Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135TN60

Protein Details
Accession A0A135TN60    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
380-401LNGSRKSRSKSRFPSPPRSPSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
143-164KARKAAEGRTGEKADNKPEAPK
384-397RKSRSKSRFPSPPR
Subcellular Location(s) mito 8.5, cyto_mito 6, plas 5, extr 5, E.R. 4, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001727  Gdt1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF01169  UPF0016  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01214  UPF0016  
Amino Acid Sequences MRLRTRPSPLLLLLIPSLVAGLAVETKDKNGGKAVASTEKATDSTVTSGIKTRYGTDHAPVDGKDGMPHEGPFVDQTRETKKENADIDGKKGLPPLKGRPSDPTVVNGKKIPETNDGVMNDKTRQKPKEGTTGTEGGVSEKDKARKAAEGRTGEKADNKPEAPKEKPPLPHSEQEKLSSEKDTTTGKEHDHDHHTADEVAGLEKPADLPSKLDDKPNPLPNSAHKDHLDLPKSKGKSSSSLDDEAEGVIQPFHSFVLSLTMILVSEVGDKTFLVAALMAMKHDRMVVFSAAFGALLVMTVLSAVLGHAVPTLIPKRVTSFLAAGLFFVFGAKLLREGLGMDPNEGVTAELHEVERELAEKEKEGKRRGSAVSPYALEMGLNGSRKSRSKSRFPSPPRSPSSSPPRSPSPGSGGIRGSLNGLNNLLGLLLSPAWVQTFVMTFLGEWGDRSQIATIAMAAGQDYWWVILGAMVGHCICTGAAVIGGRAIAGRVSLKVVTVGGAVAFLVFGFIYFFEAFYA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.2
3 0.14
4 0.13
5 0.07
6 0.07
7 0.04
8 0.04
9 0.06
10 0.07
11 0.09
12 0.1
13 0.11
14 0.19
15 0.2
16 0.21
17 0.23
18 0.26
19 0.25
20 0.29
21 0.33
22 0.33
23 0.34
24 0.34
25 0.31
26 0.29
27 0.28
28 0.25
29 0.21
30 0.16
31 0.17
32 0.18
33 0.18
34 0.17
35 0.22
36 0.23
37 0.25
38 0.24
39 0.25
40 0.26
41 0.3
42 0.32
43 0.31
44 0.33
45 0.32
46 0.34
47 0.31
48 0.29
49 0.26
50 0.24
51 0.22
52 0.2
53 0.21
54 0.19
55 0.19
56 0.17
57 0.16
58 0.16
59 0.17
60 0.18
61 0.18
62 0.18
63 0.23
64 0.29
65 0.34
66 0.36
67 0.39
68 0.39
69 0.44
70 0.44
71 0.45
72 0.46
73 0.44
74 0.45
75 0.44
76 0.41
77 0.35
78 0.38
79 0.36
80 0.32
81 0.36
82 0.41
83 0.46
84 0.49
85 0.5
86 0.52
87 0.54
88 0.54
89 0.49
90 0.45
91 0.44
92 0.42
93 0.43
94 0.39
95 0.36
96 0.35
97 0.37
98 0.36
99 0.33
100 0.35
101 0.34
102 0.37
103 0.36
104 0.35
105 0.34
106 0.32
107 0.31
108 0.33
109 0.38
110 0.41
111 0.43
112 0.45
113 0.52
114 0.54
115 0.6
116 0.56
117 0.53
118 0.5
119 0.5
120 0.44
121 0.38
122 0.33
123 0.23
124 0.22
125 0.19
126 0.17
127 0.19
128 0.23
129 0.24
130 0.27
131 0.27
132 0.32
133 0.35
134 0.39
135 0.43
136 0.45
137 0.45
138 0.48
139 0.48
140 0.43
141 0.46
142 0.41
143 0.37
144 0.36
145 0.34
146 0.33
147 0.38
148 0.43
149 0.41
150 0.46
151 0.47
152 0.49
153 0.54
154 0.53
155 0.56
156 0.54
157 0.57
158 0.54
159 0.54
160 0.5
161 0.47
162 0.47
163 0.42
164 0.38
165 0.33
166 0.28
167 0.22
168 0.22
169 0.21
170 0.19
171 0.2
172 0.21
173 0.21
174 0.23
175 0.26
176 0.28
177 0.31
178 0.31
179 0.28
180 0.26
181 0.26
182 0.22
183 0.19
184 0.15
185 0.1
186 0.09
187 0.08
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.08
194 0.07
195 0.08
196 0.11
197 0.17
198 0.18
199 0.22
200 0.22
201 0.28
202 0.35
203 0.42
204 0.41
205 0.37
206 0.38
207 0.39
208 0.46
209 0.41
210 0.38
211 0.31
212 0.32
213 0.36
214 0.41
215 0.4
216 0.34
217 0.37
218 0.39
219 0.39
220 0.37
221 0.36
222 0.31
223 0.32
224 0.32
225 0.34
226 0.31
227 0.32
228 0.31
229 0.27
230 0.26
231 0.19
232 0.16
233 0.1
234 0.07
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.03
241 0.04
242 0.03
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.06
250 0.06
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.04
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.02
285 0.02
286 0.02
287 0.02
288 0.02
289 0.02
290 0.02
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.07
298 0.09
299 0.1
300 0.11
301 0.11
302 0.14
303 0.17
304 0.18
305 0.17
306 0.16
307 0.16
308 0.17
309 0.17
310 0.14
311 0.12
312 0.11
313 0.09
314 0.08
315 0.05
316 0.04
317 0.05
318 0.04
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.08
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.12
329 0.12
330 0.12
331 0.11
332 0.1
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.09
345 0.1
346 0.12
347 0.19
348 0.25
349 0.32
350 0.36
351 0.4
352 0.4
353 0.46
354 0.47
355 0.46
356 0.45
357 0.41
358 0.39
359 0.35
360 0.32
361 0.27
362 0.24
363 0.17
364 0.12
365 0.12
366 0.12
367 0.13
368 0.12
369 0.14
370 0.18
371 0.22
372 0.28
373 0.35
374 0.38
375 0.47
376 0.56
377 0.64
378 0.71
379 0.75
380 0.8
381 0.8
382 0.83
383 0.79
384 0.78
385 0.72
386 0.7
387 0.73
388 0.71
389 0.66
390 0.62
391 0.62
392 0.59
393 0.58
394 0.53
395 0.49
396 0.49
397 0.46
398 0.45
399 0.39
400 0.36
401 0.33
402 0.3
403 0.25
404 0.18
405 0.18
406 0.15
407 0.15
408 0.13
409 0.12
410 0.12
411 0.09
412 0.07
413 0.05
414 0.05
415 0.04
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.07
424 0.08
425 0.09
426 0.09
427 0.08
428 0.09
429 0.11
430 0.1
431 0.1
432 0.1
433 0.11
434 0.11
435 0.12
436 0.12
437 0.12
438 0.12
439 0.11
440 0.1
441 0.09
442 0.09
443 0.08
444 0.07
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.07
456 0.07
457 0.08
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.06
464 0.06
465 0.05
466 0.07
467 0.07
468 0.07
469 0.08
470 0.08
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.05
475 0.06
476 0.08
477 0.08
478 0.11
479 0.11
480 0.12
481 0.13
482 0.13
483 0.12
484 0.11
485 0.1
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.05
490 0.05
491 0.04
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.05
497 0.09
498 0.09