FuNGI

A0A165RIR1

Protein Details

Accession

A0A165RIR1

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
29-54	HTFHPDYKPKKLPAFKKNKKPASDAS	Hydrophilic
70-92	VTVGRGTRPSPPRPRRAPSPELS	Hydrophilic
131-156	EQSTPRPPTSQRPKPRPVNRPANTYT	Hydrophilic
171-195	YGEVRGRPGPRQTKRRKASPALSES	Hydrophilic
199-220	NSSRNKRSERAKGKGKGRERES	Basic
752-774	GTEPVNGRPKPRRKMRQGATSLQ	Hydrophilic
786-809	VPDPSGKRKTTRKRSNNDSHGPTD	Hydrophilic
852-876	SDHARSVDKPRPRPKARLKQADALA	Hydrophilic
986-1009	SGRVRVSRTPKSSRRAPLQRTEDH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
37-48	PKKLPAFKKNKK
176-189	GRPGPRQTKRRKAS
201-222	SRNKRSERAKGKGKGRERESAK
760-765	PKPRRK
861-868	PRPRPKAR

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MDRGTRRQNNGKVSKECSEEGVIVNGELHTFHPDYKPKKLPAFKKNKKPASDASLPASQSSQTSTTSTKVTVGRGTRPSPPRPRRAPSPELSVATTSRAYTAAHGTYQPLNELHPNRRRTPSPVDIDSSPEQSTPRPPTSQRPKPRPVNRPANTYTQLRKSQDVIDVDPDYGEVRGRPGPRQTKRRKASPALSESEYENSSRNKRSERAKGKGKGRERESAKPDKYPSTLSYHGSDEEPSRRFSRGNAKEQTRTVKAARQAEFPLPPPLTSQTPQRLVKGRELQDFPMGSPSPSSSQTSQRRAKPGEPEEFPMDSYSPLSSQKSQGRPEASKSGAFPLFSSVLSLPEKGSLQSRSKKTISSSQKSRVHKGAALSSAESSTDNGDDGDDGEELQPFPLQTQLLESIGRSPPKRSEGQNSDLDDDEATRARKRRRADAAPNEILADILRAGEGPEFDEDDMVLLGREIDPHTLCPWCDERLPAAPSPHLESLITTARNASVRNPRPTNPLGLRAPVGMFVSVCQRHRFESHQVPKAQARGWPTKIDWERVPLRIKTLKPRLQEIIDDVDEDFLLGVQRRDDVEDDDSDKWADRPRKGSVFWRDVAKNVRKSGSRKATGVAGQLANFNKTQPGYYGELGYVIIHQTMYDMFPPASFSPDSTLPLNPNDFIQLILIPEATVSLIMEDMGQTREEAVVTLRDSAEYGVAMFPDDQTEGANAVDQGEQIIMKRAEARRRELEVEDRIEEELLLASSQGTEPVNGRPKPRRKMRQGATSLQLESEKSDPEVVVPDPSGKRKTTRKRSNNDSHGPTDSEASDAPSTSRTDAYSSGGRRVTRSQSRACSVTTNSDVDMDVSDHARSVDKPRPRPKARLKQADALAVDKLTDRANVGRAQTNGSYDLFPTSSPEPVPEVHWDEKGVTREGSTIDEERTPRPSKTLRRAFAASKKANVFPLQMARERHVQSSDDKHSRTMRADSRSDPMVEDENPVSGRVRVSRTPKSSRRAPLQRTEDHGWLLDDPGPGE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.66
3	0.59
4	0.52
5	0.45
6	0.38
7	0.33
8	0.3
9	0.25
10	0.2
11	0.2
12	0.16
13	0.13
14	0.12
15	0.12
16	0.13
17	0.14
18	0.16
19	0.23
20	0.32
21	0.38
22	0.47
23	0.54
24	0.57
25	0.66
26	0.73
27	0.76
28	0.79
29	0.85
30	0.85
31	0.88
32	0.91
33	0.9
34	0.86
35	0.83
36	0.8
37	0.77
38	0.75
39	0.67
40	0.62
41	0.58
42	0.52
43	0.46
44	0.39
45	0.31
46	0.24
47	0.23
48	0.2
49	0.17
50	0.19
51	0.21
52	0.22
53	0.24
54	0.24
55	0.25
56	0.26
57	0.27
58	0.31
59	0.33
60	0.38
61	0.43
62	0.46
63	0.5
64	0.55
65	0.62
66	0.66
67	0.72
68	0.74
69	0.77
70	0.81
71	0.83
72	0.84
73	0.83
74	0.77
75	0.76
76	0.71
77	0.64
78	0.59
79	0.51
80	0.42
81	0.37
82	0.32
83	0.23
84	0.18
85	0.17
86	0.15
87	0.15
88	0.19
89	0.18
90	0.19
91	0.19
92	0.22
93	0.24
94	0.24
95	0.24
96	0.2
97	0.2
98	0.27
99	0.32
100	0.39
101	0.44
102	0.5
103	0.54
104	0.6
105	0.61
106	0.6
107	0.63
108	0.63
109	0.62
110	0.6
111	0.58
112	0.52
113	0.54
