Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135VA93

Protein Details
Accession A0A135VA93    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-60EPATEKAPKKVTKKEKVEKTPKRKAPEEABasic
150-169VGKVPKFKKQKQLTNGKKEEHydrophilic
284-305SGWSHKVSKEEKKRLERAEKLKBasic
366-386ETPKSAKKAAAKGGKRRKSRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-83RKRTRSVTGKEPVAKKAAKVEKAEKVEPATEKAPKKVTKKEKVEKTPKRKAPEEAQASPVAAKKQKPAKANAKSKKSA
261-303NKRFKKIPWHKIAAGEVAKPRTESGWSHKVSKEEKKRLERAEK
369-386KSAKKAAAKGGKRRKSRG
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12, cyto 7, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPELRKRTRSVTGKEPVAKKAAKVEKAEKVEPATEKAPKKVTKKEKVEKTPKRKAPEEAQASPVAAKKQKPAKANAKSKKSAPAPEPVEEEEKQAEPEATEDAETSVVAFEEEEDDDEEVDADIAALAAGLDPEDAPAGKGTFKEGQDVGKVPKFKKQKQLTNGKKEEPGVVFISRLPHGFYEHELKGYFSQFGNITRLRLARNKKSGASKHYAFLEFAEASTAEIVAKTMDSYLLFGHILKVKTVPADQLHEDVWKGANKRFKKIPWHKIAAGEVAKPRTESGWSHKVSKEEKKRLERAEKLKAIGYEFEAPKLKEAVAPPPEPMAVDAPEETKAIEAAAPVEEEKKTVEEEVKEVEEKVAEVETPKSAKKAAAKGGKRRKSRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.74
3 0.71
4 0.66
5 0.65
6 0.6
7 0.52
8 0.53
9 0.54
10 0.52
11 0.55
12 0.58
13 0.59
14 0.64
15 0.64
16 0.58
17 0.53
18 0.52
19 0.47
20 0.44
21 0.4
22 0.41
23 0.43
24 0.45
25 0.5
26 0.52
27 0.58
28 0.64
29 0.69
30 0.72
31 0.79
32 0.83
33 0.85
34 0.89
35 0.92
36 0.93
37 0.93
38 0.93
39 0.89
40 0.87
41 0.82
42 0.79
43 0.76
44 0.76
45 0.73
46 0.65
47 0.61
48 0.54
49 0.49
50 0.44
51 0.38
52 0.33
53 0.3
54 0.29
55 0.34
56 0.41
57 0.47
58 0.51
59 0.57
60 0.62
61 0.68
62 0.76
63 0.78
64 0.78
65 0.77
66 0.74
67 0.74
68 0.69
69 0.66
70 0.58
71 0.58
72 0.53
73 0.52
74 0.52
75 0.45
76 0.44
77 0.37
78 0.36
79 0.29
80 0.25
81 0.22
82 0.2
83 0.17
84 0.12
85 0.13
86 0.11
87 0.09
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.07
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.05
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.06
108 0.06
109 0.05
110 0.04
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.02
115 0.02
116 0.02
117 0.02
118 0.02
119 0.02
120 0.02
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.04
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.1
130 0.15
131 0.15
132 0.18
133 0.18
134 0.19
135 0.2
136 0.23
137 0.23
138 0.21
139 0.26
140 0.23
141 0.3
142 0.38
143 0.42
144 0.5
145 0.56
146 0.61
147 0.66
148 0.77
149 0.79
150 0.81
151 0.8
152 0.72
153 0.65
154 0.57
155 0.52
156 0.41
157 0.34
158 0.25
159 0.21
160 0.18
161 0.16
162 0.18
163 0.14
164 0.14
165 0.12
166 0.1
167 0.11
168 0.12
169 0.13
170 0.17
171 0.16
172 0.17
173 0.17
174 0.17
175 0.17
176 0.17
177 0.16
178 0.1
179 0.11
180 0.11
181 0.12
182 0.16
183 0.15
184 0.15
185 0.15
186 0.17
187 0.18
188 0.24
189 0.3
190 0.34
191 0.4
192 0.42
193 0.44
194 0.51
195 0.53
196 0.53
197 0.52
198 0.45
199 0.41
200 0.41
201 0.38
202 0.3
203 0.26
204 0.22
205 0.15
206 0.14
207 0.12
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.03
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.09
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.14
231 0.13
232 0.14
233 0.15
234 0.16
235 0.14
236 0.17
237 0.18
238 0.18
239 0.18
240 0.18
241 0.17
242 0.14
243 0.15
244 0.15
245 0.16
246 0.19
247 0.26
248 0.28
249 0.35
250 0.41
251 0.44
252 0.52
253 0.6
254 0.67
255 0.68
256 0.72
257 0.68
258 0.65
259 0.61
260 0.57
261 0.48
262 0.41
263 0.36
264 0.32
265 0.3
266 0.26
267 0.25
268 0.19
269 0.2
270 0.2
271 0.24
272 0.31
273 0.33
274 0.37
275 0.39
276 0.45
277 0.49
278 0.56
279 0.59
280 0.6
281 0.68
282 0.72
283 0.77
284 0.8
285 0.83
286 0.82
287 0.79
288 0.8
289 0.74
290 0.67
291 0.62
292 0.54
293 0.46
294 0.38
295 0.33
296 0.31
297 0.27
298 0.29
299 0.3
300 0.29
301 0.29
302 0.29
303 0.26
304 0.21
305 0.23
306 0.28
307 0.3
308 0.31
309 0.29
310 0.29
311 0.29
312 0.26
313 0.25
314 0.19
315 0.14
316 0.15
317 0.15
318 0.14
319 0.15
320 0.15
321 0.13
322 0.11
323 0.1
324 0.09
325 0.08
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.12
332 0.12
333 0.12
334 0.13
335 0.13
336 0.14
337 0.16
338 0.2
339 0.2
340 0.22
341 0.26
342 0.28
343 0.27
344 0.27
345 0.25
346 0.2
347 0.18
348 0.17
349 0.14
350 0.11
351 0.12
352 0.13
353 0.17
354 0.2
355 0.22
356 0.23
357 0.24
358 0.29
359 0.35
360 0.41
361 0.46
362 0.53
363 0.6
364 0.69
365 0.79
366 0.83