Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165T1M6

Protein Details
Accession A0A165T1M6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
218-243NGGALKKKGRPSRRDKQKKAKDALGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
222-238LKKKGRPSRRDKQKKAK
Subcellular Location(s) cyto 12, mito 9.5, mito_nucl 7.5, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019188  SNAPC1  
Pfam View protein in Pfam  
PF09808  SNAPC1  
Amino Acid Sequences MSTAAGPSANRGDITLQPSYFTSSLYVEPLCEDIANLVNLFAQQYVETWPPTQPFALFKRLWSEQGWRWLHFKVLDARARETFVNVTERLFVERLTDGVPLMARVVALFALYTFHLTQPTAQNLPIHSVGHIAVPLDIYHALRLLPSSLATPELLPLQPYVAYVLKTLEVSKSFHILPQAELRPYKPSTLPREVFVTEEQESVILAALSGSATTSGANGGALKKKGRPSRRDKQKKAKDALGALEKYLEKNTTVLAPEPMPMSESVPSVAADHAQTTHRMVVHPPSATREQYRSHKVEALGMLNPYGVDSIMAVQEPTRSVNAGREALQRANEAVLARLKMIDEMAAEQGLEVGGEGGEKTGLARIERAVQQVLSSGDTAVSTGILGLLEGAGLDPSWEM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.28
3 0.25
4 0.25
5 0.26
6 0.3
7 0.27
8 0.23
9 0.2
10 0.18
11 0.19
12 0.21
13 0.2
14 0.15
15 0.16
16 0.16
17 0.15
18 0.12
19 0.11
20 0.1
21 0.12
22 0.13
23 0.12
24 0.11
25 0.1
26 0.11
27 0.11
28 0.1
29 0.08
30 0.07
31 0.08
32 0.12
33 0.14
34 0.15
35 0.16
36 0.19
37 0.2
38 0.22
39 0.22
40 0.2
41 0.24
42 0.27
43 0.34
44 0.31
45 0.31
46 0.36
47 0.37
48 0.38
49 0.35
50 0.38
51 0.35
52 0.44
53 0.46
54 0.42
55 0.43
56 0.4
57 0.41
58 0.35
59 0.35
60 0.33
61 0.38
62 0.41
63 0.41
64 0.44
65 0.41
66 0.42
67 0.37
68 0.31
69 0.24
70 0.22
71 0.24
72 0.2
73 0.19
74 0.2
75 0.2
76 0.21
77 0.19
78 0.16
79 0.14
80 0.14
81 0.14
82 0.13
83 0.13
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.06
91 0.05
92 0.06
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.05
98 0.05
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.1
103 0.1
104 0.13
105 0.17
106 0.21
107 0.2
108 0.21
109 0.22
110 0.21
111 0.24
112 0.23
113 0.18
114 0.15
115 0.14
116 0.14
117 0.12
118 0.12
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.12
159 0.13
160 0.13
161 0.14
162 0.16
163 0.15
164 0.15
165 0.2
166 0.21
167 0.21
168 0.22
169 0.22
170 0.24
171 0.24
172 0.25
173 0.22
174 0.27
175 0.32
176 0.4
177 0.4
178 0.36
179 0.38
180 0.37
181 0.34
182 0.28
183 0.24
184 0.16
185 0.15
186 0.14
187 0.11
188 0.1
189 0.08
190 0.08
191 0.04
192 0.03
193 0.02
194 0.03
195 0.02
196 0.02
197 0.02
198 0.02
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.04
205 0.05
206 0.07
207 0.1
208 0.12
209 0.13
210 0.17
211 0.25
212 0.33
213 0.41
214 0.49
215 0.55
216 0.64
217 0.74
218 0.81
219 0.84
220 0.88
221 0.89
222 0.89
223 0.85
224 0.8
225 0.73
226 0.64
227 0.58
228 0.53
229 0.43
230 0.34
231 0.31
232 0.25
233 0.22
234 0.21
235 0.17
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.12
247 0.11
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.1
263 0.11
264 0.14
265 0.14
266 0.14
267 0.15
268 0.2
269 0.23
270 0.23
271 0.22
272 0.25
273 0.29
274 0.31
275 0.33
276 0.31
277 0.33
278 0.4
279 0.48
280 0.46
281 0.45
282 0.46
283 0.43
284 0.44
285 0.4
286 0.34
287 0.28
288 0.24
289 0.21
290 0.17
291 0.16
292 0.12
293 0.09
294 0.06
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.08
303 0.09
304 0.1
305 0.1
306 0.11
307 0.11
308 0.16
309 0.21
310 0.21
311 0.24
312 0.27
313 0.3
314 0.32
315 0.33
316 0.29
317 0.25
318 0.24
319 0.22
320 0.17
321 0.17
322 0.18
323 0.16
324 0.16
325 0.16
326 0.15
327 0.14
328 0.13
329 0.11
330 0.09
331 0.1
332 0.11
333 0.1
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.07
338 0.06
339 0.04
340 0.04
341 0.03
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.05
348 0.08
349 0.1
350 0.11
351 0.12
352 0.14
353 0.2
354 0.24
355 0.27
356 0.26
357 0.24
358 0.23
359 0.25
360 0.24
361 0.19
362 0.17
363 0.14
364 0.12
365 0.12
366 0.12
367 0.09
368 0.07
369 0.06
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04