FuNGI

A0A135UIC8

Protein Details

Accession

A0A135UIC8

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-45	LPGQPGQPRPPPIKRRPKGDPLVARKRPG	Basic
207-231	LKDPSLDKKPKPKEKEKDVQFHRQP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
24-55	PRPPPIKRRPKGDPLVARKRPGAPRPAASRPP
213-236	DKKPKPKEKEKDVQFHRQPRSEKE
428-447	KAEEERRKEGKRTTKALIKR
524-533	KKGKSLKRPG
546-552	SRKKLKK

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSAQPPGLPNGQNPNGLPGQPGQPRPPPIKRRPKGDPLVARKRPGAPRPAASRPPPGSLQTASGARPSPAGTGHHGLQRPETEEDIRAKRAANGGWLDPAPQNVREFKIVTTKKALKDGVRHHVIKLSSAKAELEKNGIDPTNQEEFTRPVTLQRRDPRQPPPGREVKHEEPEPQPVDEKEAERLAQLKADREAIRAVELAKSAPSLKDPSLDKKPKPKEKEKDVQFHRQPRSEKEKKQQGLRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYVAPLSETTVCFVATRDGKFAAIPLEKWYKFTAKPHFNTMRLEEAEALMSKKTDIGRWYMRDKQKKSEQDEWEATRHALYGPARIKTESSTFRGSSREEKQDHDEIDMEGDEFQDDDENPGLDVDNDEDTKEATDRIRRDQMGANLFGEADERRVEKELNEMRKAEEERRKEGKRTTKALIKREKETIYQSDSSGYDPFESSSSEDDSDEEKRKEEEKDKDKDEENKDKDGDFKDKTASGVSSKGNTTPSGRQKHTDALKKGKSLKRPGSPNLSESSGNESSRKKLKKHAAASVHQSRSSTPSGGLKSHLKGAMSDGEATGGEMSDGQLRKKKIKLVGSGARGTPVGSRAGSPVPAASGSKPGSPVPEGSPAPRGPIQAHEIVDALPELPGGISIGNLMRRFQGRIGDGPGQMDRKEWIKLVKENCAYGSDKILRRRP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.38
3	0.36
4	0.34
5	0.27
6	0.31
7	0.35
8	0.39
9	0.4
10	0.44
11	0.51
12	0.59
13	0.66
14	0.68
15	0.73
16	0.79
17	0.8
18	0.82
19	0.84
20	0.86
21	0.85
22	0.84
23	0.84
24	0.83
25	0.87
26	0.84
27	0.79
28	0.73
29	0.73
30	0.72
31	0.69
32	0.68
33	0.64
34	0.65
35	0.69
36	0.73
37	0.73
38	0.68
39	0.7
40	0.64
41	0.62
42	0.57
43	0.52
44	0.48
45	0.41
46	0.39
47	0.34
48	0.33
49	0.29
50	0.29
51	0.27
52	0.23
53	0.23
54	0.21
55	0.18
56	0.18
57	0.2
58	0.22
59	0.25
60	0.28
61	0.33
62	0.35
63	0.34
64	0.36
65	0.36
66	0.35
67	0.33
68	0.33
69	0.29
70	0.31
71	0.37
72	0.37
73	0.37
74	0.34
75	0.32
76	0.32
77	0.35
78	0.31
79	0.3
80	0.28
81	0.27
82	0.29
83	0.28
84	0.27
85	0.23
86	0.26
87	0.23
88	0.23
89	0.25
90	0.25
91	0.28
92	0.29
93	0.29
94	0.27
95	0.35
96	0.35
97	0.36
98	0.41
99	0.45
100	0.45
101	0.51
102	0.53
103	0.48
104	0.54
105	0.58
106	0.59
107	0.6
108	0.58
109	0.52
110	0.53
111	0.48
112	0.44
113	0.41
114	0.35
115	0.28
116	0.28
117	0.29
118	0.27
119	0.29
120	0.25
121	0.23
122	0.2
123	0.2
124	0.23
125	0.22
126	0.18
127	0.17
128	0.21
129	0.23
130	0.23
131	0.22
132	0.21
133	0.23
134	0.26
135	0.27
136	0.22
137	0.24
138	0.33
139	0.37
140	0.44
141	0.51
142	0.57
143	0.61
144	0.68
145	0.69
146	0.71
