FuNGI

A0A166Y2Y6

Protein Details

Accession

A0A166Y2Y6

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
66-86	DANGRKRKRDLDSSSKSKKKL	Basic
376-399	ATPGKQRGTKRIPPRDKLKERLSP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
70-75	RKRKRD
81-84	KSKK
383-393	GTKRIPPRDKL
499-503	APKRR

Subcellular Location(s)

cyto 10, cyto_nucl 10, nucl 8, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

TAVTPPAYHGGNARVNAGEPIFFSDRQTPTENISRVAGHPTKPITTNQVPPTAPGRRQLSTATMADANGRKRKRDLDSSSKSKKKLATEPSTVSVSSVLRPQLCPPVLASAPGVRLPKSVPFNPYVKQDGLSSKRRQKVPAVSQDLVLHSSSHQTMDYTAREDGISDSQQALKHYVGVFDPKTGTLQVVEAKKMVVRGVARAKHATEQAMRAPADNQSYYDLKKDLGQTFGTKKAKKAIESVALNAIDPNKTRDSAPKKLDTASKAILQEIGGVTATMASREQLQAAVDEAKPVPKPNLEAEAIQDVYDPDEFIGREILAAVPIKDWVEPAKNGEEILCYSRHVAARVKKVADSGSVAKMRLLRYFYFLFTFYTMATPGKQRGTKRIPPRDKLKERLSPAPQVVIEHIRRKFSDGGEMRKFHIDLLITHCCALACIIDNFEVDTSKLREDLRLDQKDMNNYFYEIGAKVKQVATKEKGKAAHVAKLALPLNFPKLRSVAPKRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.26
3	0.28
4	0.26
5	0.19
6	0.14
7	0.2
8	0.21
9	0.21
10	0.24
11	0.29
12	0.31
13	0.34
14	0.38
15	0.33
16	0.35
17	0.44
18	0.42
19	0.36
20	0.36
21	0.34
22	0.31
23	0.38
24	0.36
25	0.29
26	0.34
27	0.36
28	0.37
29	0.37
30	0.39
31	0.39
32	0.4
33	0.47
34	0.45
35	0.49
36	0.46
37	0.46
38	0.51
39	0.5
40	0.47
41	0.46
42	0.47
43	0.41
44	0.43
45	0.43
46	0.4
47	0.38
48	0.36
49	0.3
50	0.26
51	0.24
52	0.28
53	0.3
54	0.33
55	0.36
56	0.38
57	0.39
58	0.44
59	0.52
60	0.54
61	0.59
62	0.61
63	0.64
64	0.7
65	0.77
66	0.82
67	0.81
68	0.75
69	0.7
70	0.67
71	0.64
72	0.64
73	0.64
74	0.62
75	0.62
76	0.64
77	0.62
78	0.58
79	0.5
80	0.4
81	0.33
82	0.25
83	0.2
84	0.19
85	0.19
86	0.19
87	0.2
88	0.23
89	0.29
90	0.29
91	0.28
92	0.25
93	0.27
94	0.25
95	0.25
96	0.24
97	0.17
98	0.18
99	0.22
100	0.22
101	0.17
102	0.18
103	0.18
104	0.24
105	0.28
106	0.3
107	0.3
108	0.33
109	0.35
110	0.37
111	0.4
112	0.38
113	0.33
114	0.3
115	0.29
116	0.34
117	0.37
118	0.43
119	0.47
120	0.51
121	0.58
122	0.6
123	0.61
124	0.61
125	0.64
126	0.66
127	0.67
128	0.66
129	0.59
130	0.57
131	0.55
132	0.48
133	0.39
134	0.3
135	0.2
136	0.12
137	0.14
138	0.13
139	0.12
140	0.11
141	0.1
142	0.11
143	0.15
144	0.16
145	0.16
146	0.15
147	0.15
148	0.15
149	0.15
150	0.15
151	0.14
152	0.13
153	0.12
154	0.13
155	0.15
156	0.16
157	0.17
158	0.17
159	0.14
160	0.16
161	0.16
162	0.16
163	0.14
164	0.17
165	0.17
166	0.16
167	0.16
168	0.14
169	0.15
170	0.14
171	0.13
172	0.09
173	0.1
174	0.13
175	0.15
176	0.15
177	0.14
178	0.14
179	0.14
180	0.15
181	0.13
182	0.12
183	0.1
184	0.15
185	0.22
186	0.25
187	0.27
188	0.28
189	0.29
190	0.29
191	0.3
192	0.27
193	0.21
194	0.21
195	0.21
196	0.23
197	0.22
198	0.2
199	0.19
200	0.19
201	0.19
202	0.17
203	0.15
204	0.14
205	0.16
206	0.16
207	0.17
208	0.15
209	0.13
210	0.16
211	0.2
212	0.18
213	0.19
214	0.19
215	0.21
216	0.23
217	0.32
218	0.35
219	0.31
220	0.31
221	0.37
222	0.38
223	0.36
224	0.38
225	0.33
226	0.34
227	0.34
228	0.33
229	0.29
230	0.26
231	0.24
232	0.21
233	0.18
234	0.11
235	0.11
236	0.13
237	0.11
238	0.12
239	0.13
240	0.21
241	0.27
242	0.34
243	0.38
244	0.39
245	0.39
246	0.41
247	0.45
248	0.38
249	0.35
250	0.29
251	0.28
252	0.24
253	0.23
254	0.2
255	0.16
256	0.15
257	0.11
258	0.09
259	0.06
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.05
264	0.04
265	0.04
266	0.04
267	0.06
268	0.06
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.07
274	0.1
275	0.09
276	0.1
277	0.1
278	0.11
279	0.12
280	0.13
281	0.13
282	0.12
283	0.15
284	0.15
285	0.2
286	0.19
287	0.18
288	0.19
289	0.2
290	0.19
291	0.17
292	0.15
293	0.1
294	0.1
295	0.1
296	0.08
297	0.05
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.08
302	0.06
303	0.06
304	0.06
305	0.06
306	0.06
307	0.07
308	0.07
309	0.06
310	0.07
311	0.08
312	0.07
313	0.08
314	0.09
315	0.12
316	0.13
317	0.15
318	0.17
319	0.17
320	0.17
321	0.17
322	0.15
323	0.13
324	0.15
325	0.13
326	0.11
327	0.12
328	0.16
329	0.17
330	0.18
331	0.24
332	0.28
333	0.37
334	0.41
335	0.41
336	0.38
337	0.39
338	0.37
339	0.32
340	0.28
341	0.23
342	0.24
343	0.24
344	0.24
345	0.24
346	0.27
347	0.26
348	0.26
349	0.27
350	0.21
351	0.24
352	0.26
353	0.25
354	0.23
355	0.23
356	0.2
357	0.18
358	0.17
359	0.13
360	0.12
361	0.12
362	0.12
363	0.12
364	0.14
365	0.17
366	0.23
367	0.28
368	0.3
369	0.39
370	0.47
371	0.54
372	0.62
373	0.69
374	0.72
375	0.76
376	0.83
377	0.84
378	0.84
379	0.84
380	0.82
381	0.79
382	0.75
383	0.76
384	0.71
385	0.66
386	0.59
387	0.55
388	0.46
389	0.39
390	0.37
391	0.36
392	0.36
393	0.37
394	0.38
395	0.38
396	0.38
397	0.41
398	0.42
399	0.35
400	0.4
401	0.39
402	0.45
403	0.49
404	0.5
405	0.48
406	0.48
407	0.46
408	0.36
409	0.33
410	0.26
411	0.2
412	0.26
413	0.29
414	0.26
415	0.26
416	0.26
417	0.22
418	0.21
419	0.19
420	0.13
421	0.1
422	0.11
423	0.12
424	0.13
425	0.13
426	0.13
427	0.13
428	0.13
429	0.11
430	0.14
431	0.15
432	0.15
433	0.19
434	0.19
435	0.22
436	0.25
437	0.34
438	0.4
439	0.44
440	0.46
441	0.5
442	0.53
443	0.59
444	0.57
445	0.5
446	0.41
447	0.37
448	0.34
449	0.28
450	0.27
451	0.18
452	0.2
453	0.19
454	0.18
455	0.2
456	0.22
457	0.25
458	0.27
459	0.36
460	0.38
461	0.45
462	0.49
463	0.51
464	0.53
465	0.52
466	0.56
467	0.51
468	0.52
469	0.45
470	0.43
471	0.38
472	0.42
473	0.42
474	0.34
475	0.33
476	0.28
477	0.34
478	0.35
479	0.34
480	0.31
481	0.31
482	0.35
483	0.43

A0A166Y2Y6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer