Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G3JJD8

Protein Details
Accession G3JJD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
279-307AGRAKATPTKSPRRRRRRAAKSAPTQDPEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
281-299RAKATPTKSPRRRRRRAAK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
KEGG cmt:CCM_05390  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MDTTPSHKRPPSPHLISNPFIKKKNLQWTLNAPGPIPRSSPPLDRESYPGLRTDYTAGPGSSAPEPRPTAPAVESGAAIIDDHLQHFSEHLAQFVRQRTGEDSILCKLSIDEYAAIYTANAGSEQGAHFVIHQHDHPIAGTHYDLRLQINETSSVSWAIMYGLPGDPNSMRLNRNATETRIHSIWNHLIETASPETGSLMIWDTGTYSILPRRSKYAPALDPDSGASDGETASPSPPTTQQSLLHAAFQARKIKIRLHGTKLPDPYVIYMRLTKTEDAAGRAKATPTKSPRRRRRRAAKSAPTQDPETSNSETNGYGDSDADLVPVTSSQLPQKDAAALSALEKELRELDDDEVRRTNAYKGATNSIGSIHQRKWYLSLERDLSGFAPTKSKSDRMTWEPKRSSAAETLDPGTSDSSSRLTYPFYVRGTEFERSVVTGRLGADILCDEGVRGFVPRMGWKPVVN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.74
3 0.7
4 0.71
5 0.72
6 0.68
7 0.65
8 0.63
9 0.6
10 0.62
11 0.7
12 0.7
13 0.63
14 0.63
15 0.66
16 0.68
17 0.66
18 0.58
19 0.47
20 0.43
21 0.43
22 0.38
23 0.34
24 0.28
25 0.29
26 0.32
27 0.38
28 0.38
29 0.41
30 0.42
31 0.41
32 0.44
33 0.45
34 0.46
35 0.41
36 0.39
37 0.35
38 0.33
39 0.32
40 0.31
41 0.26
42 0.24
43 0.26
44 0.22
45 0.21
46 0.2
47 0.22
48 0.22
49 0.23
50 0.21
51 0.25
52 0.28
53 0.28
54 0.31
55 0.29
56 0.28
57 0.26
58 0.27
59 0.23
60 0.21
61 0.19
62 0.16
63 0.15
64 0.12
65 0.11
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.1
72 0.1
73 0.1
74 0.11
75 0.15
76 0.15
77 0.16
78 0.17
79 0.18
80 0.23
81 0.28
82 0.3
83 0.24
84 0.26
85 0.27
86 0.3
87 0.31
88 0.28
89 0.26
90 0.25
91 0.26
92 0.24
93 0.2
94 0.16
95 0.15
96 0.13
97 0.12
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.08
104 0.08
105 0.06
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.11
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.14
121 0.14
122 0.15
123 0.14
124 0.13
125 0.12
126 0.11
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.12
131 0.13
132 0.12
133 0.13
134 0.14
135 0.15
136 0.15
137 0.16
138 0.15
139 0.15
140 0.14
141 0.13
142 0.11
143 0.09
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.09
153 0.08
154 0.1
155 0.13
156 0.15
157 0.16
158 0.18
159 0.23
160 0.22
161 0.28
162 0.28
163 0.27
164 0.28
165 0.29
166 0.3
167 0.26
168 0.26
169 0.2
170 0.23
171 0.24
172 0.21
173 0.19
174 0.16
175 0.16
176 0.15
177 0.18
178 0.15
179 0.11
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.08
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.09
196 0.14
197 0.16
198 0.16
199 0.21
200 0.23
201 0.26
202 0.29
203 0.33
204 0.31
205 0.33
206 0.36
207 0.32
208 0.3
209 0.27
210 0.24
211 0.17
212 0.13
213 0.1
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.06
223 0.09
224 0.11
225 0.13
226 0.15
227 0.16
228 0.19
229 0.24
230 0.23
231 0.21
232 0.2
233 0.19
234 0.19
235 0.21
236 0.24
237 0.2
238 0.23
239 0.25
240 0.28
241 0.33
242 0.4
243 0.43
244 0.43
245 0.48
246 0.5
247 0.54
248 0.52
249 0.47
250 0.38
251 0.33
252 0.28
253 0.25
254 0.21
255 0.16
256 0.17
257 0.16
258 0.18
259 0.19
260 0.18
261 0.16
262 0.18
263 0.18
264 0.19
265 0.21
266 0.18
267 0.18
268 0.19
269 0.19
270 0.19
271 0.21
272 0.25
273 0.31
274 0.41
275 0.5
276 0.6
277 0.7
278 0.77
279 0.85
280 0.88
281 0.91
282 0.91
283 0.93
284 0.93
285 0.92
286 0.91
287 0.9
288 0.85
289 0.77
290 0.68
291 0.58
292 0.5
293 0.43
294 0.37
295 0.31
296 0.26
297 0.23
298 0.22
299 0.2
300 0.18
301 0.16
302 0.12
303 0.1
304 0.09
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.06
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.06
314 0.06
315 0.08
316 0.11
317 0.14
318 0.16
319 0.17
320 0.17
321 0.18
322 0.17
323 0.17
324 0.14
325 0.12
326 0.11
327 0.12
328 0.12
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.12
336 0.14
337 0.2
338 0.22
339 0.24
340 0.24
341 0.24
342 0.23
343 0.23
344 0.23
345 0.21
346 0.22
347 0.24
348 0.25
349 0.3
350 0.31
351 0.3
352 0.27
353 0.24
354 0.25
355 0.25
356 0.27
357 0.24
358 0.28
359 0.3
360 0.3
361 0.33
362 0.36
363 0.39
364 0.38
365 0.43
366 0.41
367 0.39
368 0.39
369 0.35
370 0.29
371 0.25
372 0.23
373 0.17
374 0.2
375 0.2
376 0.25
377 0.28
378 0.33
379 0.33
380 0.37
381 0.44
382 0.46
383 0.57
384 0.61
385 0.67
386 0.66
387 0.65
388 0.63
389 0.58
390 0.54
391 0.49
392 0.44
393 0.37
394 0.37
395 0.36
396 0.31
397 0.3
398 0.26
399 0.21
400 0.17
401 0.15
402 0.13
403 0.14
404 0.14
405 0.15
406 0.16
407 0.17
408 0.2
409 0.25
410 0.3
411 0.29
412 0.31
413 0.31
414 0.34
415 0.36
416 0.35
417 0.31
418 0.26
419 0.25
420 0.24
421 0.25
422 0.23
423 0.19
424 0.18
425 0.18
426 0.18
427 0.17
428 0.15
429 0.14
430 0.13
431 0.13
432 0.1
433 0.1
434 0.08
435 0.08
436 0.09
437 0.08
438 0.1
439 0.09
440 0.11
441 0.15
442 0.21
443 0.25
444 0.31