Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A166SXT9

Protein Details
Accession A0A166SXT9    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-44ASKLAKPVKMAKGKKFDKKNAQHFTLVHydrophilic
318-339TTTTMGGRKKKRKGALTNPSAYHydrophilic
402-427FLGSYTKPGKRTNKKSRPQTGLEQLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-35AKPVKMAKGKKFDK
325-330RKKKRK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito_nucl 14, mito 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences LILLLRSPSRHLNRPYSASKLAKPVKMAKGKKFDKKNAQHFTLVHRPQNDPLIHDENAPSMVLNPVPQKGGSSKGKHLSDLASELGSDAVSIRENEGEAAEYGVYYDDTQYDYMQHLRDLNSGGGEAVWVEASAAANKDKDKGKGKQTSLEDALRQMDLEHKSEALLDESVLPNKNLQRSNYQNQQDIPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDDAYVDEDDDIFQELSKDSREIDQYEFEDQFDYDDEDEGWESDGTAKPNKEYRGDTVPQLIPVEGEALPEHQNEDWLEDFKQFKKDQKGGKVQEKAAPSEMQSSIWTTTTMGGRKKKRKGALTNPSAYSMTSSSMVRTEQLTLLDARFDRIEEEYTSEMGGDDMASVSEVSTATSVAGPTRGDFDSIMDDFLGSYTKPGKRTNKKSRPQTGLEQLDEIRKGLGPARLRSKNY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.68
3 0.65
4 0.67
5 0.63
6 0.6
7 0.61
8 0.61
9 0.57
10 0.58
11 0.6
12 0.61
13 0.66
14 0.7
15 0.69
16 0.73
17 0.78
18 0.82
19 0.83
20 0.84
21 0.85
22 0.87
23 0.89
24 0.87
25 0.83
26 0.79
27 0.7
28 0.69
29 0.68
30 0.64
31 0.59
32 0.53
33 0.51
34 0.49
35 0.55
36 0.48
37 0.4
38 0.4
39 0.4
40 0.37
41 0.36
42 0.33
43 0.25
44 0.25
45 0.23
46 0.15
47 0.11
48 0.12
49 0.1
50 0.13
51 0.15
52 0.16
53 0.17
54 0.17
55 0.19
56 0.19
57 0.27
58 0.32
59 0.35
60 0.41
61 0.48
62 0.49
63 0.48
64 0.48
65 0.42
66 0.35
67 0.32
68 0.26
69 0.17
70 0.16
71 0.15
72 0.13
73 0.1
74 0.08
75 0.06
76 0.05
77 0.06
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.08
86 0.09
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.09
99 0.11
100 0.14
101 0.14
102 0.15
103 0.16
104 0.17
105 0.18
106 0.19
107 0.18
108 0.15
109 0.14
110 0.13
111 0.1
112 0.08
113 0.06
114 0.04
115 0.04
116 0.03
117 0.03
118 0.04
119 0.04
120 0.06
121 0.07
122 0.08
123 0.09
124 0.1
125 0.15
126 0.18
127 0.24
128 0.31
129 0.37
130 0.45
131 0.52
132 0.54
133 0.57
134 0.57
135 0.56
136 0.53
137 0.49
138 0.4
139 0.32
140 0.32
141 0.24
142 0.2
143 0.14
144 0.16
145 0.16
146 0.17
147 0.16
148 0.15
149 0.15
150 0.15
151 0.15
152 0.11
153 0.09
154 0.07
155 0.08
156 0.09
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.13
161 0.16
162 0.22
163 0.23
164 0.24
165 0.3
166 0.37
167 0.43
168 0.49
169 0.5
170 0.47
171 0.45
172 0.45
173 0.39
174 0.32
175 0.26
176 0.18
177 0.14
178 0.12
179 0.11
180 0.09
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.12
190 0.12
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.04
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.09
218 0.1
219 0.12
220 0.13
221 0.15
222 0.16
223 0.18
224 0.18
225 0.16
226 0.14
227 0.12
228 0.11
229 0.09
230 0.09
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.07
236 0.06
237 0.07
238 0.05
239 0.05
240 0.07
241 0.09
242 0.1
243 0.14
244 0.14
245 0.16
246 0.21
247 0.24
248 0.25
249 0.25
250 0.28
251 0.32
252 0.33
253 0.31
254 0.32
255 0.3
256 0.28
257 0.26
258 0.22
259 0.14
260 0.13
261 0.14
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.11
269 0.09
270 0.11
271 0.1
272 0.12
273 0.11
274 0.12
275 0.13
276 0.15
277 0.17
278 0.18
279 0.25
280 0.25
281 0.31
282 0.38
283 0.44
284 0.49
285 0.56
286 0.63
287 0.64
288 0.71
289 0.7
290 0.64
291 0.62
292 0.57
293 0.5
294 0.42
295 0.35
296 0.27
297 0.26
298 0.24
299 0.2
300 0.18
301 0.18
302 0.16
303 0.16
304 0.15
305 0.11
306 0.13
307 0.17
308 0.21
309 0.26
310 0.34
311 0.43
312 0.53
313 0.61
314 0.66
315 0.7
316 0.75
317 0.79
318 0.81
319 0.82
320 0.81
321 0.79
322 0.71
323 0.66
324 0.56
325 0.45
326 0.37
327 0.27
328 0.19
329 0.15
330 0.14
331 0.13
332 0.14
333 0.14
334 0.13
335 0.13
336 0.14
337 0.14
338 0.14
339 0.15
340 0.15
341 0.15
342 0.17
343 0.16
344 0.16
345 0.14
346 0.14
347 0.14
348 0.14
349 0.17
350 0.14
351 0.18
352 0.17
353 0.17
354 0.17
355 0.15
356 0.13
357 0.11
358 0.09
359 0.06
360 0.05
361 0.04
362 0.04
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.08
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.14
379 0.14
380 0.14
381 0.14
382 0.15
383 0.18
384 0.18
385 0.18
386 0.14
387 0.14
388 0.13
389 0.13
390 0.12
391 0.07
392 0.1
393 0.17
394 0.21
395 0.26
396 0.35
397 0.46
398 0.56
399 0.67
400 0.76
401 0.79
402 0.86
403 0.92
404 0.93
405 0.9
406 0.86
407 0.84
408 0.83
409 0.79
410 0.71
411 0.64
412 0.56
413 0.53
414 0.47
415 0.38
416 0.29
417 0.22
418 0.22
419 0.23
420 0.27
421 0.28
422 0.35
423 0.45