Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A166YDX4

Protein Details
Accession A0A166YDX4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-86GPEQKKWQSNGNKPNGNKRGFQGQGGRGKDKQRKSKRERNITEGSSHydrophilic
280-299GPPGHNKRNKPRQPLDRVPEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-79PNGNKRGFQGQGGRGKDKQRKSKRER
Subcellular Location(s) mito 11, cyto 9.5, cyto_nucl 8, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030390  MeTrfase_TrmA_AS  
IPR030391  MeTrfase_TrmA_CS  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR025795  tRNA_(uracil-5-)_MeTrfase  
IPR010280  U5_MeTrfase_fam  
Gene Ontology GO:0030697  F:S-adenosylmethionine-dependent tRNA (m5U54) methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF05958  tRNA_U5-meth_tr  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51687  SAM_MT_RNA_M5U  
PS51622  SAM_MT_RNA_M5U_2  
PS01230  TRMA_1  
PS01231  TRMA_2  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
Amino Acid Sequences MSSSTETPRPQPASKPAQEVPSEPAAPAATASQQGQGQGQGPEQKKWQSNGNKPNGNKRGFQGQGGRGKDKQRKSKRERNITEGSSEEVLAADVQALIASRKESLPEPAAAEAGAEAKEGDAEAAAEPAPSQPLPAPFTEIEVEVLALSSTGDGLAVHAGSPPTQIYVVPFVAPGDVAKVKVIRHFPSESYSMADYLSVVTPGPLRDDTRVNCKYFTQCSGCQFQMLDYGTQLAHKRTIVEKAYRNFSNLNPELVPEVAETIGSPLQYGYRTKLTPHFDGPPGHNKRNKPRQPLDRVPEVGFNVKGRRVVLDIEDCPIGTDAVRLGMKRERSRIAREFGNYTKGATILLRESTKRYPKKVLGGDAAAAAAGAGQEQEQPPAETPSDAIRVDTDTHTDVKTCLSEAGAMSTEYIGRYLFTNPANSFFQNNNSILPTFTGYIRDRVMPPAGPNRDRIKYLIDAYSGSGLFTITLASLFQGSTGIDIAKDSIECARKNAKLNDLPESQCNFLAADAPQLFKQVTYPADETVVVIDPPRKGCDNDFLSQLLRFGPRRVVYVSCNVHTQARDVGVLVRGDGGDGTKYEIESLVGFDFFPQTGHVEGVAVLNRVENTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.65
3 0.6
4 0.61
5 0.59
6 0.54
7 0.49
8 0.46
9 0.41
10 0.33
11 0.32
12 0.25
13 0.23
14 0.21
15 0.17
16 0.12
17 0.14
18 0.15
19 0.16
20 0.17
21 0.18
22 0.18
23 0.19
24 0.2
25 0.2
26 0.23
27 0.28
28 0.3
29 0.33
30 0.37
31 0.43
32 0.46
33 0.47
34 0.53
35 0.55
36 0.62
37 0.69
38 0.74
39 0.74
40 0.72
41 0.81
42 0.8
43 0.73
44 0.67
45 0.6
46 0.6
47 0.53
48 0.55
49 0.53
50 0.51
51 0.56
52 0.57
53 0.59
54 0.54
55 0.62
56 0.65
57 0.66
58 0.69
59 0.72
60 0.77
61 0.83
62 0.88
63 0.89
64 0.92
65 0.89
66 0.86
67 0.84
68 0.75
69 0.68
70 0.59
71 0.51
72 0.41
73 0.33
74 0.25
75 0.16
76 0.14
77 0.1
78 0.09
79 0.06
80 0.05
81 0.04
82 0.04
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.07
87 0.08
88 0.09
89 0.11
90 0.13
91 0.17
92 0.2
93 0.21
94 0.22
95 0.21
96 0.21
97 0.19
98 0.17
99 0.12
100 0.1
101 0.08
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.06
106 0.06
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.05
114 0.06
115 0.06
116 0.08
117 0.07
118 0.08
119 0.1
120 0.14
121 0.17
122 0.17
123 0.21
124 0.19
125 0.22
126 0.22
127 0.2
128 0.17
129 0.14
130 0.14
131 0.09
132 0.09
133 0.06
134 0.05
135 0.04
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.12
155 0.13
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.1
166 0.13
167 0.14
168 0.19
169 0.24
170 0.23
171 0.27
172 0.29
173 0.28
174 0.3
175 0.31
176 0.27
177 0.24
178 0.22
179 0.18
180 0.15
181 0.14
182 0.1
183 0.09
184 0.09
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.1
191 0.11
192 0.12
193 0.14
194 0.2
195 0.22
196 0.3
197 0.35
198 0.34
199 0.33
200 0.34
201 0.37
202 0.34
203 0.38
204 0.33
205 0.32
206 0.34
207 0.38
208 0.35
209 0.31
210 0.28
211 0.23
212 0.23
213 0.2
214 0.17
215 0.12
216 0.13
217 0.12
218 0.15
219 0.16
220 0.12
221 0.13
222 0.13
223 0.15
224 0.16
225 0.22
226 0.24
227 0.29
228 0.34
229 0.36
230 0.41
231 0.4
232 0.4
233 0.35
234 0.33
235 0.36
236 0.3
237 0.29
238 0.23
239 0.22
240 0.21
241 0.19
242 0.18
243 0.09
244 0.08
245 0.06
246 0.06
247 0.05
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.05
253 0.06
254 0.08
255 0.09
256 0.11
257 0.14
258 0.14
259 0.16
260 0.23
261 0.27
262 0.28
263 0.3
264 0.3
265 0.3
266 0.32
267 0.34
268 0.37
269 0.39
270 0.43
271 0.45
272 0.47
273 0.55
274 0.63
275 0.68
276 0.67
277 0.69
278 0.73
279 0.77
280 0.8
281 0.75
282 0.69
283 0.64
284 0.55
285 0.49
286 0.4
287 0.32
288 0.24
289 0.21
290 0.17
291 0.16
292 0.16
293 0.14
294 0.13
295 0.13
296 0.13
297 0.13
298 0.15
299 0.14
300 0.14
301 0.14
302 0.12
303 0.12
304 0.11
305 0.09
306 0.05
307 0.05
308 0.04
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.09
313 0.13
314 0.19
315 0.22
316 0.26
317 0.29
318 0.32
319 0.4
320 0.42
321 0.42
322 0.4
323 0.39
324 0.4
325 0.36
326 0.36
327 0.29
328 0.24
329 0.21
330 0.17
331 0.16
332 0.11
333 0.11
334 0.08
335 0.1
336 0.11
337 0.12
338 0.16
339 0.22
340 0.32
341 0.35
342 0.38
343 0.43
344 0.46
345 0.53
346 0.54
347 0.51
348 0.44
349 0.4
350 0.37
351 0.29
352 0.25
353 0.16
354 0.12
355 0.07
356 0.04
357 0.03
358 0.02
359 0.02
360 0.03
361 0.05
362 0.05
363 0.06
364 0.07
365 0.08
366 0.09
367 0.11
368 0.11
369 0.1
370 0.11
371 0.12
372 0.15
373 0.14
374 0.13
375 0.12
376 0.13
377 0.15
378 0.14
379 0.14
380 0.12
381 0.14
382 0.14
383 0.14
384 0.13
385 0.12
386 0.12
387 0.1
388 0.09
389 0.08
390 0.09
391 0.08
392 0.1
393 0.09
394 0.09
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.08
400 0.06
401 0.05
402 0.07
403 0.08
404 0.12
405 0.13
406 0.17
407 0.18
408 0.22
409 0.24
410 0.24
411 0.25
412 0.22
413 0.25
414 0.25
415 0.25
416 0.22
417 0.22
418 0.21
419 0.19
420 0.18
421 0.16
422 0.12
423 0.12
424 0.17
425 0.16
426 0.19
427 0.2
428 0.22
429 0.21
430 0.23
431 0.25
432 0.21
433 0.23
434 0.3
435 0.36
436 0.35
437 0.4
438 0.43
439 0.43
440 0.43
441 0.41
442 0.36
443 0.33
444 0.35
445 0.31
446 0.26
447 0.23
448 0.23
449 0.24
450 0.19
451 0.15
452 0.11
453 0.09
454 0.08
455 0.07
456 0.07
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.12
476 0.18
477 0.18
478 0.23
479 0.3
480 0.34
481 0.42
482 0.45
483 0.49
484 0.5
485 0.52
486 0.55
487 0.52
488 0.5
489 0.48
490 0.47
491 0.4
492 0.33
493 0.31
494 0.24
495 0.19
496 0.2
497 0.14
498 0.17
499 0.17
500 0.18
501 0.18
502 0.19
503 0.19
504 0.16
505 0.18
506 0.15
507 0.16
508 0.19
509 0.21
510 0.2
511 0.21
512 0.21
513 0.2
514 0.17
515 0.17
516 0.12
517 0.12
518 0.15
519 0.17
520 0.19
521 0.23
522 0.23
523 0.24
524 0.28
525 0.35
526 0.37
527 0.37
528 0.37
529 0.35
530 0.34
531 0.32
532 0.3
533 0.23
534 0.23
535 0.23
536 0.23
537 0.29
538 0.29
539 0.32
540 0.34
541 0.35
542 0.33
543 0.41
544 0.44
545 0.37
546 0.39
547 0.37
548 0.38
549 0.36
550 0.34
551 0.29
552 0.25
553 0.24
554 0.21
555 0.23
556 0.22
557 0.21
558 0.19
559 0.16
560 0.14
561 0.13
562 0.13
563 0.11
564 0.09
565 0.09
566 0.13
567 0.13
568 0.13
569 0.13
570 0.13
571 0.13
572 0.12
573 0.14
574 0.12
575 0.11
576 0.11
577 0.11
578 0.12
579 0.11
580 0.11
581 0.11
582 0.11
583 0.12
584 0.13
585 0.12
586 0.11
587 0.12
588 0.15
589 0.16
590 0.14
591 0.13
592 0.14