FuNGI

A0A166SME4

Protein Details

Accession

A0A166SME4

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
597-623	NNATPSDKPEHHKRTRRGRGGGKAAAN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
207-262	EKKANKQKEAAAAKSAKQARQESNTKGKASASTAEDSKKGKKDSKGEKSADKPKET
383-404	KSGRSRRGGGGKNAGAGDSKGK
424-436	LKKKDEEKNKEKG
606-620	EHHKRTRRGRGGGKA

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF03467 Smg4_UPF3
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3 cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MATSGAQGASRKTNGVLPASGQQPAADAPKSNKSRTPVEGDKVIIRRLPPGMTEQELWNNLGDEWKAGNGLVSWHNFAQGKISQDPAKPSRPGRVYLHVLKRESLNTLSTLIQAKSWEDAKMTSNSASLVGPPVLEFAIYNKVPSGKKRTDPRQGTIDQDPEFMAFLLSLTNPEMDKENENSENKDAEESKPEAKVTTTPLIEFIKEKKANKQKEAAAAKSAKQARQESNTKGKASASTAEDSKKGKKDSKGEKSADKPKETVKILTKKATAEAAKAAETVASQISQASSSSQDAPKSRRAGIAAAARILQRDLGISPGSAHRRARLDAAKAEAEAKAATTKEAAQPAAEPPAPTPAPVAAPAQPSSAASQTSERSTTPTAPKSGRSRRGGGGKNAGAGDSKGKSTEAGPSTTPAPAKAPVVLLKKKDEEKNKEKGSKNDKEASSSASQSAAPATNTKSNPQAGPKSSGKGGNSKKGSAAVTPGVTRGFVKHANPSQGVTEALLKQAMEAFGTVTFVEIDKRKGFAYVDFSDHDSLVKAVAASPVQVAQGTVQVLERKEKKPAAANSNAKSEPSSANANAGAAGSNPAAPPASGPANNATPSDKPEHHKRTRRGRGGGKAAANASGSNSGNKDARSEPAASTAGTG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.32
3	0.29
4	0.26
5	0.3
6	0.31
7	0.31
8	0.27
9	0.22
10	0.2
11	0.21
12	0.23
13	0.19
14	0.2
15	0.23
16	0.33
17	0.39
18	0.41
19	0.44
20	0.45
21	0.51
22	0.53
23	0.57
24	0.55
25	0.55
26	0.55
27	0.53
28	0.55
29	0.52
30	0.49
31	0.43
32	0.36
33	0.35
34	0.33
35	0.32
36	0.26
37	0.29
38	0.3
39	0.31
40	0.32
41	0.31
42	0.34
43	0.34
44	0.33
45	0.28
46	0.25
47	0.21
48	0.22
49	0.19
50	0.14
51	0.13
52	0.13
53	0.12
54	0.11
55	0.12
56	0.09
57	0.12
58	0.16
59	0.17
60	0.19
61	0.19
62	0.24
63	0.24
64	0.24
65	0.26
66	0.24
67	0.27
68	0.26
69	0.31
70	0.31
71	0.33
72	0.42
73	0.42
74	0.45
75	0.47
76	0.48
77	0.53
78	0.51
79	0.54
80	0.52
81	0.54
82	0.55
83	0.58
84	0.65
85	0.62
86	0.6
87	0.56
88	0.53
89	0.47
90	0.43
91	0.36
92	0.28
93	0.22
94	0.23
95	0.21
96	0.21
97	0.23
98	0.19
99	0.18
100	0.18
101	0.17
102	0.18
103	0.19
104	0.18
105	0.15
106	0.17
107	0.19
108	0.21
109	0.22
110	0.19
111	0.18
112	0.18
113	0.18
114	0.16
115	0.13
116	0.13
117	0.11
118	0.1
119	0.09
120	0.1
121	0.08
122	0.08
123	0.08
124	0.07
125	0.14
126	0.14
127	0.15
128	0.15
129	0.21
130	0.23
131	0.3
132	0.37
133	0.37
134	0.45
135	0.55
136	0.63
137	0.68
138	0.72
139	0.71
140	0.7
141	0.65
142	0.62
143	0.58
144	0.54
145	0.43
146	0.38
147	0.33
148	0.25
149	0.23
150	0.18
151	0.12
152	0.06
153	0.06
154	0.06
155	0.05
156	0.06
157	0.06
158	0.07
159	0.07
160	0.08
161	0.11
162	0.12
163	0.15
164	0.17
165	0.21
166	0.25
167	0.27
168	0.29
169	0.29
170	0.28
171	0.25
172	0.26
173	0.23
174	0.19
175	0.23
176	0.23
177	0.24
178	0.24
179	0.24
180	0.21
181	0.21
182	0.21
183	0.21
184	0.24
185	0.22
186	0.2
187	0.23
188	0.23
189	0.23
190	0.23
191	0.21
192	0.26
193	0.3
194	0.32
195	0.38
196	0.47
197	0.54
198	0.57
199	0.61
200	0.55
201	0.59
202	0.63
203	0.55
204	0.52
205	0.47
206	0.43
207	0.44
208	0.44
209	0.37
210	0.37
211	0.41
212	0.39
213	0.44
214	0.49
215	0.48
216	0.54
217	0.56
218	0.51
219	0.46
220	0.42
221	0.36
222	0.33
223	0.3
224	0.23
225	0.2
226	0.21
227	0.22
228	0.24
229	0.25
230	0.28
231	0.3
232	0.32
233	0.36
234	0.41
235	0.49
236	0.57
237	0.64
238	0.67
239	0.65
240	0.67
241	0.69
242	0.72
243	0.69
244	0.6
245	0.52
246	0.46
247	0.5
248	0.45
249	0.43
250	0.42
251	0.44
252	0.45
253	0.48
254	0.46
255	0.39
256	0.39
257	0.38
258	0.3
259	0.23
260	0.22
261	0.19
262	0.17
263	0.16
264	0.14
265	0.09
266	0.09
267	0.08
268	0.06
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.06
275	0.06
276	0.07
277	0.08
278	0.11
279	0.12
280	0.15
281	0.18
282	0.22
283	0.27
284	0.29
285	0.29
286	0.27
287	0.27
288	0.25
289	0.26
290	0.28
291	0.22
292	0.19
293	0.19
294	0.18
295	0.17
296	0.16
297	0.11
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.07
305	0.11
306	0.14
307	0.16
308	0.17
309	0.18
310	0.2
311	0.21
312	0.26
313	0.25
314	0.26
315	0.24
316	0.26
317	0.23
318	0.21
319	0.21
320	0.16
321	0.13
322	0.1
323	0.08
324	0.07
325	0.07
326	0.07
327	0.07
328	0.08
329	0.1
330	0.12
331	0.12
332	0.1
333	0.11
334	0.12
335	0.15
336	0.14
337	0.11
338	0.1
339	0.15
340	0.15
341	0.14
342	0.14
343	0.11
344	0.11
345	0.12
346	0.13
347	0.11
348	0.13
349	0.13
350	0.13
351	0.12
352	0.12
353	0.13
354	0.12
355	0.1
356	0.09
357	0.11
358	0.12
359	0.13
360	0.14
361	0.13
362	0.15
363	0.16
364	0.2
365	0.24
366	0.25
367	0.28
368	0.28
369	0.34
370	0.41
371	0.48
372	0.52
373	0.51
374	0.52
375	0.53
376	0.6
377	0.6
378	0.54
379	0.53
380	0.44
381	0.42
382	0.38
383	0.33
384	0.25
385	0.2
386	0.19
387	0.12
388	0.12
389	0.1
390	0.1
391	0.11
392	0.11
393	0.18
394	0.16
395	0.17
396	0.17
397	0.18
398	0.19
399	0.21
400	0.2
401	0.14
402	0.14
403	0.13
404	0.14
405	0.13
406	0.14
407	0.18
408	0.25
409	0.28
410	0.29
411	0.32
412	0.36
413	0.41
414	0.47
415	0.5
416	0.53
417	0.57
418	0.64
419	0.68
420	0.73
421	0.71
422	0.73
423	0.74
424	0.73
425	0.71
426	0.7
427	0.62
428	0.58
429	0.54
430	0.49
431	0.41
432	0.34
433	0.28
434	0.21
435	0.2
436	0.16
437	0.17
438	0.13
439	0.11
440	0.13
441	0.15
442	0.21
443	0.22
444	0.24
445	0.26
446	0.28
447	0.3
448	0.34
449	0.38
450	0.34
451	0.4
452	0.41
453	0.39
454	0.4
455	0.41
456	0.36
457	0.39
458	0.42
459	0.44
460	0.44
461	0.42
462	0.41
463	0.4
464	0.39
465	0.3
466	0.28
467	0.22
468	0.21
469	0.2
470	0.2
471	0.16
472	0.16
473	0.15
474	0.13
475	0.15
476	0.17
477	0.19
478	0.26
479	0.31
480	0.35
481	0.36
482	0.36
483	0.33
484	0.3
485	0.29
486	0.21
487	0.2
488	0.15
489	0.15
490	0.15
491	0.13
492	0.12
493	0.13
494	0.12
495	0.09
496	0.08
497	0.08
498	0.07
499	0.08
500	0.08
501	0.06
502	0.07
503	0.07
504	0.11
505	0.12
506	0.17
507	0.18
508	0.19
509	0.19
510	0.21
511	0.22
512	0.21
513	0.27
514	0.25
515	0.26
516	0.27
517	0.29
518	0.28
519	0.27
520	0.23
521	0.17
522	0.14
523	0.11
524	0.1
525	0.08
526	0.08
527	0.1
528	0.1
529	0.09
530	0.1
531	0.1
532	0.1
533	0.1
534	0.1
535	0.08
536	0.1
537	0.1
538	0.1
539	0.12
540	0.15
541	0.16
542	0.25
543	0.31
544	0.31
545	0.39
546	0.41
547	0.44
548	0.49
549	0.56
550	0.56
551	0.6
552	0.66
553	0.62
554	0.66
555	0.62
556	0.53
557	0.46
558	0.41
559	0.33
560	0.28
561	0.3
562	0.23
563	0.25
564	0.25
565	0.23
566	0.2
567	0.18
568	0.15
569	0.09
570	0.11
571	0.09
572	0.09
573	0.09
574	0.1
575	0.1
576	0.1
577	0.1
578	0.12
579	0.17
580	0.17
581	0.19
582	0.23
583	0.26
584	0.28
585	0.28
586	0.27
587	0.24
588	0.28
589	0.33
590	0.34
591	0.37
592	0.47
593	0.57
594	0.64
595	0.73
596	0.78
597	0.82
598	0.88
599	0.9
600	0.89
601	0.88
602	0.88
603	0.87
604	0.84
605	0.77
606	0.7
607	0.61
608	0.53
609	0.44
610	0.35
611	0.28
612	0.25
613	0.22
614	0.22
615	0.22
616	0.24
617	0.27
618	0.27
619	0.28
620	0.25
621	0.29
622	0.29
623	0.3
624	0.27
625	0.29
626	0.3

A0A166SME4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer