FuNGI

A0A165QKX6

Protein Details

Accession

A0A165QKX6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
65-89	GDILRKARAARERKERKTENAEGGR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
69-81	RKARAARERKERK

Subcellular Location(s)

cyto 11, nucl 6, cyto_pero 6, mito 4, cysk 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MPVVQPVMKLEIPEPVVAARRSGGESGDWRGQVEEENRRRVETMTEEEREQERRDVLERFGPDVGDILRKARAARERKERKTENAEGGREEIPLVPGSPSRSPPLSIDGRSSRPSSPPHSALSRPGTRPSSRADRKIRFAELMPTDIHVYESAPPSPRKKALPLPPPTPEDGPTTPLGQWKGSVGPIRRRDAQALIADPSAATVSSLEEGTPEDIRRRFFPTAPAHDPSLEWIEGGPSSAVLSTPTESTLRFDLTGTPIPPELSATLPTHLGLHHHADGDHAGYTLEDIFLLSRSTVPAQRATMLGVLSRIVRRLGKGRACDSEQGIEQLQGQVDAVRKRALAAGVEAMGERGSVGARAIDLMWEAIVGWEEELVAIEGVELKLVRQQDISPSGSDSKGEDALTSLPLEYVLSQVSSAFATGAQPVETLSQLLAILHRLAQHTNDMANVIVSSTGLVASVIQRFLLTSIPPIDTTPPPVPFALQLLATLASASRTNASALLDPADALLRFVTTLPSASPYPLALATALIHGTLHLYAVFASYGLYSHIATTASEHFGRLGQYILSEECKSRQLREAWLGLLEAWMVCAQDPHRTTPGHEILWSQVAGWGWGDDVLEIRGTLTDADGSVWTALWRAVAAWLEGAKINGVKGGEKERSVVIAAFQAGFKDGLEKTIIENSGRVLSKVLGQLASTGVRALQPEELPTLQEMAQHADRLAAALRLWLACISPQSSGPLDSPPFQLPFRELSDLCAQLTTHPVWECVFVQGSVPYGHAFCRPLSLLLSTYLQLWRRTPGVSDDLWMAQALAIMNRLLPGDEESARRIVELVTGLVTPEFMNVRGWTVPPVIWEGGGMDSIKPFLEFSLRPRVDAYIGPRWMSPESLSLSVTQRLPAAGKVMASDRRDLPLPITRDWMCVSLDYLLRSGDSDVFKSLPSSWDASETEIVRASLLLARIVREVLQLHGLQAFSMTREETIFSCMKVFMLEHGQQHNDSTEEVFRDKIVGQFMDDLVAPFTASASPRSLSLPTPVDSSQSLERVATRFLGASTPFYQFYTDFVALYDATSFSHPLFARLLLPPTSMRYPVDFRKFLWADYAHLLKTVMTPIEAVLTDNLGEYLWPVERDPEVVGAYLRALVKGLPEGFLRFVAVHHVACNIWQDLSDTTEEKAQRLLRAVVDQGSLEVIREVALYRQTREGNMTLPPQCFQDMGEWRDRRLDFVKRFGERHMTDCLKGLFDKT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.19
3	0.25
4	0.24
5	0.24
6	0.19
7	0.2
8	0.22
9	0.22
10	0.21
11	0.19
12	0.22
13	0.27
14	0.31
15	0.29
16	0.28
17	0.27
18	0.27
19	0.29
20	0.33
21	0.38
22	0.4
23	0.49
24	0.49
25	0.5
26	0.51
27	0.46
28	0.44
29	0.4
30	0.4
31	0.4
32	0.42
33	0.4
34	0.44
35	0.46
36	0.45
37	0.41
38	0.37
39	0.32
40	0.32
41	0.36
42	0.35
43	0.34
44	0.37
45	0.36
46	0.34
47	0.32
48	0.29
49	0.25
50	0.24
51	0.22
52	0.2
53	0.19
54	0.18
55	0.2
56	0.21
57	0.23
58	0.28
59	0.36
60	0.4
61	0.49
62	0.58
63	0.66
64	0.74
65	0.83
66	0.82
67	0.82
68	0.83
69	0.81
70	0.81
71	0.78
72	0.71
73	0.62
74	0.59
75	0.51
76	0.41
77	0.34
78	0.24
79	0.18
80	0.16
81	0.15
82	0.13
83	0.14
84	0.19
85	0.22
86	0.24
87	0.27
88	0.29
89	0.3
90	0.3
91	0.35
92	0.37
93	0.34
94	0.39
95	0.4
96	0.43
97	0.45
98	0.46
99	0.41
100	0.41
101	0.45
102	0.44
103	0.47
104	0.46
105	0.47
106	0.49
107	0.49
108	0.51
109	0.54
110	0.55
111	0.49
112	0.53
113	0.54
114	0.51
115	0.52
116	0.51
