FuNGI

A0A166PC49

Protein Details

Accession

A0A166PC49

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
92-117	ISIATLSSKPKRKRGVKVLEKKASEP	Hydrophilic
289-308	PPGKGVPKAKAPRKKPRTIT	Basic
334-361	DEAAKPKGKKRASKAKKPKKVPPPEPVL	Basic
680-704	PKLAANTSPKRPRGRPRKNSETEMS	Hydrophilic
710-737	PSAQPPPPSPKRGRGRPKKNAEPVKTIS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
100-170	KPKRKRGVKVLEKKASEPSPKPTRDVGASPPWKKYMKPKDTADTLEKRPRTTKAKALAKKGGVKSHHFAKP
289-305	PPGKGVPKAKAPRKKPR
338-355	KPKGKKRASKAKKPKKVP
688-698	PKRPRGRPRKN
713-733	QPPPPSPKRGRGRPKKNAEPV
743-748	KKGKAK

Subcellular Location(s)

nucl 26, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017956 AT_hook_DNA-bd_motif IPR027784 Slx4_ascomycetes IPR018574 Structure-sp_endonuc_su_Slx4
Gene Ontology	GO:0033557 C:Slx1-Slx4 complex GO:0017108 F:5'-flap endonuclease activity GO:0003677 F:DNA binding GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair GO:0006260 P:DNA replication GO:0006996 P:organelle organization
Pfam	View protein in Pfam PF09494 Slx4
CDD	cd22999 SAP_SLX4

