FuNGI

A0A166T2F4

Protein Details

Accession

A0A166T2F4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
12-40	GNDAAEPAPKRNKKPNPKTRDHQNAHIDP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-27	KRNKKPN

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 10.5, cyto 7.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MASKRNYAAPDGNDAAEPAPKRNKKPNPKTRDHQNAHIDPTWGQKYVFSSAAGSTTVPVDPDLDFEDDADAMAYLKSVRTQANGIPHLLVAPKVPIGPQLPKELQDDGRDDVEEGEDVEEDRDIYTTGQGDFRGYYQDGAYTARPDNWDDRRAPRDDDADDSEWQGNEGIYDEEEEENNADPETAIHEAYFAAILSRFNTLRRILHTTPPPDVVAALPRTHGYHVGAFGPKSGTFSIWSQRLRSTDPLPAQIASMDKDGVLRVVRVLLGGKFLRRGCELRERTSRWLWALLARLPERGELNHAEIGWVRDLGRRAVLMMQSLADMAALRDALEGEGMDLGVHDAVDESSDDEDVLREMEVEERDGEEVSGKTGETPSAASQVLAETAKPERSDPTPEKPTDDGEVEEGEIDDDQKSEPMDVSEDGEIDEGEVAEEPAPAETLEEVRARLLAQLDTAAEDAPSEAPSEEPIAEVEDEEMADQLRARMNMRATLNMILTVAGEFYGQRDLLEFRNPFPGM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.27
3	0.25
4	0.24
5	0.24
6	0.32
7	0.39
8	0.47
9	0.57
10	0.67
11	0.73
12	0.83
13	0.87
14	0.87
15	0.89
16	0.9
17	0.91
18	0.91
19	0.85
20	0.84
21	0.83
22	0.78
23	0.75
24	0.69
25	0.59
26	0.5
27	0.52
28	0.45
29	0.36
30	0.31
31	0.27
32	0.28
33	0.3
34	0.3
35	0.22
36	0.21
37	0.2
38	0.21
39	0.19
40	0.16
41	0.12
42	0.12
43	0.12
44	0.11
45	0.1
46	0.1
47	0.1
48	0.11
49	0.13
50	0.14
51	0.13
52	0.13
53	0.13
54	0.12
55	0.12
56	0.1
57	0.07
58	0.06
59	0.06
60	0.06
61	0.05
62	0.06
63	0.08
64	0.11
65	0.13
66	0.14
67	0.17
68	0.21
69	0.29
70	0.31
71	0.3
72	0.27
73	0.26
74	0.25
75	0.23
76	0.2
77	0.12
78	0.11
79	0.11
80	0.1
81	0.11
82	0.14
83	0.17
84	0.23
85	0.25
86	0.31
87	0.32
88	0.34
89	0.36
90	0.36
91	0.36
92	0.34
93	0.34
94	0.28
95	0.28
96	0.25
97	0.23
98	0.19
99	0.17
100	0.13
101	0.1
102	0.08
103	0.07
104	0.07
105	0.07
106	0.07
107	0.06
108	0.06
109	0.06
110	0.06
111	0.07
112	0.08
113	0.09
114	0.1
115	0.11
116	0.11
117	0.12
118	0.12
119	0.12
120	0.15
121	0.14
122	0.14
123	0.12
124	0.13
125	0.13
126	0.15
127	0.15
128	0.14
129	0.15
130	0.16
131	0.18
132	0.2
133	0.26
134	0.29
135	0.33
136	0.34
137	0.4
138	0.43
139	0.44
140	0.45
141	0.41
142	0.4
143	0.36
144	0.36
145	0.34
146	0.32
147	0.29
148	0.28
149	0.26
150	0.22
151	0.2
152	0.17
153	0.11
154	0.08
155	0.09
156	0.07
157	0.06
158	0.07
159	0.07
160	0.08
161	0.08
162	0.08
163	0.08
164	0.08
165	0.08
166	0.08
167	0.06
168	0.06
169	0.06
170	0.08
171	0.08
172	0.07
173	0.07
174	0.07
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.05
179	0.04
180	0.05
181	0.05
182	0.06
183	0.09
184	0.09
185	0.1
186	0.14
187	0.15
188	0.17
189	0.21
190	0.28
191	0.28
192	0.34
193	0.39
194	0.39
195	0.38
196	0.38
197	0.34
198	0.26
199	0.24
200	0.17
201	0.16
202	0.15
203	0.13
204	0.12
205	0.12
206	0.13
207	0.13
208	0.14
209	0.11
210	0.11
211	0.11
212	0.13
213	0.14
214	0.13
215	0.13
216	0.13
217	0.12
218	0.12
219	0.12
220	0.1
221	0.1
222	0.12
223	0.16
224	0.2
225	0.21
226	0.21
227	0.23
228	0.25
229	0.26
230	0.27
231	0.25
232	0.25
233	0.26
234	0.27
235	0.25
236	0.23
237	0.2
238	0.18
239	0.16
240	0.11
241	0.1
242	0.08
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.06
249	0.05
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.07
254	0.05
255	0.09
256	0.09
257	0.1
258	0.14
259	0.14
260	0.16
261	0.17
262	0.18
263	0.19
264	0.29
265	0.32
266	0.34
267	0.42
268	0.44
269	0.46
270	0.48
271	0.46
272	0.36
273	0.34
274	0.28
275	0.23
276	0.22
277	0.19
278	0.21
279	0.2
280	0.2
281	0.19
282	0.19
283	0.17
284	0.15
285	0.16
286	0.13
287	0.15
288	0.15
289	0.15
290	0.14
291	0.14
292	0.15
293	0.12
294	0.11
295	0.09
296	0.1
297	0.12
298	0.12
299	0.12
300	0.11
301	0.11
302	0.13
303	0.13
304	0.11
305	0.1
306	0.09
307	0.08
308	0.08
309	0.07
310	0.05
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.03
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.03
325	0.03
326	0.03
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.03
331	0.03
332	0.04
333	0.04
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.06
340	0.05
341	0.06
342	0.05
343	0.04
344	0.05
345	0.08
346	0.08
347	0.09
348	0.09
349	0.09
350	0.1
351	0.1
352	0.1
353	0.09
354	0.08
355	0.09
356	0.09
357	0.08
358	0.08
359	0.09
360	0.09
361	0.08
362	0.09
363	0.09
364	0.12
365	0.12
366	0.11
367	0.11
368	0.11
369	0.12
370	0.11
371	0.1
372	0.09
373	0.11
374	0.14
375	0.14
376	0.15
377	0.16
378	0.19
379	0.28
380	0.31
381	0.38
382	0.44
383	0.44
384	0.47
385	0.46
386	0.45
387	0.4
388	0.36
389	0.28
390	0.21
391	0.21
392	0.16
393	0.15
394	0.12
395	0.09
396	0.08
397	0.08
398	0.06
399	0.06
400	0.06
401	0.07
402	0.08
403	0.08
404	0.09
405	0.09
406	0.11
407	0.11
408	0.13
409	0.12
410	0.12
411	0.11
412	0.11
413	0.1
414	0.08
415	0.08
416	0.05
417	0.05
418	0.05
419	0.06
420	0.06
421	0.06
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.06
426	0.06
427	0.07
428	0.08
429	0.11
430	0.12
431	0.12
432	0.12
433	0.12
434	0.12
435	0.14
436	0.14
437	0.12
438	0.11
439	0.12
440	0.12
441	0.12
442	0.12
443	0.1
444	0.08
445	0.08
446	0.08
447	0.08
448	0.08
449	0.08
450	0.08
451	0.08
452	0.1
453	0.12
454	0.11
455	0.1
456	0.11
457	0.12
458	0.12
459	0.12
460	0.11
461	0.09
462	0.09
463	0.09
464	0.09
465	0.07
466	0.07
467	0.08
468	0.09
469	0.13
470	0.15
471	0.16
472	0.21
473	0.23
474	0.3
475	0.31
476	0.33
477	0.31
478	0.33
479	0.32
480	0.27
481	0.24
482	0.18
483	0.16
484	0.12
485	0.1
486	0.07
487	0.06
488	0.06
489	0.07
490	0.11
491	0.1
492	0.1
493	0.12
494	0.14
495	0.17
496	0.26
497	0.26
498	0.24

A0A166T2F4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer