Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165T6T1

Protein Details
Accession A0A165T6T1    Localization Confidence High Confidence Score 23.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-101VQESRAPKGKARVKRRRRGTDTGDDGERRQTQRKRKRKQQLEDIDLSQHydrophilic
116-142IEAILKPKKSSRPKRKRKDDEDVLDRVBasic
354-373VDIERRKKNAERLRTLTRKIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-91RAPKGKARVKRRRRGTDTGDDGERRQTQRKRKRK
121-133KPKKSSRPKRKRK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MTIKDLERAIFGGESDDELSAPEEDGTYVPQKRARRASPMGDEESSEDSGDEYVQESRAPKGKARVKRRRRGTDTGDDGERRQTQRKRKRKQQLEDIDLSQLPPEQASKLKLDMQIEAILKPKKSSRPKRKRKDDEDVLDRVADEEVSRLREAMLSAAADDEQANREKLPATAKLRLLPQVMEVLRKSSLANSIMDNNLLEGVRRWLDPLPDRSLPALDIQREFFPILKKMEFIDTAVLKESKLGHVIVFYTKSKRVTPDIQRLANDLVSAWSRPIIKRSASYRDRIIPTAQVGEGEAARGPERLNTILARAKESEKNRVRKNAVMIPQRELGSYTVAPRSGVGLTKGTVSVDVDIERRKKNAERLRTLTRKIQMKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.13
4 0.11
5 0.11
6 0.12
7 0.1
8 0.11
9 0.09
10 0.08
11 0.09
12 0.1
13 0.12
14 0.18
15 0.2
16 0.24
17 0.29
18 0.35
19 0.43
20 0.52
21 0.54
22 0.57
23 0.61
24 0.66
25 0.69
26 0.7
27 0.66
28 0.57
29 0.52
30 0.45
31 0.42
32 0.34
33 0.25
34 0.18
35 0.14
36 0.13
37 0.12
38 0.1
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.11
43 0.12
44 0.16
45 0.23
46 0.25
47 0.27
48 0.36
49 0.45
50 0.52
51 0.63
52 0.69
53 0.74
54 0.82
55 0.89
56 0.9
57 0.89
58 0.89
59 0.86
60 0.85
61 0.81
62 0.75
63 0.7
64 0.6
65 0.53
66 0.5
67 0.47
68 0.41
69 0.43
70 0.46
71 0.52
72 0.62
73 0.72
74 0.76
75 0.81
76 0.89
77 0.9
78 0.92
79 0.92
80 0.91
81 0.88
82 0.82
83 0.72
84 0.64
85 0.53
86 0.43
87 0.32
88 0.23
89 0.15
90 0.11
91 0.1
92 0.09
93 0.12
94 0.15
95 0.16
96 0.18
97 0.22
98 0.25
99 0.25
100 0.24
101 0.23
102 0.25
103 0.24
104 0.22
105 0.24
106 0.23
107 0.22
108 0.23
109 0.27
110 0.32
111 0.42
112 0.53
113 0.59
114 0.67
115 0.78
116 0.87
117 0.94
118 0.95
119 0.93
120 0.92
121 0.91
122 0.88
123 0.83
124 0.74
125 0.63
126 0.52
127 0.43
128 0.33
129 0.23
130 0.14
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.1
140 0.09
141 0.08
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.06
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.11
156 0.14
157 0.19
158 0.21
159 0.26
160 0.27
161 0.29
162 0.3
163 0.31
164 0.29
165 0.22
166 0.18
167 0.19
168 0.18
169 0.17
170 0.16
171 0.15
172 0.14
173 0.15
174 0.14
175 0.1
176 0.13
177 0.12
178 0.13
179 0.12
180 0.14
181 0.13
182 0.13
183 0.12
184 0.09
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.05
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.1
194 0.13
195 0.18
196 0.22
197 0.25
198 0.25
199 0.26
200 0.25
201 0.24
202 0.21
203 0.2
204 0.19
205 0.15
206 0.16
207 0.16
208 0.16
209 0.17
210 0.17
211 0.15
212 0.15
213 0.17
214 0.18
215 0.18
216 0.18
217 0.17
218 0.19
219 0.18
220 0.16
221 0.16
222 0.14
223 0.14
224 0.16
225 0.15
226 0.13
227 0.14
228 0.15
229 0.11
230 0.13
231 0.12
232 0.1
233 0.11
234 0.12
235 0.12
236 0.14
237 0.15
238 0.17
239 0.2
240 0.23
241 0.25
242 0.27
243 0.31
244 0.37
245 0.44
246 0.51
247 0.55
248 0.56
249 0.54
250 0.53
251 0.49
252 0.4
253 0.31
254 0.2
255 0.15
256 0.13
257 0.12
258 0.1
259 0.11
260 0.13
261 0.14
262 0.18
263 0.2
264 0.21
265 0.27
266 0.33
267 0.4
268 0.42
269 0.45
270 0.47
271 0.5
272 0.51
273 0.48
274 0.44
275 0.37
276 0.34
277 0.33
278 0.27
279 0.19
280 0.17
281 0.16
282 0.14
283 0.11
284 0.1
285 0.08
286 0.09
287 0.1
288 0.09
289 0.1
290 0.13
291 0.14
292 0.16
293 0.15
294 0.19
295 0.24
296 0.24
297 0.25
298 0.25
299 0.28
300 0.34
301 0.37
302 0.44
303 0.48
304 0.57
305 0.61
306 0.68
307 0.69
308 0.66
309 0.7
310 0.68
311 0.68
312 0.67
313 0.62
314 0.57
315 0.56
316 0.51
317 0.44
318 0.37
319 0.29
320 0.25
321 0.24
322 0.23
323 0.21
324 0.21
325 0.21
326 0.2
327 0.21
328 0.18
329 0.19
330 0.18
331 0.17
332 0.17
333 0.18
334 0.18
335 0.16
336 0.16
337 0.15
338 0.14
339 0.13
340 0.15
341 0.17
342 0.24
343 0.3
344 0.32
345 0.33
346 0.38
347 0.44
348 0.53
349 0.59
350 0.62
351 0.66
352 0.7
353 0.79
354 0.81
355 0.8
356 0.78
357 0.76