FuNGI

G3J402

Protein Details

Accession

G3J402

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-34	MSTPPTQNMNGKPKRKPNPLRPMRPRPRQVPSAA	Hydrophilic
181-206	APVAKEVVPKKPKKQKEERTVFNRGP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
12-29	KPKRKPNPLRPMRPRPRQ
189-198	PKKPKKQKEE
475-560	EKKDGEKKDEKDKDDKDEKNKIKAASAQGKHKPADKKSKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKMKKTAVTAPGSRAGTPIPGAVRKKK
676-676	R

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 9, cyto_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	cmt:CCM_00431 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSTPPTQNMNGKPKRKPNPLRPMRPRPRQVPSAAANRPDQKSSSASAAAGPSRSNAANGGKQSLDELRKQYGGWSEPPPPYKYTDIPIMTTKKALLDGIRYHLMKLSSTKADGGPIDPTDQEEFARPVTLHRRDARLPPPGRTVKEEAPQRLPVDEQERERLVQIKADKEVQRAINQAKIAPVAKEVVPKKPKKQKEERTVFNRGPRTVAAKKESDLRYEEALPWHLEDVDGKNVWVGSYVAALSESNVAFVIDQSVFRMIPLEKWYRFTSKPQFQAFTIDQAEEYMNRKIDVGRWVMKDEEKKSGQEDLQATRRMLYGSGMIKTESDTFKAASRAEKMEHDEIDMSGDEFQDDDEAPMFERNDDDDTKDSKDRIRREQLGANLFGDGDEGQVDQELQQQLKEELERQKFGKATRKALIKRDREDIYESDKSEDNPWSSSVRIPHQLLSYYQYTDVMQSDEESSDEENEEKKEDEKKDGEKKDEKDKDDKDEKNKIKAASAQGKHKPADKKSKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKMKKTAVTAPGSRAGTPIPGAVRKKKLGAGSTSDGEATAGEMSDGAGPRKKIKLVASAKGTPSASRAGSPVPAGASPPPSSAGIEPWEILEKIPDGGISIVELIKPFQSRVGTKPGQMAKGDWIKLVTRLCEYGPEKLLRKRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.82
2	0.86
3	0.88
4	0.88
5	0.89
6	0.92
7	0.94
8	0.94
9	0.95
10	0.94
11	0.94
12	0.93
13	0.9
14	0.88
15	0.84
16	0.78
17	0.75
18	0.72
19	0.71
20	0.67
21	0.62
22	0.6
23	0.6
24	0.59
25	0.53
26	0.48
27	0.42
28	0.4
29	0.38
30	0.36
31	0.3
32	0.27
33	0.26
34	0.28
35	0.27
36	0.24
37	0.22
38	0.18
39	0.2
40	0.2
41	0.18
42	0.19
43	0.22
44	0.27
45	0.28
46	0.31
47	0.27
48	0.27
49	0.29
50	0.32
51	0.31
52	0.31
53	0.33
54	0.33
55	0.34
56	0.34
57	0.35
58	0.34
59	0.33
60	0.33
61	0.34
62	0.37
63	0.42
64	0.47
65	0.46
66	0.42
67	0.43
68	0.43
69	0.41
70	0.38
71	0.41
72	0.38
73	0.38
74	0.43
75	0.43
76	0.39
77	0.37
78	0.34
79	0.27
80	0.26
81	0.25
82	0.2
83	0.22
84	0.24
85	0.27
86	0.33
87	0.31
88	0.3
89	0.32
90	0.3
91	0.26
92	0.26
93	0.27
94	0.24
95	0.25
96	0.27
97	0.24
98	0.26
99	0.25
100	0.23
101	0.21
102	0.18
103	0.19
104	0.17
105	0.19
106	0.18
107	0.18
108	0.17
109	0.16
110	0.17
111	0.15
112	0.18
113	0.15
114	0.19
115	0.28
116	0.33
117	0.38
118	0.41
119	0.47
120	0.48
121	0.56
122	0.58
123	0.58
124	0.55
125	0.52
126	0.57
127	0.58
128	0.57
129	0.55
130	0.54
131	0.49
132	0.54
133	0.56
134	0.52
135	0.51
136	0.52
137	0.47
138	0.42
139	0.37
140	0.35
141	0.34
142	0.33
143	0.31
144	0.32
145	0.33
146	0.33
147	0.33
148	0.33
149	0.27
150	0.28
151	0.29
152	0.27
153	0.28
154	0.35
155	0.36
156	0.33
157	0.39
158	0.36
159	0.35
160	0.37
161	0.37
162	0.33
163	0.31
164	0.3
165	0.25
166	0.25
167	0.23
168	0.18
169	0.17
170	0.15
171	0.16
172	0.23
173	0.24
174	0.3
175	0.39
176	0.44
177	0.53
178	0.61
179	0.68
180	0.71
181	0.8
182	0.81
183	0.83
184	0.87
185	0.86
186	0.84
187	0.83
188	0.77
189	0.74
190	0.69
191	0.58
192	0.51
193	0.43
194	0.43
195	0.4
196	0.42
197	0.39
198	0.35
199	0.35
200	0.41
201	0.41
202	0.36
203	0.34
204	0.31
205	0.29
206	0.29
207	0.29
208	0.22
209	0.23
210	0.2
211	0.18
212	0.16
213	0.13
214	0.11
215	0.12
216	0.12
217	0.14
218	0.13
219	0.12
220	0.12
221	0.12
222	0.12
223	0.11
224	0.09
225	0.05
226	0.06
227	0.06
228	0.05
229	0.06
230	0.06
231	0.06
232	0.08
233	0.07
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.06
238	0.07
239	0.08
240	0.06
241	0.06
242	0.07
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.1
247	0.08
248	0.11
249	0.16
250	0.22
251	0.21
252	0.25
253	0.28
254	0.31
255	0.32
256	0.38
257	0.43
258	0.44
259	0.51
260	0.5
261	0.5
262	0.45
263	0.49
264	0.42
265	0.36
266	0.29
267	0.22
268	0.18
269	0.17
270	0.17
271	0.13
272	0.14
273	0.12
274	0.12
275	0.12
276	0.12
277	0.12
278	0.15
279	0.18
280	0.2
281	0.23
282	0.23
283	0.24
284	0.25
285	0.28
286	0.31
287	0.29
288	0.31
289	0.28
290	0.27
291	0.28
292	0.3
293	0.27
294	0.26
295	0.26
296	0.24
297	0.27
298	0.29
299	0.28
300	0.25
301	0.25
302	0.2
303	0.18
304	0.14
305	0.13
306	0.12
307	0.13
308	0.12
309	0.12
310	0.12
311	0.13
312	0.15
313	0.11
314	0.11
315	0.11
316	0.11
317	0.13
318	0.15
319	0.15
320	0.14
321	0.16
322	0.16
323	0.17
324	0.18
325	0.2
326	0.2
327	0.2
328	0.18
329	0.16
330	0.14
331	0.14
332	0.12
333	0.08
334	0.06
335	0.06
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.04
340	0.05
341	0.04
342	0.04
343	0.05
344	0.05
345	0.07
346	0.07
347	0.06
348	0.07
349	0.08
350	0.1
351	0.11
352	0.12
353	0.13
354	0.15
355	0.18
356	0.2
357	0.2
358	0.21
359	0.28
360	0.31
361	0.37
362	0.44
363	0.45
364	0.47
365	0.5
366	0.51
367	0.48
368	0.43
369	0.35
370	0.27
371	0.22
372	0.18
373	0.14
374	0.09
375	0.05
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.08
383	0.1
384	0.1
385	0.1
386	0.11
387	0.12
388	0.13
389	0.13
390	0.14
391	0.21
392	0.24
393	0.27
394	0.26
395	0.3
396	0.31
397	0.35
398	0.4
399	0.36
400	0.39
401	0.42
402	0.5
403	0.51
404	0.58
405	0.63
406	0.61
407	0.59
408	0.6
409	0.56
410	0.49
411	0.49
412	0.42
413	0.4
414	0.36
415	0.33
416	0.29
417	0.28
418	0.27
419	0.26
420	0.26
421	0.2
422	0.18
423	0.19
424	0.18
425	0.18
426	0.19
427	0.2
428	0.21
429	0.25
430	0.25
431	0.26
432	0.26
433	0.27
434	0.25
435	0.25
436	0.23
437	0.19
438	0.18
439	0.16
440	0.15
441	0.15
442	0.14
443	0.11
444	0.09
445	0.09
446	0.1
447	0.09
448	0.09
449	0.09
450	0.09
451	0.09
452	0.09
453	0.09
454	0.1
455	0.11
456	0.12
457	0.12
458	0.14
459	0.21
460	0.23
461	0.28
462	0.32
463	0.4
464	0.48
465	0.53
466	0.58
467	0.58
468	0.6
469	0.65
470	0.67
471	0.64
472	0.63
473	0.62
474	0.63
475	0.65
476	0.67
477	0.64
478	0.67
479	0.68
480	0.66
481	0.67
482	0.59
483	0.53
484	0.51
485	0.52
486	0.51
487	0.51
488	0.52
489	0.54
490	0.58
491	0.56
492	0.58
493	0.57
494	0.56
495	0.63
496	0.59
497	0.62
498	0.68
499	0.77
500	0.77
501	0.77
502	0.76
503	0.72
504	0.75
505	0.7
506	0.63
507	0.54
508	0.5
509	0.44
510	0.37
511	0.3
512	0.23
513	0.24
514	0.22
515	0.21
516	0.23
517	0.22
518	0.27
519	0.37
520	0.41
521	0.39
522	0.45
523	0.54
524	0.59
525	0.64
526	0.68
527	0.69
528	0.69
529	0.68
530	0.63
531	0.61
532	0.52
533	0.45
534	0.36
535	0.26
536	0.22
537	0.2
538	0.19
539	0.16
540	0.21
541	0.27
542	0.34
543	0.41
544	0.42
545	0.45
546	0.46
547	0.48
548	0.47
549	0.46
550	0.45
551	0.42
552	0.41
553	0.38
554	0.34
555	0.28
556	0.23
557	0.18
558	0.12
559	0.07
560	0.06
561	0.05
562	0.05
563	0.05
564	0.08
565	0.1
566	0.12
567	0.15
568	0.17
569	0.22
570	0.27
571	0.28
572	0.31
573	0.34
574	0.42
575	0.46
576	0.52
577	0.54
578	0.55
579	0.54
580	0.54
581	0.5
582	0.4
583	0.35
584	0.32
585	0.26
586	0.22
587	0.22
588	0.19
589	0.2
590	0.2
591	0.19
592	0.16
593	0.16
594	0.16
595	0.17
596	0.2
597	0.19
598	0.19
599	0.2
600	0.2
601	0.21
602	0.2
603	0.21
604	0.2
605	0.19
606	0.18
607	0.18
608	0.2
609	0.19
610	0.18
611	0.17
612	0.14
613	0.14
614	0.14
615	0.12
616	0.1
617	0.1
618	0.1
619	0.08
620	0.09
621	0.09
622	0.09
623	0.1
624	0.1
625	0.13
626	0.14
627	0.14
628	0.17
629	0.23
630	0.26
631	0.3
632	0.39
633	0.39
634	0.4
635	0.48
636	0.5
637	0.48
638	0.46
639	0.44
640	0.43
641	0.47
642	0.46
643	0.39
644	0.35
645	0.32
646	0.36
647	0.38
648	0.32
649	0.27
650	0.28
651	0.27
652	0.34
653	0.35
654	0.37
655	0.4
656	0.43
657	0.47

G3J402

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer