Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G3JQM3

Protein Details
Accession G3JQM3    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
372-397LGNYGGKPGKRTHKKAKAQTGLEQLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
296-301RKKKRK
378-388KPGKRTHKKAK
405-412PARIKGRR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG cmt:CCM_07779  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPKGKWIDKKSAQHFTLVHRPQNDPLIYDENAPSMVLNPTEGSKNGGQGKNLGDLASELGSDAEHIRANEGEAANYGVYYDDSEYDYMQHLRDLNTGVGDVVFVEAKTTGNAGKGKQKQSLEDALKQMDLEHKAGDVLDPDMLPSKDLPRMSYEQQQDVPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDDAFIDDEDDDIFDQLAKDGYEVDEYEFEDNQFDDDDGWESDDTAKPNKEYKDDEVPQLVAVQEQPDQGPSQDWLADFQKFKKEQKTGGPLKAVGAPAQSELQSNWTTTTNGGRKKKRKGALTVASGFSMTSSSLVRTEQLSFLDARFDKLEEKYNEEFDDTASVSAISTASSVTGPVRGDFDNIMDEFLGNYGGKPGKRTHKKAKAQTGLEQLDEIRRELGPARIKGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.62
3 0.63
4 0.6
5 0.57
6 0.51
7 0.53
8 0.51
9 0.57
10 0.5
11 0.41
12 0.38
13 0.38
14 0.34
15 0.34
16 0.31
17 0.23
18 0.23
19 0.21
20 0.16
21 0.13
22 0.14
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.13
27 0.15
28 0.16
29 0.19
30 0.18
31 0.24
32 0.32
33 0.34
34 0.33
35 0.35
36 0.37
37 0.36
38 0.35
39 0.29
40 0.2
41 0.18
42 0.19
43 0.15
44 0.12
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.1
52 0.1
53 0.11
54 0.12
55 0.13
56 0.17
57 0.16
58 0.15
59 0.14
60 0.15
61 0.13
62 0.13
63 0.12
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.13
74 0.14
75 0.13
76 0.14
77 0.15
78 0.15
79 0.17
80 0.18
81 0.16
82 0.15
83 0.15
84 0.13
85 0.11
86 0.09
87 0.07
88 0.06
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.11
98 0.14
99 0.16
100 0.25
101 0.32
102 0.37
103 0.42
104 0.43
105 0.42
106 0.45
107 0.52
108 0.47
109 0.44
110 0.42
111 0.37
112 0.35
113 0.32
114 0.27
115 0.23
116 0.21
117 0.17
118 0.15
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.13
123 0.09
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.07
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.12
133 0.16
134 0.16
135 0.17
136 0.19
137 0.23
138 0.26
139 0.32
140 0.33
141 0.32
142 0.34
143 0.34
144 0.29
145 0.26
146 0.23
147 0.15
148 0.12
149 0.1
150 0.08
151 0.07
152 0.06
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.03
176 0.03
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.1
212 0.11
213 0.13
214 0.14
215 0.15
216 0.2
217 0.22
218 0.24
219 0.26
220 0.29
221 0.35
222 0.36
223 0.37
224 0.33
225 0.31
226 0.28
227 0.25
228 0.2
229 0.1
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.11
244 0.13
245 0.16
246 0.17
247 0.19
248 0.26
249 0.29
250 0.34
251 0.39
252 0.41
253 0.42
254 0.5
255 0.58
256 0.56
257 0.57
258 0.55
259 0.46
260 0.44
261 0.42
262 0.34
263 0.24
264 0.18
265 0.14
266 0.13
267 0.14
268 0.12
269 0.1
270 0.1
271 0.13
272 0.13
273 0.13
274 0.13
275 0.14
276 0.14
277 0.14
278 0.23
279 0.25
280 0.33
281 0.42
282 0.51
283 0.59
284 0.68
285 0.76
286 0.75
287 0.76
288 0.76
289 0.78
290 0.76
291 0.74
292 0.68
293 0.59
294 0.52
295 0.44
296 0.35
297 0.25
298 0.17
299 0.1
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.09
304 0.09
305 0.1
306 0.11
307 0.13
308 0.14
309 0.14
310 0.15
311 0.15
312 0.14
313 0.21
314 0.19
315 0.2
316 0.19
317 0.19
318 0.21
319 0.23
320 0.32
321 0.27
322 0.33
323 0.34
324 0.35
325 0.35
326 0.33
327 0.3
328 0.22
329 0.23
330 0.16
331 0.14
332 0.11
333 0.1
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.1
345 0.11
346 0.11
347 0.14
348 0.14
349 0.16
350 0.16
351 0.17
352 0.17
353 0.17
354 0.17
355 0.14
356 0.13
357 0.11
358 0.11
359 0.12
360 0.08
361 0.08
362 0.13
363 0.17
364 0.18
365 0.22
366 0.29
367 0.39
368 0.49
369 0.59
370 0.65
371 0.71
372 0.81
373 0.88
374 0.91
375 0.89
376 0.84
377 0.82
378 0.81
379 0.73
380 0.63
381 0.53
382 0.44
383 0.4
384 0.37
385 0.3
386 0.22
387 0.19
388 0.2
389 0.22
390 0.28
391 0.31
392 0.36