Amino Acid Sequences

MGSPFRSTRHDARNLSSSPGLPSLDQLKSQFPKNPPIRSGSVAIPIPDQASHHFTGASSFLRQEPSTIDLTTPCKDPNEPAMPQQEDDVTVISIATLSSKPKRKRGVKVLEKKASEPSPKPTRDVGASPPWKKYMKPKDTADTLEKRPRTTKAKALAKKGGVKSHHFAKPKTEEEAETPPLPKKNADEPLELEAALRRRMDWTPPPADSRFATGSRPSQAIDLPFSATRSPSRAASKDTFENLLKKYGRPDEDAPMRPSAEPSDGENPAFKKRKLIETVSISDSSKMAPPGKGVPKAKAPRKKPRTITELATAAYVVPDATEQEIPQESVVNEDEAAKPKGKKRASKAKKPKKVPPPEPVLLSPTAALRQAANQDYIFGTSSQLAREHSPAFLRDLQSALQASNLLREEDPFVTPINSDAIEPEPKQKLWDVGARDEDGRLLDLEVINLADTPQVVLSAAAGLDPFGYAAGVEDQAVAAPLPAHIPSDVSFPDIDDLLSNVAVGDASTGQTQAAPLPVHIPSDVSFPDIDDLLGNEAGGDMPRGQKEASPFSPAARPAETEPGIPSAVLISSGSASNVEAVPELPPAQLPSALEREAPKSTAAEMSTSGIPKPDFDLYTDNQLAREIASYGFKPVKRRQAMLALLDQCWTSKQRTALASLSTNHPISTTSQAQAVALKLPKLAANTSPKRPRGRPRKNSETEMSSSEPPPSAQPPPPSPKRGRGRPKKNAEPVKTISTLTTAKKGKAKASLAAQVVPKLASLAPSPRSKKAKASVVIEIPDSASDGSLSPSPSACSSPEPMFSPPPEDVSVSIGDDTEMSLATSPTSQSSVLFAQITEAVTSAPPTTDPKKPSFHEMMLMYDPVVLEDLATWLNTGQLSRVGYDGEVSPNEVKQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.61
2	0.59
3	0.53
4	0.44
5	0.38
6	0.37
7	0.33
8	0.25
9	0.27
10	0.28
11	0.27
12	0.29
13	0.28
14	0.34
15	0.36
16	0.42
17	0.46
18	0.44
19	0.52
20	0.58
21	0.63
22	0.58
23	0.61
24	0.6
25	0.56
26	0.55
27	0.47
28	0.46
29	0.39
30	0.36
31	0.31
32	0.28
33	0.25
34	0.22
35	0.2
36	0.18
37	0.22
38	0.22
39	0.22
40	0.21
41	0.2
42	0.21
43	0.23
44	0.21
45	0.17
46	0.17
47	0.19
48	0.23
49	0.23
50	0.22
51	0.22
52	0.23
53	0.24
54	0.23
55	0.21
56	0.21
57	0.25
58	0.27
59	0.26
60	0.25
61	0.25
62	0.26
63	0.29
64	0.34
65	0.37
66	0.37
67	0.41
68	0.47
69	0.46
70	0.45
71	0.42
72	0.34
73	0.28
74	0.27
75	0.22
76	0.13
77	0.11
78	0.1
79	0.08
80	0.07
81	0.06
82	0.07
83	0.08
84	0.14
85	0.22
86	0.32
87	0.4
88	0.49
89	0.59
90	0.66
91	0.76
92	0.81
93	0.84
94	0.85
95	0.89
96	0.91
97	0.89
98	0.82
99	0.73
100	0.71
101	0.67
102	0.64
103	0.57
104	0.56
105	0.58
106	0.58
107	0.59
108	0.55
109	0.51
110	0.47
111	0.47
112	0.44
113	0.44
114	0.51
115	0.51
116	0.51
117	0.53
118	0.5
119	0.5
120	0.54
121	0.55
122	0.55
123	0.6
124	0.63
125	0.65
126	0.68
127	0.71
128	0.68
129	0.64
130	0.63
131	0.64
132	0.6
133	0.56
134	0.55
135	0.57
136	0.56
137	0.56
138	0.56
139	0.57
140	0.65
141	0.68
142	0.72
143	0.72
144	0.71
145	0.73
146	0.69
147	0.66
148	0.6
149	0.6
150	0.56
151	0.57
152	0.58
153	0.55
154	0.51
155	0.53
156	0.56
157	0.54
158	0.54
159	0.48
160	0.42
161	0.42
162	0.47
163	0.42
164	0.36
165	0.34
166	0.34
167	0.35
168	0.34
169	0.32
170	0.3
171	0.35
172	0.41
173	0.43
174	0.42
175	0.41
176	0.43
177	0.42
178	0.37
179	0.28
180	0.23
181	0.22
182	0.21
183	0.19
184	0.15
185	0.18
186	0.2
187	0.26
188	0.3
189	0.35
190	0.38
191	0.4
192	0.44
193	0.42
194	0.44
195	0.37
196	0.35
197	0.31
198	0.27
199	0.27
200	0.26
201	0.29
202	0.29
203	0.29
204	0.24
205	0.22
206	0.23
207	0.22
208	0.21
209	0.18
210	0.18
211	0.17
212	0.18
213	0.17
214	0.17
215	0.17
216	0.18
217	0.19
218	0.21
219	0.27
220	0.28
221	0.33
222	0.35
223	0.38
224	0.38
225	0.39
226	0.38
227	0.34
228	0.36
229	0.31
230	0.36