114	0.5
115	0.44
116	0.35
117	0.28
118	0.26
119	0.24
120	0.31
121	0.32
122	0.34
123	0.37
124	0.4
125	0.5
126	0.6
127	0.68
128	0.71
129	0.74
130	0.79
131	0.84
132	0.9
133	0.89
134	0.89
135	0.89
136	0.83
137	0.82
138	0.76
139	0.73
140	0.68
141	0.64
142	0.61
143	0.58
144	0.61
145	0.55
146	0.54
147	0.48
148	0.48
149	0.48
150	0.44
151	0.38
152	0.35
153	0.33
154	0.3
155	0.27
156	0.23
157	0.17
158	0.14
159	0.13
160	0.08
161	0.1
162	0.16
163	0.18
164	0.23
165	0.32
166	0.42
167	0.51
168	0.62
169	0.69
170	0.75
171	0.81
172	0.85
173	0.85
174	0.84
175	0.83
176	0.82
177	0.78
178	0.72
179	0.66
180	0.58
181	0.5
182	0.44
183	0.36
184	0.27
185	0.24
186	0.24
187	0.28
188	0.33
189	0.36
190	0.39
191	0.45
192	0.53
193	0.61
194	0.65
195	0.68
196	0.72
197	0.76
198	0.79
199	0.83
200	0.82
201	0.81
202	0.76
203	0.76
204	0.71
205	0.72
206	0.71
207	0.72
208	0.66
209	0.63
210	0.62
211	0.58
212	0.54
213	0.49
214	0.44
215	0.4
216	0.41
217	0.37
218	0.35
219	0.32
220	0.31
221	0.28
222	0.26
223	0.23
224	0.27
225	0.26
226	0.27
227	0.27
228	0.27
229	0.27
230	0.3
231	0.37
232	0.39
233	0.47
234	0.52
235	0.56
236	0.6
237	0.64
238	0.66
239	0.58
240	0.54
241	0.47
242	0.44
243	0.45
244	0.48
245	0.45
246	0.42
247	0.41
248	0.41
249	0.41
250	0.37
251	0.37
252	0.3
253	0.28
254	0.26
255	0.26
256	0.27
257	0.26
258	0.32
259	0.32
260	0.4
261	0.41
262	0.44
263	0.49
264	0.47
265	0.54
266	0.56
267	0.53
268	0.52
269	0.53
270	0.49
271	0.47
272	0.44
273	0.36
274	0.32
275	0.28
276	0.21
277	0.19
278	0.19
279	0.17
280	0.19
281	0.22
282	0.19
283	0.28
284	0.37
285	0.45
286	0.51
287	0.54
288	0.6
289	0.61
290	0.63
291	0.63
292	0.61
293	0.59
294	0.54
295	0.52
296	0.48
297	0.45
298	0.4
299	0.32
300	0.25
301	0.18
302	0.17
303	0.13
304	0.11
305	0.13
306	0.15
307	0.16
308	0.22
309	0.29
310	0.35
311	0.38
312	0.42
313	0.45
314	0.44
315	0.47
316	0.46
317	0.41
318	0.36
319	0.34
320	0.33
321	0.29
322	0.26
323	0.22
324	0.19
325	0.18
326	0.16
327	0.17
328	0.12
329	0.14
330	0.15
331	0.15
332	0.12
333	0.13
334	0.13
335	0.12
336	0.16
337	0.18
338	0.24
339	0.32
340	0.35
341	0.4
342	0.41
343	0.43
344	0.43
345	0.47
346	0.5
347	0.5
348	0.54
349	0.58
350	0.64
351	0.66
352	0.68
353	0.63
354	0.56
355	0.49
356	0.45
357	0.39
358	0.34
359	0.31
360	0.26
361	0.22
362	0.19
363	0.17
364	0.15
365	0.11
366	0.08
367	0.07
368	0.07
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.05
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.07
380	0.06
381	0.05
382	0.06
383	0.07
384	0.07
385	0.06
386	0.08
387	0.09
388	0.1
389	0.1
390	0.1
391	0.12
392	0.15
393	0.19
394	0.18
395	0.19
396	0.23
397	0.27
398	0.31
399	0.31
400	0.37
401	0.4
402	0.44
403	0.48
404	0.45
405	0.42
406	0.38
407	0.35
408	0.25
409	0.2
410	0.15
411	0.12
412	0.11
413	0.13
414	0.19
415	0.25
416	0.3
417	0.33
418	0.41
419	0.48
420	0.55
421	0.62
422	0.66
423	0.69
424	0.65
425	0.62
426	0.53
427	0.44
428	0.35
429	0.24
430	0.14
431	0.06
432	0.04
433	0.04
434	0.03
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.05
439	0.05
440	0.06
441	0.06
442	0.06
443	0.06
444	0.05
445	0.05
446	0.04
447	0.03
448	0.03
449	0.03
450	0.03
451	0.04
452	0.04
453	0.06
454	0.07
455	0.08
456	0.09
457	0.1
458	0.1
459	0.12
460	0.14
461	0.14
462	0.14
463	0.14
464	0.15
465	0.19
466	0.21
467	0.2
468	0.19
469	0.19
470	0.19
471	0.22
472	0.2
473	0.15
474	0.13
475	0.11
476	0.13
477	0.16
478	0.15
479	0.11
480	0.11
481	0.12
482	0.13
483	0.13
484	0.15
485	0.22
486	0.28
487	0.35
488	0.38
489	0.38
490	0.43
491	0.44
492	0.45
493	0.37
494	0.37
495	0.31
496	0.29
497	0.28
498	0.22
499	0.21
500	0.15
501	0.14
502	0.08
503	0.06
504	0.06
505	0.11
506	0.13
507	0.14
508	0.16
509	0.16
510	0.18
511	0.21
512	0.24
513	0.26
514	0.34
515	0.4
516	0.45
517	0.45
518	0.46
519	0.45
520	0.44
521	0.39
522	0.3
523	0.28
524	0.28
525	0.29
526	0.29
527	0.28
528	0.34
529	0.34
530	0.35
531	0.3
532	0.3
533	0.3
534	0.33
535	0.37
536	0.28
537	0.32
538	0.34
539	0.36
540	0.4
541	0.47
542	0.48
543	0.45
544	0.49
545	0.47
546	0.42
547	0.4
548	0.33
549	0.27
550	0.22
551	0.2
552	0.16
553	0.13
554	0.12
555	0.11
556	0.08
557	0.04
558	0.05
559	0.05
560	0.05
561	0.05
562	0.06
563	0.07
564	0.08
565	0.09
566	0.1
567	0.12
568	0.13
569	0.16
570	0.15
571	0.16
572	0.15
573	0.14
574	0.13
575	0.18
576	0.22
577	0.22
578	0.26
579	0.31
580	0.34
581	0.36
582	0.43
583	0.45
584	0.45
585	0.43
586	0.45
587	0.4
588	0.4
589	0.47
590	0.46
591	0.43
592	0.4
593	0.42
594	0.41
595	0.45
596	0.51
597	0.52
598	0.47
599	0.43
600	0.41
601	0.41
602	0.38
603	0.36
604	0.29
605	0.2
606	0.17
607	0.2
608	0.19
609	0.17
610	0.15
611	0.14
612	0.13
613	0.12
614	0.12
615	0.1
616	0.14
617	0.16
618	0.17
619	0.17
620	0.15
621	0.15
622	0.15
623	0.13
624	0.09
625	0.06
626	0.05
627	0.05
628	0.04
629	0.05
630	0.05
631	0.06
632	0.06
633	0.07
634	0.07
635	0.07
636	0.1
637	0.1
638	0.12
639	0.11
640	0.11
641	0.13
642	0.14
643	0.17
644	0.15
645	0.17
646	0.16
647	0.18
648	0.19
649	0.16
650	0.15
651	0.14
652	0.13
653	0.11
654	0.1
655	0.08
656	0.07
657	0.07
658	0.07
659	0.05
660	0.05
661	0.05
662	0.04
663	0.04
664	0.03
665	0.03
666	0.03
667	0.03
668	0.03
669	0.03
670	0.05
671	0.06
672	0.06
673	0.06
674	0.06
675	0.06
676	0.06
677	0.07
678	0.07
679	0.08
680	0.08
681	0.1
682	0.09
683	0.09
684	0.1
685	0.09
686	0.09
687	0.07
688	0.07
689	0.05
690	0.05
691	0.06
692	0.06
693	0.06
694	0.06
695	0.07
696	0.06
697	0.06
698	0.07
699	0.07
700	0.06
701	0.07
702	0.06
703	0.07
704	0.07
705	0.07
706	0.06
707	0.06
708	0.06
