FuNGI

A0A165TRS1

Protein Details

Accession

A0A165TRS1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
302-321	KEKVKERDARKAKPRLRVNW	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
279-317	KRGKQRRASERLSSGDNKETLKAKEKVKERDARKAKPRL

Subcellular Location(s)

mito 10, extr 6, cyto 5, pero 2, E.R. 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MRVVATFHQPSSVVSSAKCKLTAAQEFVVVGKTNRVEIFSLQPDGLRRECHLEIWGRIICVKALPAGDLSKILVLTDHPDPRLIVLEYTADRQGSPSLVSKDYVELHDRVARPAEFVTDVLVSPSGRVAVVSCYTGKLKLIHFKEGKKPEAFDVSIPELYITALTFLHVEEDAYALGILHINHQQQLQLLSRDIDLANFEISPTPSVIVRSSILPSSTFPEIDSPHLLVPVPPFTSPEADESYDDTDDNPRIHRGGLLVLGGRKILFVEHESSEQQEVKRGKQRRASERLSSGDNKETLKAKEKVKERDARKAKPRLRVNWPWSEITACCPVDEDGRRFLIGDAYGRLAMLAFTDPLSLVLIPLGETSPATTLTYLASQVLYVGSHYGDSQLLRISPTPTSDADADTLPIPKGVATVEPSALGAPSPSAKGKGRAADMDWNREAREAKEAKDGRVVGTKGSYVDVVERSENVAPIVDAAMADLEGSGQIIACSGGRNCGSLKVIRTGADFREKAAIEGLTNVTNIWPVRTRFEDTIDSHVVASTLEDTYVFRIDSAEAITRLDPAMDGLLASAPTLAVKNVPRRTTANGRSVYVDSSLVVQVTPEKVRLVEYNAALGLFSLVSEGWDARKEGRSVVAADINASQIVLGLGRGRLALFNLSESRQFQMLKHRDFADVTYGPLEIAAVSCAPFDIAKNYASTIAVSFWGTNRVALLSLASAESYLSTLCEVSLPSLPRSLLLHNFGSGRNKKEADFRPHLLAGLADGTVVSFAFKEKDGELADQKQFSLGSAPIAFTTCVVDGRRAVFASGSRASVIYWDKQRLHQSPVMLKEPVVAARLNASAFPSCLMLATLSSLLIGNVRGVDKMQIKTVPFGLENPKRISHHAPLKAFLVACTRTAPPRIGDAEDRISSLKVLDDTTFSALSTFACEPGEEITATLAMSGKDEHPSPCSICIGTVEFQVDEREPSAGRIILFSLDSGAGLAPTLRMLASQDVGGCVYQLVNVKGMIVAAVNTSVMVFKTETMNASTIRLNKVSEWNHNYIVTSLVCNDRTLIVGDAISSVSMLRLDADGKLQSIARDYAPLWPVAVEAIGKGGVIGANSDCNLFTFALARADNRSTLERNGSYHIGDVVNKFIPGGLGSADLTNKLLEPKLVFFTSTGRIGVVLEMSDDISLHMTALQRNMAKRMIGPGNTFHAKWRAPANSKGHSDAEAAFGFLDGDFLEHYLSVPQAEKYLEGDNEAERISVSSAQIRDVLEKLQSLH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.3
3	0.33
4	0.35
5	0.35
6	0.28
7	0.29
8	0.37
9	0.43
10	0.41
11	0.37
12	0.36
13	0.36
14	0.35
15	0.34
16	0.26
17	0.19
18	0.19
19	0.19
20	0.21
21	0.22
22	0.23
23	0.22
24	0.23
25	0.3
26	0.29
27	0.3
28	0.27
29	0.28
30	0.3
31	0.33
32	0.33
33	0.29
34	0.27
35	0.31
36	0.32
37	0.32
38	0.34
39	0.34
40	0.33
41	0.37
42	0.37
43	0.31
44	0.31
45	0.3
46	0.25
47	0.2
48	0.19
49	0.16
50	0.15
51	0.15
52	0.16
53	0.17
54	0.17
55	0.17
56	0.16
57	0.15
58	0.14
59	0.13
60	0.11
61	0.1
62	0.13
63	0.19
64	0.23
65	0.22
66	0.24
67	0.24
68	0.25
69	0.28
70	0.25
71	0.19
72	0.15
73	0.19
74	0.19
75	0.22
76	0.23
77	0.19
78	0.17
79	0.18
80	0.19
81	0.16
82	0.17
83	0.21
84	0.23
85	0.24
86	0.25
87	0.25
88	0.26
89	0.28
90	0.29
91	0.27
92	0.24
93	0.26
94	0.32
95	0.32
96	0.31
97	0.33
98	0.3
99	0.27
100	0.27
101	0.26
102	0.2
103	0.19
104	0.19
105	0.15
106	0.14
107	0.14
108	0.15
109	0.12
110	0.11
111	0.11
112	0.1
113	0.08
114	0.09
115	0.08
116	0.11