231	0.33
232	0.3
233	0.34
234	0.38
235	0.38
236	0.39
237	0.4
238	0.41
239	0.48
240	0.51
241	0.48
242	0.43
243	0.41
244	0.36
245	0.34
246	0.28
247	0.22
248	0.18
249	0.19
250	0.22
251	0.22
252	0.22
253	0.24
254	0.24
255	0.31
256	0.35
257	0.32
258	0.34
259	0.37
260	0.45
261	0.48
262	0.51
263	0.49
264	0.49
265	0.53
266	0.48
267	0.46
268	0.38
269	0.32
270	0.28
271	0.21
272	0.17
273	0.17
274	0.16
275	0.15
276	0.17
277	0.24
278	0.3
279	0.36
280	0.36
281	0.36
282	0.43
283	0.52
284	0.59
285	0.6
286	0.64
287	0.68
288	0.75
289	0.81
290	0.79
291	0.78
292	0.77
293	0.72
294	0.66
295	0.6
296	0.53
297	0.44
298	0.36
299	0.28
300	0.2
301	0.15
302	0.11
303	0.06
304	0.04
305	0.03
306	0.04
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.08
311	0.09
312	0.09
313	0.09
314	0.1
315	0.08
316	0.1
317	0.11
318	0.09
319	0.09
320	0.1
321	0.12
322	0.14
323	0.16
324	0.17
325	0.2
326	0.25
327	0.34
328	0.39
329	0.44
330	0.5
331	0.6
332	0.66
333	0.74
334	0.81
335	0.83
336	0.86
337	0.87
338	0.87
339	0.86
340	0.87
341	0.84
342	0.81
343	0.78
344	0.71
345	0.66
346	0.57
347	0.49
348	0.39
349	0.31
350	0.23
351	0.15
352	0.14
353	0.11
354	0.1
355	0.07
356	0.09
357	0.12
358	0.13
359	0.14
360	0.13
361	0.13
362	0.13
363	0.14
364	0.13
365	0.09
366	0.09
367	0.09
368	0.09
369	0.09
370	0.1
371	0.11
372	0.11
373	0.14
374	0.14
375	0.13
376	0.14
377	0.14
378	0.16
379	0.18
380	0.18
381	0.16
382	0.16
383	0.15
384	0.16
385	0.15
386	0.12
387	0.09
388	0.09
389	0.08
390	0.1
391	0.11
392	0.1
393	0.09
394	0.1
395	0.12
396	0.12
397	0.13
398	0.1
399	0.1
400	0.09
401	0.09
402	0.09
403	0.08
404	0.07
405	0.07
406	0.07
407	0.09
408	0.11
409	0.12
410	0.16
411	0.17
412	0.17
413	0.18
414	0.18
415	0.17
416	0.18
417	0.21
418	0.19
419	0.2
420	0.21
421	0.21
422	0.2
423	0.18
424	0.16
425	0.12
426	0.1
427	0.07
428	0.06
429	0.06
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.03
438	0.03
439	0.03
440	0.03
441	0.03
442	0.03
443	0.03
444	0.03
445	0.03
446	0.03
447	0.03
448	0.03
449	0.03
450	0.03
451	0.03
452	0.03
453	0.02
454	0.02
455	0.02
456	0.03
457	0.03
458	0.03
459	0.04
460	0.04
461	0.04
462	0.04
463	0.04
464	0.03
465	0.03
466	0.03
467	0.03
468	0.04
469	0.04
470	0.05
471	0.04
472	0.05
473	0.06
474	0.08
475	0.08
476	0.09
477	0.08
478	0.08
479	0.09
480	0.08
481	0.07
482	0.05
483	0.06
484	0.05
485	0.05
486	0.04
487	0.04
488	0.04
489	0.03
490	0.03
491	0.03
492	0.03
493	0.04
494	0.04
495	0.04
496	0.04
497	0.05
498	0.05
499	0.05
500	0.07
501	0.07
502	0.07
503	0.09
504	0.09
505	0.1
506	0.09
507	0.1
508	0.08
509	0.1
510	0.1
511	0.09
512	0.09
513	0.08
514	0.09
515	0.08
516	0.08
517	0.05
518	0.06
519	0.06
520	0.06
521	0.05
522	0.05
523	0.05
524	0.05
525	0.05
526	0.05
527	0.04
528	0.07
529	0.07
530	0.08
531	0.09
532	0.1
533	0.14
534	0.2
535	0.2
536	0.23
537	0.23
538	0.23
539	0.27
540	0.26
541	0.25
542	0.2
543	0.2
544	0.17
545	0.23
546	0.22
547	0.19
548	0.19
549	0.18
550	0.17
551	0.15
552	0.13
553	0.07
554	0.07
555	0.06
556	0.05
557	0.04
558	0.05
559	0.05
560	0.05
561	0.05
562	0.05
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.05
567	0.06
568	0.06
569	0.07
570	0.07
571	0.06
572	0.07
573	0.07
574	0.08
575	0.09
576	0.08
577	0.11
578	0.13
579	0.14
580	0.15
581	0.15
582	0.18
583	0.18
584	0.19
585	0.16
586	0.14
587	0.15
588	0.16
589	0.15
590	0.12
591	0.12
592	0.13
593	0.15
594	0.15
595	0.14
596	0.13
597	0.13
598	0.12
599	0.14
600	0.15
601	0.14
602	0.15
603	0.2
604	0.19
605	0.26
606	0.27
607	0.25
608	0.22
609	0.22
610	0.2
611	0.15
612	0.15
613	0.09
614	0.08
615	0.1
616	0.1
617	0.13
618	0.19
619	0.2
620	0.27
621	0.34
622	0.43
623	0.45
624	0.47
625	0.47
626	0.5
627	0.52
628	0.47
629	0.47
630	0.38
631	0.35
632	0.33
633	0.29
634	0.21
635	0.19
636	0.19
637	0.14
638	0.16
639	0.19
640	0.24
641	0.25
642	0.29
643	0.3
644	0.3
645	0.31
646	0.29
647	0.3
648	0.28
649	0.27
650	0.22
651	0.2
652	0.18
653	0.18
654	0.22
655	0.21
656	0.18
657	0.2
658	0.2
659	0.2
660	0.21
661	0.19
662	0.17
663	0.16
664	0.16
665	0.14
666	0.15
667	0.16
668	0.16
669	0.17
670	0.19
671	0.28
672	0.33
673	0.43
674	0.51
675	0.56
676	0.62
677	0.69
678	0.73
679	0.75
680	0.8
681	0.81
682	0.83
683	0.87
684	0.86
685	0.85
686	0.79
687	0.74
688	0.65
689	0.59
690	0.52
691	0.44
692	0.38
693	0.33
694	0.28
695	0.23
696	0.23
697	0.23
698	0.24
699	0.27
700	0.33
701	0.39
702	0.48
703	0.55
704	0.6
705	0.62
706	0.67
707	0.72
708	0.76
709	0.79
710	0.81
711	0.84
712	0.87
713	0.91
714	0.91
715	0.91
716	0.91
717	0.86
718	0.83
719	0.76
720	0.72
721	0.63
722	0.53
723	0.43
724	0.37
725	0.36
726	0.3
727	0.34
728	0.31
729	0.34
730	0.39
731	0.42
732	0.43
733	0.47
734	0.47
735	0.44
736	0.47
737	0.49
738	0.45
739	0.45
740	0.41
741	0.34
742	0.32
743	0.27
744	0.21
745	0.16
746	0.14
747	0.12
748	0.13
749	0.18
750	0.22
751	0.31
752	0.35
753	0.43
754	0.49
755	0.5
756	0.57
757	0.59
758	0.63
759	0.61
760	0.61
761	0.6
762	0.58
763	0.56
764	0.48
765	0.4
766	0.31
767	0.24
768	0.2
769	0.13
770	0.09
771	0.08
772	0.07
773	0.09
774	0.11
775	0.12
776	0.12
777	0.13
778	0.14
779	0.15
780	0.17
781	0.17
782	0.18
783	0.22
784	0.23
785	0.26
786	0.27
787	0.29
788	0.32
789	0.32
790	0.33
791	0.29
792	0.3
793	0.29
794	0.27
795	0.24
796	0.22
797	0.22
798	0.18
799	0.17
800	0.13
801	0.12
802	0.11
803	0.1
804	0.08
805	0.07
806	0.06
807	0.06
808	0.06
809	0.07
810	0.08
811	0.08
812	0.1
813	0.11
814	0.12
815	0.11
816	0.15
817	0.15
818	0.17
819	0.17
820	0.15
821	0.15
822	0.16
823	0.17
824	0.13
825	0.12
826	0.1
827	0.1
828	0.12
829	0.1
830	0.09
831	0.1
832	0.16
833	0.21
834	0.28
835	0.33
836	0.38
837	0.45
838	0.48
839	0.55
840	0.56
841	0.53
842	0.52
843	0.48
844	0.47
845	0.42
846	0.39
847	0.3
848	0.24
849	0.22
850	0.16
851	0.15
852	0.1
853	0.07
854	0.07
855	0.08
856	0.08
857	0.08
858	0.08
859	0.07
860	0.09
861	0.1
862	0.1
863	0.1
864	0.13
865	0.15
866	0.15
867	0.16
868	0.15
869	0.15
870	0.16
871	0.17
872	0.17
873	0.16
874	0.19

A0A166PC49

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer