Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G3JQF4

Protein Details
Accession G3JQF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
395-419GERARTKARAERRKENERKLRQSHMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
222-240EPPKFKHKKIPRGPPSPPP
386-415RSRSGSESDGERARTKARAERRKENERKLR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG cmt:CCM_07710  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MASIAASLQSSLPKPKYTGEDEEIPSHAKPRGPRIVGAGQIDETQIVLKRAGPPPYGQRVGWRPRSQEDFGDGGAFPEVPVAQYPLDMGKKGSTASNALAIQVDAEGKVKYDAIARQGHGDGRIIHTSFKDLIPLRQRADAGEIDLARPDKETVAATAERTRDALAKLVSGALAAQKPKNVNVGQRAEPTFVRYTPADQMGDNSKKQDRIMKIVEKQRDPLEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEMWRIPPPVSNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDITINDKHAQFAEAVKMAERHAREEVQQRALMQQRLAEKEKMQKEDNLRALAQKAREERNAANTSRGRRNSRDSADSRDSRDSRSRSSGYDSRRSSRSRSGSESDGERARTKARAERRKENERKLRQSHMGAERQMQAMAREQNRDLSEKIQLGLAKPTQSKETMYDSRLFNQSSGFDSGFNEDNHYDKPLFAAQDAISSIYRPRANMDDDEDADTGDREMAKIQRTGRFGDALGKGTFKGAAEVEAREGPVQFEKEAADPFNVDKFLSEVDKKESGGGGEGGSSGKRGYGLQEDEDRGKKRARVEDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.36
3 0.42
4 0.44
5 0.49
6 0.46
7 0.51
8 0.51
9 0.51
10 0.48
11 0.44
12 0.37
13 0.34
14 0.32
15 0.28
16 0.3
17 0.37
18 0.45
19 0.45
20 0.47
21 0.5
22 0.52
23 0.53
24 0.5
25 0.42
26 0.33
27 0.31
28 0.29
29 0.22
30 0.16
31 0.14
32 0.13
33 0.13
34 0.13
35 0.15
36 0.22
37 0.28
38 0.33
39 0.32
40 0.35
41 0.43
42 0.51
43 0.52
44 0.45
45 0.48
46 0.52
47 0.6
48 0.65
49 0.63
50 0.59
51 0.62
52 0.69
53 0.63
54 0.57
55 0.52
56 0.44
57 0.38
58 0.35
59 0.28
60 0.22
61 0.19
62 0.15
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.07
67 0.08
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.14
73 0.16
74 0.16
75 0.17
76 0.17
77 0.18
78 0.19
79 0.2
80 0.17
81 0.18
82 0.18
83 0.22
84 0.2
85 0.2
86 0.19
87 0.17
88 0.14
89 0.12
90 0.12
91 0.07
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.13
99 0.15
100 0.2
101 0.24
102 0.24
103 0.27
104 0.28
105 0.29
106 0.26
107 0.26
108 0.21
109 0.21
110 0.25
111 0.22
112 0.22
113 0.21
114 0.23
115 0.22
116 0.21
117 0.23
118 0.2
119 0.27
120 0.33
121 0.38
122 0.37
123 0.38
124 0.38
125 0.33
126 0.36
127 0.29
128 0.23
129 0.21
130 0.2
131 0.16
132 0.19
133 0.18
134 0.14
135 0.15
136 0.14
137 0.1
138 0.11
139 0.12
140 0.11
141 0.14
142 0.15
143 0.16
144 0.19
145 0.2
146 0.19
147 0.19
148 0.19
149 0.17
150 0.17
151 0.19
152 0.15
153 0.15
154 0.15
155 0.14
156 0.13
157 0.1
158 0.1
159 0.08
160 0.1
161 0.12
162 0.13
163 0.16
164 0.18
165 0.19
166 0.26
167 0.25
168 0.28
169 0.34
170 0.38
171 0.38
172 0.42
173 0.42
174 0.38
175 0.36
176 0.35
177 0.28
178 0.24
179 0.23
180 0.19
181 0.2
182 0.21
183 0.24
184 0.2
185 0.18
186 0.2
187 0.26
188 0.29
189 0.28
190 0.28
191 0.28
192 0.29
193 0.31
194 0.36
195 0.3
196 0.33
197 0.4
198 0.43
199 0.47
200 0.52
201 0.57
202 0.51
203 0.51
204 0.47
205 0.44
206 0.41
207 0.43
208 0.46
209 0.46
210 0.47
211 0.55
212 0.59
213 0.57
214 0.63
215 0.64
216 0.65
217 0.68
218 0.77
219 0.75
220 0.77
221 0.79
222 0.78
223 0.76
224 0.72
225 0.66
226 0.56
227 0.52
228 0.49
229 0.5
230 0.5
231 0.5
232 0.48
233 0.49
234 0.51
235 0.46
236 0.43
237 0.43
238 0.42
239 0.4
240 0.37
241 0.35
242 0.34
243 0.33
244 0.32
245 0.29
246 0.21
247 0.16
248 0.17
249 0.18
250 0.26
251 0.29
252 0.36
253 0.41
254 0.47
255 0.52
256 0.49
257 0.5
258 0.42
259 0.41
260 0.38
261 0.41
262 0.38
263 0.38
264 0.4
265 0.36
266 0.33
267 0.33
268 0.29
269 0.2
270 0.18
271 0.14
272 0.15
273 0.15
274 0.14
275 0.12
276 0.13
277 0.12
278 0.15
279 0.14
280 0.13
281 0.14
282 0.15
283 0.15
284 0.13
285 0.14
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.13
295 0.12
296 0.13
297 0.13
298 0.14
299 0.17
300 0.24
301 0.27
302 0.26
303 0.26
304 0.24
305 0.27
306 0.3
307 0.28
308 0.22
309 0.21
310 0.22
311 0.25
312 0.28
313 0.25
314 0.24
315 0.31
316 0.36
317 0.37
318 0.35
319 0.35
320 0.37
321 0.44
322 0.44
323 0.38
324 0.34
325 0.31
326 0.32
327 0.3
328 0.26
329 0.23
330 0.24
331 0.26
332 0.28
333 0.3
334 0.29
335 0.35
336 0.37
337 0.33
338 0.35
339 0.35
340 0.39
341 0.44
342 0.49
343 0.45
344 0.45
345 0.52
346 0.53
347 0.54
348 0.56
349 0.51
350 0.52
351 0.55
352 0.53
353 0.5
354 0.49
355 0.46
356 0.43
357 0.48
358 0.43
359 0.4
360 0.44
361 0.41
362 0.35
363 0.41
364 0.42
365 0.41
366 0.47
367 0.46
368 0.44
369 0.48
370 0.49
371 0.47
372 0.5
373 0.51
374 0.46
375 0.49
376 0.48
377 0.45
378 0.45
379 0.42
380 0.37
381 0.33
382 0.31
383 0.26
384 0.24
385 0.24
386 0.25
387 0.25
388 0.29
389 0.37
390 0.45
391 0.51
392 0.6
393 0.67
394 0.74
395 0.8
396 0.83
397 0.84
398 0.84
399 0.86
400 0.81
401 0.8
402 0.74
403 0.69
404 0.67
405 0.64
406 0.59
407 0.51
408 0.49
409 0.44
410 0.39
411 0.36
412 0.28
413 0.21
414 0.21
415 0.26
416 0.25
417 0.26
418 0.26
419 0.3
420 0.31
421 0.33
422 0.29
423 0.24
424 0.26
425 0.24
426 0.24
427 0.21
428 0.2
429 0.19
430 0.23
431 0.23
432 0.23
433 0.23
434 0.25
435 0.25
436 0.25
437 0.26
438 0.24
439 0.3
440 0.3
441 0.31
442 0.35
443 0.34
444 0.37
445 0.39
446 0.37
447 0.29
448 0.26
449 0.24
450 0.22
451 0.24
452 0.2
453 0.16
454 0.17
455 0.19
456 0.21
457 0.2
458 0.2
459 0.17
460 0.19
461 0.19
462 0.22
463 0.19
464 0.16
465 0.18
466 0.18
467 0.18
468 0.16
469 0.18
470 0.15
471 0.17
472 0.17
473 0.17
474 0.14
475 0.13
476 0.15
477 0.18
478 0.19
479 0.18
480 0.21
481 0.23
482 0.27
483 0.29
484 0.32
485 0.31
486 0.31
487 0.34
488 0.3
489 0.26
490 0.22
491 0.2
492 0.15
493 0.12
494 0.1
495 0.07
496 0.11
497 0.15
498 0.18
499 0.23
500 0.28
501 0.32
502 0.34
503 0.38
504 0.37
505 0.35
506 0.32
507 0.35
508 0.33
509 0.3
510 0.29
511 0.26
512 0.23
513 0.22
514 0.23
515 0.15
516 0.15
517 0.12
518 0.14
519 0.16
520 0.16
521 0.19
522 0.18
523 0.19
524 0.18
525 0.17
526 0.16
527 0.19
528 0.2
529 0.17
530 0.17
531 0.18
532 0.19
533 0.22
534 0.21
535 0.18
536 0.17
537 0.19
538 0.22
539 0.21
540 0.18
541 0.16
542 0.15
543 0.17
544 0.22
545 0.23
546 0.22
547 0.27
548 0.3
549 0.3
550 0.3
551 0.29
552 0.24
553 0.23
554 0.21
555 0.16
556 0.13
557 0.14
558 0.13
559 0.12
560 0.12
561 0.09
562 0.09
563 0.09
564 0.1
565 0.13
566 0.2
567 0.24
568 0.28
569 0.34
570 0.38
571 0.43
572 0.5
573 0.49
574 0.46
575 0.48
576 0.47
577 0.5
578 0.55