Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135TFY7

Protein Details
Accession A0A135TFY7    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MARRKANKGKKPKKLTAPIAISDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-14RRKANKGKKPKK
156-188KTKAKNTKKRGRPSASSSTPPASNKRGKRNGHP
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.5, mito 3, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR008251  Chromo_shadow_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF01393  Chromo_shadow  
CDD cd18657  CSD_Swi6  
Amino Acid Sequences MARRKANKGKKPKKLTAPIAISDDEMSDAGGEIAIPLKEKRAKSRSAEYRDDVSEAKSEEDIPMISGDLNGSATKPARAARAAKPAKADSVVADEQEEEGDEDDDLEADEYVVEKILDHLASDDASAPFLLKEGASEILEEYLRKLGGREALFEEKTKAKNTKKRGRPSASSSTPPASNKRGKRNGHPAESTPPLSAKEAKAKAWTLPSGSWEDDVESIDACEDEESGSIIIYLNWRNGQKTKHPKEVVYKRCPQKMLQFYEKHIRIIKAGPDADLPELDAAPEAKM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.89
3 0.87
4 0.82
5 0.75
6 0.69
7 0.6
8 0.5
9 0.4
10 0.31
11 0.22
12 0.16
13 0.12
14 0.08
15 0.07
16 0.06
17 0.05
18 0.05
19 0.04
20 0.06
21 0.07
22 0.08
23 0.09
24 0.16
25 0.22
26 0.26
27 0.36
28 0.4
29 0.47
30 0.52
31 0.63
32 0.66
33 0.68
34 0.71
35 0.65
36 0.63
37 0.57
38 0.53
39 0.43
40 0.34
41 0.29
42 0.23
43 0.21
44 0.16
45 0.16
46 0.14
47 0.14
48 0.12
49 0.1
50 0.09
51 0.08
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.06
56 0.07
57 0.06
58 0.06
59 0.09
60 0.09
61 0.1
62 0.12
63 0.14
64 0.16
65 0.2
66 0.24
67 0.28
68 0.38
69 0.4
70 0.4
71 0.43
72 0.41
73 0.39
74 0.35
75 0.29
76 0.19
77 0.22
78 0.21
79 0.16
80 0.16
81 0.14
82 0.13
83 0.12
84 0.11
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.04
94 0.04
95 0.03
96 0.03
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.05
103 0.06
104 0.06
105 0.05
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.12
135 0.13
136 0.14
137 0.16
138 0.2
139 0.2
140 0.21
141 0.22
142 0.2
143 0.22
144 0.24
145 0.29
146 0.34
147 0.41
148 0.51
149 0.59
150 0.64
151 0.72
152 0.78
153 0.77
154 0.75
155 0.75
156 0.74
157 0.68
158 0.62
159 0.54
160 0.46
161 0.43
162 0.39
163 0.36
164 0.34
165 0.38
166 0.42
167 0.5
168 0.57
169 0.58
170 0.64
171 0.71
172 0.71
173 0.69
174 0.65
175 0.57
176 0.54
177 0.54
178 0.46
179 0.36
180 0.29
181 0.24
182 0.24
183 0.24
184 0.21
185 0.27
186 0.27
187 0.28
188 0.31
189 0.31
190 0.31
191 0.32
192 0.31
193 0.24
194 0.22
195 0.24
196 0.23
197 0.23
198 0.21
199 0.17
200 0.17
201 0.15
202 0.15
203 0.13
204 0.09
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.09
220 0.11
221 0.13
222 0.17
223 0.19
224 0.23
225 0.27
226 0.32
227 0.4
228 0.49
229 0.55
230 0.61
231 0.64
232 0.66
233 0.72
234 0.77
235 0.77
236 0.75
237 0.76
238 0.74
239 0.77
240 0.75
241 0.69
242 0.68
243 0.68
244 0.67
245 0.67
246 0.63
247 0.62
248 0.7
249 0.67
250 0.61
251 0.57
252 0.5
253 0.43
254 0.44
255 0.44
256 0.41
257 0.39
258 0.36
259 0.33
260 0.33
261 0.32
262 0.26
263 0.22
264 0.15
265 0.14
266 0.13
267 0.12