Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135UFP4

Protein Details
Accession A0A135UFP4    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-73AAKMQESKQEWKRRRAVKKDSRVKMGHHydrophilic
263-282GLIRDKPAKKQKPPKNPALMHydrophilic
407-438AQGQQKQQNHGRKDDRKRKWENKSFDKNDNASHydrophilic
464-489VKESSPKRSPKASPKGSPKTSPKVKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-67KRRRAVKKDS
266-277RDKPAKKQKPPK
418-442RKDDRKRKWENKSFDKNDNASKKRR
468-488SPKRSPKASPKGSPKTSPKVK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito_nucl 11, mito 6.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
CDD cd02867  PseudoU_synth_TruB_4  
Amino Acid Sequences MAKDTVYEGVFAINKPYGMSSAQVIRDCQQQMNPSAIFKPLIERDLAAKMQESKQEWKRRRAVKKDSRVKMGHGGTLDPLATGVLILGVGSGTKSLGSFLDCTKTYETVVLFGASTDTYDRVGRILSRRPYDEITKEKVEKAMDSFRGKFQQIPPLYSALKMEGKPLYEYAREGKAIPREIVGRDVEVTELEMVEWYEPGTHNYRWPTEEAETAEKNLAEQVWRVEKQGASGRRLTPEEEKEEEKALSEHETVKKKFEERQDGLIRDKPAKKQKPPKNPALMSGALGQLPGGKGSNLIPPPPSEDEPFPWTDKGPPAARIRMKVTSGFYVRSFCHDLGAKVDSAGMMAELERSRQGDFEVRTDSCLEYEDVLKGEDVWGPKVMKALSEWTEKYPNGAPQSQRERQNAQGQQKQQNHGRKDDRKRKWENKSFDKNDNASKKRRNSSSGDEAPAAKVVKSEQASDVKESSPKRSPKASPKGSPKTSPKVKSANTKKFDDVWEGIQD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.18
4 0.16
5 0.15
6 0.16
7 0.16
8 0.21
9 0.26
10 0.27
11 0.29
12 0.29
13 0.35
14 0.37
15 0.36
16 0.34
17 0.36
18 0.36
19 0.4
20 0.38
21 0.33
22 0.32
23 0.31
24 0.28
25 0.22
26 0.27
27 0.25
28 0.25
29 0.24
30 0.24
31 0.24
32 0.29
33 0.29
34 0.23
35 0.22
36 0.25
37 0.28
38 0.34
39 0.35
40 0.39
41 0.48
42 0.58
43 0.63
44 0.68
45 0.73
46 0.77
47 0.84
48 0.85
49 0.87
50 0.87
51 0.9
52 0.91
53 0.88
54 0.87
55 0.79
56 0.73
57 0.71
58 0.62
59 0.54
60 0.45
61 0.38
62 0.3
63 0.29
64 0.24
65 0.15
66 0.12
67 0.08
68 0.07
69 0.06
70 0.05
71 0.03
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.04
81 0.04
82 0.05
83 0.06
84 0.08
85 0.1
86 0.11
87 0.17
88 0.17
89 0.2
90 0.22
91 0.22
92 0.21
93 0.22
94 0.21
95 0.17
96 0.17
97 0.14
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.1
110 0.14
111 0.18
112 0.26
113 0.32
114 0.36
115 0.38
116 0.41
117 0.44
118 0.46
119 0.47
120 0.45
121 0.44
122 0.46
123 0.45
124 0.44
125 0.43
126 0.38
127 0.33
128 0.31
129 0.32
130 0.32
131 0.35
132 0.35
133 0.36
134 0.39
135 0.39
136 0.39
137 0.35
138 0.39
139 0.36
140 0.37
141 0.34
142 0.34
143 0.33
144 0.29
145 0.26
146 0.2
147 0.23
148 0.2
149 0.22
150 0.2
151 0.2
152 0.21
153 0.22
154 0.21
155 0.17
156 0.19
157 0.19
158 0.2
159 0.19
160 0.19
161 0.22
162 0.24
163 0.26
164 0.24
165 0.23
166 0.22
167 0.22
168 0.25
169 0.21
170 0.16
171 0.14
172 0.14
173 0.12
174 0.1
175 0.1
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.08
187 0.12
188 0.13
189 0.17
190 0.19
191 0.21
192 0.22
193 0.23
194 0.23
195 0.21
196 0.23
197 0.21
198 0.23
199 0.21
200 0.21
201 0.2
202 0.17
203 0.15
204 0.13
205 0.11
206 0.07
207 0.08
208 0.1
209 0.14
210 0.15
211 0.16
212 0.17
213 0.17
214 0.2
215 0.26
216 0.27
217 0.24
218 0.28
219 0.28
220 0.29
221 0.3
222 0.29
223 0.28
224 0.28
225 0.29
226 0.28
227 0.28
228 0.26
229 0.27
230 0.24
231 0.19
232 0.16
233 0.12
234 0.11
235 0.11
236 0.14
237 0.19
238 0.25
239 0.25
240 0.28
241 0.3
242 0.3
243 0.34
244 0.38
245 0.42
246 0.38
247 0.46
248 0.48
249 0.48
250 0.48
251 0.47
252 0.41
253 0.38
254 0.39
255 0.38
256 0.44
257 0.5
258 0.56
259 0.63
260 0.71
261 0.76
262 0.79
263 0.81
264 0.8
265 0.73
266 0.66
267 0.61
268 0.52
269 0.41
270 0.36
271 0.27
272 0.17
273 0.16
274 0.12
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.07
282 0.13
283 0.12
284 0.13
285 0.14
286 0.14
287 0.19
288 0.22
289 0.22
290 0.19
291 0.2
292 0.22
293 0.25
294 0.27
295 0.24
296 0.21
297 0.2
298 0.2
299 0.21
300 0.23
301 0.22
302 0.26
303 0.29
304 0.36
305 0.38
306 0.38
307 0.4
308 0.38
309 0.37
310 0.34
311 0.32
312 0.3
313 0.29
314 0.27
315 0.24
316 0.24
317 0.23
318 0.24
319 0.26
320 0.21
321 0.22
322 0.22
323 0.21
324 0.22
325 0.23
326 0.18
327 0.14
328 0.14
329 0.11
330 0.09
331 0.09
332 0.05
333 0.04
334 0.04
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.09
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.12
343 0.16
344 0.17
345 0.2
346 0.23
347 0.22
348 0.24
349 0.25
350 0.23
351 0.17
352 0.17
353 0.15
354 0.11
355 0.12
356 0.12
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.09
361 0.1
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.15
366 0.15
367 0.16
368 0.19
369 0.18
370 0.16
371 0.16
372 0.2
373 0.21
374 0.26
375 0.27
376 0.28
377 0.33
378 0.32
379 0.34
380 0.32
381 0.34
382 0.34
383 0.37
384 0.36
385 0.4
386 0.5
387 0.54
388 0.58
389 0.58
390 0.57
391 0.59
392 0.65
393 0.64
394 0.64
395 0.65
396 0.65
397 0.69
398 0.71
399 0.71
400 0.7
401 0.72
402 0.67
403 0.69
404 0.72
405 0.72
406 0.77
407 0.8
408 0.82
409 0.83
410 0.9
411 0.9
412 0.91
413 0.91
414 0.9
415 0.9
416 0.91
417 0.87
418 0.84
419 0.82
420 0.76
421 0.75
422 0.76
423 0.72
424 0.7
425 0.73
426 0.75
427 0.75
428 0.77
429 0.74
430 0.7
431 0.72
432 0.73
433 0.7
434 0.64
435 0.57
436 0.52
437 0.46
438 0.43
439 0.35
440 0.24
441 0.19
442 0.17
443 0.22
444 0.22
445 0.24
446 0.25
447 0.32
448 0.34
449 0.37
450 0.37
451 0.32
452 0.37
453 0.38
454 0.39
455 0.42
456 0.46
457 0.48
458 0.55
459 0.62
460 0.67
461 0.75
462 0.77
463 0.78
464 0.82
465 0.87
466 0.85
467 0.85
468 0.83
469 0.83
470 0.83
471 0.79
472 0.76
473 0.76
474 0.76
475 0.78
476 0.8
477 0.8
478 0.76
479 0.75
480 0.71
481 0.67
482 0.63
483 0.6
484 0.52