147	0.74
148	0.71
149	0.71
150	0.71
151	0.66
152	0.67
153	0.66
154	0.63
155	0.63
156	0.59
157	0.55
158	0.48
159	0.54
160	0.49
161	0.41
162	0.37
163	0.29
164	0.32
165	0.3
166	0.28
167	0.24
168	0.23
169	0.22
170	0.2
171	0.22
172	0.18
173	0.19
174	0.19
175	0.18
176	0.18
177	0.24
178	0.24
179	0.23
180	0.24
181	0.21
182	0.2
183	0.18
184	0.17
185	0.13
186	0.12
187	0.11
188	0.1
189	0.11
190	0.11
191	0.1
192	0.12
193	0.14
194	0.14
195	0.19
196	0.22
197	0.28
198	0.38
199	0.45
200	0.48
201	0.55
202	0.65
203	0.7
204	0.76
205	0.8
206	0.79
207	0.81
208	0.86
209	0.84
210	0.84
211	0.8
212	0.82
213	0.79
214	0.78
215	0.75
216	0.71
217	0.67
218	0.65
219	0.69
220	0.68
221	0.68
222	0.69
223	0.73
224	0.72
225	0.77
226	0.74
227	0.71
228	0.69
229	0.63
230	0.56
231	0.47
232	0.44
233	0.36
234	0.32
235	0.25
236	0.18
237	0.16
238	0.12
239	0.1
240	0.1
241	0.11
242	0.13
243	0.13
244	0.12
245	0.12
246	0.12
247	0.12
248	0.11
249	0.09
250	0.06
251	0.08
252	0.08
253	0.07
254	0.08
255	0.08
256	0.09
257	0.1
258	0.09
259	0.08
260	0.09
261	0.09
262	0.09
263	0.09
264	0.12
265	0.14
266	0.15
267	0.15
268	0.15
269	0.15
270	0.15
271	0.15
272	0.15
273	0.13
274	0.12
275	0.16
276	0.23
277	0.22
278	0.24
279	0.26
280	0.25
281	0.27
282	0.33
283	0.39
284	0.4
285	0.42
286	0.5
287	0.53
288	0.51
289	0.51
290	0.46
291	0.42
292	0.34
293	0.32
294	0.23
295	0.18
296	0.17
297	0.15
298	0.13
299	0.07
300	0.07
301	0.06
302	0.08
303	0.09
304	0.1
305	0.11
306	0.16
307	0.21
308	0.25
309	0.3
310	0.36
311	0.43
312	0.5
313	0.52
314	0.55
315	0.59
316	0.63
317	0.66
318	0.67
319	0.62
320	0.6
321	0.61
322	0.55
323	0.48
324	0.41
325	0.34
326	0.24
327	0.21
328	0.14
329	0.13
330	0.11
331	0.16
332	0.18
333	0.19
334	0.2
335	0.2
336	0.21
337	0.18
338	0.23
339	0.2
340	0.21
341	0.23
342	0.23
343	0.24
344	0.25
345	0.26
346	0.27
347	0.29
348	0.33
349	0.31
350	0.33
351	0.37
352	0.39
353	0.37
354	0.32
355	0.27
356	0.19
357	0.18
358	0.16
359	0.11
360	0.07
361	0.06
362	0.05
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.06
377	0.06
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.07
382	0.07
383	0.08
384	0.08
385	0.14
386	0.16
387	0.21
388	0.27
389	0.27
390	0.29
391	0.32
392	0.35
393	0.33
394	0.32
395	0.27
396	0.21
397	0.21
398	0.18
399	0.15
400	0.1
401	0.07
402	0.07
403	0.08
404	0.09
405	0.1
406	0.11
407	0.1
408	0.19
409	0.25
410	0.3
411	0.32
412	0.32
413	0.31
414	0.36
415	0.38
416	0.38
417	0.39
418	0.37
419	0.42
420	0.5
421	0.53
422	0.52
423	0.58
424	0.59
425	0.59
426	0.6
427	0.58
428	0.57
429	0.61
430	0.65
431	0.67
432	0.61
433	0.57
434	0.58
435	0.55
436	0.5
437	0.48
438	0.43
439	0.39
440	0.36
441	0.32
442	0.28
443	0.27
444	0.25
445	0.21
446	0.17
447	0.12
448	0.11
449	0.12
450	0.1
451	0.1
452	0.1
453	0.11
454	0.12
455	0.12
456	0.12
457	0.12
458	0.14
459	0.18
460	0.23
461	0.22
462	0.21
463	0.23
464	0.26
465	0.31
466	0.37
467	0.42
468	0.45
469	0.52
470	0.54
471	0.57
472	0.59
473	0.61
474	0.62
475	0.62
476	0.57
477	0.55
478	0.52
479	0.48
480	0.48
481	0.44
482	0.42
483	0.33
484	0.31
485	0.29
486	0.29
487	0.29
488	0.26
489	0.23
490	0.18
491	0.2
492	0.2
493	0.2
494	0.2
495	0.21
496	0.21
497	0.21
498	0.23
499	0.28
500	0.36
501	0.41
502	0.43
503	0.43
504	0.45
505	0.52
506	0.56
507	0.56
508	0.54
509	0.57
510	0.59
511	0.62
512	0.69
513	0.67
514	0.67
515	0.68
516	0.7
517	0.68
518	0.71
519	0.71
520	0.71
521	0.68
522	0.62
523	0.55
524	0.49
525	0.41
526	0.34
527	0.36
528	0.3
529	0.28
530	0.3
531	0.28
532	0.31
533	0.4
534	0.45
535	0.41
536	0.47
537	0.56
538	0.62
539	0.67
540	0.71
541	0.69
542	0.68
543	0.74
544	0.74
545	0.67
546	0.58
547	0.52
548	0.44
549	0.41
550	0.38
551	0.3
552	0.23
553	0.25
554	0.27
555	0.28
556	0.31
557	0.31
558	0.3
559	0.34
560	0.34
561	0.28
562	0.25
563	0.27
564	0.28
565	0.24
566	0.23
567	0.17
568	0.16
569	0.16
570	0.15
571	0.12
572	0.07
573	0.06
574	0.05
575	0.06
576	0.11
577	0.13
578	0.16
579	0.22
580	0.26
581	0.33
582	0.37
583	0.44
584	0.46
585	0.53
586	0.57
587	0.61
588	0.65
589	0.65
590	0.64
591	0.57
592	0.51
593	0.42
594	0.35
595	0.28
596	0.21
597	0.18
598	0.15
599	0.15
600	0.16
601	0.18
602	0.19
603	0.17
604	0.16
605	0.14
606	0.15
607	0.16
608	0.14
609	0.19
610	0.2
611	0.21
612	0.23
613	0.23
614	0.25
615	0.25
616	0.27
617	0.24
618	0.3
619	0.29
620	0.3
621	0.35
622	0.32
623	0.35
624	0.35
625	0.33
626	0.27
627	0.31
628	0.34
629	0.32
630	0.33
631	0.28
632	0.26
633	0.24
634	0.23
635	0.18
636	0.13
637	0.08
638	0.07
639	0.06
640	0.05
641	0.05
642	0.05
643	0.05
644	0.04
645	0.06
646	0.09
647	0.14
648	0.15
649	0.16
650	0.2
651	0.23
652	0.26
653	0.27
654	0.31
655	0.3
656	0.33
657	0.39
658	0.4
659	0.38
660	0.39
661	0.41
662	0.37
663	0.33
664	0.3
665	0.27
666	0.25
667	0.27
668	0.28
669	0.31
670	0.35
671	0.42
672	0.46
673	0.53
674	0.53
675	0.52
676	0.5
677	0.47
678	0.43
679	0.37
680	0.4
681	0.39
682	0.42

A0A135UIC8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer