Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165QPV2

Protein Details
Accession A0A165QPV2    Localization Confidence Low Confidence Score 6.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-72EKKWTSVIRLQKKARRQAIMHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) pero 10, cyto_nucl 7.5, cyto 7, nucl 6, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017252  Dynein_regulator_LIS1  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR037190  LIS1_N  
IPR006594  LisH  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005874  C:microtubule  
GO:0005875  C:microtubule associated complex  
GO:0000922  C:spindle pole  
GO:0070840  F:dynein complex binding  
GO:0051301  P:cell division  
GO:0000132  P:establishment of mitotic spindle orientation  
GO:0051012  P:microtubule sliding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MSLLSERQKEELHKAILEYLHSNNFTDAFNSLKSDTGIEYTPDPKAKYAGLLEKKWTSVIRLQKKARRQAIMDLENRNAALQEELSLSPAKRAQMQTDWVPRAPAAYVLTGHRGQVLKVAFHPTFNLIASASEDGTVKIWDWETGEFERTLKGHTRAVNDVDFDSKGNLLVSCSSDLLIKIWDAQNEWRNTKTFSGHDHTVSSVRFMPGDQQIVSASRDKTIRVFDVASTHLVRTITGHSEWVRCVQPSDDGRLLASASNDQTARLSDPLSGETKMEFRGHDHVVEVVAFAPVAAYTAIRELGGLPDKDRVKRPGAYLATGSRDKAVKIWDCQSGQLIRTLAGHDNWVRALVFHPTGKFLLSASDDYTIRVWELTTGRCMKTVQAHGHFVTCLAWGPQSKSQGADGAKTNGDAKAEPDKFVNVVASGSVDQTIKIWLP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.4
3 0.37
4 0.35
5 0.31
6 0.27
7 0.29
8 0.29
9 0.29
10 0.25
11 0.25
12 0.23
13 0.21
14 0.18
15 0.15
16 0.15
17 0.17
18 0.17
19 0.17
20 0.17
21 0.17
22 0.17
23 0.17
24 0.17
25 0.16
26 0.19
27 0.2
28 0.24
29 0.27
30 0.27
31 0.26
32 0.27
33 0.26
34 0.27
35 0.3
36 0.35
37 0.38
38 0.4
39 0.45
40 0.45
41 0.45
42 0.44
43 0.39
44 0.33
45 0.33
46 0.4
47 0.45
48 0.52
49 0.61
50 0.65
51 0.74
52 0.8
53 0.8
54 0.76
55 0.69
56 0.69
57 0.69
58 0.7
59 0.66
60 0.6
61 0.53
62 0.48
63 0.45
64 0.35
65 0.25
66 0.18
67 0.13
68 0.09
69 0.09
70 0.11
71 0.11
72 0.12
73 0.14
74 0.14
75 0.16
76 0.18
77 0.18
78 0.22
79 0.24
80 0.27
81 0.29
82 0.34
83 0.39
84 0.45
85 0.47
86 0.41
87 0.4
88 0.35
89 0.31
90 0.27
91 0.22
92 0.14
93 0.13
94 0.14
95 0.14
96 0.19
97 0.18
98 0.18
99 0.19
100 0.18
101 0.17
102 0.2
103 0.2
104 0.17
105 0.19
106 0.25
107 0.21
108 0.21
109 0.22
110 0.19
111 0.19
112 0.18
113 0.16
114 0.1
115 0.1
116 0.12
117 0.11
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.09
123 0.09
124 0.07
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.1
130 0.13
131 0.14
132 0.15
133 0.14
134 0.14
135 0.15
136 0.14
137 0.16
138 0.18
139 0.19
140 0.22
141 0.26
142 0.29
143 0.3
144 0.33
145 0.31
146 0.27
147 0.25
148 0.22
149 0.19
150 0.15
151 0.13
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.07
157 0.08
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.11
171 0.16
172 0.22
173 0.25
174 0.27
175 0.26
176 0.26
177 0.27
178 0.28
179 0.26
180 0.22
181 0.23
182 0.27
183 0.27
184 0.27
185 0.26
186 0.25
187 0.24
188 0.22
189 0.18
190 0.14
191 0.12
192 0.12
193 0.11
194 0.13
195 0.13
196 0.15
197 0.13
198 0.12
199 0.12
200 0.13
201 0.15
202 0.15
203 0.13
204 0.14
205 0.14
206 0.14
207 0.16
208 0.17
209 0.16
210 0.14
211 0.14
212 0.12
213 0.14
214 0.15
215 0.15
216 0.13
217 0.12
218 0.13
219 0.12
220 0.11
221 0.11
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.13
226 0.13
227 0.14
228 0.15
229 0.17
230 0.16
231 0.14
232 0.15
233 0.13
234 0.18
235 0.19
236 0.23
237 0.21
238 0.2
239 0.2
240 0.19
241 0.19
242 0.13
243 0.12
244 0.09
245 0.08
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.11
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.1
256 0.12
257 0.14
258 0.13
259 0.12
260 0.12
261 0.13
262 0.14
263 0.14
264 0.12
265 0.13
266 0.17
267 0.18
268 0.18
269 0.17
270 0.15
271 0.14
272 0.14
273 0.12
274 0.07
275 0.06
276 0.05
277 0.04
278 0.04
279 0.03
280 0.04
281 0.04
282 0.03
283 0.04
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.09
290 0.13
291 0.14
292 0.14
293 0.2
294 0.24
295 0.27
296 0.32
297 0.33
298 0.34
299 0.37
300 0.39
301 0.42
302 0.41
303 0.39
304 0.37
305 0.35
306 0.35
307 0.33
308 0.31
309 0.24
310 0.23
311 0.21
312 0.21
313 0.25
314 0.24
315 0.27
316 0.31
317 0.34
318 0.34
319 0.35
320 0.37
321 0.32
322 0.29
323 0.28
324 0.25
325 0.19
326 0.2
327 0.21
328 0.19
329 0.17
330 0.21
331 0.18
332 0.19
333 0.18
334 0.19
335 0.16
336 0.14
337 0.15
338 0.15
339 0.17
340 0.18
341 0.19
342 0.2
343 0.2
344 0.21
345 0.2
346 0.15
347 0.15
348 0.15
349 0.16
350 0.15
351 0.18
352 0.18
353 0.19
354 0.19
355 0.16
356 0.14
357 0.13
358 0.11
359 0.12
360 0.16
361 0.16
362 0.23
363 0.27
364 0.28
365 0.29
366 0.3
367 0.29
368 0.34
369 0.4
370 0.42
371 0.42
372 0.47
373 0.46
374 0.47
375 0.43
376 0.35
377 0.27
378 0.19
379 0.15
380 0.11
381 0.14
382 0.15
383 0.21
384 0.26
385 0.3
386 0.3
387 0.31
388 0.31
389 0.33
390 0.32
391 0.31
392 0.3
393 0.29
394 0.29
395 0.28
396 0.29
397 0.24
398 0.24
399 0.21
400 0.21
401 0.27
402 0.28
403 0.28
404 0.28
405 0.29
406 0.27
407 0.28
408 0.26
409 0.16
410 0.15
411 0.13
412 0.14
413 0.13
414 0.13
415 0.14
416 0.12
417 0.12
418 0.12