Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165KMU9

Protein Details
Accession A0A165KMU9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-127STPPDIIHHSPRPRRRPTKLRRRPVRTTHRPLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
106-125PRPRRRPTKLRRRPVRTTHR
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 6, cyto_nucl 5, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016487  Lsm6/sSmF  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0120114  C:Sm-like protein family complex  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
Amino Acid Sequences LTSFVGKRVVVRLTSGIDYRGTRALCLDEYMIIALEQTEELVGGTLTNRYGDTYIRGHSGSCSLMLMSAQPPTVLYIGYSPPNHLECVPSPAIHDSTPPDIIHHSPRPRRRPTKLRRRPVRTTHRPL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.25
3 0.22
4 0.22
5 0.22
6 0.22
7 0.24
8 0.21
9 0.19
10 0.19
11 0.2
12 0.17
13 0.18
14 0.16
15 0.11
16 0.11
17 0.11
18 0.1
19 0.07
20 0.06
21 0.05
22 0.05
23 0.04
24 0.04
25 0.03
26 0.03
27 0.03
28 0.03
29 0.03
30 0.03
31 0.03
32 0.04
33 0.05
34 0.05
35 0.05
36 0.06
37 0.07
38 0.07
39 0.1
40 0.11
41 0.12
42 0.13
43 0.13
44 0.13
45 0.12
46 0.13
47 0.1
48 0.09
49 0.08
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.05
55 0.06
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.06
60 0.07
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.08
65 0.12
66 0.12
67 0.12
68 0.15
69 0.16
70 0.17
71 0.15
72 0.17
73 0.14
74 0.2
75 0.2
76 0.17
77 0.18
78 0.19
79 0.21
80 0.18
81 0.18
82 0.16
83 0.18
84 0.21
85 0.19
86 0.18
87 0.19
88 0.22
89 0.28
90 0.33
91 0.4
92 0.47
93 0.57
94 0.65
95 0.74
96 0.81
97 0.84
98 0.86
99 0.88
100 0.9
101 0.91
102 0.93
103 0.93
104 0.92
105 0.92
106 0.92
107 0.92