Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165SVI0

Protein Details
Accession A0A165SVI0    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
146-172PASVWDPPKKPKPPKSNKTWRGRSQGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
153-165PKKPKPPKSNKTW
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MFSIPIAPKRKYQDADFSDDDEEPTLGRQVLPVANLPADFNGVPEDGLQYLFTVRRDARSLPQITRVANPYEVKEEQRESVIGEMNAEHPLLPSEEWREVFLKRFKNFRKNSMQPTLRVDVPSASRKLIPDKKERDLWWAFLTGQPASVWDPPKKPKPPKSNKTWRGRSQGSSMDTLVYSDSAEPSQELSYSLEDGRIFSTSSSEMWRVTTDGVELTSSLNAATSLPTPSGTPAPPDRIEELSSSNTAPSGPASGSLLEDIRPPEPTPTFMKQIDHRYALHLLMYFTHWINLHLERGSTPSPHAIADLHLRWIFVLLSRVEDYVSADETSLLRSLARACMSLIEEGRTRGLLDTAGITAEPPPIDEPACWMVITAVVSIWGQRDLWMDAEAMLRRLPT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.63
3 0.58
4 0.54
5 0.47
6 0.43
7 0.38
8 0.29
9 0.24
10 0.16
11 0.15
12 0.14
13 0.12
14 0.11
15 0.11
16 0.14
17 0.16
18 0.17
19 0.19
20 0.18
21 0.19
22 0.19
23 0.19
24 0.16
25 0.17
26 0.15
27 0.13
28 0.13
29 0.12
30 0.12
31 0.11
32 0.12
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.08
37 0.1
38 0.13
39 0.13
40 0.18
41 0.18
42 0.22
43 0.25
44 0.28
45 0.32
46 0.39
47 0.43
48 0.4
49 0.47
50 0.47
51 0.46
52 0.47
53 0.44
54 0.38
55 0.38
56 0.37
57 0.31
58 0.34
59 0.34
60 0.33
61 0.34
62 0.33
63 0.29
64 0.29
65 0.27
66 0.22
67 0.23
68 0.23
69 0.18
70 0.16
71 0.15
72 0.15
73 0.15
74 0.14
75 0.11
76 0.08
77 0.09
78 0.1
79 0.09
80 0.1
81 0.14
82 0.17
83 0.18
84 0.2
85 0.21
86 0.21
87 0.28
88 0.33
89 0.36
90 0.36
91 0.46
92 0.52
93 0.61
94 0.65
95 0.67
96 0.7
97 0.7
98 0.75
99 0.76
100 0.71
101 0.64
102 0.65
103 0.59
104 0.5
105 0.43
106 0.35
107 0.27
108 0.28
109 0.3
110 0.26
111 0.24
112 0.23
113 0.24
114 0.33
115 0.38
116 0.4
117 0.44
118 0.49
119 0.53
120 0.58
121 0.57
122 0.56
123 0.51
124 0.47
125 0.38
126 0.33
127 0.28
128 0.24
129 0.25
130 0.16
131 0.15
132 0.12
133 0.11
134 0.12
135 0.16
136 0.18
137 0.2
138 0.26
139 0.32
140 0.41
141 0.5
142 0.57
143 0.63
144 0.71
145 0.78
146 0.81
147 0.86
148 0.88
149 0.88
150 0.89
151 0.89
152 0.85
153 0.82
154 0.78
155 0.69
156 0.63
157 0.59
158 0.5
159 0.42
160 0.35
161 0.27
162 0.22
163 0.2
164 0.15
165 0.09
166 0.07
167 0.05
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.07
189 0.08
190 0.09
191 0.1
192 0.09
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.11
218 0.1
219 0.12
220 0.14
221 0.19
222 0.19
223 0.21
224 0.22
225 0.22
226 0.23
227 0.2
228 0.2
229 0.18
230 0.18
231 0.16
232 0.13
233 0.12
234 0.11
235 0.1
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.07
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.11
250 0.12
251 0.15
252 0.15
253 0.18
254 0.22
255 0.25
256 0.29
257 0.29
258 0.32
259 0.34
260 0.41
261 0.43
262 0.4
263 0.37
264 0.35
265 0.35
266 0.32
267 0.28
268 0.21
269 0.16
270 0.14
271 0.15
272 0.13
273 0.11
274 0.13
275 0.12
276 0.12
277 0.15
278 0.16
279 0.17
280 0.16
281 0.16
282 0.14
283 0.18
284 0.19
285 0.17
286 0.17
287 0.17
288 0.17
289 0.17
290 0.17
291 0.14
292 0.14
293 0.2
294 0.19
295 0.21
296 0.2
297 0.2
298 0.19
299 0.2
300 0.18
301 0.13
302 0.16
303 0.11
304 0.14
305 0.15
306 0.16
307 0.15
308 0.15
309 0.15
310 0.13
311 0.15
312 0.12
313 0.11
314 0.12
315 0.12
316 0.13
317 0.12
318 0.1
319 0.08
320 0.09
321 0.11
322 0.14
323 0.15
324 0.15
325 0.14
326 0.17
327 0.19
328 0.21
329 0.2
330 0.19
331 0.2
332 0.2
333 0.21
334 0.19
335 0.18
336 0.15
337 0.14
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.1
342 0.1
343 0.09
344 0.08
345 0.09
346 0.11
347 0.1
348 0.1
349 0.11
350 0.13
351 0.14
352 0.14
353 0.18
354 0.18
355 0.19
356 0.18
357 0.16
358 0.15
359 0.16
360 0.17
361 0.12
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.1
366 0.11
367 0.1
368 0.1
369 0.11
370 0.14
371 0.15
372 0.16
373 0.16
374 0.15
375 0.15
376 0.2
377 0.2
378 0.18