKRAEVSKKPAPFSQFKTSSSSNSPAGNPQLSDAEARAKAHRDKLLNFQAQNAQRTTVRDEAADFDVSGAAAGTGGNMWSTPEERAKELKRQQKVLREMEWNARPEYEKRRQIVSIDLVGGRVVKKMAAVERLPSPEQEEDDSQWDQENYTPQPQGGGGAFSRNPLLGHMIKPVYEPKGKAAELQGRRDRKTQWRRVQDDLRDNEAVILDGGAHGHASTADEPACGDVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.25
4 0.24
5 0.23
6 0.21
7 0.17
8 0.13
9 0.11
10 0.12
11 0.14
12 0.13
13 0.13
14 0.13
15 0.17
16 0.17
17 0.19
18 0.17
19 0.19
20 0.2
21 0.2
22 0.2
23 0.18
24 0.17
25 0.15
26 0.16
27 0.11
28 0.1
29 0.09
30 0.09
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.07
35 0.07
36 0.08
37 0.11
38 0.13
39 0.16
40 0.22
41 0.27
42 0.3
43 0.36
44 0.39
45 0.47
46 0.53
47 0.61
48 0.65
49 0.71
50 0.75
51 0.75
52 0.75
53 0.69
54 0.66
55 0.55
56 0.46
57 0.38
58 0.34
59 0.29
60 0.28
61 0.25
62 0.22
63 0.26
64 0.25
65 0.23
66 0.22
67 0.23
68 0.22
69 0.22
70 0.22
71 0.26
72 0.3
73 0.37
74 0.42
75 0.47
76 0.57
77 0.65
78 0.74
79 0.76
80 0.83
81 0.87
82 0.89
83 0.9
84 0.9
85 0.89
86 0.89
87 0.89
88 0.87
89 0.87
90 0.81
91 0.74
92 0.64
93 0.55
94 0.52
95 0.46
96 0.4
97 0.31
98 0.27
99 0.26
100 0.26
101 0.27
102 0.2
103 0.2
104 0.21
105 0.29
106 0.36
107 0.38
108 0.41
109 0.44
110 0.51
111 0.55
112 0.57
113 0.57
114 0.53
115 0.51
116 0.5
117 0.46
118 0.42
119 0.37
120 0.31
121 0.25
122 0.25
123 0.3
124 0.27
125 0.27
126 0.22
127 0.21
128 0.2
129 0.21
130 0.22
131 0.17
132 0.18
133 0.2
134 0.25
135 0.25
136 0.26
137 0.25
138 0.28
139 0.31
140 0.3
141 0.32
142 0.3
143 0.29
144 0.28
145 0.3
146 0.24
147 0.23
148 0.23
149 0.21
150 0.2
151 0.19
152 0.17
153 0.14
154 0.14
155 0.13
156 0.14
157 0.12
158 0.11
159 0.16
160 0.18
161 0.2
162 0.27
163 0.31
164 0.39
165 0.46
166 0.54
167 0.56
168 0.58
169 0.62
170 0.56
171 0.6
172 0.55
173 0.57
174 0.5
175 0.46
176 0.46
177 0.44
178 0.47
179 0.43
180 0.42
181 0.34
182 0.36
183 0.33
184 0.29
185 0.25
186 0.21
187 0.16
188 0.12
189 0.11
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.03
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.08
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.12
216 0.11
217 0.16
218 0.19
219 0.25
220 0.3
221 0.32
222 0.32
223 0.35
224 0.35
225 0.33
226 0.29
227 0.27
228 0.24
229 0.27
230 0.28
231 0.26
232 0.26
233 0.23
234 0.21
235 0.22
236 0.19
237 0.16
238 0.13
239 0.12
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.07
244 0.08
245 0.07
246 0.13
247 0.13
248 0.14
249 0.14
250 0.14
251 0.18
252 0.18
253 0.19
254 0.15
255 0.14
256 0.13
257 0.15
258 0.14
259 0.1
260 0.1
261 0.08
262 0.07
263 0.08
264 0.1
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.05
277 0.08
278 0.1
279 0.12
280 0.12
281 0.15
282 0.17
283 0.17
284 0.19
285 0.21
286 0.23
287 0.26
288 0.27
289 0.3
290 0.34
291 0.37
292 0.36
293 0.31
294 0.28
295 0.3
296 0.39
297 0.38
298 0.4
299 0.4
300 0.44
301 0.46
302 0.47
303 0.47
304 0.42
305 0.43
306 0.45
307 0.44
308 0.41
309 0.45
310 0.43
311 0.41
312 0.4
313 0.37
314 0.29
315 0.28
316 0.27
317 0.24
318 0.26
319 0.23
320 0.19
321 0.17
322 0.15
323 0.14
324 0.14
325 0.12
326 0.13
327 0.14
328 0.15
329 0.16
330 0.2
331 0.23
332 0.28
333 0.32
334 0.31
335 0.33
336 0.41
337 0.48
338 0.48
339 0.45
340 0.42
341 0.44
342 0.45
343 0.45
344 0.37
345 0.3
346 0.27
347 0.29
348 0.31
349 0.28
350 0.24
351 0.21
352 0.21
353 0.22
354 0.22
355 0.21
356 0.16
357 0.12
358 0.11
359 0.11
360 0.1
361 0.06
362 0.04
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.04
371 0.05
372 0.07
373 0.09
374 0.14
375 0.16
376 0.19
377 0.27
378 0.3
379 0.39
380 0.46
381 0.52
382 0.54
383 0.61
384 0.64
385 0.67
386 0.72
387 0.68
388 0.64
389 0.61
390 0.58
391 0.58
392 0.58
393 0.51
394 0.43
395 0.38
396 0.36
397 0.36
398 0.43
399 0.44
400 0.46
401 0.46
402 0.49
403 0.5
404 0.48
405 0.49
406 0.44
407 0.36
408 0.31
409 0.28
410 0.24
411 0.23
412 0.23
413 0.16
414 0.13
415 0.1
416 0.08
417 0.09
418 0.13
419 0.16
420 0.21
421 0.21
422 0.23
423 0.28
424 0.32
425 0.32
426 0.29
427 0.3
428 0.26
429 0.27
430 0.28
431 0.26
432 0.23
433 0.27
434 0.27
435 0.23
436 0.23
437 0.21
438 0.18
439 0.18
440 0.22
441 0.21
442 0.26
443 0.26
444 0.24
445 0.25
446 0.24
447 0.24
448 0.19
449 0.18
450 0.13
451 0.17
452 0.18
453 0.18
454 0.19
455 0.17
456 0.16
457 0.14
458 0.2
459 0.18
460 0.19
461 0.24
462 0.24
463 0.24
464 0.26
465 0.3
466 0.31
467 0.33
468 0.33
469 0.32
470 0.39
471 0.39
472 0.4
473 0.43
474 0.46
475 0.48
476 0.56
477 0.6
478 0.6
479 0.64
480 0.65
481 0.66
482 0.67
483 0.71
484 0.73
485 0.74
486 0.78
487 0.79
488 0.84
489 0.85
490 0.84
491 0.83
492 0.77
493 0.73
494 0.63
495 0.58
496 0.49
497 0.4
498 0.31
499 0.21
500 0.15
501 0.08
502 0.07
503 0.08
504 0.06
505 0.06
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.08
510 0.09
511 0.12
512 0.12
513 0.12
514 0.13