Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G3JKI9

Protein Details
Accession G3JKI9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
184-204ETPTASKRKGRGRKSNADAAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
83-179KRGRGRPPSGGVKKVYVPSGKPRGRPPTGKTPKPAYVPTGKPRGRPKGSGAKPAAAKATPKKTATSTGRPRGRPSSAAATPADEGGARRGRRPRASD
186-197PTASKRKGRGRK
Subcellular Location(s) cyto 10.5, mito 8, cyto_nucl 8, nucl 4.5, extr 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG cmt:CCM_05586  -  
Amino Acid Sequences MYLFIFAASQLFNLGLCDRYLSAIRLPGLFLFARKAIAHQHPSRYPFHPPKASFHIAHKRIIHTMAKTPEDANTTAAGDATAKRGRGRPPSGGVKKVYVPSGKPRGRPPTGKTPKPAYVPTGKPRGRPKGSGAKPAAAKATPKKTATSTGRPRGRPSSAAATPADEGGARRGRRPRASDAVGLETPTASKRKGRGRKSNADAAEEQLAQEDQDANAGEEDEEDEDAEAEEDVETA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.09
4 0.11
5 0.11
6 0.13
7 0.15
8 0.16
9 0.17
10 0.2
11 0.21
12 0.2
13 0.2
14 0.18
15 0.19
16 0.18
17 0.16
18 0.15
19 0.14
20 0.16
21 0.15
22 0.17
23 0.21
24 0.29
25 0.37
26 0.38
27 0.46
28 0.49
29 0.53
30 0.56
31 0.51
32 0.54
33 0.54
34 0.58
35 0.59
36 0.56
37 0.59
38 0.62
39 0.64
40 0.56
41 0.57
42 0.59
43 0.52
44 0.56
45 0.52
46 0.47
47 0.44
48 0.46
49 0.4
50 0.32
51 0.36
52 0.36
53 0.34
54 0.33
55 0.31
56 0.29
57 0.28
58 0.26
59 0.2
60 0.16
61 0.15
62 0.14
63 0.13
64 0.1
65 0.08
66 0.08
67 0.12
68 0.13
69 0.13
70 0.15
71 0.19
72 0.25
73 0.33
74 0.37
75 0.36
76 0.4
77 0.5
78 0.53
79 0.53
80 0.49
81 0.42
82 0.4
83 0.38
84 0.35
85 0.27
86 0.25
87 0.28
88 0.37
89 0.39
90 0.4
91 0.45
92 0.49
93 0.53
94 0.56
95 0.53
96 0.54
97 0.59
98 0.6
99 0.58
100 0.55
101 0.54
102 0.52
103 0.48
104 0.4
105 0.38
106 0.4
107 0.4
108 0.45
109 0.42
110 0.44
111 0.51
112 0.57
113 0.53
114 0.51
115 0.52
116 0.52
117 0.54
118 0.57
119 0.51
120 0.45
121 0.43
122 0.41
123 0.37
124 0.27
125 0.28
126 0.26
127 0.31
128 0.32
129 0.32
130 0.33
131 0.32
132 0.4
133 0.43
134 0.46
135 0.49
136 0.54
137 0.6
138 0.6
139 0.63
140 0.6
141 0.57
142 0.49
143 0.44
144 0.42
145 0.36
146 0.37
147 0.32
148 0.28
149 0.25
150 0.23
151 0.18
152 0.11
153 0.1
154 0.13
155 0.19
156 0.18
157 0.24
158 0.31
159 0.38
160 0.45
161 0.5
162 0.52
163 0.54
164 0.57
165 0.55
166 0.51
167 0.49
168 0.42
169 0.37
170 0.3
171 0.22
172 0.19
173 0.18
174 0.17
175 0.13
176 0.18
177 0.25
178 0.35
179 0.45
180 0.55
181 0.63
182 0.71
183 0.79
184 0.81
185 0.83
186 0.74
187 0.7
188 0.61
189 0.52
190 0.46
191 0.36
192 0.29
193 0.22
194 0.19
195 0.14
196 0.14
197 0.12
198 0.08
199 0.1
200 0.11
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.1
205 0.09
206 0.11
207 0.09
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.06