Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165PDN2

Protein Details
Accession A0A165PDN2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MASASNSRKRKRDTDDAGKVTHydrophilic
39-65FPAHRPPKNTSFRCWRRDKRVDGTDPFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
417-425QPRPKRGRR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009668  RNA_pol-assoc_fac_A49-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06870  RNA_pol_I_A49  
Amino Acid Sequences MASASNSRKRKRDTDDAGKVTLQNSTLPASQLGPVLASFPAHRPPKNTSFRCWRRDKRVDGTDPFASQDTIVAGETETVEFFTSGETQQASVGCSYLVGVHNKRTNTTVFRPAPLHVMSQQVKALKNLAPIEVTNEERAQLRNKLGEAFGTKKAKAAIRAQERNRVDIDALKGVTGHLQETIMENTSSLPTLEEAKEVVNSNRLIPPHNPDAERPDDVYKLHDIIPETEFNALSVAPFRSAQNDRERKALLPFRHSNWINQHVFKLFQAPKLRKTDMKIVMYISAMFAFKLAARSVNDKETLQKKLTGVPQIVTDGLLSRFTESERDTNKIKVTSQAETMLMTYMLALCLRVDDFSTDTELIAHDLKLPVSKVNPLFKALGCNIRKLDHKDLKRLGLPDSAAESKRAVLEVPVKFPQPRPKRGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.83
3 0.79
4 0.74
5 0.66
6 0.59
7 0.49
8 0.41
9 0.31
10 0.22
11 0.2
12 0.2
13 0.2
14 0.19
15 0.2
16 0.18
17 0.19
18 0.19
19 0.17
20 0.14
21 0.12
22 0.12
23 0.12
24 0.11
25 0.11
26 0.13
27 0.22
28 0.28
29 0.31
30 0.34
31 0.42
32 0.51
33 0.61
34 0.61
35 0.61
36 0.66
37 0.73
38 0.78
39 0.81
40 0.81
41 0.81
42 0.86
43 0.86
44 0.85
45 0.85
46 0.84
47 0.78
48 0.74
49 0.66
50 0.57
51 0.5
52 0.41
53 0.31
54 0.22
55 0.18
56 0.13
57 0.11
58 0.1
59 0.08
60 0.07
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.08
71 0.08
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.11
79 0.11
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.09
84 0.12
85 0.17
86 0.19
87 0.26
88 0.3
89 0.31
90 0.33
91 0.32
92 0.33
93 0.34
94 0.37
95 0.41
96 0.39
97 0.41
98 0.42
99 0.4
100 0.4
101 0.35
102 0.32
103 0.23
104 0.29
105 0.28
106 0.28
107 0.3
108 0.29
109 0.28
110 0.27
111 0.28
112 0.22
113 0.25
114 0.25
115 0.23
116 0.2
117 0.19
118 0.22
119 0.22
120 0.21
121 0.18
122 0.17
123 0.17
124 0.17
125 0.19
126 0.19
127 0.2
128 0.21
129 0.22
130 0.22
131 0.23
132 0.22
133 0.22
134 0.22
135 0.22
136 0.26
137 0.28
138 0.27
139 0.27
140 0.3
141 0.3
142 0.31
143 0.34
144 0.36
145 0.43
146 0.51
147 0.52
148 0.58
149 0.57
150 0.54
151 0.48
152 0.4
153 0.31
154 0.25
155 0.25
156 0.18
157 0.17
158 0.15
159 0.14
160 0.13
161 0.14
162 0.11
163 0.09
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.09
168 0.1
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.06
177 0.05
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.14
189 0.16
190 0.16
191 0.17
192 0.17
193 0.22
194 0.23
195 0.25
196 0.25
197 0.23
198 0.28
199 0.28
200 0.28
201 0.24
202 0.21
203 0.19
204 0.18
205 0.19
206 0.15
207 0.14
208 0.14
209 0.14
210 0.13
211 0.14
212 0.15
213 0.14
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.1
218 0.09
219 0.07
220 0.05
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.13
227 0.16
228 0.21
229 0.3
230 0.36
231 0.36
232 0.39
233 0.4
234 0.36
235 0.41
236 0.43
237 0.35
238 0.36
239 0.39
240 0.38
241 0.46
242 0.45
243 0.43
244 0.43
245 0.49
246 0.44
247 0.41
248 0.41
249 0.33
250 0.33
251 0.28
252 0.31
253 0.24
254 0.27
255 0.35
256 0.36
257 0.42
258 0.48
259 0.51
260 0.45
261 0.48
262 0.51
263 0.5
264 0.49
265 0.43
266 0.37
267 0.35
268 0.32
269 0.28
270 0.19
271 0.12
272 0.09
273 0.08
274 0.07
275 0.06
276 0.07
277 0.08
278 0.08
279 0.1
280 0.12
281 0.17
282 0.2
283 0.22
284 0.23
285 0.22
286 0.29
287 0.31
288 0.34
289 0.31
290 0.32
291 0.3
292 0.34
293 0.39
294 0.37
295 0.34
296 0.3
297 0.29
298 0.27
299 0.26
300 0.2
301 0.15
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.14
310 0.15
311 0.22
312 0.24
313 0.27
314 0.29
315 0.32
316 0.36
317 0.35
318 0.33
319 0.33
320 0.34
321 0.33
322 0.33
323 0.32
324 0.28
325 0.26
326 0.25
327 0.18
328 0.14
329 0.11
330 0.08
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.05
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.1
342 0.11
343 0.15
344 0.14
345 0.13
346 0.13
347 0.13
348 0.13
349 0.13
350 0.12
351 0.11
352 0.12
353 0.13
354 0.16
355 0.16
356 0.17
357 0.18
358 0.25
359 0.29
360 0.35
361 0.37
362 0.37
363 0.39
364 0.37
365 0.42
366 0.39
367 0.42
368 0.36
369 0.4
370 0.39
371 0.41
372 0.47
373 0.47
374 0.54
375 0.55
376 0.6
377 0.64
378 0.68
379 0.7
380 0.69
381 0.63
382 0.55
383 0.51
384 0.45
385 0.37
386 0.37
387 0.36
388 0.31
389 0.31
390 0.28
391 0.25
392 0.25
393 0.23
394 0.18
395 0.18
396 0.26
397 0.28
398 0.33
399 0.34
400 0.37
401 0.4
402 0.47
403 0.52
404 0.54
405 0.61