FuNGI

A0A137PA58

Protein Details

Accession

A0A137PA58

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
140-161	GGGVRNKKMLFKKRTKQIYEQD	Hydrophilic
339-369	DDQPKKQSKVSKSNKKMKKIAKKASHSQNSE	Hydrophilic
463-486	STGPKSPKSGDKNKLKQRPSDPRN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
343-361	KKQSKVSKSNKKMKKIAKK

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSQNNKNEDAKRKAQAKYGVPPPRQKDSYGGIFNLNPRSLPVSVHGVSKRFEPDPNARSLVSARPSHLPKGRFKRLPLYFSGQSRPHHYLRFSRNDVELKKLVPPVTLERKNVTDVAEDDDDSIYKTHNAPNTANIAPIGGGVRNKKMLFKKRTKQIYEQDPEARKTRERESRPWVLSDKDDVNHFESNFLGTEKCKYVVLEPHKDGFSVTPLQFHYRFDKRLPFKPMTAEEIDEFSKQKKNVEMDRWFLRQKDKKKSEQDKLLEEEGGAYKNPGMKLTDSASAKKNMVKGDIDEMDYDEDFQDDDEAIPELGADNEENKETERSIKRSQLQIDDDDEDDQPKKQSKVSKSNKKMKKIAKKASHSQNSEDDLSSEEENIPFLSSDEEEEENEDQEEAAGKKWASKAEELSKQAYNARTNKQPSANGKVGSPGSNHSGPNSPNGPSSRPSSPQSFNQQQTGSPSTGPKSPKSGDKNKLKQRPSDPRNPYAPHRPSPLAQVTHINEVSSHSQSSRHGQSSQSGERAQQASRSGANVASSQQAQAAPGEMPPYAPTGLNKAEVINFLRYFSHDNPCTVKLLFRAFKPHVKNQPKMTQEQISQRTGIILEILNEICKYGENKSFYLKDEFRN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.69
3	0.67
4	0.67
5	0.7
6	0.71
7	0.7
8	0.75
9	0.74
10	0.75
11	0.7
12	0.63
13	0.59
14	0.56
15	0.58
16	0.53
17	0.48
18	0.42
19	0.42
20	0.45
21	0.45
22	0.39
23	0.3
24	0.27
25	0.3
26	0.27
27	0.26
28	0.24
29	0.26
30	0.26
31	0.33
32	0.35
33	0.33
34	0.33
35	0.36
36	0.37
37	0.32
38	0.35
39	0.35
40	0.41
41	0.43
42	0.48
43	0.47
44	0.41
45	0.41
46	0.4
47	0.4
48	0.37
49	0.35
50	0.31
51	0.37
52	0.4
53	0.46
54	0.51
55	0.49
56	0.53
57	0.61
58	0.69
59	0.67
60	0.68
61	0.7
62	0.71
63	0.7
64	0.65
65	0.63
66	0.58
67	0.56
68	0.59
69	0.54
70	0.5
71	0.53
72	0.53
73	0.5
74	0.49
75	0.5
76	0.51
77	0.55
78	0.61
79	0.59
80	0.57
81	0.58
82	0.61
83	0.58
84	0.56
85	0.49
86	0.41
87	0.4
88	0.41
89	0.36
90	0.29
91	0.31
92	0.33
93	0.41
94	0.45
95	0.43
96	0.42
97	0.44
98	0.45
99	0.43
100	0.36
101	0.28
102	0.23
103	0.26
104	0.23
105	0.21
106	0.2
107	0.18
108	0.17
109	0.15
110	0.14
111	0.09
112	0.1
113	0.12
114	0.16
115	0.2
116	0.24
117	0.24
118	0.27
119	0.32
120	0.3
121	0.28
122	0.24
123	0.2
124	0.16
125	0.15
126	0.12
127	0.09
128	0.12
129	0.14
130	0.17
131	0.22
132	0.23
133	0.29
134	0.38
135	0.46
136	0.53
137	0.61
138	0.68
139	0.73
140	0.82
141	0.81
142	0.81
143	0.79
144	0.8
145	0.74
146	0.71
147	0.7
148	0.64
149	0.61
150	0.58
151	0.52
152	0.45
153	0.45
154	0.48
155	0.5
156	0.52
157	0.56
158	0.59
159	0.65
160	0.63
161	0.62
162	0.56
163	0.48
164	0.44
165	0.4
166	0.36
167	0.27
168	0.28
169	0.26
170	0.27
171	0.27
172	0.25
173	0.21
174	0.18
175	0.17
176	0.16
177	0.14
178	0.11
179	0.09
180	0.13
181	0.14
182	0.14
183	0.14
184	0.14
185	0.17
186	0.25
187	0.32
188	0.36
189	0.37
190	0.39
191	0.39
192	0.38
193	0.35
194	0.27
195	0.23
196	0.21
197	0.18
198	0.18
199	0.19
200	0.24
201	0.25
202	0.26
203	0.3
204	0.29
205	0.32
206	0.32
207	0.41
208	0.41
209	0.48
210	0.53
211	0.49
212	0.45
213	0.48
214	0.46
215	0.42
216	0.38
217	0.32
218	0.25
219	0.24
220	0.24
221	0.19
222	0.18
223	0.15
224	0.19
225	0.18
226	0.2
227	0.23
228	0.28
229	0.34
230	0.42
231	0.44
232	0.44
233	0.48
234	0.49
235	0.46
236	0.42
237	0.45
238	0.44
239	0.49
240	0.55
241	0.58
242	0.63
243	0.72
244	0.79
245	0.78
246	0.79
247	0.75
248	0.68
249	0.65
250	0.57
251	0.46
252	0.36
253	0.29
254	0.2
255	0.16
256	0.12
257	0.08
258	0.08
259	0.1
260	0.11
261	0.1
262	0.11
263	0.11
264	0.13
265	0.15
266	0.19
267	0.18
268	0.21
269	0.22
270	0.23
271	0.24
272	0.24
273	0.25
274	0.21
275	0.22
276	0.2
277	0.18
278	0.2
279	0.2
280	0.18
281	0.15
282	0.15
283	0.13
284	0.12
285	0.11
286	0.07
287	0.06
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.04
292	0.04
293	0.04
294	0.05
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.03
302	0.04
303	0.05
304	0.05
305	0.06
306	0.06
307	0.07
308	0.07
309	0.15
310	0.18
311	0.23
312	0.27
313	0.33
314	0.36
315	0.4
316	0.43
317	0.41
318	0.39
319	0.35
320	0.34
321	0.29
322	0.26
323	0.22
324	0.19
325	0.15
326	0.14
327	0.13
328	0.13
329	0.15
330	0.16
331	0.18
332	0.25
333	0.32
334	0.43
335	0.53
336	0.61
337	0.68
338	0.77
339	0.81
340	0.81
341	0.82
342	0.8
343	0.81
344	0.8
345	0.8
346	0.79
347	0.79
348	0.8
349	0.82
350	0.8
351	0.72
352	0.65
353	0.59
354	0.53
355	0.48
356	0.38
357	0.28
358	0.22
359	0.21
360	0.18
361	0.14
362	0.11
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.08
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.07
372	0.09
373	0.09
374	0.09
375	0.11
376	0.12
377	0.11
378	0.11
379	0.1
380	0.07
381	0.07
382	0.09
383	0.07
384	0.07
385	0.09
386	0.09
387	0.12
388	0.15
389	0.18
390	0.18
391	0.2
392	0.25
393	0.3
394	0.37
395	0.36
396	0.37
397	0.35
398	0.34
399	0.36
400	0.34
401	0.34
402	0.33
403	0.35
404	0.4
405	0.43
406	0.47
407	0.47
408	0.49
409	0.48
410	0.5
411	0.5
412	0.43
413	0.39
414	0.38
415	0.35
416	0.3
417	0.26
418	0.2
419	0.21
420	0.23
421	0.23
422	0.21
423	0.24
424	0.23
425	0.27
426	0.27
427	0.23
428	0.25
429	0.27
430	0.28
431	0.25
432	0.3
433	0.29
434	0.31
435	0.33
436	0.35
437	0.37
438	0.41
439	0.48
440	0.51
441	0.5
442	0.5
443	0.47
444	0.42
445	0.44
446	0.41
447	0.33
448	0.26
449	0.26
450	0.23
451	0.28
452	0.3
453	0.27
454	0.29
455	0.31
456	0.39
457	0.45
458	0.53
459	0.58
460	0.66
461	0.74
462	0.77
463	0.84
464	0.8
465	0.79
466	0.8
467	0.81
468	0.78
469	0.79
470	0.76
471	0.73
472	0.76
473	0.72
474	0.68
475	0.67
476	0.67
477	0.61
478	0.6
479	0.56
480	0.49
481	0.53
482	0.53
483	0.45
484	0.4
485	0.42
486	0.38
487	0.41
488	0.4
489	0.33
490	0.25
491	0.27
492	0.29
493	0.23
494	0.22
495	0.16
496	0.19
497	0.21
498	0.28
499	0.31
500	0.31
501	0.3
502	0.31
503	0.37
504	0.42
505	0.45
506	0.42
507	0.36
508	0.34
509	0.39
510	0.39
511	0.34
512	0.3
513	0.28
514	0.27
515	0.27
516	0.27
517	0.22
518	0.2
519	0.21
520	0.18
521	0.17
522	0.17
523	0.16
524	0.15
525	0.16
526	0.15
527	0.14
528	0.14
529	0.14
530	0.11
531	0.11
532	0.12
533	0.1
534	0.1
535	0.1
536	0.13
537	0.12
538	0.13
539	0.13
540	0.17
541	0.2
542	0.22
543	0.21
544	0.2
545	0.21
546	0.23
547	0.26
548	0.26
549	0.24
550	0.23
551	0.24
552	0.25
553	0.29
554	0.3
555	0.37
556	0.33
557	0.36
558	0.4
559	0.41
560	0.42
561	0.36
562	0.34
563	0.29
564	0.36
565	0.37
566	0.35
567	0.42
568	0.44
569	0.52
570	0.57
571	0.62
572	0.63
573	0.69
574	0.73
575	0.74
576	0.78
577	0.75
578	0.72
579	0.69
580	0.65
581	0.63
582	0.65
583	0.62
584	0.56
585	0.51
586	0.46
587	0.41
588	0.34
589	0.28
590	0.2
591	0.14
592	0.12
593	0.15
594	0.15
595	0.15
596	0.15
597	0.15
598	0.13
599	0.15
600	0.15
601	0.18
602	0.25
603	0.28
604	0.3
605	0.38
606	0.41
607	0.42
608	0.49

A0A137PA58

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer