Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135UGP3

Protein Details
Accession A0A135UGP3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
240-259PMDVERSRSRSRSRSRARSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-150RKLRRK
249-257RSRSRSRAR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 15, nucl 11.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSKPDLVYADERRFLDERGSSASLAPNGENPATIMEKAVRERIIDSYFYKEQCFAVNEADIVDRVVEHVTFIGGTSGVTQKPTPFLCLAFKLLQLAPSDEVLETYLGFGGEKFKYLRALACFYVRMTRKAKDVYLFLEPFLEDRRKLRRKGRQGTSLTFMDDFVDDLLTKTRVCATSFRELPKRVDLVDLGELEERISPLGDIDDLLDDEEEIEEENAGANGADESEGEVAEDGSGAGEPMDVERSRSRSRSRSRARSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.37
3 0.32
4 0.29
5 0.3
6 0.31
7 0.27
8 0.27
9 0.29
10 0.25
11 0.24
12 0.22
13 0.18
14 0.2
15 0.19
16 0.18
17 0.15
18 0.16
19 0.17
20 0.16
21 0.15
22 0.15
23 0.18
24 0.21
25 0.24
26 0.22
27 0.21
28 0.23
29 0.26
30 0.26
31 0.25
32 0.25
33 0.27
34 0.3
35 0.3
36 0.3
37 0.26
38 0.25
39 0.25
40 0.26
41 0.2
42 0.19
43 0.18
44 0.17
45 0.16
46 0.16
47 0.12
48 0.1
49 0.08
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.06
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.04
61 0.04
62 0.06
63 0.08
64 0.08
65 0.1
66 0.11
67 0.11
68 0.15
69 0.16
70 0.17
71 0.16
72 0.17
73 0.19
74 0.2
75 0.23
76 0.2
77 0.19
78 0.19
79 0.18
80 0.19
81 0.17
82 0.16
83 0.14
84 0.13
85 0.13
86 0.11
87 0.1
88 0.08
89 0.08
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.04
94 0.05
95 0.04
96 0.07
97 0.07
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.12
102 0.13
103 0.16
104 0.15
105 0.17
106 0.17
107 0.18
108 0.17
109 0.16
110 0.22
111 0.21
112 0.23
113 0.23
114 0.24
115 0.27
116 0.28
117 0.29
118 0.25
119 0.25
120 0.22
121 0.24
122 0.23
123 0.19
124 0.17
125 0.16
126 0.14
127 0.16
128 0.16
129 0.11
130 0.15
131 0.25
132 0.32
133 0.38
134 0.47
135 0.54
136 0.63
137 0.72
138 0.76
139 0.75
140 0.74
141 0.7
142 0.66
143 0.56
144 0.47
145 0.37
146 0.29
147 0.2
148 0.15
149 0.12
150 0.07
151 0.07
152 0.05
153 0.06
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.11
159 0.13
160 0.14
161 0.18
162 0.21
163 0.29
164 0.33
165 0.38
166 0.42
167 0.43
168 0.45
169 0.46
170 0.42
171 0.34
172 0.32
173 0.27
174 0.23
175 0.23
176 0.2
177 0.16
178 0.15
179 0.14
180 0.13
181 0.13
182 0.1
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.04
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.11
229 0.1
230 0.15
231 0.2
232 0.27
233 0.33
234 0.4
235 0.47
236 0.53
237 0.63
238 0.7
239 0.76