FuNGI

A0A166T4P1

Protein Details

Accession

A0A166T4P1

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
82-107	AQSGQPRPPPIKRRPRGDPLVARKRP	Basic
271-294	KDPNADKKPKPKEKEKDVQFHRQP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
88-118	RPPPIKRRPRGDPLVARKRPGAPRPTASRPP
275-298	ADKKPKPKEKEKDVQFHRQPRSEK
490-510	KKAEEERRKEGKKTQKALIKR
588-598	LKKGKSLKRPG
611-617	SRKKLKK

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

RPFPPALAYCAAAVPLDVAPDASAHRRHGRPLPKELREPASFRETHRTRGIRIVRYSYIMSAPPPGLPNGQNPNGQQPQQPAQSGQPRPPPIKRRPRGDPLVARKRPGAPRPTASRPPPGGLQTASGARPSPGTSGHHGLQRPETEEDIKARRAANGGWLDPAPQNVREFKIVTTKKALRDGVRHHVMKLSSAKADLEKRGIDPTNQEEFTRPVTLQRRDPRQPPPGREVKQEQAEPQPVDEKEAERLAQLKAEREAVRAVELAKSAPSLKDPNADKKPKPKEKEKDVQFHRQPRSEKEKKQQELRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYVAPLSETTVCFVATRDGKFAAVPLEKWYKFTAKPHFNTMRLEEAEALMSKKTDVGRWYMRDKQKRSEQEEWEATRHALYGPARIKTESSTFRAASREEKLDHDQIDMEGDEFQDDDENPGLEQDNDEEYKEANDRIRRDQLGANLFGEADERRVEKEMNELKKAEEERRKEGKKTQKALIKREKETIYQSDSSGYDPFESSSSEDGSDEEKQKEENKDKEKDDENKDKDKDPDSKDKTASGVSSKGNTTPSGRQKHTDALKKGKSLKRPGSPNLSESSGNESSRKKLKKHAAASVHQSRSSTPSAGLKSNLGKGAMSDGEATGGEMSDGQLRKKKIKLVGSGARGTPVGSRAGSPMPATSGSKPGSPLPDGSPVPRAGSPNGPIEAWEIVDALPELPGGISIGNLMRRFQGRIGDGPGQMDRKEWIKLVKENCAYGPDKILRRRPT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.09
3	0.09
4	0.08
5	0.08
6	0.08
7	0.09
8	0.12
9	0.16
10	0.19
11	0.24
12	0.33
13	0.36
14	0.42
15	0.51
16	0.58
17	0.6
18	0.67
19	0.72
20	0.71
21	0.76
22	0.76
23	0.74
24	0.69
25	0.65
26	0.6
27	0.57
28	0.52
29	0.48
30	0.53
31	0.48
32	0.49
33	0.55
34	0.54
35	0.48
36	0.56
37	0.61
38	0.59
39	0.62
40	0.61
41	0.54
42	0.54
43	0.52
44	0.44
45	0.38
46	0.31
47	0.26
48	0.24
49	0.22
50	0.21
51	0.21
52	0.21
53	0.23
54	0.23
55	0.3
56	0.34
57	0.38
58	0.4
59	0.4
60	0.47
61	0.49
62	0.49
63	0.46
64	0.44
65	0.47
66	0.47
67	0.47
68	0.4
69	0.43
70	0.5
71	0.5
72	0.51
73	0.53
74	0.55
75	0.6
76	0.67
77	0.69
78	0.7
79	0.77
80	0.79
81	0.79
82	0.81
83	0.84
84	0.83
85	0.83
86	0.83
87	0.82
88	0.85
89	0.8
90	0.73
91	0.67
92	0.67
93	0.66
94	0.64
95	0.62
96	0.58
97	0.62
98	0.67
99	0.72
100	0.72
101	0.68
102	0.69
103	0.63
104	0.59
105	0.56
106	0.5
107	0.45
108	0.37
109	0.34
110	0.28
111	0.27
112	0.25
113	0.21
114	0.19
115	0.16
116	0.17
117	0.16
118	0.15
119	0.15
120	0.19
121	0.23
122	0.27
123	0.3
124	0.33
125	0.34
126	0.35
127	0.37
128	0.36
129	0.35
130	0.32
131	0.32
132	0.29
133	0.3
134	0.33
135	0.32
136	0.32
137	0.31
138	0.29
139	0.28
140	0.28
141	0.26
142	0.28
143	0.28
144	0.26
145	0.25
146	0.24
147	0.25
148	0.23
149	0.26
150	0.21
151	0.19
152	0.21
153	0.22
154	0.25
155	0.25
156	0.26
157	0.24
158	0.32
159	0.32
160	0.33
161	0.39
162	0.41
163	0.43
164	0.49
165	0.51
166	0.46
167	0.51
168	0.54
169	0.55
170	0.58
171	0.55
172	0.48
173	0.48
174	0.44
175	0.41
176	0.39
177	0.32
178	0.25
179	0.25
180	0.25
181	0.26
182	0.3
183	0.27
184	0.26
185	0.24
186	0.24
187	0.29
188	0.29
189	0.26
190	0.26
191	0.29
192	0.32
193	0.32
194	0.31
195	0.27
196	0.28
197	0.3
198	0.28
199	0.22
200	0.23
201	0.31
202	0.35
203	0.42
204	0.48
205	0.54
206	0.58
207	0.65
208	0.66
209	0.68
210	0.71
211	0.68
212	0.68
213	0.69
214	0.65
215	0.66
216	0.63
217	0.6
218	0.58
219	0.54
220	0.49
221	0.46
222	0.48
223	0.42
224	0.37
225	0.35
226	0.29
227	0.3
228	0.28
229	0.23
230	0.2
231	0.21
232	0.2
233	0.15
234	0.18
235	0.15
236	0.17
237	0.17
238	0.16
239	0.16
240	0.22
241	0.22
242	0.21
243	0.22
244	0.19
245	0.19
246	0.17
247	0.16
248	0.11
249	0.11
250	0.1
251	0.09
252	0.1
253	0.1
254	0.09
255	0.11
256	0.13
257	0.14
258	0.21
259	0.24
260	0.33
261	0.42
262	0.48
263	0.5
264	0.57
265	0.67
266	0.69
267	0.73
268	0.74
269	0.74
270	0.77
271	0.83
272	0.81
273	0.8
274	0.77
275	0.8
276	0.77
277	0.77
278	0.73
279	0.69
280	0.65
281	0.62
282	0.67
283	0.66
284	0.66
285	0.67
286	0.72
287	0.71
288	0.77
289	0.74
290	0.72
291	0.69
292	0.64
293	0.57
294	0.48
295	0.43
296	0.35
297	0.32
298	0.24
299	0.18
300	0.14
301	0.1
302	0.09
303	0.1
304	0.1
305	0.12
306	0.11
307	0.11
308	0.11
309	0.11
310	0.11
311	0.1
312	0.08
313	0.05
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.08
320	0.09
321	0.09
322	0.08
323	0.08
324	0.08
325	0.08
326	0.09
327	0.11
328	0.13
329	0.14
330	0.14
331	0.14
332	0.14
333	0.14
334	0.14
335	0.14
336	0.12
337	0.12
338	0.14
339	0.21
340	0.21
341	0.23
342	0.24
343	0.24
344	0.25
345	0.32
346	0.37
347	0.39
348	0.4
349	0.48
350	0.51
351	0.49
352	0.49
353	0.44
354	0.4
355	0.32
356	0.3
357	0.22
358	0.17
359	0.16
360	0.14
361	0.12
362	0.07
363	0.06
364	0.06
365	0.08
366	0.08
367	0.1
368	0.11
369	0.15
370	0.2
371	0.23
372	0.28
373	0.34
374	0.41
375	0.48
376	0.5
377	0.53
378	0.57
379	0.62
380	0.65
381	0.65
382	0.6
383	0.59
384	0.61
385	0.55
386	0.48
387	0.4
388	0.33
389	0.24
390	0.21
391	0.14
392	0.12
393	0.11
394	0.16
395	0.18
396	0.2
397	0.21
398	0.21
399	0.21
400	0.19
401	0.24
402	0.21
403	0.22
404	0.24
405	0.23
406	0.25
407	0.26
408	0.25
409	0.24
410	0.23
411	0.23
412	0.2
413	0.23
414	0.26
415	0.28
416	0.27
417	0.23
418	0.2
419	0.17
420	0.17
421	0.13
422	0.1
423	0.07
424	0.06
425	0.05
426	0.05
427	0.05
428	0.05
429	0.05
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.07
435	0.07
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.08
440	0.09
441	0.09
442	0.09
443	0.09
444	0.1
445	0.11
446	0.12
447	0.14
448	0.18
449	0.21
450	0.26
451	0.31
452	0.31
453	0.32
454	0.33
455	0.34
456	0.33
457	0.31
458	0.26
459	0.21
460	0.2
461	0.17
462	0.16
463	0.1
464	0.08
465	0.08
466	0.08
467	0.09
468	0.11
469	0.11
470	0.1
471	0.2
472	0.26
473	0.29
474	0.32
475	0.31
476	0.3
477	0.35
478	0.38
479	0.37
480	0.38
481	0.38
482	0.44
483	0.53
484	0.56
485	0.55
486	0.61
487	0.63
488	0.65
489	0.66
490	0.64
491	0.61
492	0.65
493	0.71
494	0.73
495	0.7
496	0.63
497	0.64
498	0.6
499	0.56
500	0.54
501	0.48
502	0.43
503	0.37
504	0.34
505	0.29
506	0.27
507	0.26
508	0.21
509	0.17
510	0.12
511	0.11
512	0.12
513	0.1
514	0.11
515	0.11
516	0.11
517	0.11
518	0.11
519	0.11
520	0.11
521	0.13
522	0.17
523	0.19
524	0.18
525	0.18
526	0.2
527	0.25
528	0.33
529	0.38
530	0.43
531	0.47
532	0.53
533	0.55
534	0.59
535	0.61
536	0.61
537	0.62
538	0.64
539	0.62
540	0.64
541	0.64
542	0.62
543	0.59
544	0.56
545	0.56
546	0.52
547	0.57
548	0.55
549	0.58
550	0.56
551	0.52
552	0.48
553	0.41
554	0.37
555	0.28
556	0.26
557	0.22
558	0.23
559	0.23
560	0.23
561	0.23
562	0.23
563	0.24
564	0.28
565	0.36
566	0.42
567	0.43
568	0.44
569	0.46
570	0.52
571	0.56
572	0.57
573	0.55
574	0.57
575	0.6
576	0.63
577	0.7
578	0.67
579	0.68
580	0.69
581	0.7
582	0.69
583	0.72
584	0.72
585	0.72
586	0.69
587	0.62
588	0.55
589	0.49
590	0.41
591	0.35
592	0.36
593	0.3
594	0.28
595	0.3
596	0.29
597	0.32
598	0.4
599	0.46
600	0.41
601	0.47
602	0.57
603	0.63
604	0.68
605	0.71
606	0.7
607	0.69
608	0.75
609	0.75
610	0.68
611	0.59
612	0.52
613	0.45
614	0.41
615	0.39
616	0.3
617	0.23
618	0.26
619	0.28
620	0.3
621	0.3
622	0.29
623	0.3
624	0.32
625	0.32
626	0.26
627	0.23
628	0.2
629	0.23
630	0.19
631	0.16
632	0.13
633	0.11
634	0.11
635	0.11
636	0.11
637	0.07
638	0.07
639	0.06
640	0.05
641	0.06
642	0.11
643	0.13
644	0.16
645	0.22
646	0.26
647	0.33
648	0.38
649	0.44
650	0.46
651	0.53
652	0.57
653	0.61
654	0.66
655	0.65
656	0.64
657	0.57
658	0.51
659	0.43
660	0.35
661	0.28
662	0.21
663	0.18
664	0.15
665	0.15
666	0.17
667	0.19
668	0.19
669	0.18
670	0.17
671	0.16
672	0.19
673	0.21
674	0.2
675	0.25
676	0.25
677	0.26
678	0.27
679	0.29
680	0.31
681	0.3
682	0.3
683	0.27
684	0.34
685	0.33
686	0.34
687	0.35
688	0.31
689	0.32
690	0.32
691	0.32
692	0.27
693	0.32
694	0.33
695	0.33
696	0.33
697	0.3
698	0.28
699	0.27
700	0.25
701	0.19
702	0.16
703	0.12
704	0.1
705	0.11
706	0.11
707	0.08
708	0.07
709	0.07
710	0.06
711	0.05
712	0.06
713	0.05
714	0.05
715	0.05
716	0.06
717	0.09
718	0.14
719	0.15
720	0.16
721	0.2
722	0.23
723	0.26
724	0.27
725	0.31
726	0.3
727	0.33
728	0.39
729	0.4
730	0.38
731	0.39
732	0.41
733	0.37
734	0.33
735	0.3
736	0.27
737	0.25
738	0.27
739	0.28
740	0.31
741	0.35
742	0.42
743	0.46
744	0.53
745	0.53
746	0.53
747	0.51
748	0.5
749	0.45
750	0.39
751	0.42
752	0.4
753	0.45
754	0.51

A0A166T4P1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer