Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A161W3L9

Protein Details
Accession A0A161W3L9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-50TPEEEPKKRGRGRPPKADGQKKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
33-125PKKRGRGRPPKADGQKKAAYVPTGRPRGRPKGSGGVKKAAAPKPAAGTGRGRGRPRKSDVAEATASPKPSAATPRKSTPAKSTGRPRGRPRKS
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 7.5, cyto_nucl 6.5, cyto 4.5, extr 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
Amino Acid Sequences LILCNFLRFPSFYLINIQLPPTTMAPITPEEEPKKRGRGRPPKADGQKKAAYVPTGRPRGRPKGSGGVKKAAAPKPAAGTGRGRGRPRKSDVAEATASPKPSAATPRKSTPAKSTGRPRGRPRKSDASTTAPTPKSAESAKSKAKNSDDSMKESSLSDSSSASDEEGVSSLKCEDQGLEDVAKSPSDAAEEVRRWFPPKMIRGLFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.3
3 0.3
4 0.29
5 0.22
6 0.22
7 0.24
8 0.19
9 0.17
10 0.14
11 0.13
12 0.14
13 0.16
14 0.17
15 0.17
16 0.23
17 0.28
18 0.33
19 0.37
20 0.41
21 0.48
22 0.53
23 0.59
24 0.63
25 0.68
26 0.73
27 0.79
28 0.8
29 0.81
30 0.84
31 0.86
32 0.8
33 0.76
34 0.72
35 0.62
36 0.59
37 0.51
38 0.43
39 0.36
40 0.4
41 0.41
42 0.45
43 0.45
44 0.49
45 0.54
46 0.6
47 0.62
48 0.57
49 0.53
50 0.54
51 0.61
52 0.62
53 0.58
54 0.54
55 0.5
56 0.5
57 0.52
58 0.46
59 0.41
60 0.34
61 0.32
62 0.29
63 0.31
64 0.28
65 0.22
66 0.21
67 0.24
68 0.3
69 0.34
70 0.36
71 0.4
72 0.45
73 0.5
74 0.53
75 0.56
76 0.51
77 0.54
78 0.51
79 0.47
80 0.43
81 0.36
82 0.34
83 0.27
84 0.25
85 0.17
86 0.16
87 0.12
88 0.12
89 0.2
90 0.22
91 0.27
92 0.3
93 0.34
94 0.4
95 0.41
96 0.42
97 0.4
98 0.43
99 0.4
100 0.43
101 0.49
102 0.53
103 0.6
104 0.66
105 0.7
106 0.73
107 0.77
108 0.76
109 0.74
110 0.74
111 0.68
112 0.67
113 0.62
114 0.58
115 0.52
116 0.49
117 0.49
118 0.39
119 0.37
120 0.31
121 0.27
122 0.23
123 0.22
124 0.25
125 0.24
126 0.3
127 0.38
128 0.42
129 0.44
130 0.48
131 0.5
132 0.51
133 0.49
134 0.52
135 0.47
136 0.47
137 0.47
138 0.42
139 0.38
140 0.33
141 0.3
142 0.21
143 0.19
144 0.14
145 0.11
146 0.11
147 0.12
148 0.11
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.08
162 0.11
163 0.14
164 0.15
165 0.16
166 0.15
167 0.17
168 0.17
169 0.17
170 0.14
171 0.11
172 0.09
173 0.11
174 0.11
175 0.13
176 0.21
177 0.23
178 0.27
179 0.3
180 0.32
181 0.34
182 0.35
183 0.38
184 0.39
185 0.43
186 0.5