Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G3J6V4

Protein Details
Accession G3J6V4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
342-368KEAEHKRAIKQKKKDKWKANNPEKAAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
346-368HKRAIKQKKKDKWKANNPEKAAA
426-456RRGGGAGGRRGGDSRGRGRGGSRGGRGGYAR
Subcellular Location(s) cyto 20, nucl 2, mito 2, pero 2, mito_nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038664  Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf  
IPR007504  H/ACA_rnp_Gar1/Naf1  
IPR040309  Naf1  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005732  C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000493  P:box H/ACA snoRNP assembly  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG cmt:CCM_00886  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04410  Gar1  
Amino Acid Sequences MSGFQIPGLGQAKPNETLPPLPPDLAAAAASAAGHEDIPDAPEQQTTQDTITPTSAPEPAPAPAGSDADAMVIDEQPPASPPSLTSALEAAIGGLASEPAQPVAAQEQFQQQAEPIEPPVVELQNDAGDNPEWEIDSSPYASSSESSSDSSSDDDSDNEGYELLGVEETARMLMEAEAGSEDEGSGPGGAKAGSTAQLRTKNEQAEPAVTRPAVTITEAMPLEELGAVEHMVDTTALVMGITPGEYQVLDTGSVLCTAARVVVGAVAETIGKVTRPMYTVRFNSADEMAELGVAVGTTLYYTPAHATFVFTQPLKGLKGSDASNLYDEEAGDEEMEFSDDEKEAEHKRAIKQKKKDKWKANNPEKAAAAAAAAARAKDHPLRQQQNVDAGLNYDEDDDGPYKPLARPSSLASGPGASQYDQPSSSRRGGGAGGRRGGDSRGRGRGGSRGGRGGYARGGGGGSSRDGYSMPPQGLPQQTHYAQPPPPPQAPQPAFGMQFPGWPPAPAPGAVPPPPPGWPGSAAAAAPPAAPAPPAVPAQQGGYNLDPAMIAAIMGQLQAQAANNAGGAAWGAQQQQPPPGPGW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.26
3 0.27
4 0.3
5 0.3
6 0.33
7 0.32
8 0.31
9 0.29
10 0.27
11 0.25
12 0.22
13 0.18
14 0.12
15 0.09
16 0.08
17 0.08
18 0.07
19 0.07
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.07
24 0.07
25 0.09
26 0.1
27 0.11
28 0.11
29 0.13
30 0.13
31 0.15
32 0.17
33 0.17
34 0.17
35 0.19
36 0.2
37 0.2
38 0.22
39 0.2
40 0.19
41 0.19
42 0.2
43 0.18
44 0.18
45 0.18
46 0.17
47 0.2
48 0.18
49 0.19
50 0.17
51 0.18
52 0.17
53 0.15
54 0.14
55 0.11
56 0.11
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.09
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.16
70 0.2
71 0.2
72 0.19
73 0.18
74 0.17
75 0.17
76 0.16
77 0.1
78 0.07
79 0.06
80 0.05
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.11
91 0.13
92 0.13
93 0.15
94 0.21
95 0.23
96 0.23
97 0.22
98 0.19
99 0.19
100 0.2
101 0.19
102 0.14
103 0.13
104 0.13
105 0.14
106 0.16
107 0.15
108 0.14
109 0.13
110 0.13
111 0.14
112 0.14
113 0.13
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.1
119 0.08
120 0.09
121 0.1
122 0.09
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.1
130 0.1
131 0.11
132 0.12
133 0.14
134 0.14
135 0.14
136 0.14
137 0.15
138 0.14
139 0.13
140 0.12
141 0.11
142 0.12
143 0.12
144 0.12
145 0.11
146 0.1
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.03
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.09
181 0.1
182 0.12
183 0.17
184 0.24
185 0.27
186 0.3
187 0.34
188 0.34
189 0.34
190 0.36
191 0.32
192 0.29
193 0.29
194 0.27
195 0.24
196 0.21
197 0.2
198 0.16
199 0.16
200 0.12
201 0.11
202 0.1
203 0.08
204 0.12
205 0.12
206 0.11
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.03
256 0.04
257 0.03
258 0.03
259 0.04
260 0.04
261 0.06
262 0.07
263 0.1
264 0.13
265 0.19
266 0.2
267 0.23
268 0.24
269 0.23
270 0.24
271 0.22
272 0.19
273 0.13
274 0.12
275 0.08
276 0.06
277 0.06
278 0.04
279 0.03
280 0.03
281 0.02
282 0.02
283 0.02
284 0.02
285 0.02
286 0.03
287 0.04
288 0.04
289 0.05
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.1
294 0.1
295 0.12
296 0.15
297 0.14
298 0.13
299 0.13
300 0.15
301 0.14
302 0.12
303 0.11
304 0.1
305 0.13
306 0.13
307 0.15
308 0.15
309 0.15
310 0.15
311 0.15
312 0.14
313 0.12
314 0.11
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.04
325 0.05
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.09
330 0.11
331 0.13
332 0.15
333 0.19
334 0.24
335 0.33
336 0.43
337 0.49
338 0.57
339 0.65
340 0.72
341 0.8
342 0.84
343 0.86
344 0.87
345 0.89
346 0.91
347 0.91
348 0.89
349 0.81
350 0.75
351 0.64
352 0.53
353 0.42
354 0.31
355 0.2
356 0.13
357 0.1
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.1
364 0.13
365 0.16
366 0.23
367 0.33
368 0.39
369 0.43
370 0.47
371 0.47
372 0.48
373 0.47
374 0.39
375 0.29
376 0.24
377 0.21
378 0.16
379 0.14
380 0.09
381 0.07
382 0.06
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.1
387 0.1
388 0.11
389 0.13
390 0.19
391 0.19
392 0.2
393 0.22
394 0.24
395 0.3
396 0.28
397 0.28
398 0.22
399 0.21
400 0.19
401 0.19
402 0.17
403 0.11
404 0.14
405 0.15
406 0.16
407 0.17
408 0.18
409 0.2
410 0.23
411 0.26
412 0.24
413 0.22
414 0.21
415 0.23
416 0.28
417 0.32
418 0.32
419 0.32
420 0.31
421 0.31
422 0.31
423 0.31
424 0.29
425 0.28
426 0.29
427 0.33
428 0.33
429 0.34
430 0.34
431 0.38
432 0.41
433 0.41
434 0.37
435 0.35
436 0.34
437 0.36
438 0.35
439 0.31
440 0.25
441 0.19
442 0.17
443 0.13
444 0.12
445 0.1
446 0.1
447 0.1
448 0.09
449 0.09
450 0.09
451 0.09
452 0.09
453 0.12
454 0.16
455 0.19
456 0.2
457 0.19
458 0.2
459 0.26
460 0.31
461 0.31
462 0.3
463 0.33
464 0.33
465 0.36
466 0.38
467 0.37
468 0.35
469 0.41
470 0.43
471 0.43
472 0.45
473 0.45
474 0.46
475 0.51
476 0.5
477 0.45
478 0.43
479 0.41
480 0.39
481 0.35
482 0.36
483 0.26
484 0.27
485 0.26
486 0.26
487 0.22
488 0.21
489 0.21
490 0.2
491 0.22
492 0.18
493 0.18
494 0.19
495 0.24
496 0.26
497 0.28
498 0.27
499 0.27
500 0.28
501 0.28
502 0.25
503 0.22
504 0.22
505 0.22
506 0.22
507 0.22
508 0.2
509 0.18
510 0.18
511 0.15
512 0.13
513 0.11
514 0.09
515 0.07
516 0.08
517 0.08
518 0.07
519 0.11
520 0.12
521 0.13
522 0.15
523 0.15
524 0.18
525 0.2
526 0.21
527 0.21
528 0.21
529 0.21
530 0.2
531 0.19
532 0.16
533 0.13
534 0.12
535 0.08
536 0.06
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.06
542 0.05
543 0.05
544 0.07
545 0.07
546 0.07
547 0.08
548 0.09
549 0.09
550 0.08
551 0.08
552 0.07
553 0.06
554 0.06
555 0.07
556 0.09
557 0.12
558 0.15
559 0.18
560 0.21
561 0.28
562 0.3