Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135U3J7

Protein Details
Accession A0A135U3J7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-124DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
411-430KRRKETEDRREAGFKRRKLQ
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_nucl 9, nucl 7.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGIPAAFRWLSNKYPKIISPVIEEQPVKMDDGSEIPVDTTGPNPNGEELDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPAPKDEEEMMLEVFRYTDRVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAQEKEEDKQELLKLLKQQNGGAVPDDTLEGAAKKAFDSNSITPGTPFMDILASSLRYWCAYKLNTDPAWAKVKIIISDATVPGEGEHKIMSFVRSQRISPDYDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFFQDSKAKMCKLCGQKGHEARACRGQAKEKVGEFDEQEKSPTLKPFIWLHVPILREYLAVELNVPGLPFRFDLERALDDWVFMCCFVGNDFLPHLPALEIRENGIDTLTAIWKDNLPFMGGYVTKDGHVDLGRAQYILNGLAKQEDAIFKRRKETEDRREAGFKRRKLQEEQRNPRFAKPKQVDDASAGLSLFAVAGGPNGITHDKVVGRSSNMNANTANKSAASAIRDQLKGLMPKNEPIQEDDSAKATKEEVPKSADETSVLGKRKAEDDSTAKADSTATSAKGPSTSAAEEAAVDHVRMWEEGYADRYYEQKFHVDRSDLEFRHKVAQAYVEGLSWVLLYYFQGCPSWEWYYPYHYAPFAADFVELDKMDVHFEKGRISKPFEQLMSVLPAASRHALPEVFHDLMLNEDSNVIDFYPSDFEIDLNGKKMAWQGVALLPFIEMPRLLAAIETKYPLLSEADKARNGVGRDVLLLSDAHHELYDEITTGFYSKKQGAPTLKLSPRTSDGLAGNIEKIPDYLPHGELAYPLERDGMPNLDYDRSLRVWYTFPESSHPHKSMLLRGAKPPAPALDRNDIETLKGKSARGGRGYGGVPFQRGGGHHNGGRRGGQFSYAPDSGQGRQDRGPPSYGGNGGGYGRQGFQSSGPPPIQSSWQPPPPGHPGFGMGLPPPPPPAGYGNDGRASNGSYRGGGYNQHQNYGPPPPGPHSQYSYPDGGRQGGRGGYQGRGGYGGGRGGGGGGGGRYGGGRNNY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.48
3 0.52
4 0.52
5 0.47
6 0.44
7 0.46
8 0.45
9 0.47
10 0.45
11 0.37
12 0.38
13 0.37
14 0.31
15 0.23
16 0.21
17 0.16
18 0.18
19 0.2
20 0.15
21 0.15
22 0.13
23 0.13
24 0.13
25 0.13
26 0.13
27 0.17
28 0.18
29 0.19
30 0.19
31 0.21
32 0.22
33 0.22
34 0.21
35 0.18
36 0.2
37 0.19
38 0.18
39 0.17
40 0.15
41 0.14
42 0.12
43 0.09
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.09
48 0.1
49 0.12
50 0.18
51 0.21
52 0.23
53 0.29
54 0.38
55 0.46
56 0.51
57 0.53
58 0.53
59 0.51
60 0.52
61 0.47
62 0.41
63 0.35
64 0.31
65 0.26
66 0.21
67 0.19
68 0.16
69 0.14
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.13
74 0.13
75 0.17
76 0.19
77 0.27
78 0.37
79 0.43
80 0.45
81 0.44
82 0.45
83 0.44
84 0.44
85 0.39
86 0.32
87 0.29
88 0.26
89 0.25
90 0.24
91 0.21
92 0.2
93 0.18
94 0.15
95 0.1
96 0.13
97 0.19
98 0.26
99 0.36
100 0.45
101 0.55
102 0.66
103 0.74
104 0.8
105 0.82
106 0.78
107 0.76
108 0.76
109 0.75
110 0.74
111 0.75
112 0.68
113 0.64
114 0.67
115 0.61
116 0.53
117 0.49
118 0.41
119 0.31
120 0.33
121 0.31
122 0.29
123 0.29
124 0.31
125 0.34
126 0.39
127 0.43
128 0.4
129 0.4
