Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A166RF61

Protein Details
Accession A0A166RF61    Localization Confidence Low Confidence Score 6.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24SRYPNSRRCYHYNRIPHQSQRLPTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 19, nucl 3.5, cyto_nucl 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031120  HIR1-like  
IPR011494  HIRA-like_C  
IPR019015  HIRA_B_motif  
IPR011044  Quino_amine_DH_bsu  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF07569  Hira  
PF09453  HIRA_B  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences SRYPNSRRCYHYNRIPHQSQRLPTAKSFKNTPSRRYLRFFLPGRRPGLNDPRPSAMRVIKPTWLSHSGEQKDFEVYSCHVSSDGKRLATAGGDGHVRVWSTEAIYGDANGEADGKPRQLCHMSHHLGTIHSVRFSPNGRYLASGADDKLICVYHLDKSPPVASFGLGAEPPPVENWKTYKRLVGHENDVQDLAWSYDSSILVSVGLDSKIVVWSGHSFEKLKTITVHSSHVKGITFDPANKFFATASDDRTIKIFRFTPPAPNATQHDMVNNFVLETTISAPFKSSPLTTYFRRCSWSPDGNHIAAPNAVNGPVSSVAIIERTRWDSEINLIGHEGPTEVCMFSPRLFHTENPADQPVDNALVTVIASAGQDKTLSIWNTNTSRPVVILQDVASKSISDLAWSPDGTTIFASSLDGSLLGIKFDHGELGWVANADENDKALQKYGASRKGMGIAEDIEGLNLENQSKAGESRAAESRMGALMGDASSSKGPAPATNGTKSAGNGTGTSTPKATNGNVEPEKDKEKDKPVEENGDKSAERVKELKSRVTVGKDGRKRVAPLLVSSSGTGQSSLPQTQLVGATSTAKAAQNEAPQTVLDLERPFEGLPKGGVAAMLLGNKRKAPVVEGEEEDDHASKRQATDPTPVVLNGVDGVEQASVVPAAHGVVPTPEYLRPAVLNPSIAFAQIRLAVPKVRSHILRPLERGVLLPESSTDEASKVPENIILEARNPVQIRDPSSISATKRGTLLWQDYLPRAVILVTGNKQFWAAACEDGSIYTWTPAGRRLMNPIIMESQPVILECRNSYLLCINAVGLCHVWDLQRQAALHPPVSLGPVLELATTTLNLNTTTPGPGITSAQLNSTGHIVVTLTNGDGYYYTRDMFTWQRVSEAWWAVGSQYWNSNDSSISALQSTAVGPVTPAKPKDENTANVSAGIIPYLERHTTNEFLLKGRAYTLQRIVKLLLSKDGFEGFESTVSIAHLENRIAAALHLDARDEFRLYLFMYAKRLGAEGHRGKVEELLNSLLGGILKDKDEKANDGGRGWFSQEEEICGWDRKELLKGVVMILGKFRELQRLTIQYARVLDLNLESDGAMEIES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.83
3 0.82
4 0.83
5 0.81
6 0.75
7 0.74
8 0.72
9 0.67
10 0.66
11 0.66
12 0.63
13 0.6
14 0.62
15 0.61
16 0.65
17 0.67
18 0.68
19 0.69
20 0.71
21 0.73
22 0.74
23 0.7
24 0.66
25 0.69
26 0.69
27 0.68
28 0.7
29 0.7
30 0.68
31 0.66
32 0.62
33 0.62
34 0.66
35 0.64
36 0.62
37 0.59
38 0.61
39 0.59
40 0.57
41 0.55
42 0.51
43 0.5
44 0.5
45 0.49
46 0.48
47 0.49
48 0.49
49 0.5
50 0.47
51 0.44
52 0.43
53 0.5
54 0.49
55 0.5
56 0.49
57 0.44
58 0.42
59 0.38
60 0.32
61 0.26
62 0.22
63 0.24
64 0.23
65 0.22
66 0.2
67 0.22
68 0.24
69 0.3
70 0.34
71 0.28
72 0.28
73 0.28
74 0.28
75 0.26
76 0.24
77 0.16
78 0.13
79 0.14
80 0.14
81 0.14
82 0.14
83 0.13
84 0.12
85 0.13
86 0.12
87 0.12
88 0.15
89 0.14
90 0.15
91 0.15
92 0.15
93 0.14
94 0.13
95 0.12
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.11
100 0.13
101 0.15
102 0.16
103 0.17
104 0.22
105 0.26
106 0.28
107 0.32
108 0.4
109 0.41
110 0.41
111 0.43
112 0.39
113 0.34
114 0.36
115 0.34
116 0.26
117 0.23
118 0.22
119 0.21
120 0.24
121 0.27
122 0.29
123 0.31
124 0.32
125 0.31
126 0.33
127 0.32
128 0.3
129 0.3
130 0.26
131 0.19
132 0.21
133 0.2
134 0.18
135 0.19
136 0.16
137 0.14
138 0.14
139 0.15
140 0.15
141 0.2
142 0.22
143 0.22
144 0.26
145 0.28
146 0.27
147 0.29
148 0.24
149 0.2
150 0.18
151 0.18
152 0.17
153 0.14
154 0.13
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.14
160 0.13
161 0.17
162 0.23
163 0.29
164 0.34
165 0.36
166 0.41
167 0.41
168 0.47
169 0.51
170 0.51
171 0.5
172 0.5
173 0.5
174 0.44
175 0.4
176 0.33
177 0.26
178 0.2
179 0.15
180 0.1
181 0.09
182 0.08
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.1
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.1
201 0.13
202 0.16
203 0.18
204 0.18
205 0.18
206 0.26
207 0.25
208 0.24
209 0.23
210 0.26
211 0.29
212 0.3
213 0.35
214 0.31
215 0.33
216 0.32
217 0.32
218 0.28
219 0.24
220 0.23
221 0.24
222 0.24
223 0.25
224 0.29
225 0.3
226 0.31
227 0.3
228 0.29
229 0.22
230 0.21
231 0.23
232 0.2
233 0.22
234 0.25
235 0.25
236 0.25
237 0.27
238 0.27
239 0.22
240 0.25
241 0.23
242 0.2
243 0.28
244 0.29
245 0.36
246 0.38
247 0.41
248 0.38
249 0.39
250 0.41
251 0.39
252 0.4
253 0.32
254 0.32
255 0.29
256 0.28
257 0.25
258 0.21
259 0.15
260 0.12
261 0.12
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.13
269 0.13
270 0.14
271 0.15
272 0.13
273 0.12
274 0.17
275 0.22
276 0.25
277 0.33
278 0.36
279 0.36
280 0.4
281 0.38
282 0.4
283 0.44
284 0.48
285 0.42
286 0.46
287 0.5
288 0.46
289 0.46
290 0.39
291 0.32
292 0.25
293 0.22
294 0.15
295 0.1
296 0.1
297 0.09
298 0.08
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.11
309 0.14
310 0.15
311 0.16
312 0.16
313 0.15
314 0.18
315 0.23
316 0.2
317 0.17
318 0.17
319 0.16
320 0.15
321 0.15
322 0.12
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.08
329 0.09
330 0.1
331 0.13
332 0.14
333 0.17
334 0.19
335 0.19
336 0.26
337 0.3
338 0.31
339 0.31
340 0.32
341 0.28
342 0.26
343 0.27
344 0.2
345 0.16
346 0.14
347 0.1
348 0.08
349 0.07
350 0.07
351 0.06
352 0.05
353 0.03
354 0.04
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.06
361 0.11
362 0.12
363 0.12
364 0.14
365 0.19
366 0.21
367 0.22
368 0.23
369 0.2
370 0.19
371 0.18
372 0.19
373 0.15
374 0.13
375 0.13
376 0.11
377 0.16
378 0.16
379 0.16
380 0.15
381 0.13
382 0.12
383 0.14
384 0.13
385 0.09
386 0.1
387 0.11
388 0.13
389 0.13
390 0.13
391 0.12
392 0.13
393 0.13
394 0.12
395 0.09
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.06
400 0.06
401 0.05
402 0.05
403 0.04
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.05
408 0.05
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.04
413 0.05
414 0.05
415 0.06
416 0.06
417 0.05
418 0.05
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.07
425 0.08
426 0.08
427 0.08
428 0.09
429 0.08
430 0.15
431 0.22
432 0.28
433 0.27
434 0.28
435 0.28
436 0.33
437 0.32
438 0.26
439 0.2
440 0.14
441 0.13
442 0.13
443 0.12
444 0.07
445 0.07
446 0.06
447 0.06
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.08
457 0.09
458 0.12
459 0.16
460 0.17
461 0.17
462 0.16
463 0.16
464 0.14
465 0.13
466 0.1
467 0.06
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.05
475 0.05
476 0.06
477 0.07
478 0.07
479 0.12
480 0.16
481 0.19
482 0.21
483 0.21
484 0.2
485 0.21
486 0.21
487 0.18
488 0.15
489 0.12
490 0.11
491 0.12
492 0.17
493 0.17
494 0.17
495 0.16
496 0.15
497 0.15
498 0.17
499 0.15
500 0.14
501 0.14
502 0.21
503 0.22
504 0.23
505 0.23
506 0.24
507 0.27
508 0.25
509 0.26
510 0.23
511 0.29
512 0.34
513 0.35
514 0.39
515 0.38
516 0.45
517 0.44
518 0.41
519 0.35
520 0.32
521 0.29
522 0.24
523 0.26
524 0.17
525 0.18
526 0.18
527 0.2
528 0.24
529 0.26
530 0.29
531 0.25
532 0.28
533 0.29
534 0.29
535 0.31
536 0.3
537 0.37
538 0.38
539 0.4
540 0.39
541 0.38
542 0.37
543 0.34
544 0.33
545 0.25
546 0.22
547 0.23
548 0.21
549 0.2
550 0.18
551 0.17
552 0.13
553 0.12
554 0.12
555 0.07
556 0.08
557 0.1
558 0.1
559 0.1
560 0.09
561 0.09
562 0.09
563 0.1
564 0.08
565 0.07
566 0.06
567 0.08
568 0.08
569 0.08
570 0.08
571 0.09
572 0.09
573 0.1
574 0.13
575 0.15
576 0.16
577 0.16
578 0.15
579 0.13
580 0.14
581 0.13
582 0.1
583 0.09
584 0.08
585 0.08
586 0.08
587 0.09
588 0.08
589 0.09
590 0.09
591 0.08
592 0.08
593 0.07
594 0.07
595 0.06
596 0.06
597 0.04
598 0.05
599 0.05
600 0.07
601 0.08
602 0.09
603 0.1
604 0.1
605 0.11
606 0.11
607 0.11
608 0.1
609 0.15
610 0.18
611 0.2
612 0.21
613 0.22
614 0.21
615 0.21
616 0.2
617 0.15
618 0.11
619 0.1
620 0.1
621 0.08
622 0.1
623 0.14
624 0.17
625 0.18
626 0.23
627 0.24
628 0.24
629 0.24
630 0.22
631 0.18
632 0.15
633 0.13
634 0.08
635 0.06
636 0.05
637 0.04
638 0.05
639 0.04
640 0.04
641 0.04
642 0.03
643 0.03
644 0.03
645 0.03
646 0.03
647 0.03
648 0.04
649 0.04
650 0.04
651 0.04
652 0.05
653 0.06
654 0.08
655 0.08
656 0.09
657 0.09
658 0.1
659 0.1
660 0.11
661 0.14
662 0.13
663 0.14
664 0.13
665 0.14
666 0.14
667 0.13
668 0.12
669 0.08
670 0.09
671 0.1
672 0.1
673 0.09
674 0.1
675 0.13
676 0.14
677 0.17
678 0.19
679 0.2
680 0.21
681 0.22
682 0.29
683 0.34
684 0.37
685 0.37
686 0.37
687 0.35
688 0.33
689 0.31
690 0.25
691 0.2
692 0.16
693 0.13
694 0.11
695 0.13
696 0.13
697 0.13
698 0.11
699 0.1
700 0.1
701 0.12
702 0.13
703 0.1
704 0.1
705 0.11
706 0.12
707 0.12
708 0.14
709 0.13
710 0.12
711 0.14
712 0.14
713 0.16
714 0.16
715 0.15
716 0.19
717 0.21
718 0.25
719 0.26
720 0.26
721 0.23
722 0.27
723 0.3
724 0.26
725 0.3
726 0.27
727 0.25
728 0.24
729 0.23
730 0.22
731 0.23
732 0.25
733 0.2
734 0.21
735 0.22
736 0.23
737 0.24
738 0.21
739 0.16
740 0.13
741 0.1
742 0.09
743 0.09
744 0.12
745 0.13
746 0.16
747 0.16
748 0.16
749 0.16
750 0.15
751 0.14
752 0.13
753 0.11
754 0.1
755 0.1
756 0.11
757 0.1
758 0.11
759 0.12
760 0.1
761 0.09
762 0.08
763 0.09
764 0.09
765 0.1
766 0.13