117	0.12
118	0.14
119	0.14
120	0.16
121	0.18
122	0.19
123	0.21
124	0.21
125	0.25
126	0.32
127	0.35
128	0.42
129	0.47
130	0.53
131	0.6
132	0.64
133	0.66
134	0.6
135	0.59
136	0.53
137	0.54
138	0.49
139	0.4
140	0.38
141	0.35
142	0.32
143	0.3
144	0.25
145	0.18
146	0.17
147	0.16
148	0.1
149	0.07
150	0.06
151	0.06
152	0.07
153	0.06
154	0.08
155	0.07
156	0.08
157	0.07
158	0.08
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.05
163	0.05
164	0.07
165	0.07
166	0.09
167	0.14
168	0.15
169	0.17
170	0.17
171	0.18
172	0.18
173	0.22
174	0.23
175	0.21
176	0.21
177	0.2
178	0.2
179	0.21
180	0.19
181	0.16
182	0.14
183	0.12
184	0.12
185	0.1
186	0.11
187	0.11
188	0.12
189	0.13
190	0.12
191	0.11
192	0.11
193	0.13
194	0.14
195	0.14
196	0.14
197	0.15
198	0.16
199	0.17
200	0.17
201	0.16
202	0.17
203	0.18
204	0.19
205	0.17
206	0.16
207	0.18
208	0.19
209	0.22
210	0.23
211	0.2
212	0.19
213	0.2
214	0.19
215	0.17
216	0.18
217	0.18
218	0.17
219	0.15
220	0.17
221	0.18
222	0.2
223	0.2
224	0.21
225	0.21
226	0.21
227	0.21
228	0.22
229	0.23
230	0.2
231	0.19
232	0.17
233	0.17
234	0.19
235	0.19
236	0.19
237	0.18
238	0.18
239	0.19
240	0.19
241	0.16
242	0.15
243	0.15
244	0.14
245	0.14
246	0.15
247	0.15
248	0.14
249	0.13
250	0.11
251	0.09
252	0.09
253	0.08
254	0.1
255	0.13
256	0.15
257	0.17
258	0.18
259	0.19
260	0.22
261	0.23
262	0.21
263	0.25
264	0.26
265	0.31
266	0.39
267	0.44
268	0.49
269	0.55
270	0.64
271	0.67
272	0.73
273	0.72
274	0.7
275	0.69
276	0.65
277	0.62
278	0.56
279	0.5
280	0.46
281	0.42
282	0.36
283	0.33
284	0.35
285	0.33
286	0.37
287	0.4
288	0.41
289	0.46
290	0.53
291	0.58
292	0.63
293	0.68
294	0.65
295	0.69
296	0.73
297	0.75
298	0.76
299	0.78
300	0.75
301	0.76
302	0.8
303	0.77
304	0.78
305	0.79
306	0.76
307	0.75
308	0.72
309	0.64
310	0.56
311	0.5
312	0.4
313	0.34
314	0.34
315	0.24
316	0.21
317	0.2
318	0.2
319	0.24
320	0.29
321	0.28
322	0.24
323	0.25
324	0.25
325	0.25
326	0.24
327	0.2
328	0.16
329	0.15
330	0.13
331	0.13
332	0.13
333	0.12
334	0.11
335	0.09
336	0.07
337	0.07
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.07
345	0.06
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.06
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.08
361	0.09
362	0.08
363	0.08
364	0.07
365	0.06
366	0.07
367	0.07
368	0.06
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.06
375	0.07
376	0.07
377	0.08
378	0.08
379	0.09
380	0.1
381	0.11
382	0.12
383	0.12
384	0.13
385	0.15
386	0.15
387	0.17
388	0.16
389	0.15
390	0.15
391	0.14
392	0.13
393	0.11
394	0.12
395	0.1
396	0.09
397	0.09
398	0.07
399	0.08
400	0.07
401	0.08
402	0.09
403	0.11
404	0.11
405	0.11
406	0.11
407	0.11
408	0.1
409	0.08
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.07
414	0.08
415	0.11
416	0.13
417	0.18
418	0.21
419	0.24
420	0.25
421	0.25
422	0.27
423	0.32
424	0.33
425	0.35
426	0.33
427	0.3
428	0.28
429	0.29
430	0.28
431	0.2
432	0.27
433	0.23
434	0.23
435	0.32
436	0.33
437	0.32
438	0.36
439	0.35
440	0.28
441	0.32
442	0.3
443	0.21
444	0.21
445	0.2
446	0.15
447	0.16
448	0.14
449	0.08
450	0.1
451	0.1
452	0.11
453	0.11
454	0.1
455	0.12
456	0.12
457	0.12
458	0.1
459	0.09
460	0.07
461	0.07
462	0.07
463	0.05
464	0.04
465	0.04
466	0.04
467	0.03
468	0.03
469	0.03
470	0.02
471	0.02
472	0.02
473	0.02
474	0.02
475	0.02
476	0.03
477	0.03
478	0.03
479	0.05
480	0.05
481	0.08
482	0.08
483	0.1
484	0.1
485	0.12
486	0.14
487	0.15
488	0.17
489	0.18
490	0.19
491	0.18
492	0.2
493	0.2
494	0.21
495	0.26
496	0.24
497	0.21
498	0.25
499	0.24
500	0.23
501	0.22
502	0.2
503	0.12
504	0.13
505	0.14
506	0.09
507	0.09
508	0.08
509	0.07
510	0.09
511	0.09
512	0.09
513	0.12
514	0.12
515	0.16
516	0.19
517	0.22
518	0.21
519	0.25
520	0.28
521	0.25
522	0.3
523	0.28
524	0.25
525	0.22
526	0.21
527	0.17
528	0.12
529	0.11
530	0.06
531	0.05
532	0.04
533	0.05
534	0.05
535	0.06
536	0.07
537	0.07
538	0.06
539	0.06
540	0.06
541	0.07
542	0.08
543	0.08
544	0.08
545	0.08
546	0.08
547	0.08
548	0.08
549	0.07
550	0.06
551	0.05
552	0.05
553	0.04
554	0.04
555	0.03
556	0.04
557	0.04
558	0.04
559	0.03
560	0.03
561	0.03
562	0.04
563	0.04
564	0.06
565	0.1
566	0.18
567	0.23
568	0.24
569	0.27
570	0.29
571	0.34
572	0.41
573	0.43
574	0.43
575	0.4
576	0.4
577	0.39
578	0.38
579	0.33
580	0.24
581	0.18
582	0.11
583	0.1
584	0.1
585	0.07
586	0.06
587	0.06
588	0.06
589	0.08
590	0.08
591	0.08
592	0.08
593	0.08
594	0.09
595	0.1
596	0.13
597	0.14
598	0.14
599	0.14
600	0.13
601	0.13
602	0.12
603	0.1
604	0.07
605	0.03
606	0.03
607	0.03
608	0.03
609	0.03
610	0.03
611	0.04
612	0.04
613	0.05
614	0.06
615	0.07
616	0.11
617	0.11
618	0.11
619	0.13
620	0.13
621	0.14
622	0.14
623	0.14
624	0.11
625	0.12
626	0.11
627	0.1
628	0.09
629	0.07
630	0.06
631	0.04
632	0.04
633	0.03
634	0.03
635	0.03
636	0.04
637	0.04
638	0.04
639	0.04
640	0.04
641	0.05
642	0.06
643	0.05
644	0.07
645	0.08
646	0.09
647	0.1
648	0.11
649	0.11
650	0.12
651	0.13
652	0.12
653	0.22
654	0.29
655	0.29
656	0.31
657	0.32
658	0.31
659	0.3
660	0.3
661	0.25
662	0.18
663	0.16
664	0.14
665	0.13
666	0.11
667	0.11
668	0.1
669	0.04
670	0.04
671	0.04
672	0.03
673	0.03
674	0.03
675	0.03
676	0.04
677	0.04
678	0.04
679	0.06
680	0.07
681	0.08
682	0.08
683	0.09
684	0.09
685	0.09
686	0.09
687	0.08
688	0.07
689	0.07
690	0.07
691	0.07
692	0.06
693	0.1
694	0.09
695	0.09
696	0.09
697	0.08
698	0.08
699	0.08
700	0.08
701	0.04
702	0.05
703	0.05
704	0.04
705	0.04
706	0.04
707	0.04
708	0.04
709	0.04
710	0.03
711	0.04
712	0.04
713	0.04
714	0.04
715	0.04
716	0.06
717	0.09
718	0.11
719	0.11
720	0.13
721	0.13
722	0.13
723	0.15
724	0.15
725	0.15
726	0.17
727	0.17
728	0.16
729	0.18
730	0.18
731	0.25
732	0.27
733	0.27
734	0.28
735	0.29
736	0.29
737	0.37
738	0.43
739	0.44
740	0.46
741	0.45
742	0.44
743	0.43
744	0.42
745	0.33
746	0.25
747	0.17
748	0.11
749	0.09
750	0.05
751	0.04
752	0.04
753	0.04
754	0.04
755	0.03
756	0.03
757	0.03
758	0.05
759	0.05
760	0.07
761	0.07
762	0.1
763	0.12
764	0.14
765	0.17
766	0.21
767	0.22
768	0.21
769	0.21
770	0.19
771	0.17
772	0.15
773	0.14
774	0.09
775	0.09
776	0.09
777	0.09
778	0.09
779	0.1
780	0.1
781	0.08
782	0.09
783	0.07
784	0.09
785	0.1
786	0.11
787	0.11
788	0.13
789	0.14
790	0.13
791	0.13
792	0.11
793	0.11
794	0.15
795	0.15
796	0.14
797	0.13
798	0.13
799	0.12
800	0.15
801	0.17
802	0.16
803	0.2
804	0.25
805	0.26
806	0.31
807	0.39
808	0.38
809	0.42
810	0.39
811	0.39
812	0.39
813	0.42
814	0.41
815	0.33
816	0.3
817	0.25
818	0.24
819	0.21
820	0.17
821	0.12
822	0.09
823	0.11
824	0.12
825	0.11
826	0.1
827	0.1
828	0.09
829	0.09
830	0.1
831	0.08
832	0.07
833	0.07
834	0.07
835	0.06
836	0.05
837	0.06
838	0.06
839	0.05
840	0.06
841	0.05
842	0.05
843	0.05
844	0.06
845	0.05
846	0.06
847	0.06
848	0.06
849	0.07
850	0.12
851	0.16
852	0.17
853	0.19
854	0.21
855	0.21
856	0.23
857	0.24
858	0.21
859	0.17
860	0.19
861	0.26
862	0.29
863	0.33
864	0.34
865	0.36
866	0.36
867	0.4
868	0.43
869	0.42
870	0.45
871	0.48
872	0.46
873	0.44
874	0.44
875	0.42
876	0.36
877	0.28
878	0.24
879	0.18
880	0.18
881	0.18
882	0.18
883	0.19
884	0.21
885	0.22
886	0.18
887	0.22
888	0.23
889	0.23
890	0.24
891	0.25
892	0.27
893	0.26
894	0.26
895	0.22
896	0.2
897	0.17
898	0.15
899	0.13
900	0.09
901	0.1
902	0.1
903	0.1
904	0.11
905	0.13
906	0.13
907	0.12
908	0.11
909	0.1
910	0.09
911	0.12
912	0.1
913	0.09
914	0.09
915	0.09
916	0.1
917	0.11
918	0.12
919	0.09
920	0.08
921	0.08
922	0.08
923	0.08
924	0.08
925	0.07
926	0.06
927	0.06
928	0.08
929	0.09
930	0.1
931	0.12
932	0.13
933	0.15
934	0.18
935	0.18
936	0.19
937	0.19
938	0.17
939	0.16
940	0.17
941	0.17
942	0.16
943	0.16
944	0.15
945	0.13
946	0.14
947	0.15
948	0.14
949	0.12
950	0.12
951	0.12
952	0.11
953	0.12
954	0.13
955	0.13
956	0.12
957	0.12
958	0.12
959	0.11
960	0.11
961	0.1
962	0.09
963	0.07
964	0.07
965	0.07
966	0.06
967	0.05
968	0.05
969	0.05
970	0.04
971	0.04
972	0.04
973	0.04
974	0.04
975	0.06
976	0.08
977	0.08
978	0.09
979	0.09
980	0.09
981	0.1
982	0.1
983	0.08
984	0.07
985	0.06
986	0.08
987	0.11
988	0.11
989	0.12
990	0.12
991	0.12
992	0.12
993	0.12
994	0.09
995	0.06
996	0.06
997	0.05
998	0.05
999	0.05
1000	0.05
1001	0.05
1002	0.05
1003	0.05
1004	0.07
1005	0.07
1006	0.08
1007	0.1
1008	0.12
1009	0.13
1010	0.15
1011	0.17
1012	0.16
1013	0.18
1014	0.2
1015	0.21
1016	0.24
1017	0.24
1018	0.23
1019	0.24
1020	0.32
1021	0.34
1022	0.4
1023	0.43
1024	0.44
1025	0.45
1026	0.44
1027	0.42
1028	0.34
1029	0.32
1030	0.23
1031	0.17
1032	0.16
1033	0.18
1034	0.18
1035	0.17
1036	0.18
1037	0.15
1038	0.16
1039	0.16
1040	0.15
1041	0.11
1042	0.11
1043	0.1
1044	0.1
1045	0.1
1046	0.08
1047	0.07
1048	0.05
1049	0.05
1050	0.05
1051	0.05
1052	0.05
1053	0.06
1054	0.07
1055	0.08
1056	0.11
1057	0.11
1058	0.12
1059	0.13
1060	0.13
1061	0.13
1062	0.15
1063	0.17
1064	0.14
1065	0.16
1066	0.16
1067	0.21
1068	0.21
1069	0.21
1070	0.18
1071	0.16
1072	0.16
1073	0.14
1074	0.14
1075	0.07
1076	0.06
1077	0.07
1078	0.06
1079	0.06
1080	0.06
1081	0.06
1082	0.06
1083	0.06
1084	0.07
1085	0.07
1086	0.08
1087	0.09
1088	0.1
1089	0.09
1090	0.09
1091	0.11
1092	0.1
1093	0.1
1094	0.11
1095	0.12
1096	0.16
1097	0.17
1098	0.17
1099	0.19
1100	0.21
1101	0.22
1102	0.23
1103	0.26
1104	0.25
1105	0.28
1106	0.34
1107	0.32
1108	0.32
1109	0.35
1110	0.34
1111	0.3
1112	0.28
1113	0.27
1114	0.22
1115	0.22
1116	0.21
1117	0.21
1118	0.2
1119	0.19
1120	0.18
1121	0.15
1122	0.14
1123	0.12
1124	0.11
1125	0.08
1126	0.08
1127	0.09
1128	0.1
1129	0.11
1130	0.11
1131	0.11
1132	0.11
1133	0.11
1134	0.12
1135	0.13
1136	0.14
1137	0.16
1138	0.18
1139	0.22
1140	0.23
1141	0.22
1142	0.21
1143	0.24
1144	0.25
1145	0.25
1146	0.22
1147	0.17
1148	0.17
1149	0.17
1150	0.17
1151	0.13
1152	0.09
1153	0.08
1154	0.08
1155	0.08
1156	0.08
1157	0.07
1158	0.07
1159	0.08
1160	0.08
1161	0.07
1162	0.09
1163	0.11
1164	0.13
1165	0.16
1166	0.2
1167	0.23
1168	0.25
1169	0.29
1170	0.3
1171	0.29
1172	0.28
1173	0.34
1174	0.36
1175	0.36
1176	0.36
1177	0.36
1178	0.41
1179	0.43
1180	0.42
1181	0.38
1182	0.39
1183	0.36
1184	0.37
1185	0.42
1186	0.44
1187	0.47
1188	0.55
1189	0.58
1190	0.59
1191	0.62
1192	0.63
1193	0.56
1194	0.48
1195	0.45
1196	0.37
1197	0.34
1198	0.25
1199	0.22
1200	0.17
1201	0.15
1202	0.13
1203	0.11
1204	0.1
1205	0.05
1206	0.06
1207	0.06
1208	0.06
1209	0.07
1210	0.06
1211	0.07
1212	0.08
1213	0.09
1214	0.1
1215	0.12
1216	0.12
1217	0.14
1218	0.15
1219	0.15
1220	0.17
1221	0.22
1222	0.2
1223	0.21
1224	0.22
1225	0.2
1226	0.21
1227	0.21
1228	0.18
1229	0.13
1230	0.13
1231	0.13
1232	0.14
1233	0.15
1234	0.19
1235	0.2
1236	0.21
1237	0.24
1238	0.24
1239	0.25
1240	0.24
1241	0.24
1242	0.2

A0A165TRS1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer