Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135V6J6

Protein Details
Accession A0A135V6J6    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-23DGSVRKRKRDLDGSSKSKKKQBasic
313-336ATPGKQRGTKRIPPRDKLKERMEPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-12KRKRD
16-21SSKSKK
321-329TKRIPPRDK
434-441RSVAPKRR
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 10, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009668  RNA_pol-assoc_fac_A49-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06870  RNA_pol_I_A49  
Amino Acid Sequences MADGSVRKRKRDLDGSSKSKKKQATEPSTVVVSSFQRPQLCPPVLASTPGIRIAKNVQFNPYVKQDVSSVKRRSKTPAVSQDLVLHSTDHQTMDYTAREDGISDSQQALKHYVGIYDPETGKLQVVEAKKMVVRGVARAKHASEQAMTAPADYSSYYDLKKDLGQTFGTKKAKKAIESVALNAIDPNKTRDSAPKKLDTASKAIMEAIGGATATMASREQLQAVVDEAKPVPRPNLEAEAIQDVYDPDEFIGREILAAIPVKDWIDPAKKGEEVLCYSRHVAGRVKKIADSGNVSKMRLLRYFYFLFTFYTMATPGKQRGTKRIPPRDKLKERMEPAPQVVIEHIRRKFSDGGEMRKFHMDLLITHCCAVACIIDNFEVETSKLREDLRLDQKDMNNYFFEIGAKVKQGASKEKGVKAPHVAKLALPLNFPKLRSVAPKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.79
3 0.83
4 0.84
5 0.79
6 0.76
7 0.73
8 0.69
9 0.68
10 0.7
11 0.69
12 0.7
13 0.69
14 0.65
15 0.6
16 0.53
17 0.44
18 0.36
19 0.29
20 0.25
21 0.26
22 0.27
23 0.3
24 0.32
25 0.38
26 0.44
27 0.43
28 0.4
29 0.38
30 0.4
31 0.36
32 0.38
33 0.33
34 0.26
35 0.26
36 0.31
37 0.29
38 0.23
39 0.25
40 0.3
41 0.34
42 0.39
43 0.38
44 0.37
45 0.42
46 0.44
47 0.46
48 0.44
49 0.42
50 0.34
51 0.33
52 0.33
53 0.35
54 0.41
55 0.46
56 0.48
57 0.52
58 0.57
59 0.58
60 0.62
61 0.63
62 0.65
63 0.66
64 0.68
65 0.68
66 0.65
67 0.63
68 0.61
69 0.53
70 0.46
71 0.36
72 0.26
73 0.19
74 0.2
75 0.2
76 0.15
77 0.13
78 0.13
79 0.14
80 0.16
81 0.16
82 0.15
83 0.14
84 0.14
85 0.13
86 0.13
87 0.14
88 0.15
89 0.14
90 0.14
91 0.15
92 0.17
93 0.19
94 0.2
95 0.2
96 0.16
97 0.18
98 0.17
99 0.16
100 0.14
101 0.15
102 0.15
103 0.17
104 0.17
105 0.17
106 0.18
107 0.17
108 0.17
109 0.14
110 0.14
111 0.15
112 0.16
113 0.17
114 0.16
115 0.18
116 0.18
117 0.19
118 0.18
119 0.17
120 0.16
121 0.19
122 0.27
123 0.28
124 0.3
125 0.32
126 0.33
127 0.33
128 0.34
129 0.29
130 0.22
131 0.19
132 0.17
133 0.19
134 0.17
135 0.14
136 0.12
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.12
146 0.13
147 0.15
148 0.19
149 0.18
150 0.19
151 0.2
152 0.23
153 0.26
154 0.34
155 0.38
156 0.34
157 0.34
158 0.4
159 0.42
160 0.39
161 0.41
162 0.37
163 0.37
164 0.37
165 0.37
166 0.32
167 0.29
168 0.27
169 0.24
170 0.2
171 0.13
172 0.13
173 0.15
174 0.13
175 0.13
176 0.14
177 0.23
178 0.29
179 0.36
180 0.4
181 0.41
182 0.41
183 0.43
184 0.47
185 0.4
186 0.37
187 0.31
188 0.26
189 0.22
190 0.2
191 0.17
192 0.13
193 0.11
194 0.06
195 0.04
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.04
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.09
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.11
217 0.12
218 0.12
219 0.11
220 0.13
221 0.14
222 0.19
223 0.18
224 0.17
225 0.17
226 0.18
227 0.17
228 0.15
229 0.13
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.07
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.1
252 0.14
253 0.15
254 0.17
255 0.19
256 0.19
257 0.19
258 0.21
259 0.2
260 0.19
261 0.21
262 0.21
263 0.2
264 0.21
265 0.23
266 0.23
267 0.22
268 0.25
269 0.29
270 0.36
271 0.39
272 0.39
273 0.36
274 0.38
275 0.37
276 0.34
277 0.33
278 0.28
279 0.32
280 0.32
281 0.32
282 0.32
283 0.32
284 0.33
285 0.29
286 0.3
287 0.23
288 0.27
289 0.29
290 0.28
291 0.26
292 0.24
293 0.22
294 0.19
295 0.18
296 0.12
297 0.12
298 0.12
299 0.11
300 0.12
301 0.14
302 0.16
303 0.22
304 0.26
305 0.28
306 0.37
307 0.45
308 0.53
309 0.61
310 0.68
311 0.71
312 0.74
313 0.82
314 0.83
315 0.83
316 0.83
317 0.81
318 0.79
319 0.74
320 0.73
321 0.69
322 0.62
323 0.55
324 0.5
325 0.41
326 0.33
327 0.3
328 0.3
329 0.29
330 0.33
331 0.33
332 0.33
333 0.34
334 0.38
335 0.4
336 0.34
337 0.39
338 0.38
339 0.44
340 0.48
341 0.49
342 0.47
343 0.47
344 0.45
345 0.35
346 0.32
347 0.25
348 0.19
349 0.25
350 0.29
351 0.25
352 0.25
353 0.25
354 0.22
355 0.21
356 0.19
357 0.13
358 0.1
359 0.1
360 0.12
361 0.12
362 0.12
363 0.13
364 0.13
365 0.12
366 0.1
367 0.14
368 0.15
369 0.15
370 0.18
371 0.18
372 0.21
373 0.25
374 0.34
375 0.4
376 0.43
377 0.46
378 0.49
379 0.53
380 0.58
381 0.57
382 0.5
383 0.41
384 0.37
385 0.34
386 0.28
387 0.25
388 0.17
389 0.17
390 0.17
391 0.17
392 0.18
393 0.19
394 0.21
395 0.25
396 0.32
397 0.35
398 0.42
399 0.47
400 0.52
401 0.56
402 0.57
403 0.58
404 0.59
405 0.61
406 0.58
407 0.55
408 0.5
409 0.44
410 0.48
411 0.48
412 0.4
413 0.35
414 0.32
415 0.36
416 0.39
417 0.39
418 0.35
419 0.32
420 0.35
421 0.43