Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135V7C1

Protein Details
Accession A0A135V7C1    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-52ESSTVTKKSKSEKKDKKEKKAKKAAAAEAEPHydrophilic
61-86ALEESKAEKKERKRKEKEARKAAEAABasic
118-145DLDVKTEKKDKKEKKDKKKKVAEAETEABasic
152-173AEEKKEKKSKKAKKAKDETALABasic
283-324AGGGGKSKFRQNKIKERNVQLDENRHRRMQKEEEYKKERAKQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-12KRKR
28-46KKSKSEKKDKKEKKAKKAA
66-82KAEKKERKRKEKEARKA
109-138KKAKKSKKEDLDVKTEKKDKKEKKDKKKKV
155-167KKEKKSKKAKKAK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MASAELSKKRKRAEPAAAVADESSTVTKKSKSEKKDKKEKKAKKAAAAEAEPATEGGEFIALEESKAEKKERKRKEKEARKAAEAAAAAAPSDADADAMDVDPPVTEEKKAKKSKKEDLDVKTEKKDKKEKKDKKKKVAEAETEANGLETVAEEKKEKKSKKAKKAKDETALAAAPVVEEAAEPAAQEEETPAEGGKREKYIVFVGNLPYTANKDSINAHFAAYKPSLVRCLHKDGNPNVCRGIAFLEFSNGSNMRTCLDKMHHTSFDDGLSPARQINLELSAGGGGKSKFRQNKIKERNVQLDENRHRRMQKEEEYKKERAKQGGANSQQESIHPSRLAMMYQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.73
3 0.73
4 0.67
5 0.59
6 0.5
7 0.4
8 0.3
9 0.22
10 0.16
11 0.1
12 0.12
13 0.14
14 0.18
15 0.23
16 0.33
17 0.42
18 0.5
19 0.6
20 0.69
21 0.77
22 0.85
23 0.9
24 0.91
25 0.94
26 0.94
27 0.94
28 0.94
29 0.91
30 0.9
31 0.88
32 0.84
33 0.81
34 0.72
35 0.65
36 0.54
37 0.46
38 0.36
39 0.28
40 0.2
41 0.12
42 0.1
43 0.06
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.11
52 0.13
53 0.16
54 0.21
55 0.25
56 0.36
57 0.46
58 0.56
59 0.66
60 0.73
61 0.81
62 0.88
63 0.92
64 0.92
65 0.93
66 0.87
67 0.8
68 0.74
69 0.63
70 0.56
71 0.44
72 0.35
73 0.25
74 0.19
75 0.14
76 0.11
77 0.1
78 0.06
79 0.06
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.05
86 0.05
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.05
91 0.07
92 0.08
93 0.1
94 0.15
95 0.23
96 0.33
97 0.43
98 0.5
99 0.57
100 0.64
101 0.73
102 0.77
103 0.79
104 0.78
105 0.73
106 0.76
107 0.74
108 0.69
109 0.66
110 0.64
111 0.58
112 0.57
113 0.63
114 0.62
115 0.66
116 0.74
117 0.78
118 0.82
119 0.9
120 0.92
121 0.93
122 0.93
123 0.9
124 0.89
125 0.88
126 0.81
127 0.76
128 0.68
129 0.58
130 0.48
131 0.39
132 0.29
133 0.2
134 0.14
135 0.08
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.07
141 0.1
142 0.18
143 0.27
144 0.29
145 0.37
146 0.48
147 0.57
148 0.68
149 0.76
150 0.77
151 0.8
152 0.87
153 0.85
154 0.81
155 0.73
156 0.63
157 0.55
158 0.46
159 0.35
160 0.25
161 0.17
162 0.1
163 0.07
164 0.06
165 0.02
166 0.02
167 0.02
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.08
183 0.1
184 0.11
185 0.12
186 0.12
187 0.14
188 0.16
189 0.17
190 0.17
191 0.17
192 0.17
193 0.17
194 0.16
195 0.15
196 0.12
197 0.13
198 0.13
199 0.12
200 0.1
201 0.11
202 0.14
203 0.16
204 0.18
205 0.16
206 0.15
207 0.15
208 0.15
209 0.18
210 0.16
211 0.16
212 0.14
213 0.15
214 0.2
215 0.2
216 0.24
217 0.24
218 0.32
219 0.35
220 0.37
221 0.45
222 0.45
223 0.54
224 0.51
225 0.49
226 0.42
227 0.37
228 0.34
229 0.26
230 0.23
231 0.14
232 0.13
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.14
237 0.17
238 0.14
239 0.14
240 0.15
241 0.15
242 0.13
243 0.15
244 0.15
245 0.16
246 0.19
247 0.25
248 0.3
249 0.36
250 0.38
251 0.37
252 0.39
253 0.36
254 0.33
255 0.27
256 0.21
257 0.17
258 0.15
259 0.15
260 0.13
261 0.13
262 0.12
263 0.11
264 0.13
265 0.13
266 0.12
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.1
272 0.12
273 0.1
274 0.14
275 0.17
276 0.25
277 0.32
278 0.39
279 0.49
280 0.56
281 0.67
282 0.73
283 0.81
284 0.82
285 0.83
286 0.85
287 0.8
288 0.78
289 0.74
290 0.74
291 0.73
292 0.73
293 0.7
294 0.66
295 0.64
296 0.6
297 0.62
298 0.6
299 0.61
300 0.63
301 0.68
302 0.73
303 0.76
304 0.8
305 0.81
306 0.8
307 0.76
308 0.72
309 0.69
310 0.66
311 0.69
312 0.71
313 0.7
314 0.68
315 0.63
316 0.58
317 0.52
318 0.46
319 0.44
320 0.37
321 0.35
322 0.29
323 0.27
324 0.28