Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A150VFB3

Protein Details
Accession A0A150VFB3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
334-366TEAKTSAKKESKEERKKRRKSRPNATSPNTPASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
340-356AKKESKEERKKRRKSRP
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MTAQTVALDETVASKPEIIEWWLQGAHNFPNPTWPDERLIHQYFHELPFFDWTSKNGAAMLQARSDLPSWNRVHDRKAFEDILRRQIGTEYVIVGEPQPIPGDEKGRTNGMWVIRKLDRIPQPRHSEANPYPETELLETYYFIGGNVYKAPSVADVVANRMLNVTTNLSRFFERAKRLPTFSPTTGHTYLPHKSKRETAAGSTAASPARSREGSLAPGAETQSLRSGSLLQDGHAASGDFPVMANSQDAKLLMQSLSMAIQFGDEYMDENPLLGEPGNFKFTSTSAAVKKRKADEEAAAAAKAREQKESTVSQMSSAKDTPQPEKVPSPPAIFTEAKTSAKKESKEERKKRRKSRPNATSPNTPASVSSILPPSGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.14
4 0.16
5 0.15
6 0.17
7 0.16
8 0.19
9 0.2
10 0.2
11 0.19
12 0.2
13 0.22
14 0.25
15 0.26
16 0.22
17 0.3
18 0.33
19 0.36
20 0.37
21 0.35
22 0.35
23 0.36
24 0.41
25 0.41
26 0.42
27 0.39
28 0.35
29 0.38
30 0.36
31 0.36
32 0.34
33 0.26
34 0.23
35 0.28
36 0.29
37 0.26
38 0.23
39 0.22
40 0.26
41 0.25
42 0.25
43 0.19
44 0.17
45 0.2
46 0.23
47 0.23
48 0.18
49 0.18
50 0.18
51 0.19
52 0.19
53 0.2
54 0.18
55 0.25
56 0.26
57 0.32
58 0.4
59 0.41
60 0.47
61 0.5
62 0.54
63 0.49
64 0.54
65 0.5
66 0.45
67 0.52
68 0.49
69 0.5
70 0.46
71 0.42
72 0.36
73 0.34
74 0.32
75 0.24
76 0.21
77 0.13
78 0.12
79 0.12
80 0.11
81 0.1
82 0.11
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.12
88 0.14
89 0.17
90 0.17
91 0.2
92 0.22
93 0.23
94 0.23
95 0.21
96 0.23
97 0.26
98 0.3
99 0.27
100 0.31
101 0.31
102 0.33
103 0.33
104 0.37
105 0.39
106 0.42
107 0.47
108 0.51
109 0.56
110 0.58
111 0.6
112 0.53
113 0.54
114 0.49
115 0.52
116 0.44
117 0.38
118 0.35
119 0.32
120 0.31
121 0.23
122 0.2
123 0.12
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.08
129 0.07
130 0.08
131 0.06
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.1
144 0.13
145 0.13
146 0.12
147 0.11
148 0.11
149 0.09
150 0.1
151 0.11
152 0.1
153 0.11
154 0.12
155 0.13
156 0.14
157 0.14
158 0.17
159 0.2
160 0.23
161 0.27
162 0.31
163 0.33
164 0.35
165 0.36
166 0.37
167 0.37
168 0.33
169 0.31
170 0.27
171 0.31
172 0.3
173 0.28
174 0.26
175 0.24
176 0.27
177 0.32
178 0.35
179 0.31
180 0.31
181 0.36
182 0.38
183 0.4
184 0.37
185 0.31
186 0.31
187 0.29
188 0.28
189 0.23
190 0.21
191 0.16
192 0.15
193 0.13
194 0.09
195 0.12
196 0.11
197 0.11
198 0.12
199 0.13
200 0.15
201 0.15
202 0.15
203 0.12
204 0.13
205 0.13
206 0.11
207 0.1
208 0.09
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.11
214 0.1
215 0.15
216 0.15
217 0.12
218 0.15
219 0.15
220 0.14
221 0.13
222 0.13
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.09
239 0.08
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.04
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.06
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.08
263 0.1
264 0.14
265 0.14
266 0.14
267 0.15
268 0.15
269 0.19
270 0.17
271 0.21
272 0.25
273 0.34
274 0.39
275 0.43
276 0.49
277 0.51
278 0.54
279 0.53
280 0.5
281 0.45
282 0.45
283 0.45
284 0.39
285 0.33
286 0.29
287 0.25
288 0.23
289 0.26
290 0.21
291 0.21
292 0.22
293 0.24
294 0.29
295 0.32
296 0.33
297 0.33
298 0.32
299 0.31
300 0.33
301 0.32
302 0.31
303 0.29
304 0.28
305 0.27
306 0.31
307 0.32
308 0.36
309 0.38
310 0.38
311 0.43
312 0.44
313 0.46
314 0.47
315 0.46
316 0.4
317 0.38
318 0.4
319 0.35
320 0.32
321 0.33
322 0.33
323 0.34
324 0.35
325 0.35
326 0.38
327 0.45
328 0.47
329 0.48
330 0.55
331 0.61
332 0.7
333 0.79
334 0.81
335 0.85
336 0.92
337 0.95
338 0.95
339 0.95
340 0.95
341 0.95
342 0.95
343 0.95
344 0.95
345 0.9
346 0.89
347 0.84
348 0.79
349 0.69
350 0.58
351 0.48
352 0.42
353 0.38
354 0.28
355 0.27
356 0.24