130 0.39
131 0.4
132 0.37
133 0.3
134 0.24
135 0.2
136 0.18
137 0.18
138 0.12
139 0.1
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.12
147 0.12
148 0.15
149 0.21
150 0.23
151 0.27
152 0.29
153 0.28
154 0.25
155 0.26
156 0.24
157 0.18
158 0.16
159 0.11
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.14
170 0.15
171 0.19
172 0.19
173 0.24
174 0.28
175 0.36
176 0.35
177 0.38
178 0.38
179 0.36
180 0.41
181 0.36
182 0.31
183 0.27
184 0.29
185 0.26
186 0.26
187 0.22
188 0.18
189 0.21
190 0.21
191 0.18
192 0.15
193 0.14
194 0.12
195 0.13
196 0.12
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.1
201 0.11
202 0.12
203 0.16
204 0.2
205 0.26
206 0.28
207 0.28
208 0.32
209 0.34
210 0.37
211 0.35
212 0.4
213 0.39
214 0.44
215 0.45
216 0.43
217 0.46
218 0.42
219 0.38
220 0.29
221 0.25
222 0.19
223 0.2
224 0.17
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.08
230 0.06
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.05
237 0.07
238 0.08
239 0.11
240 0.13
241 0.13
242 0.18
243 0.2
244 0.24
245 0.25
246 0.26
247 0.25
248 0.28
249 0.27
250 0.24
251 0.27
252 0.23
253 0.24
254 0.26
255 0.27
256 0.24
257 0.27
258 0.34
259 0.36
260 0.43
261 0.46
262 0.49
263 0.56
264 0.6
265 0.66
266 0.62
267 0.56
268 0.51
269 0.53
270 0.5
271 0.44
272 0.41
273 0.4
274 0.43
275 0.46
276 0.48
277 0.41
278 0.41
279 0.4
280 0.39
281 0.33
282 0.33
283 0.3
284 0.25
285 0.25
286 0.24
287 0.24
288 0.25
289 0.27
290 0.24
291 0.21
292 0.25
293 0.27
294 0.29
295 0.32
296 0.29
297 0.28
298 0.28
299 0.28
300 0.25
301 0.23
302 0.19
303 0.14
304 0.13
305 0.12
306 0.1
307 0.09
308 0.09
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.09
319 0.09
320 0.12
321 0.14
322 0.15
323 0.15
324 0.17
325 0.16
326 0.14
327 0.14
328 0.13
329 0.1
330 0.09
331 0.08
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.08
336 0.07
337 0.08
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.07
344 0.08
345 0.11
346 0.13
347 0.13
348 0.13
349 0.14
350 0.14
351 0.13
352 0.12
353 0.08
354 0.06
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.08
359 0.08
360 0.1
361 0.1
362 0.12
363 0.1
364 0.1
365 0.09
366 0.09
367 0.11
368 0.1
369 0.1
370 0.11
371 0.11
372 0.1
373 0.11
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.11
380 0.11
381 0.11
382 0.11
383 0.09
384 0.09
385 0.1
386 0.1
387 0.08
388 0.07
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.11
394 0.12
395 0.21
396 0.26
397 0.26
398 0.32
399 0.35
400 0.38
401 0.44
402 0.52
403 0.54
404 0.59
405 0.61
406 0.58
407 0.62
408 0.6
409 0.61
410 0.59
411 0.52
412 0.5
413 0.55
414 0.56
415 0.58
416 0.66
417 0.66
418 0.69
419 0.75
420 0.75
421 0.76
422 0.73
423 0.71
424 0.69
425 0.6
426 0.6
427 0.54
428 0.51
429 0.49
430 0.49
431 0.44
432 0.37
433 0.37
434 0.27
435 0.23
436 0.16
437 0.11
438 0.09
439 0.08
440 0.05
441 0.04
442 0.03
443 0.02
444 0.02
445 0.02
446 0.03
447 0.03
448 0.04
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.07
453 0.08
454 0.09
455 0.11
456 0.1
457 0.12
458 0.13
459 0.15
460 0.18
461 0.18
462 0.18
463 0.17
464 0.19
465 0.2
466 0.18
467 0.18
468 0.12
469 0.12
470 0.12
471 0.13
472 0.11
473 0.11
474 0.12
475 0.17
476 0.17
477 0.17
478 0.18
479 0.19
480 0.21
481 0.21
482 0.25
483 0.21
484 0.23
485 0.26
486 0.27
487 0.25
488 0.24
489 0.26
490 0.21
491 0.22
492 0.2
493 0.19
494 0.16
495 0.16
496 0.13
497 0.11
498 0.14
499 0.18
500 0.19
501 0.19
502 0.21
503 0.22
504 0.24
505 0.24
506 0.2
507 0.15
508 0.14
509 0.15
510 0.17
511 0.18
512 0.16
513 0.16
514 0.17
515 0.18
516 0.19
517 0.17
518 0.16
519 0.18
520 0.21
521 0.23
522 0.23
523 0.21
524 0.19
525 0.18
526 0.14
527 0.13
528 0.11
529 0.09
530 0.1
531 0.1
532 0.1
533 0.1
534 0.1
535 0.08
536 0.09
537 0.09
538 0.09
539 0.09
540 0.08
541 0.08
542 0.08
543 0.09
544 0.07
545 0.07
546 0.06
547 0.06
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.06
552 0.06
553 0.07
554 0.1
555 0.1
556 0.1
557 0.1
558 0.12
559 0.12
560 0.14
561 0.14
562 0.17
563 0.18
564 0.21
565 0.23
566 0.23
567 0.23
568 0.28
569 0.35
570 0.29
571 0.33
572 0.32
573 0.3
574 0.33
575 0.34
576 0.28
577 0.2
578 0.22
579 0.18
580 0.19
581 0.18
582 0.12
583 0.1
584 0.1
585 0.09
586 0.06
587 0.06
588 0.03
589 0.03
590 0.03
591 0.06
592 0.06
593 0.07
594 0.08
595 0.08
596 0.09
597 0.13
598 0.17
599 0.15
600 0.18
601 0.19
602 0.23
603 0.25
604 0.25
605 0.23
606 0.2
607 0.19
608 0.17
609 0.17
610 0.12
611 0.1
612 0.09
613 0.07
614 0.08
615 0.1
616 0.09
617 0.08
618 0.08
619 0.08
620 0.1
621 0.1
622 0.11
623 0.12
624 0.12
625 0.17
626 0.19
627 0.23
628 0.26
629 0.32
630 0.35
631 0.38
632 0.41
633 0.37
634 0.35
635 0.31
636 0.29
637 0.26
638 0.19
639 0.15
640 0.11
641 0.11
642 0.11
643 0.12
644 0.1
645 0.07
646 0.09
647 0.1
648 0.1
649 0.13
650 0.17
651 0.16
652 0.16
653 0.16
654 0.14
655 0.15
656 0.15
657 0.12
658 0.06
659 0.06
660 0.06
661 0.07
662 0.07
663 0.06
664 0.05
665 0.05
666 0.06
667 0.08
668 0.08
669 0.08
670 0.08
671 0.08
672 0.1
673 0.13
674 0.13
675 0.13
676 0.13
677 0.12
678 0.13
679 0.15
680 0.15
681 0.12
682 0.12
683 0.12
684 0.14
685 0.16
686 0.14
687 0.12
688 0.1
689 0.1
690 0.1
691 0.09
692 0.06
693 0.05
694 0.06
695 0.06
696 0.06
697 0.06
698 0.07
699 0.08
700 0.1
701 0.1
702 0.1
703 0.09
704 0.09
705 0.1
706 0.11
707 0.1
708 0.13
709 0.2
710 0.24
711 0.25
712 0.25
713 0.26
714 0.27
715 0.27
716 0.25
717 0.19
718 0.16
719 0.16
720 0.15
721 0.14
722 0.11
723 0.1
724 0.09
725 0.11
726 0.11
727 0.1
728 0.09
729 0.1
730 0.09
731 0.1
732 0.09
733 0.06
734 0.06
735 0.06
736 0.06
737 0.07
738 0.08
739 0.08
740 0.11
741 0.14
742 0.17
743 0.19
744 0.26
745 0.31
746 0.36
747 0.41
748 0.47
749 0.49
750 0.52
751 0.51
752 0.47
753 0.45
754 0.43
755 0.38
756 0.33
757 0.29
758 0.25
759 0.25
760 0.22
761 0.2
762 0.17
763 0.17
764 0.12
765 0.12
766 0.1
767 0.1
768 0.13
769 0.15
770 0.15
771 0.16
772 0.16
773 0.16
774 0.16
775 0.18
776 0.16
777 0.13
778 0.13
779 0.13
780 0.13
781 0.14
782 0.15
783 0.15
784 0.13
785 0.14
786 0.16
787 0.15
788 0.16
789 0.16
790 0.17
791 0.16
792 0.17
793 0.16
794 0.16
795 0.17
796 0.19
797 0.25
798 0.24
799 0.23
800 0.28
801 0.32
802 0.37
803 0.43
804 0.42
805 0.37
806 0.39
807 0.41
808 0.42
809 0.45
810 0.47
811 0.42
812 0.44
813 0.5
814 0.48
815 0.46
816 0.42
817 0.38
818 0.35
819 0.36
820 0.38
821 0.39
822 0.38
823 0.39
824 0.41
825 0.36
826 0.32
827 0.34
828 0.31
829 0.28
830 0.3
831 0.27
832 0.3
833 0.36
834 0.41
835 0.39
836 0.39
837 0.34
838 0.36
839 0.36
840 0.32
841 0.31
842 0.26
843 0.24
844 0.21
845 0.21
846 0.18
847 0.18
848 0.21
849 0.23
850 0.26
851 0.27
852 0.32
853 0.35
854 0.35
855 0.38
856 0.35
857 0.31
858 0.27
859 0.28
860 0.25
861 0.24
862 0.29
863 0.26
864 0.24
865 0.23
866 0.26
867 0.25
868 0.31
869 0.31
870 0.28
871 0.3
872 0.37
873 0.39
874 0.39
875 0.39
876 0.33
877 0.33
878 0.34
879 0.32
880 0.27
881 0.23
882 0.22
883 0.2
884 0.19
885 0.17
886 0.14
887 0.13
888 0.13
889 0.13
890 0.13
891 0.14
892 0.2
893 0.21
894 0.26
895 0.26
896 0.26
897 0.27
898 0.28
899 0.31
900 0.28
901 0.35
902 0.37
903 0.42
904 0.45
905 0.44
906 0.48
907 0.52
908 0.5
909 0.44
910 0.37
911 0.33
912 0.32
913 0.32
914 0.28
915 0.2
916 0.2
917 0.2
918 0.2
919 0.19
920 0.18
921 0.17
922 0.18
923 0.21
924 0.22
925 0.26
926 0.29
927 0.32
928 0.36
929 0.35
930 0.34
931 0.31
932 0.3
933 0.27
934 0.27
935 0.23
936 0.19
937 0.21
938 0.22
939 0.22
940 0.24
941 0.26
942 0.32
943 0.32
944 0.35
945 0.34
946 0.33
947 0.36
948 0.39
949 0.38
950 0.3
951 0.32
952 0.34
953 0.41
954 0.45
955 0.46
956 0.45
957 0.47
958 0.5
959 0.51
960 0.52
961 0.46
962 0.45
963 0.42
964 0.41
965 0.36
966 0.32
967 0.3
968 0.27
969 0.26
970 0.27
971 0.27
972 0.24
973 0.27
974 0.26
975 0.23
976 0.22
977 0.22
978 0.18
979 0.18
980 0.17
981 0.13
982 0.12
983 0.11
984 0.1
985 0.1
986 0.08
987 0.07
988 0.05
989 0.05
990 0.05
991 0.05
992 0.06
993 0.07