767 0.16
768 0.18
769 0.18
770 0.25
771 0.27
772 0.31
773 0.3
774 0.28
775 0.28
776 0.24
777 0.24
778 0.18
779 0.15
780 0.12
781 0.11
782 0.11
783 0.09
784 0.11
785 0.1
786 0.13
787 0.14
788 0.14
789 0.15
790 0.16
791 0.16
792 0.15
793 0.15
794 0.12
795 0.11
796 0.11
797 0.11
798 0.08
799 0.08
800 0.07
801 0.08
802 0.08
803 0.1
804 0.12
805 0.13
806 0.16
807 0.16
808 0.17
809 0.23
810 0.25
811 0.23
812 0.21
813 0.2
814 0.18
815 0.19
816 0.18
817 0.1
818 0.08
819 0.09
820 0.09
821 0.08
822 0.07
823 0.07
824 0.07
825 0.08
826 0.08
827 0.07
828 0.07
829 0.08
830 0.08
831 0.09
832 0.1
833 0.11
834 0.1
835 0.1
836 0.1
837 0.11
838 0.12
839 0.12
840 0.13
841 0.12
842 0.13
843 0.16
844 0.15
845 0.15
846 0.15
847 0.13
848 0.1
849 0.1
850 0.09
851 0.07
852 0.08
853 0.08
854 0.07
855 0.07
856 0.07
857 0.07
858 0.07
859 0.08
860 0.11
861 0.12
862 0.12
863 0.12
864 0.13
865 0.16
866 0.2
867 0.25
868 0.27
869 0.26
870 0.27
871 0.27
872 0.3
873 0.33
874 0.3
875 0.24
876 0.19
877 0.19
878 0.17
879 0.19
880 0.18
881 0.13
882 0.16
883 0.17
884 0.19
885 0.19
886 0.2
887 0.17
888 0.17
889 0.19
890 0.15
891 0.14
892 0.13
893 0.12
894 0.11
895 0.12
896 0.11
897 0.09
898 0.08
899 0.07
900 0.07
901 0.12
902 0.15
903 0.2
904 0.21
905 0.25
906 0.29
907 0.32
908 0.4
909 0.42
910 0.43
911 0.44
912 0.47
913 0.42
914 0.38
915 0.36
916 0.28
917 0.21
918 0.17
919 0.11
920 0.06
921 0.08
922 0.11
923 0.12
924 0.13
925 0.16
926 0.21
927 0.23
928 0.24
929 0.27
930 0.25
931 0.26
932 0.28
933 0.25
934 0.21
935 0.21
936 0.26
937 0.24
938 0.29
939 0.35
940 0.38
941 0.39
942 0.41
943 0.4
944 0.37
945 0.39
946 0.34
947 0.33
948 0.28
949 0.28
950 0.27
951 0.28
952 0.24
953 0.21
954 0.22
955 0.15
956 0.14
957 0.14
958 0.12
959 0.11
960 0.11
961 0.11
962 0.09
963 0.11
964 0.13
965 0.12
966 0.13
967 0.13
968 0.13
969 0.12
970 0.12
971 0.1
972 0.1
973 0.12
974 0.11
975 0.12
976 0.12
977 0.15
978 0.17
979 0.17
980 0.15
981 0.13
982 0.15
983 0.15
984 0.2
985 0.2
986 0.21
987 0.24
988 0.25
989 0.26
990 0.25
991 0.24
992 0.2
993 0.21
994 0.29
995 0.31
996 0.34
997 0.35
998 0.36
999 0.35
1000 0.4
1001 0.37
1002 0.29
1003 0.25
1004 0.23
1005 0.21
1006 0.2
1007 0.19
1008 0.15
1009 0.13
1010 0.11
1011 0.1
1012 0.1
1013 0.11
1014 0.15
1015 0.17
1016 0.22
1017 0.24
1018 0.28
1019 0.32
1020 0.37
1021 0.37
1022 0.36
1023 0.38
1024 0.35
1025 0.33
1026 0.32
1027 0.28
1028 0.23
1029 0.27
1030 0.25
1031 0.26
1032 0.24
1033 0.25
1034 0.25
1035 0.27
1036 0.26
1037 0.22
1038 0.24
1039 0.23
1040 0.27
1041 0.28
1042 0.28
1043 0.29
1044 0.29
1045 0.28
1046 0.3
1047 0.28
1048 0.23
1049 0.23
1050 0.22
1051 0.18
1052 0.2
1053 0.2
1054 0.26
1055 0.26
1056 0.3
1057 0.35
1058 0.4
1059 0.43
1060 0.45
1061 0.45
1062 0.4
1063 0.41
1064 0.38
1065 0.31
1066 0.26
1067 0.23
1068 0.19
1069 0.2
1070 0.16
1071 0.15
1072 0.12
1073 0.11
1074 0.11