Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135SSB4

Protein Details
Accession A0A135SSB4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
152-175PGGKVSKKSARKHVPKETVKSMRKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
156-167VSKKSARKHVPK
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_nucl 9, nucl 7.5, plas 4, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000014  PAS  
IPR035965  PAS-like_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13426  PAS_9  
Amino Acid Sequences MSMQEFQYPASYLQPQKSERILSFRSQNQMSPIMNPWESCALQYQFSEGGTEQAAQGKPGAWRQPQAGADPVMYPGLYCPSGFDMMNILLRVAGRPNPKVELGAIDCSVALLLCDLEQPDCPIVYASEHFSILTGYKNSEILGKNCRFLQAPGGKVSKKSARKHVPKETVKSMRKAVEANDEFQTDVLNFRKDGTPFVNLLTMIPVRWDSQHFRYSVGFQVARED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.39
3 0.42
4 0.46
5 0.46
6 0.42
7 0.45
8 0.44
9 0.42
10 0.47
11 0.47
12 0.5
13 0.46
14 0.45
15 0.42
16 0.44
17 0.39
18 0.34
19 0.33
20 0.32
21 0.31
22 0.29
23 0.27
24 0.26
25 0.25
26 0.23
27 0.25
28 0.21
29 0.22
30 0.22
31 0.22
32 0.18
33 0.18
34 0.19
35 0.13
36 0.12
37 0.11
38 0.11
39 0.1
40 0.14
41 0.14
42 0.13
43 0.13
44 0.14
45 0.16
46 0.2
47 0.26
48 0.23
49 0.25
50 0.27
51 0.32
52 0.32
53 0.32
54 0.3
55 0.24
56 0.22
57 0.2
58 0.19
59 0.13
60 0.11
61 0.09
62 0.07
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.1
68 0.11
69 0.11
70 0.11
71 0.1
72 0.11
73 0.12
74 0.11
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.12
81 0.14
82 0.15
83 0.17
84 0.19
85 0.19
86 0.19
87 0.18
88 0.16
89 0.15
90 0.15
91 0.13
92 0.11
93 0.1
94 0.1
95 0.09
96 0.06
97 0.04
98 0.02
99 0.02
100 0.02
101 0.03
102 0.03
103 0.04
104 0.04
105 0.05
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.08
122 0.08
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.14
127 0.15
128 0.16
129 0.24
130 0.25
131 0.26
132 0.26
133 0.27
134 0.24
135 0.22
136 0.29
137 0.25
138 0.27
139 0.3
140 0.34
141 0.33
142 0.33
143 0.38
144 0.38
145 0.41
146 0.45
147 0.51
148 0.57
149 0.67
150 0.75
151 0.8
152 0.82
153 0.81
154 0.81
155 0.81
156 0.81
157 0.75
158 0.71
159 0.66
160 0.59
161 0.53
162 0.48
163 0.41
164 0.41
165 0.38
166 0.37
167 0.33
168 0.3
169 0.27
170 0.25
171 0.24
172 0.13
173 0.16
174 0.16
175 0.16
176 0.15
177 0.17
178 0.22
179 0.22
180 0.26
181 0.25
182 0.26
183 0.25
184 0.26
185 0.26
186 0.21
187 0.21
188 0.21
189 0.18
190 0.14
191 0.15
192 0.15
193 0.14
194 0.17
195 0.21
196 0.24
197 0.3
198 0.36
199 0.35
200 0.36
201 0.37
202 0.38
203 0.39
204 0.4
205 0.35