Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A161VTG0

Protein Details
Accession A0A161VTG0    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-41RSVLPKKHSSHRLRAHKLPRSNSHRRSVAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 23, cyto 2.5, cyto_nucl 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033956  Translin  
IPR016069  Translin_C  
IPR002848  Translin_fam  
IPR016068  Translin_N  
IPR036081  Translin_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0016070  P:RNA metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF01997  Translin  
CDD cd14819  Translin  
Amino Acid Sequences LRYSQSNVVVVFRSVLPKKHSSHRLRAHKLPRSNSHRRSVATPLGMDNDTNMGEVPASRLLDPQIFEHLKNKIDEDQQVRDQMSQTVQKLDRAISYVQGLLSRIHATPREQYGPLLSDVQAGIQKEIEVVAELQEIASKHPYYKYNQKWNRQVQNAIFTVLLCGWLGGLTSDGKPGPVARLLTLEEVGEIFKVPVNLKDRDAFHLTIEEYLLALTDLTQELSRLATNAVTLSDFAMPVEISSFVKDLFAGFQLLNLKNDILRKRVDAVKYDVKRVEDVVYDLSLRNLIPQKQKEVATAESTSAPKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.3
3 0.34
4 0.39
5 0.44
6 0.52
7 0.61
8 0.62
9 0.69
10 0.74
11 0.79
12 0.8
13 0.85
14 0.85
15 0.84
16 0.84
17 0.83
18 0.83
19 0.81
20 0.84
21 0.82
22 0.8
23 0.77
24 0.71
25 0.66
26 0.63
27 0.6
28 0.52
29 0.46
30 0.39
31 0.37
32 0.34
33 0.3
34 0.23
35 0.18
36 0.14
37 0.13
38 0.12
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.09
43 0.11
44 0.11
45 0.12
46 0.13
47 0.14
48 0.17
49 0.18
50 0.17
51 0.22
52 0.22
53 0.23
54 0.27
55 0.28
56 0.29
57 0.29
58 0.3
59 0.27
60 0.29
61 0.34
62 0.35
63 0.37
64 0.37
65 0.39
66 0.38
67 0.34
68 0.31
69 0.27
70 0.26
71 0.25
72 0.23
73 0.27
74 0.27
75 0.28
76 0.28
77 0.27
78 0.24
79 0.22
80 0.21
81 0.15
82 0.15
83 0.14
84 0.13
85 0.13
86 0.13
87 0.1
88 0.12
89 0.12
90 0.11
91 0.13
92 0.14
93 0.16
94 0.19
95 0.23
96 0.24
97 0.23
98 0.23
99 0.22
100 0.22
101 0.21
102 0.19
103 0.14
104 0.12
105 0.11
106 0.12
107 0.12
108 0.11
109 0.1
110 0.08
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.06
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.14
128 0.17
129 0.2
130 0.3
131 0.37
132 0.46
133 0.54
134 0.61
135 0.67
136 0.74
137 0.77
138 0.7
139 0.66
140 0.57
141 0.55
142 0.47
143 0.38
144 0.29
145 0.21
146 0.18
147 0.13
148 0.11
149 0.05
150 0.05
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.09
165 0.1
166 0.09
167 0.11
168 0.12
169 0.13
170 0.12
171 0.11
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.06
176 0.05
177 0.04
178 0.05
179 0.07
180 0.07
181 0.12
182 0.17
183 0.19
184 0.2
185 0.24
186 0.25
187 0.28
188 0.32
189 0.27
190 0.23
191 0.24
192 0.22
193 0.19
194 0.17
195 0.12
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.04
200 0.04
201 0.03
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.11
239 0.18
240 0.19
241 0.2
242 0.2
243 0.19
244 0.2
245 0.27
246 0.27
247 0.24
248 0.25
249 0.27
250 0.32
251 0.38
252 0.39
253 0.38
254 0.42
255 0.49
256 0.49
257 0.53
258 0.52
259 0.47
260 0.45
261 0.42
262 0.37
263 0.28
264 0.27
265 0.23
266 0.2
267 0.19
268 0.18
269 0.17
270 0.15
271 0.14
272 0.18
273 0.22
274 0.28
275 0.36
276 0.41
277 0.47
278 0.52
279 0.54
280 0.51
281 0.5
282 0.47
283 0.42
284 0.39
285 0.34
286 0.33