117	0.54
118	0.55
119	0.62
120	0.65
121	0.66
122	0.71
123	0.75
124	0.71
125	0.63
126	0.56
127	0.55
128	0.47
129	0.42
130	0.35
131	0.3
132	0.27
133	0.24
134	0.23
135	0.15
136	0.13
137	0.15
138	0.18
139	0.2
140	0.24
141	0.29
142	0.33
143	0.4
144	0.44
145	0.44
146	0.49
147	0.55
148	0.59
149	0.64
150	0.67
151	0.66
152	0.67
153	0.66
154	0.63
155	0.55
156	0.47
157	0.44
158	0.38
159	0.35
160	0.3
161	0.29
162	0.26
163	0.29
164	0.29
165	0.23
166	0.22
167	0.2
168	0.21
169	0.23
170	0.28
171	0.3
172	0.38
173	0.45
174	0.5
175	0.53
176	0.54
177	0.53
178	0.5
179	0.49
180	0.43
181	0.38
182	0.35
183	0.29
184	0.26
185	0.22
186	0.2
187	0.14
188	0.09
189	0.07
190	0.05
191	0.06
192	0.07
193	0.08
194	0.07
195	0.07
196	0.08
197	0.1
198	0.13
199	0.13
200	0.19
201	0.21
202	0.24
203	0.27
204	0.32
205	0.33
206	0.32
207	0.4
208	0.43
209	0.49
210	0.52
211	0.52
212	0.47
213	0.44
214	0.43
215	0.37
216	0.32
217	0.23
218	0.18
219	0.15
220	0.14
221	0.13
222	0.14
223	0.1
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.08
230	0.08
231	0.09
232	0.11
233	0.11
234	0.12
235	0.14
236	0.15
237	0.15
238	0.14
239	0.15
240	0.16
241	0.2
242	0.24
243	0.22
244	0.21
245	0.2
246	0.2
247	0.2
248	0.19
249	0.15
250	0.12
251	0.15
252	0.15
253	0.15
254	0.15
255	0.15
256	0.14
257	0.13
258	0.14
259	0.13
260	0.17
261	0.17
262	0.17
263	0.17
264	0.18
265	0.18
266	0.17
267	0.14
268	0.1
269	0.08
270	0.07
271	0.08
272	0.07
273	0.06
274	0.05
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.06
279	0.06
280	0.06
281	0.08
282	0.11
283	0.14
284	0.16
285	0.18
286	0.19
287	0.2
288	0.2
289	0.2
290	0.19
291	0.15
292	0.14
293	0.11
294	0.11
295	0.12
296	0.12
297	0.12
298	0.13
299	0.14
300	0.17
301	0.23
302	0.31
303	0.34
304	0.38
305	0.41
306	0.44
307	0.45
308	0.45
309	0.41
310	0.36
311	0.31
312	0.28
313	0.24
314	0.19
315	0.17
316	0.16
317	0.14
318	0.1
319	0.1
320	0.1
321	0.14
322	0.15
323	0.16
324	0.16
325	0.16
326	0.16
327	0.18
328	0.17
329	0.14
330	0.13
331	0.13
332	0.12
333	0.12
334	0.11
335	0.09
336	0.08
337	0.07
338	0.05
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.03
358	0.03
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.03
363	0.03
364	0.03
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.05
369	0.04
370	0.07
371	0.08
372	0.09
373	0.09
374	0.1
375	0.15
376	0.19
377	0.21
378	0.19
379	0.2
380	0.22
381	0.21
382	0.21
383	0.16
384	0.14
385	0.14
386	0.13
387	0.11
388	0.1
389	0.11
390	0.11
391	0.11
392	0.08
393	0.07
394	0.07
395	0.07
396	0.06
397	0.06
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.06
403	0.06
404	0.05
405	0.05
406	0.04
407	0.05
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.06
413	0.07
414	0.07
415	0.06
416	0.05
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.06
421	0.06
422	0.06
423	0.07
424	0.08
425	0.09
426	0.1
427	0.11
428	0.12
429	0.12
430	0.12
431	0.11
432	0.1
433	0.09
434	0.08
435	0.07
436	0.05
437	0.04
438	0.04
439	0.04
440	0.03
441	0.03
442	0.03
443	0.03
444	0.03
445	0.05
446	0.07
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.07
452	0.08
453	0.07
454	0.07
455	0.09
456	0.1
457	0.11
458	0.11
459	0.14
460	0.13
461	0.18
462	0.19
463	0.19
464	0.2
465	0.19
466	0.19
467	0.16
468	0.18
469	0.13
470	0.1
471	0.09
472	0.08
473	0.08
474	0.07
475	0.07
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.06
480	0.06
481	0.06
482	0.07
483	0.08
484	0.09
485	0.09
486	0.09
487	0.1
488	0.09
489	0.08
490	0.08
491	0.08
492	0.07
493	0.06
494	0.06
495	0.04
496	0.05
497	0.05
498	0.06
499	0.05
500	0.05
501	0.05
502	0.08
503	0.09
504	0.09
505	0.09
506	0.08
507	0.09
508	0.08
509	0.08
510	0.06
511	0.06
512	0.06
513	0.06
514	0.06
515	0.05
516	0.04
517	0.04
518	0.05
519	0.04
520	0.04
521	0.03
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.04
526	0.03
527	0.04
528	0.04
529	0.04
530	0.04
531	0.05
532	0.05
533	0.05
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.08
538	0.09
539	0.1
540	0.1
541	0.1
542	0.1
543	0.11
544	0.11
545	0.1
546	0.09
547	0.06
548	0.06
549	0.07
550	0.08
551	0.09
552	0.09
553	0.09
554	0.1
555	0.16
556	0.16
557	0.17
558	0.22
559	0.22
560	0.25
561	0.29
562	0.29
563	0.23
564	0.23
565	0.21
566	0.15
567	0.13
568	0.09
569	0.05
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.03
574	0.05
575	0.05
576	0.11
577	0.13
578	0.15
579	0.18
580	0.18
581	0.2
582	0.26
583	0.29
584	0.23
585	0.23
586	0.21
587	0.18
588	0.2
589	0.18
590	0.11
591	0.09
592	0.09
593	0.08
594	0.08
595	0.07
596	0.05
597	0.05
598	0.05
599	0.03
600	0.04
601	0.04
602	0.04
603	0.04
604	0.04
605	0.03
606	0.04
607	0.04
608	0.03
609	0.03
610	0.03
611	0.04
612	0.04
613	0.04
614	0.04
615	0.04
616	0.04
617	0.04
618	0.04
619	0.04
620	0.04
621	0.03
622	0.05
623	0.05
624	0.05
625	0.05
626	0.05
627	0.06
628	0.06
629	0.06
630	0.05
631	0.05
632	0.05
633	0.06
634	0.06
635	0.06
636	0.08
637	0.12
638	0.14
639	0.14
640	0.15
641	0.14
642	0.14
643	0.14
644	0.13
645	0.08
646	0.08
647	0.08
648	0.07
649	0.07
650	0.06
651	0.06
652	0.06
653	0.06
654	0.07
655	0.07
656	0.08
657	0.08
658	0.09
659	0.09
660	0.12
661	0.13
662	0.1
663	0.11
664	0.1
665	0.14
666	0.14
667	0.13
668	0.11
669	0.11
670	0.14
671	0.15
672	0.15
673	0.1
674	0.1
675	0.1
676	0.11
677	0.11
678	0.08
679	0.06
680	0.06
681	0.07
682	0.07
683	0.07
684	0.08
685	0.08
686	0.09
687	0.1
688	0.1
689	0.1
690	0.1
691	0.1
692	0.08
693	0.1
694	0.09
695	0.11
696	0.12
697	0.12
698	0.12
699	0.11
700	0.1
701	0.09
702	0.09
703	0.06
704	0.05
705	0.06
706	0.06
707	0.06
708	0.06
709	0.06
710	0.05
711	0.05
712	0.06
713	0.07
714	0.07
715	0.08
716	0.1
717	0.1
718	0.11
719	0.12
720	0.14
721	0.14
722	0.15
723	0.17
724	0.17
725	0.18
726	0.17
727	0.17
728	0.16
729	0.18
730	0.19
731	0.2
732	0.18
733	0.19
734	0.23
735	0.23
736	0.21
737	0.19
738	0.16
739	0.13
740	0.16
741	0.13
742	0.12
743	0.12
744	0.12
745	0.12
746	0.14
747	0.14
748	0.12
749	0.12
750	0.1
751	0.1
752	0.09
753	0.1
754	0.09
755	0.09
756	0.08
757	0.08
758	0.09
759	0.1
760	0.11
761	0.1
762	0.12
763	0.12
764	0.12
765	0.13
766	0.13
767	0.12
768	0.12
769	0.13
770	0.11
771	0.12
772	0.14
773	0.17
774	0.17
775	0.17
776	0.18
777	0.18
778	0.19
779	0.18
780	0.19
781	0.19
782	0.18
783	0.18
784	0.17
785	0.16
786	0.16
787	0.14
788	0.1
789	0.07
790	0.08
791	0.07
792	0.06
793	0.06
794	0.06
795	0.06
796	0.06
797	0.06
798	0.05
799	0.05
800	0.07
801	0.09
802	0.11
803	0.13
804	0.14
805	0.15
806	0.15
807	0.15
808	0.13
809	0.1
810	0.1
811	0.09
812	0.08
813	0.07
814	0.07
815	0.07
816	0.07
817	0.07
818	0.06
819	0.06
820	0.06
821	0.06
822	0.08
823	0.08
824	0.1
825	0.11
826	0.11
827	0.12
828	0.12
829	0.12
830	0.11
831	0.14
832	0.12
833	0.11
834	0.11
835	0.1
836	0.09
837	0.1
838	0.09
839	0.06
840	0.06
841	0.07
842	0.07
843	0.06
844	0.06
845	0.06
846	0.1
847	0.1
848	0.15
849	0.26
850	0.26
851	0.26
852	0.27
853	0.28
854	0.25
855	0.27
856	0.29
857	0.26
858	0.27
859	0.27
860	0.27
861	0.28
862	0.27
863	0.25
864	0.2
865	0.15
866	0.17
867	0.17
868	0.18
869	0.17
870	0.19
871	0.21
872	0.2
873	0.17
874	0.15
875	0.15
876	0.15
877	0.13
878	0.14
879	0.11
880	0.11
881	0.11
882	0.15
883	0.2
884	0.21
885	0.23
886	0.22
887	0.23
888	0.25
889	0.24
890	0.23
891	0.25
892	0.27
893	0.25
894	0.29
895	0.28
896	0.28
897	0.29
898	0.27
899	0.21
900	0.17
901	0.17
902	0.15
903	0.16
904	0.15
905	0.14
906	0.12
907	0.12
908	0.12
909	0.12
910	0.14
911	0.14
912	0.14
913	0.15
914	0.15
915	0.15
916	0.16
917	0.16
918	0.13
919	0.14
920	0.15
921	0.14
922	0.17
923	0.18
924	0.19
925	0.22
926	0.21
927	0.2
928	0.18
929	0.18
930	0.14
931	0.13
932	0.12
933	0.1
934	0.1
935	0.11
936	0.1
937	0.11
938	0.12
939	0.13
940	0.12
941	0.12
942	0.12
943	0.11
944	0.14
945	0.13
946	0.13
947	0.15
948	0.14
949	0.12
950	0.12
951	0.11
952	0.09
953	0.1
954	0.09
955	0.08
956	0.09
957	0.11
958	0.1
959	0.15
960	0.15
961	0.14
962	0.15
963	0.14
964	0.14
965	0.13
966	0.13
967	0.1
968	0.16
969	0.2
970	0.23
971	0.26
972	0.28
973	0.27
974	0.28
975	0.27
976	0.21
977	0.18
978	0.16
979	0.15
980	0.15
981	0.16
982	0.15
983	0.14
984	0.15
985	0.16
986	0.16
987	0.17
988	0.15
989	0.15
990	0.17
991	0.17
992	0.16
993	0.15
994	0.13
995	0.1
996	0.09
997	0.08
998	0.06
999	0.07
1000	0.08
1001	0.09
1002	0.1
1003	0.12
1004	0.12
1005	0.13
1006	0.16
1007	0.17
1008	0.16
1009	0.21
1010	0.22
1011	0.21
1012	0.25
1013	0.24
1014	0.24
1015	0.23
1016	0.25
1017	0.23
1018	0.21
1019	0.21
1020	0.18
1021	0.2
1022	0.2
1023	0.2
1024	0.18
1025	0.15
1026	0.14
1027	0.13
1028	0.16
1029	0.15
1030	0.18
1031	0.19
1032	0.2
1033	0.21
1034	0.21
1035	0.22
1036	0.19
1037	0.2
1038	0.22
1039	0.2
1040	0.18
1041	0.17
1042	0.18
1043	0.16
1044	0.16
1045	0.15
1046	0.08
1047	0.09
1048	0.1
1049	0.1
1050	0.09
1051	0.15
1052	0.15
1053	0.16
1054	0.18
1055	0.18
1056	0.2
1057	0.21
1058	0.25
1059	0.19
1060	0.21
1061	0.21
1062	0.24
1063	0.26
1064	0.25
1065	0.24
1066	0.25
1067	0.31
1068	0.38
1069	0.45
1070	0.42
1071	0.4
1072	0.49
1073	0.48
1074	0.44
1075	0.45
1076	0.37
1077	0.31
1078	0.35
1079	0.37
1080	0.26
1081	0.26
1082	0.26
1083	0.19
1084	0.2
1085	0.19
1086	0.15
1087	0.12
1088	0.12
1089	0.11
1090	0.14
1091	0.13
1092	0.12
1093	0.1
1094	0.1
1095	0.1
1096	0.09
1097	0.09
1098	0.07
1099	0.06
1100	0.06
1101	0.08
1102	0.09
1103	0.1
1104	0.1
1105	0.13
1106	0.13
1107	0.15
1108	0.16
1109	0.16
1110	0.15
1111	0.15
1112	0.15
1113	0.12
1114	0.12
1115	0.14
1116	0.13
1117	0.11
1118	0.11
1119	0.1
1120	0.11
1121	0.16
1122	0.16
1123	0.15
1124	0.16
1125	0.18
1126	0.19
1127	0.19
1128	0.18
1129	0.14
1130	0.13
1131	0.18
1132	0.19
1133	0.18
1134	0.17
1135	0.19
1136	0.17
1137	0.19
1138	0.22
1139	0.17
1140	0.14
1141	0.14
1142	0.15
1143	0.15
1144	0.18
1145	0.19
1146	0.16
1147	0.16
1148	0.22
1149	0.22
1150	0.21
1151	0.26
1152	0.27
1153	0.27
1154	0.31
1155	0.33
1156	0.3
1157	0.32
1158	0.34
1159	0.3
1160	0.27
1161	0.24
1162	0.2
1163	0.19
1164	0.16
1165	0.13
1166	0.11
1167	0.09
1168	0.08
1169	0.08
1170	0.09
1171	0.1
1172	0.18
1173	0.2
1174	0.22
1175	0.29
1176	0.3
1177	0.32
1178	0.36
1179	0.35
1180	0.3
1181	0.32
1182	0.37
1183	0.36
1184	0.36
1185	0.35
1186	0.32
1187	0.32
1188	0.29
1189	0.25
1190	0.27
1191	0.3
1192	0.34
1193	0.43
1194	0.42
1195	0.42
1196	0.5
1197	0.49
1198	0.46
1199	0.45
1200	0.5
1201	0.46
1202	0.54
1203	0.62
1204	0.59
1205	0.61
1206	0.6
1207	0.63
1208	0.55
1209	0.52
1210	0.53
1211	0.48
1212	0.43
1213	0.46
1214	0.42
1215	0.35

A0A165QKX6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer