Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135U1B7

Protein Details
Accession A0A135U1B7    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-79LEAPEPPSKRAKRALKKGKKLPVKLDSDHydrophilic
308-333GEQDKKTEEKKFKLRKWWVNKLLGRMHydrophilic
341-364DDQTRYKKRFGKDAPKRQEQKSREBasic
373-396ATEERKPRALRPPKTEKPKAPAGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-78PSKRAKRALKKGKKLPVKLDS
81-89EREAKKKEE
347-358KKRFGKDAPKRQ
377-393RKPRALRPPKTEKPKAP
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MATADSGKRSKKTKANTEPEAEAEVEDAPTQFPESSKKRKSTAAAEEIEVDLEAPEPPSKRAKRALKKGKKLPVKLDSDDEREAKKKEEKDQAKAAARSEHGVWIGNLPFFVTPDELRKWLIDNSGEMITEESITRLHMPTTKQAGKDKPSNKGFAYVDFNDVAPKVAAIALTEAELSRRKLLIKDSKSFEGRPKKEEETAAAGGAGAAAAKEEAPKSSKIFIGNLSFKTTDDDVWQHFEKCGQIDWVKVATFEDTGKCKGYGWVKFREPESAGWAVKGFVKIKEEVETEDDFVASKDKDGDDEMAEGEQDKKTEEKKFKLRKWWVNKLLGRMLKIELAEDDQTRYKKRFGKDAPKRQEQKSREEGGDGAQDATEERKPRALRPPKTEKPKAPAGELKAQDDLMVARLTGAAAKHTGTKITF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.77
3 0.79
4 0.79
5 0.72
6 0.66
7 0.58
8 0.47
9 0.36
10 0.27
11 0.2
12 0.15
13 0.13
14 0.11
15 0.09
16 0.09
17 0.11
18 0.11
19 0.11
20 0.2
21 0.28
22 0.38
23 0.47
24 0.52
25 0.55
26 0.61
27 0.66
28 0.66
29 0.68
30 0.66
31 0.6
32 0.54
33 0.52
34 0.45
35 0.39
36 0.29
37 0.19
38 0.1
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.11
43 0.12
44 0.15
45 0.25
46 0.29
47 0.36
48 0.45
49 0.55
50 0.62
51 0.72
52 0.8
53 0.81
54 0.88
55 0.91
56 0.91
57 0.9
58 0.86
59 0.84
60 0.82
61 0.78
62 0.71
63 0.68
64 0.64
65 0.59
66 0.57
67 0.5
68 0.45
69 0.43
70 0.41
71 0.4
72 0.43
73 0.43
74 0.48
75 0.56
76 0.58
77 0.61
78 0.67
79 0.69
80 0.69
81 0.65
82 0.59
83 0.53
84 0.47
85 0.42
86 0.35
87 0.29
88 0.22
89 0.21
90 0.19
91 0.17
92 0.18
93 0.16
94 0.14
95 0.12
96 0.12
97 0.11
98 0.12
99 0.1
100 0.1
101 0.15
102 0.17
103 0.18
104 0.19
105 0.19
106 0.2
107 0.2
108 0.22
109 0.18
110 0.17
111 0.18
112 0.18
113 0.17
114 0.15
115 0.14
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.07
120 0.06
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.09
125 0.12
126 0.14
127 0.21
128 0.29
129 0.32
130 0.34
131 0.4
132 0.45
133 0.47
134 0.54
135 0.53
136 0.53
137 0.53
138 0.54
139 0.48
140 0.48
141 0.43
142 0.37
143 0.39
144 0.3
145 0.29
146 0.25
147 0.25
148 0.19
149 0.19
150 0.16
151 0.09
152 0.08
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.09
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.12
168 0.14
169 0.23
170 0.31
171 0.34
172 0.39
173 0.42
174 0.45
175 0.47
176 0.47
177 0.47
178 0.48
179 0.45
180 0.42
181 0.44
182 0.42
183 0.42
184 0.41
185 0.35
186 0.3
187 0.28
188 0.24
189 0.19
190 0.16
191 0.13
192 0.11
193 0.09
194 0.03
195 0.02
196 0.02
197 0.02
198 0.02
199 0.03
200 0.04
201 0.05
202 0.07
203 0.09
204 0.1
205 0.12
206 0.14
207 0.15
208 0.16
209 0.17
210 0.21
211 0.23
212 0.22
213 0.23
214 0.22
215 0.21
216 0.22
217 0.2
218 0.15
219 0.14
220 0.15
221 0.13
222 0.17
223 0.18
224 0.16
225 0.16
226 0.16
227 0.16
228 0.14
229 0.14
230 0.13
231 0.13
232 0.13
233 0.15
234 0.15
235 0.14
236 0.13
237 0.13
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.12
242 0.13
243 0.14
244 0.15
245 0.15
246 0.15
247 0.18
248 0.24
249 0.29
250 0.31
251 0.37
252 0.39
253 0.41
254 0.42
255 0.42
256 0.37
257 0.31
258 0.31
259 0.28
260 0.25
261 0.23
262 0.22
263 0.18
264 0.18
265 0.2
266 0.17
267 0.14
268 0.17
269 0.18
270 0.19
271 0.22
272 0.21
273 0.19
274 0.22
275 0.21
276 0.19
277 0.18
278 0.16
279 0.13
280 0.12
281 0.13
282 0.09
283 0.09
284 0.1
285 0.1
286 0.11
287 0.13
288 0.14
289 0.12
290 0.13
291 0.12
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.13
300 0.18
301 0.27
302 0.34
303 0.41
304 0.51
305 0.61
306 0.67
307 0.75
308 0.8
309 0.82
310 0.84
311 0.86
312 0.84
313 0.84
314 0.8
315 0.76
316 0.74
317 0.67
318 0.58
319 0.49
320 0.41
321 0.34
322 0.3
323 0.24
324 0.17
325 0.17
326 0.18
327 0.16
328 0.18
329 0.21
330 0.25
331 0.29
332 0.3
333 0.35
334 0.39
335 0.43
336 0.5
337 0.55
338 0.63
339 0.7
340 0.78
341 0.81
342 0.84
343 0.87
344 0.84
345 0.84
346 0.78
347 0.76
348 0.74
349 0.71
350 0.61
351 0.56
352 0.49
353 0.42
354 0.41
355 0.32
356 0.23
357 0.17
358 0.16
359 0.14
360 0.17
361 0.19
362 0.17
363 0.18
364 0.25
365 0.27
366 0.34
367 0.44
368 0.51
369 0.56
370 0.63
371 0.73
372 0.76
373 0.84
374 0.88
375 0.85
376 0.81
377 0.82
378 0.76
379 0.72
380 0.7
381 0.66
382 0.65
383 0.6
384 0.56
385 0.48
386 0.44
387 0.37
388 0.3
389 0.24
390 0.17
391 0.14
392 0.11
393 0.09
394 0.1
395 0.1
396 0.11
397 0.11
398 0.11
399 0.12
400 0.13
401 0.18
402 0.19