709	0.06
710	0.12
711	0.11
712	0.11
713	0.18
714	0.23
715	0.3
716	0.35
717	0.41
718	0.41
719	0.45
720	0.48
721	0.45
722	0.46
723	0.44
724	0.43
725	0.37
726	0.32
727	0.28
728	0.25
729	0.22
730	0.15
731	0.1
732	0.07
733	0.06
734	0.05
735	0.04
736	0.05
737	0.05
738	0.07
739	0.06
740	0.07
741	0.08
742	0.16
743	0.25
744	0.27
745	0.34
746	0.42
747	0.52
748	0.61
749	0.7
750	0.74
751	0.75
752	0.84
753	0.86
754	0.86
755	0.83
756	0.79
757	0.73
758	0.66
759	0.56
760	0.46
761	0.38
762	0.28
763	0.24
764	0.19
765	0.15
766	0.13
767	0.13
768	0.12
769	0.12
770	0.14
771	0.12
772	0.13
773	0.12
774	0.17
775	0.19
776	0.25
777	0.28
778	0.28
779	0.35
780	0.44
781	0.54
782	0.6
783	0.68
784	0.73
785	0.79
786	0.87
787	0.9
788	0.9
789	0.87
790	0.82
791	0.75
792	0.67
793	0.6
794	0.5
795	0.41
796	0.32
797	0.24
798	0.18
799	0.18
800	0.15
801	0.13
802	0.13
803	0.13
804	0.15
805	0.15
806	0.16
807	0.13
808	0.15
809	0.16
810	0.19
811	0.24
812	0.24
813	0.28
814	0.31
815	0.31
816	0.32
817	0.37
818	0.43
819	0.45
820	0.5
821	0.52
822	0.55
823	0.58
824	0.57
825	0.53
826	0.48
827	0.41
828	0.41
829	0.37
830	0.32
831	0.27
832	0.26
833	0.25
834	0.21
835	0.19
836	0.13
837	0.11
838	0.11
839	0.1
840	0.1
841	0.1
842	0.12
843	0.13
844	0.19
845	0.25
846	0.33
847	0.44
848	0.53
849	0.64
850	0.69
851	0.77
852	0.82
853	0.85
854	0.87
855	0.88
856	0.84
857	0.81
858	0.78
859	0.74
860	0.64
861	0.54
862	0.44
863	0.33
864	0.28
865	0.2
866	0.17
867	0.12
868	0.12
869	0.12
870	0.13
871	0.17
872	0.2
873	0.22
874	0.26
875	0.26
876	0.3
877	0.29
878	0.29
879	0.28
880	0.26
881	0.23
882	0.19
883	0.21
884	0.17
885	0.15
886	0.17
887	0.16
888	0.17
889	0.17
890	0.18
891	0.18
892	0.19
893	0.21
894	0.23
895	0.28
896	0.29
897	0.29
898	0.29
899	0.29
900	0.33
901	0.34
902	0.3
903	0.24
904	0.22
905	0.22
906	0.23
907	0.23
908	0.22
909	0.21
910	0.2
911	0.25
912	0.26
913	0.28
914	0.34
915	0.35
916	0.32
917	0.37
918	0.44
919	0.5
920	0.59
921	0.66
922	0.63
923	0.66
924	0.7
925	0.71
926	0.71
927	0.71
928	0.64
929	0.61
930	0.61
931	0.57
932	0.57
933	0.51
934	0.44
935	0.39
936	0.43
937	0.41
938	0.43
939	0.43
940	0.43
941	0.48
942	0.48
943	0.46
944	0.4
945	0.38
946	0.39
947	0.45
948	0.51
949	0.51
950	0.49
951	0.52
952	0.55
953	0.58
954	0.56
955	0.56
956	0.54
957	0.53
958	0.57
959	0.54
960	0.53
961	0.52
962	0.48
963	0.4
964	0.35
965	0.32
966	0.28
967	0.29
968	0.24
969	0.24
970	0.23
971	0.23
972	0.21
973	0.19
974	0.21
975	0.23
976	0.28
977	0.33
978	0.41
979	0.5
980	0.57
981	0.66
982	0.71
983	0.73
984	0.77
985	0.78
986	0.81
987	0.82
988	0.81
989	0.81
990	0.82
991	0.8
992	0.78
993	0.74
994	0.67
995	0.58
996	0.51
997	0.43
998	0.35
999	0.31
1000	0.27

A0A165RIR1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer