Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A137P3Z8

Protein Details
Accession A0A137P3Z8    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-33SSSNNNNKHRSQKGNNSSNASHydrophilic
223-246EDGQKSKSGKKSKKEKAAKQAQTTHydrophilic
253-273TKLSKAAKLKKKKAKASEEKGBasic
462-486PGTETKFKSKAKPKISKPKGPSFGSHydrophilic
526-547TSGEPRAPKPPRNREANPKFGGHydrophilic
552-579SEEGGDAKSKPKKYRPKPNKPAAGTGPAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
202-241KAKKMEKASKNKFKSSAALKGEDGQKSKSGKKSKKEKAAK
254-279KLSKAAKLKKKKAKASEEKGADGKSP
468-481FKSKAKPKISKPKG
530-573PRAPKPPRNREANPKFGGKPGQSEEGGDAKSKPKKYRPKPNKPA
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MSTTVEVNTPSISSSNNNNKHRSQKGNNSSNASNAPLNPKLKLTIRQLPPSLPEEVFKSSIKPYLTDEKDIVDQKFIPGKVSKKVLTPSKPSRAVIKFETIQKLINFKNLFKNHVYVDQQGVEFKIQIIFSPIQQNPKENNIQDAKLNTLESDPEFIKFCSKLHSEGEKEKSNNSNEILLGAQQQSTNEANKKSTPLLEYLKAKKMEKASKNKFKSSAALKGEDGQKSKSGKKSKKEKAAKQAQTTDEASSATKLSKAAKLKKKKAKASEEKGADGKSPKEFTIAKKSSDSTGSPQVEKIVLAKRQDSSTSVQKESSTNSPTSSLSGAKLAQRSDKSSYKSSEAKTSILESKSALQAGEGSGTSAGSPIEKPSSRRTRKGKTFSTEQAAGLKPAGEASTFPKKGKKSINKSGANLENQQTTEANIASSPRQTNNGQESSKKSDLGTTGLVNNSGSEANSDRPGTETKFKSKAKPKISKPKGPSFGSKFGDAENSTGFKSPTESNESGAVSTKPAFKKLSYKPTDETSGEPRAPKPPRNREANPKFGGKPGQSEEGGDAKSKPKKYRPKPNKPAAGTGPASGTQPNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.34
3 0.43
4 0.5
5 0.55
6 0.61
7 0.69
8 0.75
9 0.75
10 0.74
11 0.76
12 0.8
13 0.83
14 0.82
15 0.79
16 0.71
17 0.65
18 0.58
19 0.5
20 0.42
21 0.36
22 0.37
23 0.37
24 0.39
25 0.35
26 0.35
27 0.37
28 0.4
29 0.44
30 0.46
31 0.48
32 0.53
33 0.6
34 0.6
35 0.57
36 0.56
37 0.51
38 0.48
39 0.38
40 0.33
41 0.29
42 0.3
43 0.31
44 0.27
45 0.27
46 0.25
47 0.29
48 0.29
49 0.26
50 0.28
51 0.35
52 0.38
53 0.39
54 0.37
55 0.35
56 0.4
57 0.43
58 0.38
59 0.31
60 0.28
61 0.29
62 0.34
63 0.32
64 0.3
65 0.31
66 0.34
67 0.38
68 0.44
69 0.42
70 0.41
71 0.48
72 0.54
73 0.55
74 0.61
75 0.63
76 0.66
77 0.7
78 0.66
79 0.67
80 0.62
81 0.61
82 0.55
83 0.52
84 0.47
85 0.48
86 0.52
87 0.44
88 0.43
89 0.4
90 0.42
91 0.36
92 0.4
93 0.36
94 0.33
95 0.42
96 0.41
97 0.44
98 0.41
99 0.43
100 0.37
101 0.41
102 0.41
103 0.33
104 0.34
105 0.31
106 0.29
107 0.27
108 0.26
109 0.19
110 0.17
111 0.15
112 0.14
113 0.11
114 0.11
115 0.15
116 0.14
117 0.16
118 0.24
119 0.26
120 0.31
121 0.33
122 0.38
123 0.36
124 0.42
125 0.47
126 0.39
127 0.44
128 0.4
129 0.4
130 0.38
131 0.36
132 0.32
133 0.27
134 0.26
135 0.19
136 0.16
137 0.16
138 0.14
139 0.16
140 0.13
141 0.13
142 0.14
143 0.14
144 0.17
145 0.16
146 0.16
147 0.19
148 0.2
149 0.23
150 0.27
151 0.34
152 0.35
153 0.42
154 0.48
155 0.48
156 0.48
157 0.49
158 0.49
159 0.45
160 0.44
161 0.37
162 0.33
163 0.26
164 0.26
165 0.21
166 0.16
167 0.15
168 0.12
169 0.12
170 0.1
171 0.1
172 0.13
173 0.15
174 0.18
175 0.2
176 0.21
177 0.23
178 0.24
179 0.26
180 0.25
181 0.25
182 0.23
183 0.23
184 0.26
185 0.29
186 0.34
187 0.36
188 0.41
189 0.43
190 0.42
191 0.41
192 0.45
193 0.5
194 0.52
195 0.58
196 0.62
197 0.69
198 0.74
199 0.74
200 0.69
201 0.61
202 0.59
203 0.53
204 0.52
205 0.44
206 0.41
207 0.37
208 0.38
209 0.41
210 0.38
211 0.34
212 0.27
213 0.28
214 0.3
215 0.35
216 0.38
217 0.43
218 0.48
219 0.56
220 0.65
221 0.69
222 0.76
223 0.81
224 0.81
225 0.82
226 0.85
227 0.83
228 0.78
229 0.75
230 0.65
231 0.59
232 0.52
233 0.42
234 0.31
235 0.25
236 0.19
237 0.14
238 0.13
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.11
243 0.16
244 0.23
245 0.32
246 0.41
247 0.51
248 0.6
249 0.68
250 0.75
251 0.77
252 0.79
253 0.81
254 0.82
255 0.79
256 0.77
257 0.7
258 0.63
259 0.57
260 0.48
261 0.39
262 0.31
263 0.26
264 0.2
265 0.19
266 0.17
267 0.19
268 0.21
269 0.22
270 0.31
271 0.32
272 0.3
273 0.31
274 0.31
275 0.29
276 0.29
277 0.27
278 0.19
279 0.25
280 0.25
281 0.24
282 0.23
283 0.22
284 0.2
285 0.19
286 0.18
287 0.15
288 0.17
289 0.18
290 0.19
291 0.19
292 0.2
293 0.21
294 0.2
295 0.19
296 0.24
297 0.27
298 0.26
299 0.26
300 0.26
301 0.26
302 0.26
303 0.27
304 0.22
305 0.19
306 0.19
307 0.2
308 0.19
309 0.19
310 0.18
311 0.14
312 0.11
313 0.12
314 0.13
315 0.14
316 0.16
317 0.16
318 0.19
319 0.2
320 0.23
321 0.27
322 0.3
323 0.32
324 0.34
325 0.36
326 0.36
327 0.4
328 0.38
329 0.4
330 0.36
331 0.33
332 0.3
333 0.3
334 0.31
335 0.26
336 0.24
337 0.18
338 0.18
339 0.18
340 0.18
341 0.15
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.09
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.07
356 0.12
357 0.13
358 0.17
359 0.26
360 0.38
361 0.43
362 0.52
363 0.59
364 0.65
365 0.73
366 0.8
367 0.78
368 0.73
369 0.73
370 0.69
371 0.67
372 0.58
373 0.48
374 0.44
375 0.36
376 0.31
377 0.24
378 0.19
379 0.13
380 0.11
381 0.11
382 0.06
383 0.07
384 0.12
385 0.21
386 0.23
387 0.24
388 0.3
389 0.32
390 0.39
391 0.49
392 0.54
393 0.54
394 0.62
395 0.71
396 0.71
397 0.72
398 0.72
399 0.67
400 0.6
401 0.54
402 0.46
403 0.39
404 0.33
405 0.32
406 0.25
407 0.2
408 0.18
409 0.14
410 0.12
411 0.09
412 0.11
413 0.11
414 0.15
415 0.16
416 0.16
417 0.2
418 0.21
419 0.27
420 0.33
421 0.38
422 0.37
423 0.38
424 0.43
425 0.47
426 0.48
427 0.42
428 0.35
429 0.32
430 0.31
431 0.3
432 0.26
433 0.19
434 0.2
435 0.19
436 0.2
437 0.16
438 0.15
439 0.13
440 0.11
441 0.1
442 0.09
443 0.11
444 0.12
445 0.15
446 0.16
447 0.15
448 0.17
449 0.2
450 0.23
451 0.29
452 0.32
453 0.36
454 0.45
455 0.49
456 0.56
457 0.63
458 0.69
459 0.71
460 0.76
461 0.79
462 0.82
463 0.88
464 0.87
465 0.85
466 0.86
467 0.84
468 0.78
469 0.77
470 0.73
471 0.72
472 0.65
473 0.6
474 0.5
475 0.42
476 0.44
477 0.35
478 0.29
479 0.23
480 0.22
481 0.2
482 0.21
483 0.2
484 0.15
485 0.18
486 0.19
487 0.21
488 0.28
489 0.28
490 0.28
491 0.31
492 0.32
493 0.29
494 0.28
495 0.24
496 0.17
497 0.19
498 0.25
499 0.23
500 0.28
501 0.3
502 0.3
503 0.4
504 0.47
505 0.56
506 0.54
507 0.58
508 0.56
509 0.59
510 0.62
511 0.54
512 0.49
513 0.44
514 0.46
515 0.44
516 0.43
517 0.4
518 0.44
519 0.5
520 0.54
521 0.58
522 0.62
523 0.67
524 0.74
525 0.8
526 0.81
527 0.83
528 0.85
529 0.79
530 0.74
531 0.67
532 0.63
533 0.64
534 0.55
535 0.52
536 0.47
537 0.48
538 0.41
539 0.41
540 0.39
541 0.36
542 0.34
543 0.29
544 0.26
545 0.29
546 0.37
547 0.43
548 0.49
549 0.54
550 0.64
551 0.73
552 0.83
553 0.86
554 0.89
555 0.93
556 0.94
557 0.95
558 0.88
559 0.87
560 0.81
561 0.78
562 0.69
563 0.59
564 0.51
565 0.42
566 0.38